Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3E5H3

Protein Details
Accession A0A0C3E5H3    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
44-69VGVLSHAERRKQKKRELKATKASEAAHydrophilic
388-416TVTPGPLERRKRTRDDHSHKKRARPGAALBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
52-75RRKQKKRELKATKASEAAAKKRKL
396-413RRKRTRDDHSHKKRARPG
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSSDSSSSSANTKAASKRKPPPDTETASDDDENSGSGLDQDGDVGVLSHAERRKQKKRELKATKASEAAAKKRKLNDGSAAKSSSTSRLPDEAKLKRQNSVWVGNLSYQTTRDMLKQYFDGAGEITRIHMPQRPGTGENLGFAYVDFATPDAKITAITLSEGQLDGRNLLIKDGNDFTGRPSKTSEGGEKGTMSESVKAGTTSSSLTKSAQKILRIQKQPPAPTLFLGNLGFDVTDDTIRELFEAHANFGKSNTKGKGKDKDTNDGEEVMGAGIRKIRMGTFEDSGKCKGFAFVDFTSVEHATNALINPRNHRLNGRDLVVEYASADAVRRGGGGGPKNVKQDQHGKRGRVQQYGEEKGTNPSSKHDTHRPKGDREADTLEESTVEPTVTPGPLERRKRTRDDHSHKKRARPGAALAQAPRQSAAIVPSEGRKIVF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.47
3 0.54
4 0.61
5 0.71
6 0.77
7 0.77
8 0.77
9 0.77
10 0.75
11 0.7
12 0.65
13 0.58
14 0.54
15 0.48
16 0.4
17 0.32
18 0.25
19 0.21
20 0.16
21 0.12
22 0.08
23 0.08
24 0.08
25 0.07
26 0.07
27 0.06
28 0.06
29 0.06
30 0.06
31 0.06
32 0.05
33 0.06
34 0.06
35 0.12
36 0.15
37 0.22
38 0.31
39 0.41
40 0.52
41 0.6
42 0.7
43 0.75
44 0.83
45 0.87
46 0.89
47 0.9
48 0.9
49 0.88
50 0.81
51 0.73
52 0.63
53 0.59
54 0.55
55 0.54
56 0.52
57 0.5
58 0.51
59 0.55
60 0.63
61 0.6
62 0.58
63 0.58
64 0.59
65 0.59
66 0.58
67 0.53
68 0.45
69 0.42
70 0.39
71 0.33
72 0.28
73 0.25
74 0.23
75 0.27
76 0.29
77 0.33
78 0.41
79 0.44
80 0.5
81 0.57
82 0.56
83 0.54
84 0.54
85 0.56
86 0.53
87 0.51
88 0.45
89 0.38
90 0.38
91 0.36
92 0.35
93 0.29
94 0.25
95 0.2
96 0.17
97 0.16
98 0.16
99 0.17
100 0.21
101 0.2
102 0.22
103 0.21
104 0.21
105 0.21
106 0.2
107 0.17
108 0.12
109 0.12
110 0.1
111 0.09
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.11
116 0.14
117 0.16
118 0.19
119 0.24
120 0.26
121 0.26
122 0.28
123 0.31
124 0.27
125 0.25
126 0.22
127 0.17
128 0.14
129 0.12
130 0.12
131 0.07
132 0.07
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.07
138 0.06
139 0.05
140 0.05
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.09
151 0.09
152 0.08
153 0.08
154 0.1
155 0.09
156 0.1
157 0.12
158 0.1
159 0.12
160 0.13
161 0.14
162 0.13
163 0.13
164 0.15
165 0.21
166 0.21
167 0.19
168 0.21
169 0.21
170 0.23
171 0.26
172 0.27
173 0.23
174 0.24
175 0.24
176 0.21
177 0.2
178 0.18
179 0.17
180 0.14
181 0.11
182 0.1
183 0.1
184 0.1
185 0.09
186 0.09
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.09
191 0.09
192 0.1
193 0.11
194 0.16
195 0.17
196 0.23
197 0.25
198 0.25
199 0.32
200 0.4
201 0.47
202 0.47
203 0.48
204 0.47
205 0.49
206 0.49
207 0.45
208 0.41
209 0.32
210 0.28
211 0.28
212 0.22
213 0.19
214 0.17
215 0.13
216 0.09
217 0.08
218 0.07
219 0.06
220 0.06
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.09
231 0.1
232 0.1
233 0.12
234 0.13
235 0.13
236 0.13
237 0.17
238 0.15
239 0.2
240 0.23
241 0.27
242 0.33
243 0.4
244 0.48
245 0.5
246 0.56
247 0.55
248 0.6
249 0.56
250 0.55
251 0.49
252 0.4
253 0.34
254 0.26
255 0.22
256 0.12
257 0.1
258 0.06
259 0.05
260 0.06
261 0.06
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.1
266 0.14
267 0.16
268 0.17
269 0.21
270 0.23
271 0.26
272 0.28
273 0.26
274 0.22
275 0.2
276 0.19
277 0.16
278 0.15
279 0.18
280 0.16
281 0.18
282 0.18
283 0.18
284 0.19
285 0.19
286 0.17
287 0.11
288 0.11
289 0.08
290 0.09
291 0.1
292 0.12
293 0.18
294 0.19
295 0.24
296 0.31
297 0.34
298 0.34
299 0.38
300 0.37
301 0.39
302 0.42
303 0.39
304 0.34
305 0.31
306 0.31
307 0.27
308 0.23
309 0.15
310 0.11
311 0.09
312 0.07
313 0.07
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.08
320 0.14
321 0.18
322 0.24
323 0.29
324 0.33
325 0.38
326 0.4
327 0.39
328 0.39
329 0.46
330 0.47
331 0.53
332 0.57
333 0.55
334 0.6
335 0.68
336 0.69
337 0.66
338 0.6
339 0.58
340 0.6
341 0.62
342 0.57
343 0.49
344 0.43
345 0.41
346 0.45
347 0.4
348 0.32
349 0.3
350 0.35
351 0.38
352 0.44
353 0.49
354 0.54
355 0.58
356 0.68
357 0.7
358 0.69
359 0.74
360 0.76
361 0.69
362 0.63
363 0.61
364 0.53
365 0.5
366 0.45
367 0.35
368 0.27
369 0.24
370 0.2
371 0.15
372 0.11
373 0.08
374 0.09
375 0.11
376 0.11
377 0.11
378 0.14
379 0.23
380 0.32
381 0.42
382 0.5
383 0.57
384 0.65
385 0.73
386 0.78
387 0.8
388 0.82
389 0.83
390 0.85
391 0.86
392 0.9
393 0.88
394 0.89
395 0.87
396 0.85
397 0.82
398 0.77
399 0.73
400 0.72
401 0.71
402 0.67
403 0.6
404 0.58
405 0.53
406 0.48
407 0.41
408 0.31
409 0.25
410 0.22
411 0.23
412 0.19
413 0.18
414 0.19
415 0.22
416 0.25