Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E9D3X6

Protein Details
Accession E9D3X6    Localization Confidence High Confidence Score 22.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-83SKTHDSDSKKDRSDRRDRDRDRDRDRDRIRDGSRDHDRDRRRRDRSRERRSEKDADGBasic
95-128ASANGSYRSRKRSRSRDSDRRRSRRDRYGDDYRSHydrophilic
162-188DDDRDDDRRRSRRDKDGRKRSLSAKRRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
36-80KDRSDRRDRDRDRDRDRDRIRDGSRDHDRDRRRRDRSRERRSEKD
91-120RSDRASANGSYRSRKRSRSRDSDRRRSRRD
155-190PSGRSRRDDDRDDDRRRSRRDKDGRKRSLSAKRRSK
475-481RKAPKAR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR029123  RBM39_linker  
IPR006509  RBM39_SF  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF15519  RBM39linker  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12283  RRM1_RBM39_like  
cd12284  RRM2_RBM23_RBM39  
cd12285  RRM3_RBM39_like  
Amino Acid Sequences MSGIDVEALLESTAEPGPTQQTEEAVSKTHDSDSKKDRSDRRDRDRDRDRDRDRIRDGSRDHDRDRRRRDRSRERRSEKDADGDEEMRSPRSDRASANGSYRSRKRSRSRDSDRRRSRRDRYGDDYRSSGGDYYRGGGRARTRSRSPHDDRYYRPSGRSRRDDDRDDDRRRSRRDKDGRKRSLSAKRRSKTPEPQLTEDERDKRTVFVQQLAARLRTKELIAFFEKAGPVKDAQIVKDRVSGRSKGVGYVEFKNEESVPLAIQLTGQKLLGIPIIAQFTEAEKNKAARNTEGHVSGNQNSIPFHRLYVGNIHFSITESDLQNVFEPFGELDFVQLQKDENGRSRGYGFVQFRDPNQAREALEKMNGFDLAGRPIRVGLGNDKFSSDPATNLMRLQAQGQQNSLYGQGGRGAATALGGNFDRAGGRDNDKGVGGASALDDTDVAGVNFNNYSRDALMRKLARTDEPAADTTADDKRKAPKARPEAKPLPVSVNMASRCVLLRNMFDPTEEEGDSWVKELEDDVRAECEEKYGHVVHIALDPNAQGDIYLKFDRVQGGENAIKGLNGRFFGGRQITAQPVVDAVYSSLFSRTKAI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.1
4 0.14
5 0.15
6 0.19
7 0.17
8 0.18
9 0.22
10 0.24
11 0.24
12 0.22
13 0.23
14 0.22
15 0.23
16 0.26
17 0.28
18 0.29
19 0.37
20 0.43
21 0.5
22 0.55
23 0.62
24 0.67
25 0.72
26 0.79
27 0.81
28 0.83
29 0.85
30 0.85
31 0.87
32 0.89
33 0.89
34 0.87
35 0.87
36 0.82
37 0.82
38 0.82
39 0.8
40 0.76
41 0.75
42 0.7
43 0.68
44 0.65
45 0.63
46 0.67
47 0.65
48 0.64
49 0.64
50 0.7
51 0.72
52 0.8
53 0.81
54 0.8
55 0.83
56 0.89
57 0.91
58 0.92
59 0.93
60 0.93
61 0.91
62 0.9
63 0.88
64 0.86
65 0.78
66 0.75
67 0.67
68 0.59
69 0.55
70 0.47
71 0.39
72 0.35
73 0.32
74 0.25
75 0.23
76 0.21
77 0.22
78 0.26
79 0.29
80 0.26
81 0.31
82 0.34
83 0.36
84 0.39
85 0.42
86 0.41
87 0.46
88 0.51
89 0.54
90 0.56
91 0.63
92 0.69
93 0.72
94 0.79
95 0.81
96 0.86
97 0.88
98 0.91
99 0.93
100 0.94
101 0.93
102 0.93
103 0.92
104 0.9
105 0.9
106 0.88
107 0.85
108 0.82
109 0.82
110 0.79
111 0.72
112 0.65
113 0.55
114 0.46
115 0.39
116 0.32
117 0.22
118 0.17
119 0.14
120 0.15
121 0.16
122 0.17
123 0.17
124 0.19
125 0.26
126 0.33
127 0.4
128 0.44
129 0.46
130 0.53
131 0.61
132 0.67
133 0.68
134 0.69
135 0.71
136 0.72
137 0.71
138 0.71
139 0.71
140 0.63
141 0.61
142 0.6
143 0.6
144 0.63
145 0.67
146 0.65
147 0.67
148 0.71
149 0.71
150 0.68
151 0.69
152 0.69
153 0.67
154 0.69
155 0.68
156 0.7
157 0.72
158 0.75
159 0.73
160 0.74
161 0.78
162 0.81
163 0.83
164 0.86
165 0.88
166 0.85
167 0.82
168 0.8
169 0.8
170 0.78
171 0.78
172 0.77
173 0.71
174 0.73
175 0.76
176 0.76
177 0.75
178 0.76
179 0.75
180 0.71
181 0.71
182 0.69
183 0.65
184 0.62
185 0.57
186 0.52
187 0.44
188 0.4
189 0.37
190 0.32
191 0.29
192 0.3
193 0.26
194 0.24
195 0.28
196 0.28
197 0.33
198 0.34
199 0.35
200 0.3
201 0.29
202 0.26
203 0.22
204 0.2
205 0.18
206 0.17
207 0.18
208 0.2
209 0.2
210 0.19
