FuNGI

A0A0C3E1U6

Protein Details

Accession

A0A0C3E1U6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
147-166	AASATKRKRRWDVTEPTDEN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 15.5, cyto_nucl 13.5, nucl 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1

Amino Acid Sequences

MDSPKSPRLIDSFTVPKEVLQEFADLAEEDDVDPFAETASKRQIAARQSDYHNRRFNRVAQEGVDVFKHVEEGTEVEGGYKDAMRLTRLEQEEARVRRAIEEKERKEREEGKMKMDLDKTPPAAELQDVAMELAAAKELAEAREREAASATKRKRRWDVTEPTDENVDPNKTDHGEWSKEALEASAPKKRRSRWDATPAENTTAIGETPKRSRWDQVAPVNEEPMTQIIMNAPGIMHDDKHNRYLTDEELDAILPSTGYVIVTPPPGYAPMVAPRKLMAPQVTEVGGFHIQESSDAAAIAAAAGLAPELPTEIPGVGNLAFFKPEDAQYFAKILKEEDETQLSVDEMKERKIMRLLLKIKNGTPPVRKTALRQITDKAREFGAGPLFDKILPLLMERTLEDQERHLLVKVIDRVLYKLDDLVRPYVHKILVVIEPLLIDEDYYARVEGREIISNLAKAAGLAHMISTMRPDIDHADEYVRNTTARAFSVVASALGIPALLPFLKAVCRSKKSWQARHTGIRIVQQIAIMMGCAVLPHLRNLVSCIAHGLTDEQQKVRTMTALAIAALAEAAAPYGIESFDEVLKPLWLGIRQHRGKGLAAFLKAIGFIIPLMDPEYASYYTKEVTVILIREFQTSDEEMKKIVLKVVKQCAATEGVTAQYIKQDILPDFFKSFWVRRMALDRRNYRQVVETTVELAQKSGVSEIVGRIVNDLKDEAEPYRKMVMETITKVVATLGASDIDERLEVRLVDGIIYAFQEQTTEDQVMLDGFGTVVNALGIRVKPYLTQIVSTILWRLNNKSAKVRQQAADLTTRLAVVIKQCGEDQLLSKLGLVLFEQLGEEYPDTLGSIIAAEGAIANVVGMTQMNPPVKDLLPRMTPILRNRHEKVQEASINLIGRIADRGAEFVPAREWMRICFELLDLLKAHKKAIRRAAVNSFGYIAKSLGPQDVLSVLLTNLRVQERQSRVCSTVAIAIVAETCGPFTCIPAILNEYRTAELNVRTGCLKALTFVFEYVGPQSAYYVDSVVTMLEDALTDRDLVHRQTASVIVKHLALGCAGLGCEDTMLHLMNLVWPNCFETSPHVIGAVMEAIEAMRLALGPGVLLSYTLQGLFHPARKVREVYWRVYNSLYLGAADALVPFYPDLGELSEGQNVYDRHPLQMFV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.4
3	0.35
4	0.35
5	0.33
6	0.28
7	0.21
8	0.21
9	0.17
10	0.18
11	0.18
12	0.13
13	0.13
14	0.11
15	0.1
16	0.09
17	0.09
18	0.09
19	0.08
20	0.08
21	0.07
22	0.07
23	0.1
24	0.11
25	0.15
26	0.23
27	0.25
28	0.25
29	0.3
30	0.36
31	0.39
32	0.47
33	0.48
34	0.47
35	0.52
36	0.62
37	0.64
38	0.68
39	0.7
40	0.65
41	0.65
42	0.64
43	0.64
44	0.64
45	0.62
46	0.57
47	0.5
48	0.53
49	0.47
50	0.44
51	0.36
52	0.27
53	0.23
54	0.19
55	0.18
56	0.11
57	0.11
58	0.1
59	0.11
60	0.12
61	0.13
62	0.13
63	0.12
64	0.13
65	0.12
66	0.13
67	0.12
68	0.1
69	0.12
70	0.14
71	0.14
72	0.16
73	0.19
74	0.27
75	0.28
76	0.32
77	0.3
78	0.36
79	0.43
80	0.44
81	0.45
82	0.39
83	0.36
84	0.38
85	0.43
86	0.43
87	0.45
88	0.53
89	0.57
90	0.66
91	0.7
92	0.67
93	0.69
94	0.7
95	0.69
96	0.68
97	0.64
98	0.59
99	0.61
100	0.59
101	0.58
102	0.53
103	0.48
104	0.43
105	0.46
106	0.42
107	0.36
