Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3DDL5

Protein Details
Accession A0A0C3DDL5    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
420-489LSTTTSKGGRPRKKKMETECKPTKPTRDRPRQISETGKVEGMKGRPKKTTEKTEKVKRPRGRPRKVALQEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
426-484KGGRPRKKKMETECKPTKPTRDRPRQISETGKVEGMKGRPKKTTEKTEKVKRPRGRPRK
Subcellular Location(s) mito 16, cyto_mito 10.5, nucl 7, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002054  DNA-dir_DNA_pol_X  
IPR010996  DNA_pol_b-like_N  
IPR027421  DNA_pol_lamdba_lyase_dom_sf  
IPR037160  DNA_Pol_thumb_sf  
IPR022312  DNA_pol_X  
IPR002008  DNA_pol_X_beta-like  
IPR043519  NT_sf  
IPR029398  PolB_thumb  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003887  F:DNA-directed DNA polymerase activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF14791  DNA_pol_B_thumb  
PF14716  HHH_8  
Amino Acid Sequences MLSIILSRPRVQRRTLDVLRRPSGGRLFSSPAGPNQELIQLLARYKKDEEALETRNPYKIRAFERAIKVIGDMQKPVCSGSQVRRLGGVGERIAKRIDVFLANVPYEASTKSVSSGVSKVANDLEDIRKAHIIQSLQTVSGIGKWKAKTLYDAGCTSIAELSKPEFFSLLTPFQRVCIQFAAHLDPSVSLADAETVKEFLSENISSKYEVLLVGDHRRNHLHSPTLSLIIIHPFEIKMIPPHAPYDRETKPRPPNSSHFYSIHNAFVSGAQAVSNVPLSFDVISPLESRGMVAATLAANPQRWKGIIRIPQRTENGSWEDRTERLRQIKEKEGHYGELQIFFAPKKCQGAARLALTGDLEFVKDVCDRAHRLALHFNEYGLWKWCDEERWEFMHGDNEEDIFRELGMEYILPDRRNFGFLSTTTSKGGRPRKKKMETECKPTKPTRDRPRQISETGKVEGMKGRPKKTTEKTEKVKRPRGRPRKVALQE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.71
3 0.72
4 0.71
5 0.75
6 0.74
7 0.69
8 0.62
9 0.58
10 0.55
11 0.49
12 0.44
13 0.39
14 0.41
15 0.39
16 0.42
17 0.38
18 0.37
19 0.4
20 0.37
21 0.33
22 0.29
23 0.31
24 0.26
25 0.25
26 0.25
27 0.19
28 0.21
29 0.27
30 0.27
31 0.27
32 0.28
33 0.31
34 0.3
35 0.31
36 0.35
37 0.36
38 0.4
39 0.43
40 0.46
41 0.44
42 0.46
43 0.44
44 0.4
45 0.39
46 0.41
47 0.4
48 0.44
49 0.48
50 0.51
51 0.57
52 0.59
53 0.54
54 0.47
55 0.42
56 0.4
57 0.4
58 0.33
59 0.3
60 0.27
61 0.28
62 0.28
63 0.28
64 0.23
65 0.2
66 0.23
67 0.28
68 0.36
69 0.37
70 0.37
71 0.37
72 0.36
73 0.35
74 0.33
75 0.3
76 0.23
77 0.28
78 0.28
79 0.28
80 0.29
81 0.27
82 0.24
83 0.21
84 0.2
85 0.14
86 0.15
87 0.19
88 0.21
89 0.21
90 0.2
91 0.19
92 0.17
93 0.16
94 0.15
95 0.12
96 0.1
97 0.1
98 0.11
99 0.13
100 0.13
101 0.14
102 0.15
103 0.16
104 0.18
105 0.18
106 0.18
107 0.18
108 0.18
109 0.16
110 0.18
111 0.18
112 0.19
113 0.2
114 0.2
115 0.2
116 0.21
117 0.22
118 0.22
119 0.2
120 0.17
121 0.23
122 0.22
123 0.2
124 0.2
125 0.18
126 0.14
127 0.17
128 0.2
129 0.16
130 0.2
131 0.21
132 0.25
133 0.27
134 0.27
135 0.27
136 0.27
137 0.31
138 0.29
139 0.29
140 0.27
141 0.25
142 0.24
143 0.21
144 0.18
145 0.13
146 0.1
147 0.1
148 0.1
149 0.12
150 0.12
151 0.12
152 0.1
153 0.11
154 0.12
155 0.15
156 0.19
157 0.18
158 0.19
159 0.19
160 0.2
161 0.24
