Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6BPQ2

Protein Details
Accession Q6BPQ2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-88SNSRRTGPSNGRKRKSQPIIVNNLVKKKPRKQKKPRVSFSSSPIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
54-80NGRKRKSQPIIVNNLVKKKPRKQKKPR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
KEGG dha:DEHA2E11726g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences MAASKQYLSLSNSKSRSPESKSITLPNLKKDESIVHLHDRSDLFSNSRRTGPSNGRKRKSQPIIVNNLVKKKPRKQKKPRVSFSSSPIKISRQQSNDDMKDIDFNILDTFNKKRYQYDPDYNSPNSNIDTHNINNSDSETETQLINLKQLSSSPAKSQEHNNEKDVQILDKLIEANSNKYEDYMEKVRKNEGEFASSDDDFAVEMMKGNILSTMENRKQASMEAVRLKFKDKDYPKPISSKKSLLTRTEAHLYIIPQILKGKLETSIFYDMAKSISESSSHETMTHKEKWKINWQEFFGGYYGFKRQSFIASIILSRHKKDLQNAANRNKTVSYWTISGFSTFVLANEIVIRFVMHDFDCTISEAEKIIKESSEYGTVISDSTELIDDLNIGELLNDESKEFMKGITLDDTKSSEVDENSDDESKTKTMEYESQPDFNDTKQSKTDILDQFLGTSSDEDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.49
3 0.53
4 0.53
5 0.56
6 0.55
7 0.6
8 0.61
9 0.64
10 0.66
11 0.68
12 0.64
13 0.63
14 0.62
15 0.56
16 0.52
17 0.47
18 0.44
19 0.39
20 0.41
21 0.38
22 0.39
23 0.4
24 0.4
25 0.42
26 0.38
27 0.36
28 0.34
29 0.31
30 0.27
31 0.32
32 0.38
33 0.37
34 0.4
35 0.39
36 0.38
37 0.45
38 0.51
39 0.55
40 0.59
41 0.67
42 0.69
43 0.75
44 0.78
45 0.81
46 0.79
47 0.78
48 0.77
49 0.76
50 0.79
51 0.78
52 0.8
53 0.74
54 0.73
55 0.68
56 0.66
57 0.66
58 0.67
59 0.7
60 0.73
61 0.8
62 0.83
63 0.89
64 0.92
65 0.94
66 0.95
67 0.93
68 0.9
69 0.84
70 0.8
71 0.79
72 0.69
73 0.62
74 0.55
75 0.5
76 0.49
77 0.5
78 0.51
79 0.45
80 0.48
81 0.51
82 0.58
83 0.56
84 0.5
85 0.45
86 0.37
87 0.36
88 0.32
89 0.25
90 0.16
91 0.14
92 0.13
93 0.12
94 0.13
95 0.13
96 0.16
97 0.19
98 0.24
99 0.25
100 0.28
101 0.33
102 0.41
103 0.47
104 0.54
105 0.56
106 0.57
107 0.63
108 0.59
109 0.56
110 0.48
111 0.41
112 0.32
113 0.28
114 0.22
115 0.18
116 0.21
117 0.2
118 0.24
119 0.23
120 0.22
121 0.2
122 0.2
123 0.2
124 0.17
125 0.17
126 0.13
127 0.13
128 0.12
129 0.12
130 0.15
131 0.14
132 0.14
133 0.13
134 0.12
135 0.11
136 0.12
137 0.16
138 0.16
139 0.17
140 0.19
141 0.27
142 0.28
143 0.3
144 0.38
145 0.44
146 0.49
147 0.5
148 0.5
149 0.45
150 0.44
151 0.45
152 0.38
153 0.29
154 0.21
155 0.18
156 0.15
157 0.12
158 0.13
159 0.09
160 0.12
161 0.11
162 0.13
163 0.14
164 0.16
165 0.14
166 0.14
167 0.15
168 0.12
169 0.17
170 0.22
171 0.27
172 0.29
173 0.31