211 0.2
212 0.2
213 0.18
214 0.18
215 0.15
216 0.12
217 0.12
218 0.17
219 0.16
220 0.17
221 0.24
222 0.25
223 0.25
224 0.3
225 0.3
226 0.3
227 0.32
228 0.32
229 0.26
230 0.31
231 0.3
232 0.25
233 0.26
234 0.24
235 0.24
236 0.25
237 0.26
238 0.21
239 0.21
240 0.21
241 0.19
242 0.16
243 0.14
244 0.11
245 0.09
246 0.08
247 0.08
248 0.07
249 0.08
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.07
255 0.07
256 0.08
257 0.07
258 0.06
259 0.05
260 0.06
261 0.07
262 0.06
263 0.07
264 0.06
265 0.07
266 0.13
267 0.13
268 0.13
269 0.14
270 0.16
271 0.18
272 0.21
273 0.21
274 0.19
275 0.2
276 0.21
277 0.22
278 0.22
279 0.21
280 0.19
281 0.2
282 0.19
283 0.18
284 0.15
285 0.14
286 0.12
287 0.13
288 0.14
289 0.12
290 0.11
291 0.11
292 0.11
293 0.12
294 0.18
295 0.19
296 0.18
297 0.18
298 0.18
299 0.16
300 0.16
301 0.16
302 0.11
303 0.11
304 0.1
305 0.11
306 0.11
307 0.12
308 0.12
309 0.11
310 0.1
311 0.07
312 0.07
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.05
317 0.05
318 0.06
319 0.07
320 0.06
321 0.07
322 0.07
323 0.09
324 0.11
325 0.12
326 0.16
327 0.19
328 0.19
329 0.2
330 0.21
331 0.2
332 0.2
333 0.25
334 0.22
335 0.21
336 0.26
337 0.26
338 0.25
339 0.34
340 0.33
341 0.28
342 0.28
343 0.29
344 0.25
345 0.26
346 0.28
347 0.19
348 0.21
349 0.19
350 0.18
351 0.16
352 0.15
353 0.12
354 0.11
355 0.11
356 0.12
357 0.13
358 0.12
359 0.12
360 0.12
361 0.13
362 0.12
363 0.13
364 0.15
365 0.19
366 0.21
367 0.21
368 0.22
369 0.22
370 0.21
371 0.24
372 0.17
373 0.13
374 0.14
375 0.16
376 0.15
377 0.15
378 0.17
379 0.14
380 0.14
381 0.15
382 0.18
383 0.2
384 0.21
385 0.21
386 0.21
387 0.2
388 0.2
389 0.19
390 0.13
391 0.09
392 0.08
393 0.1
394 0.1
395 0.09
396 0.09
397 0.08
398 0.07
399 0.08
400 0.08
401 0.05
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.09
410 0.11
411 0.14
412 0.17
413 0.18
414 0.19
415 0.19
416 0.18
417 0.16
418 0.13
419 0.09
420 0.07
421 0.06
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.04
426 0.04
427 0.05
428 0.05
429 0.04
430 0.05
431 0.05
432 0.06
433 0.07
434 0.08
435 0.09
436 0.09
437 0.11
438 0.11
439 0.15
440 0.15
441 0.17
442 0.24
443 0.27
444 0.27
445 0.3
446 0.32
447 0.31
448 0.34
449 0.36
450 0.32
451 0.31
452 0.31
453 0.28
454 0.26
455 0.23
456 0.21
457 0.24
458 0.23
459 0.21
460 0.23
461 0.3
462 0.39
463 0.45
464 0.5
465 0.54
466 0.62
467 0.71
468 0.75
469 0.77
470 0.76
471 0.76
472 0.72
473 0.64
474 0.58
475 0.5
476 0.46
477 0.39
478 0.38
479 0.32
480 0.29
481 0.28
482 0.23
483 0.21
484 0.2
485 0.21
486 0.17
487 0.19
488 0.2
489 0.23
490 0.23
491 0.23
492 0.23
493 0.24
494 0.25
495 0.22
496 0.2
497 0.18
498 0.19
499 0.19
500 0.17
501 0.14
502 0.1
503 0.1
504 0.11
505 0.12
506 0.14
507 0.15
508 0.15
509 0.16
510 0.17
511 0.18
512 0.17
513 0.16
514 0.14
515 0.14
516 0.18
517 0.17
518 0.17
519 0.18
520 0.18
521 0.17
522 0.21
523 0.22
524 0.18
525 0.17
526 0.16
527 0.15
528 0.15
529 0.13
530 0.08
531 0.08
532 0.09
533 0.14
534 0.16
535 0.16
536 0.17
537 0.19
538 0.22
539 0.22
540 0.24
541 0.2
542 0.26
543 0.28
544 0.27
545 0.27
546 0.24
547 0.23
548 0.21
549 0.22
550 0.19
551 0.17
552 0.19
553 0.19
554 0.19
555 0.26
556 0.28
557 0.26
558 0.25
559 0.28
560 0.3
561 0.31
562 0.31
563 0.24
564 0.2
565 0.2
566 0.17
567 0.14
568 0.11
569 0.1
570 0.1
571 0.11
572 0.15
573 0.15