Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C9XIP0

Protein Details
Accession A0A0C9XIP0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
241-269GQAPRKHPSSQAPKKRKRRRTSIMNLLDLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
242-260QAPRKHPSSQAPKKRKRRR
Subcellular Location(s) cyto 10cyto_nucl 10, nucl 8, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005824  KOW  
IPR014722  Rib_L2_dom2  
IPR039659  SPT5  
IPR008991  Translation_prot_SH3-like_sf  
Gene Ontology GO:0032784  P:regulation of DNA-templated transcription elongation  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Amino Acid Sequences MSNFRLTSRMINKEALCLLSQYVLRMITLEVTLDEIKYILKSDFDEDEWMELTQNILLDRLDFADVEKEFVEMLAEQELRNATGASLHVSLFTVVSPTSDPPKLAGPSLKGQPNLVTSNLTAEGHNSEGTPSTTSVGPLLKDPSAWRLMMDWAQDKMDYPEFDDKIREFRPQYVHAEWQPLINAIFALSDPSNEDPRQPSSLVEDAMQIQGVRFAAPTDHLPTASAIQPSPPQSAMRHPAGQAPRKHPSSQAPKKRKRRRTSIMNLLDLAADESEENENEDEDVLPGERLSVELSIAWLHDIAVPEGVPLPLMKNIYIVDLFSASAQSFVHQYMQSRGVDVTSLPWLPRRLYVAGTCPAEIQNYLPPSHRFVTKEITLLPPIEATSLTDFKTQQTLPVRTWVRINKGIYKGDVGFVERSDRTHVVLVVAPREHPYDMPEQSGKKSLFSSELAALAGLRMEPIVSPAGVEIGFTCGDHDFIHGLLRLTAPTSSVTLFWREFDAVEIRGGQLRGSTGTLIDVEWHKRTATVLLHSAEGREGDLGGKENTIHSSIQDLRRVFSTGQTVRIIAGPYRGYVGHIVAACSGTVSLQYDGQATNVEVSELLLEMHVPDHVRSLSTRHTGVRMHLPEPTDGSQPGDTAVVCKGPYKGAEAPIEWMNTDGNQMWIYVKKGTDSFSAESDTGSTPTQHVDLHVDCIMVPVNFQDIQVYRAAHTISFSTEKGFDICVGDNIEVARGKWFRSRGTVQAVHMGKAYLDFVCDTYGQKISVPITFCRKVAERSDVQLSRWIGRDVWVIRGDKKGYQGTLRSIGRDSSHVALQGQPVQLRNNQIATPTGLVLDGTILPLDTVQELQRRSFIPVVRSITPPPPPSMAPPSEGSSATTSDAWMVTAEDLSPATHGYGSIVFLYLLYPVP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.41
3 0.33
4 0.27
5 0.24
6 0.22
7 0.22
8 0.18
9 0.18
10 0.17
11 0.16
12 0.16
13 0.15
14 0.13
15 0.12
16 0.11
17 0.09
18 0.12
19 0.13
20 0.12
21 0.11
22 0.1
23 0.11
24 0.11
25 0.12
26 0.1
27 0.11
28 0.13
29 0.17
30 0.19
31 0.2
32 0.23
33 0.21
34 0.22
35 0.22
36 0.2
37 0.17
38 0.14
39 0.13
40 0.11
41 0.12
42 0.1
43 0.1
44 0.09
45 0.1
46 0.1
47 0.11
48 0.11
49 0.1
50 0.11
51 0.16
52 0.16
53 0.17
54 0.16
55 0.15
56 0.14
57 0.14
58 0.14
59 0.08
60 0.09
61 0.12
62 0.13
63 0.12
64 0.15
65 0.16
66 0.15
67 0.15
68 0.14
69 0.1
70 0.11
71 0.12
72 0.13
73 0.13
74 0.13
75 0.12
76 0.13
77 0.13
78 0.11
79 0.11
80 0.08
81 0.07
82 0.08
83 0.1
84 0.12
85 0.17
86 0.19
87 0.19
88 0.19
89 0.25
90 0.26
91 0.28
92 0.3
93 0.28
94 0.33
95 0.4
96 0.43
97 0.38
98 0.38
99 0.37
100 0.38