174 0.34
175 0.35
176 0.36
177 0.38
178 0.32
179 0.28
180 0.24
181 0.26
182 0.26
183 0.23
184 0.22
185 0.14
186 0.13
187 0.1
188 0.1
189 0.07
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.08
200 0.15
201 0.17
202 0.21
203 0.21
204 0.21
205 0.21
206 0.21
207 0.23
208 0.18
209 0.21
210 0.24
211 0.25
212 0.27
213 0.27
214 0.3
215 0.28
216 0.28
217 0.32
218 0.3
219 0.39
220 0.43
221 0.48
222 0.48
223 0.53
224 0.56
225 0.53
226 0.52
227 0.47
228 0.45
229 0.46
230 0.48
231 0.43
232 0.43
233 0.38
234 0.38
235 0.37
236 0.33
237 0.26
238 0.23
239 0.21
240 0.19
241 0.19
242 0.16
243 0.12
244 0.13
245 0.13
246 0.12
247 0.12
248 0.1
249 0.1
250 0.11
251 0.11
252 0.13
253 0.16
254 0.16
255 0.15
256 0.15
257 0.13
258 0.13
259 0.12
260 0.09
261 0.07
262 0.07
263 0.08
264 0.1
265 0.13
266 0.14
267 0.14
268 0.15
269 0.15
270 0.18
271 0.23
272 0.28
273 0.3
274 0.35
275 0.39
276 0.44
277 0.53
278 0.6
279 0.61
280 0.59
281 0.55
282 0.53
283 0.49
284 0.45
285 0.35
286 0.26
287 0.19
288 0.15
289 0.17
290 0.15
291 0.15
292 0.15
293 0.15
294 0.17
295 0.19
296 0.19
297 0.19
298 0.17
299 0.18
300 0.19
301 0.27
302 0.26
303 0.25
304 0.28
305 0.29
306 0.32
307 0.37
308 0.45
309 0.45
310 0.54
311 0.61
312 0.66
313 0.68
314 0.65
315 0.6
316 0.51
317 0.43
318 0.37
319 0.31
320 0.26
321 0.21
322 0.21
323 0.22
324 0.21
325 0.21
326 0.17
327 0.13
328 0.11
329 0.09
330 0.08
331 0.09
332 0.09
333 0.08
334 0.1
335 0.1
336 0.09
337 0.09
338 0.09
339 0.07
340 0.08
341 0.1
342 0.08
343 0.09
344 0.1
345 0.11
346 0.12
347 0.13
348 0.13
349 0.11
350 0.11
351 0.11
352 0.13
353 0.13
354 0.14
355 0.14
356 0.13
357 0.14
358 0.16
359 0.17
360 0.18
361 0.17
362 0.15
363 0.15
364 0.15
365 0.14
366 0.12
367 0.1
368 0.06
369 0.07
370 0.07
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.07
377 0.06
378 0.05
379 0.05
380 0.06
381 0.08
382 0.09
383 0.09
384 0.08
385 0.1
386 0.11
387 0.12
388 0.12
389 0.1
390 0.11
391 0.12
392 0.14
393 0.2
394 0.21
395 0.21
396 0.23
397 0.25
398 0.23
399 0.22
400 0.22
401 0.18
402 0.17
403 0.19
404 0.19
405 0.19
406 0.21
407 0.24
408 0.22
409 0.19
410 0.22
411 0.2
412 0.19
413 0.18
414 0.16
415 0.19
416 0.27
417 0.32
418 0.38
419 0.41
420 0.43
421 0.44
422 0.47
423 0.43
424 0.36
425 0.4
426 0.33
427 0.35
428 0.34
429 0.36
430 0.35
431 0.37
432 0.45
433 0.41
434 0.44
435 0.42
436 0.39
437 0.36
438 0.34
439 0.32
440 0.23