162 0.23
163 0.21
164 0.17
165 0.17
166 0.17
167 0.19
168 0.21
169 0.17
170 0.17
171 0.15
172 0.12
173 0.13
174 0.11
175 0.1
176 0.05
177 0.05
178 0.06
179 0.06
180 0.07
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.07
186 0.06
187 0.1
188 0.1
189 0.11
190 0.13
191 0.14
192 0.14
193 0.14
194 0.14
195 0.1
196 0.09
197 0.08
198 0.07
199 0.09
200 0.15
201 0.19
202 0.19
203 0.2
204 0.22
205 0.24
206 0.26
207 0.26
208 0.25
209 0.22
210 0.26
211 0.25
212 0.25
213 0.23
214 0.19
215 0.17
216 0.14
217 0.14
218 0.09
219 0.08
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.09
227 0.1
228 0.12
229 0.14
230 0.16
231 0.17
232 0.22
233 0.26
234 0.31
235 0.33
236 0.4
237 0.48
238 0.52
239 0.56
240 0.54
241 0.56
242 0.56
243 0.58
244 0.53
245 0.45
246 0.42
247 0.4
248 0.36
249 0.31
250 0.25
251 0.2
252 0.16
253 0.14
254 0.11
255 0.08
256 0.07
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.06
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.07
269 0.07
270 0.08
271 0.08
272 0.09
273 0.09
274 0.08
275 0.08
276 0.07
277 0.07
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.06
284 0.06
285 0.08
286 0.09
287 0.1
288 0.1
289 0.11
290 0.12
291 0.15
292 0.22
293 0.29
294 0.36
295 0.44
296 0.46
297 0.52
298 0.53
299 0.53
300 0.46
301 0.42
302 0.4
303 0.33
304 0.3
305 0.26
306 0.26
307 0.24
308 0.27
309 0.27
310 0.28
311 0.33
312 0.38
313 0.42
314 0.46
315 0.54
316 0.56
317 0.54
318 0.54
319 0.49
320 0.46
321 0.4
322 0.39
323 0.31
324 0.27
325 0.24
326 0.17
327 0.16
328 0.15
329 0.17
330 0.15
331 0.16
332 0.18
333 0.18
334 0.22
335 0.24
336 0.3
337 0.32
338 0.32
339 0.31
340 0.27
341 0.27
342 0.24
343 0.2
344 0.14
345 0.1
346 0.07
347 0.06
348 0.06
349 0.07
350 0.08
351 0.09
352 0.09
353 0.14
354 0.16
355 0.2
356 0.25
357 0.25
358 0.27
359 0.34
360 0.35
361 0.36
362 0.33
363 0.3
364 0.26
365 0.26
366 0.26
367 0.23
368 0.21
369 0.16
370 0.17
371 0.19
372 0.21
373 0.24
374 0.28
375 0.27
376 0.29
377 0.32
378 0.3
379 0.3
380 0.33
381 0.29
382 0.26
383 0.22
384 0.2
385 0.18
386 0.18
387 0.18
388 0.11
389 0.11
390 0.09
391 0.08
392 0.07
393 0.08
394 0.06
395 0.07
396 0.12
397 0.16
398 0.17
399 0.17
400 0.21
401 0.21
402 0.23
403 0.23
404 0.19
405 0.2
406 0.2
407 0.28
408 0.28
409 0.29
410 0.29
411 0.3
412 0.3
413 0.35
414 0.45
415 0.47
416 0.54
417 0.62
418 0.71
419 0.8
420 0.86
421 0.88
422 0.89
423 0.88
424 0.88
425 0.88
426 0.85
427 0.83
428 0.8
429 0.8
430 0.79
431 0.81
432 0.82
433 0.83
434 0.85
435 0.86
436 0.89
437 0.84
438 0.81
439 0.79
440 0.74
441 0.67
442 0.6
443 0.54
444 0.44
445 0.4
446 0.39
447 0.36
448 0.4
449 0.43
450 0.47
451 0.51
452 0.56
453 0.64
454 0.68
455 0.73
456 0.75
457 0.77
458 0.82
459 0.86
460 0.91
461 0.91
462 0.92
463 0.9
464 0.9
465 0.91
466 0.92
467 0.91
468 0.91
469 0.89