101 0.36
102 0.31
103 0.26
104 0.21
105 0.23
106 0.24
107 0.21
108 0.17
109 0.16
110 0.17
111 0.16
112 0.16
113 0.13
114 0.12
115 0.13
116 0.14
117 0.14
118 0.13
119 0.13
120 0.14
121 0.14
122 0.16
123 0.16
124 0.15
125 0.16
126 0.19
127 0.17
128 0.18
129 0.19
130 0.22
131 0.23
132 0.22
133 0.2
134 0.18
135 0.22
136 0.23
137 0.25
138 0.23
139 0.21
140 0.22
141 0.22
142 0.21
143 0.22
144 0.24
145 0.2
146 0.22
147 0.28
148 0.29
149 0.3
150 0.32
151 0.29
152 0.31
153 0.33
154 0.35
155 0.29
156 0.35
157 0.4
158 0.42
159 0.47
160 0.44
161 0.48
162 0.44
163 0.47
164 0.41
165 0.36
166 0.32
167 0.27
168 0.23
169 0.16
170 0.14
171 0.08
172 0.08
173 0.07
174 0.09
175 0.08
176 0.08
177 0.1
178 0.13
179 0.18
180 0.18
181 0.21
182 0.21
183 0.25
184 0.28
185 0.26
186 0.24
187 0.24
188 0.27
189 0.24
190 0.22
191 0.19
192 0.17
193 0.17
194 0.17
195 0.11
196 0.09
197 0.1
198 0.1
199 0.08
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.09
204 0.12
205 0.14
206 0.15
207 0.14
208 0.15
209 0.16
210 0.18
211 0.19
212 0.18
213 0.14
214 0.15
215 0.19
216 0.21
217 0.22
218 0.21
219 0.2
220 0.21
221 0.28
222 0.32
223 0.33
224 0.32
225 0.31
226 0.36
227 0.43
228 0.48
229 0.48
230 0.49
231 0.53
232 0.54
233 0.55
234 0.52
235 0.54
236 0.58
237 0.62
238 0.66
239 0.69
240 0.76
241 0.86
242 0.92
243 0.93
244 0.91
245 0.91
246 0.9
247 0.9
248 0.9
249 0.9
250 0.86
251 0.77
252 0.68
253 0.57
254 0.47
255 0.36
256 0.26
257 0.15
258 0.08
259 0.05
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.08
268 0.07
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.05
274 0.06
275 0.05
276 0.05
277 0.06
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.05
286 0.05
287 0.07
288 0.08
289 0.07
290 0.08
291 0.07
292 0.07
293 0.08
294 0.07
295 0.06
296 0.05
297 0.06
298 0.08
299 0.09
300 0.09
301 0.09
302 0.1
303 0.11
304 0.11
305 0.1
306 0.08
307 0.08
308 0.08
309 0.07
310 0.07
311 0.05
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.07
316 0.07
317 0.1
318 0.1
319 0.12
320 0.15
321 0.19
322 0.18
323 0.18
324 0.18
325 0.15
326 0.14
327 0.13
328 0.11
329 0.09
330 0.1
331 0.09
332 0.12
333 0.14
334 0.15
335 0.16
336 0.18
337 0.17
338 0.19
339 0.2
340 0.21
341 0.24
342 0.24
343 0.23
344 0.2
345 0.19
346 0.17
347 0.16
348 0.13
349 0.12
350 0.13
351 0.14
352 0.16
353 0.17
354 0.21
355 0.23
356 0.25
357 0.22
358 0.23
359 0.28
360 0.26
361 0.26
362 0.24
363 0.24
364 0.22
365 0.2
366 0.18
367 0.12
368 0.11
369 0.1
370 0.08
371 0.07
372 0.09
373 0.1
374 0.11
375 0.13
376 0.13
377 0.13
378 0.17
379 0.16
380 0.19
381 0.24
382 0.26
383 0.25
384 0.33
385 0.33
386 0.3
387 0.36
388 0.34
389 0.33
390 0.36
391 0.38
392 0.36
393 0.4
394 0.4
395 0.35
396 0.33
397 0.28
398 0.23
399 0.22
400 0.17
401 0.12
402 0.11
403 0.14
404 0.12
405 0.12
406 0.14
407 0.14
408 0.14
409 0.14
410 0.14
411 0.12
412 0.14
413 0.14
414 0.12
415 0.12
416 0.11
417 0.12
418 0.13
419 0.12
420 0.1
421 0.12
422 0.15
423 0.16
424 0.18
425 0.19
426 0.19
427 0.2
428 0.26
429 0.23
430 0.19
431 0.19
432 0.17
433 0.17
434 0.17
435 0.18
436 0.12
437 0.13
438 0.11
439 0.11
440 0.1
441 0.07
442 0.06
443 0.04
444 0.03
445 0.02
446 0.02
447 0.02
448 0.04
449 0.04
450 0.04
451 0.04
452 0.04
453 0.05
454 0.05
455 0.05
456 0.04
457 0.05
458 0.05
459 0.05
460 0.06
461 0.05
462 0.06
463 0.06
464 0.07
465 0.06
466 0.06
467 0.07
468 0.07
469 0.07
470 0.07
471 0.07
472 0.07
473 0.07
474 0.07
475 0.06
476 0.06
477 0.07
478 0.07
479 0.08
480 0.09
481 0.11
482 0.11
483 0.11
484 0.12
485 0.11
486 0.11
487 0.11
488 0.12
489 0.1
490 0.1
491 0.1
492 0.09
493 0.1
494 0.1
495 0.09
496 0.07
497 0.07
498 0.07
499 0.08
500 0.07
501 0.06
502 0.06
503 0.06
504 0.06
505 0.07
506 0.08
507 0.11
508 0.12
509 0.12
510 0.12
511 0.12
512 0.13
513 0.15
514 0.15
515 0.15
516 0.17
517 0.17
518 0.18
519 0.18
520 0.18
521 0.14
522 0.12
523 0.1
524 0.06
525 0.06
526 0.05
527 0.06
528 0.07
529 0.07
530 0.07
531 0.07
532 0.08
533 0.09
534 0.1
535 0.09
536 0.08
537 0.12
538 0.17
539 0.21
540 0.26
541 0.25
542 0.24
543 0.25
544 0.27
545 0.23
546 0.2
547 0.25
548 0.21
549 0.24
550 0.24
551 0.23
552 0.21
553 0.22
554 0.21
555 0.13
556 0.15
557 0.12
558 0.11
559 0.12
560 0.12
561 0.11
562 0.11
563 0.11
564 0.11
565 0.11
566 0.11
567 0.1
568 0.1
569 0.09
570 0.08
571 0.07
572 0.04
573 0.05
574 0.06
575 0.06
576 0.06
577 0.07
578 0.08
579 0.08
580 0.09
581 0.09
582 0.07
583 0.08
584 0.07
585 0.07
586 0.06
587 0.06
588 0.05
589 0.05
590 0.05
591 0.03
592 0.04
593 0.04
594 0.04
595 0.05
596 0.05
597 0.05
598 0.08
599 0.08
600 0.09
601 0.09
602 0.12
603 0.17
604 0.2
605 0.22
606 0.21
607 0.24
608 0.24
609 0.27
610 0.33
611 0.3
612 0.28
613 0.28
614 0.29
615 0.26
616 0.29
617 0.28
618 0.21
619 0.18
620 0.2
621 0.17
622 0.16
623 0.16
624 0.12
625 0.1
626 0.09
627 0.1
628 0.09
629 0.09
630 0.11
631 0.11
632 0.12
633 0.13
634 0.17
635 0.19
636 0.22
637 0.24
638 0.23
639 0.26
640 0.26
641 0.26
642 0.2
643 0.18
644 0.14
645 0.12
646 0.13
647 0.1
648 0.09
649 0.09
650 0.09
651 0.1
652 0.12
653 0.13
654 0.14
655 0.14
656 0.15
657 0.16
658 0.18
659 0.19
660 0.22
661 0.22
662 0.2
663 0.23
664 0.21
665 0.19
666 0.19
667 0.17
668 0.14
669 0.13
670 0.12
671 0.1
672 0.12
673 0.13
674 0.11
675 0.11
676 0.14
677 0.14
678 0.17
679 0.17
680 0.16
681 0.14
682 0.15
683 0.15
684 0.1
685 0.1
686 0.07
687 0.09
688 0.1
689 0.1
690 0.12
691 0.11
692 0.14
693 0.16
694 0.17
695 0.14
696 0.16
697 0.17
698 0.14
699 0.14
700 0.13
701 0.14
702 0.16
703 0.15
704 0.15
705 0.16
706 0.16
707 0.16
708 0.16
709 0.13
710 0.13
711 0.14
712 0.14
713 0.14
714 0.14
715 0.14
716 0.13
717 0.14
718 0.13
719 0.12
720 0.17
721 0.16
722 0.18
723 0.23
724 0.27
725 0.27
726 0.34
727 0.38
728 0.37
729 0.45
730 0.47
731 0.43
732 0.48
733 0.46
734 0.39
735 0.36
736 0.3
737 0.21
738 0.18
739 0.18
740 0.09
741 0.09
742 0.09
743 0.09
744 0.1
745 0.11
746 0.12
747 0.13
748 0.15
749 0.15
750 0.15
751 0.17
752 0.17
753 0.2
754 0.22
755 0.23
756 0.3
757 0.31
758 0.31
759 0.33
760 0.34
761 0.36
762 0.39
763 0.43
764 0.38
765 0.4
766 0.49
767 0.46
768 0.44
769 0.45
770 0.42
771 0.37
772 0.37
773 0.34
774 0.25
775 0.25
776 0.31
777 0.26
778 0.3
779 0.32
780 0.31
781 0.33
782 0.39
783 0.39
784 0.35
785 0.4
786 0.38
787 0.36
788 0.4
789 0.41
790 0.4
791 0.46
792 0.45
793 0.41
794 0.38
795 0.37
796 0.33
797 0.31
798 0.29
799 0.24
800 0.24
801 0.23
802 0.23
803 0.22
804 0.24
805 0.27
806 0.26
807 0.26
808 0.26
809 0.28
810 0.31
811 0.33
812 0.33
813 0.31
814 0.29
815 0.28
816 0.28
817 0.27
818 0.25
819 0.2
820 0.17
821 0.14
822 0.13
823 0.11
824 0.11
825 0.08
826 0.07
827 0.07
828 0.06
829 0.06
830 0.06
831 0.07
832 0.06
833 0.08
834 0.11
835 0.17
836 0.19
837 0.2
838 0.25
839 0.26
840 0.3
841 0.33
842 0.34
843 0.33
844 0.39
845 0.43
846 0.42
847 0.44
848 0.44
849 0.45
850 0.48
851 0.46
852 0.42
853 0.4
854 0.39
855 0.42
856 0.46
857 0.42
858 0.38
859 0.38
860 0.38
861 0.38
862 0.36
863 0.32
864 0.26
865 0.25
866 0.24
867 0.21
868 0.17
869 0.16
870 0.15
871 0.13
872 0.11
873 0.11
874 0.09
875 0.09
876 0.09
877 0.09
878 0.09
879 0.09
880 0.09
881 0.09
882 0.09
883 0.09
884 0.09
885 0.1
886 0.11
887 0.12
888 0.12
889 0.12
890 0.1
891 0.1
892 0.1