108	0.35
109	0.3
110	0.28
111	0.24
112	0.19
113	0.13
114	0.13
115	0.11
116	0.11
117	0.09
118	0.08
119	0.07
120	0.06
121	0.05
122	0.04
123	0.04
124	0.05
125	0.07
126	0.09
127	0.13
128	0.14
129	0.16
130	0.23
131	0.23
132	0.22
133	0.23
134	0.26
135	0.29
136	0.38
137	0.44
138	0.47
139	0.52
140	0.6
141	0.67
142	0.72
143	0.73
144	0.74
145	0.77
146	0.75
147	0.81
148	0.75
149	0.67
150	0.6
151	0.51
152	0.43
153	0.38
154	0.31
155	0.22
156	0.21
157	0.23
158	0.22
159	0.23
160	0.28
161	0.29
162	0.31
163	0.31
164	0.34
165	0.31
166	0.3
167	0.29
168	0.22
169	0.19
170	0.21
171	0.24
172	0.28
173	0.31
174	0.37
175	0.44
176	0.5
177	0.58
178	0.61
179	0.66
180	0.68
181	0.75
182	0.77
183	0.76
184	0.77
185	0.69
186	0.63
187	0.55
188	0.45
189	0.35
190	0.27
191	0.21
192	0.16
193	0.16
194	0.17
195	0.21
196	0.27
197	0.3
198	0.31
199	0.37
200	0.4
201	0.47
202	0.51
203	0.54
204	0.57
205	0.58
206	0.57
207	0.53
208	0.46
209	0.37
210	0.3
211	0.23
212	0.16
213	0.1
214	0.1
215	0.09
216	0.11
217	0.11
218	0.1
219	0.09
220	0.07
221	0.11
222	0.11
223	0.11
224	0.16
225	0.23
226	0.25
227	0.31
228	0.33
229	0.3
230	0.31
231	0.33
232	0.3
233	0.26
234	0.24
235	0.19
236	0.17
237	0.17
238	0.15
239	0.12
240	0.09
241	0.06
242	0.05
243	0.05
244	0.05
245	0.04
246	0.05
247	0.05
248	0.07
249	0.09
250	0.09
251	0.09
252	0.09
253	0.11
254	0.11
255	0.11
256	0.12
257	0.19
258	0.24
259	0.25
260	0.25
261	0.24
262	0.26
263	0.27
264	0.29
265	0.23
266	0.2
267	0.21
268	0.22
269	0.22
270	0.2
271	0.18
272	0.17
273	0.15
274	0.12
275	0.11
276	0.1
277	0.1
278	0.1
279	0.11
280	0.08
281	0.07
282	0.07
283	0.07
284	0.06
285	0.06
286	0.05
287	0.04
288	0.03
289	0.02
290	0.02
291	0.02
292	0.02
293	0.02
294	0.02
295	0.03
296	0.03
297	0.04
298	0.05
299	0.05
300	0.05
301	0.05
302	0.07
303	0.07
304	0.07
305	0.08
306	0.07
307	0.08
308	0.08
309	0.09
310	0.1
311	0.11
312	0.13
313	0.17
314	0.17
315	0.18
316	0.2
317	0.2
318	0.2
319	0.19
320	0.17
321	0.15
322	0.18
323	0.19
324	0.2
325	0.21
326	0.19
327	0.19
328	0.19
329	0.16
330	0.13
331	0.11
332	0.14
333	0.13
334	0.14
335	0.18
336	0.19
337	0.21
338	0.24
339	0.29
340	0.28
341	0.37
342	0.43
343	0.45
344	0.51
345	0.51
346	0.49
347	0.5
348	0.5
349	0.47
350	0.47
351	0.44
352	0.44
353	0.47
354	0.46
355	0.44
356	0.5
357	0.52
358	0.48
359	0.46
360	0.45
361	0.5
362	0.55
363	0.53
364	0.44
365	0.35
366	0.33
367	0.31
368	0.29
369	0.24
370	0.18
371	0.17
372	0.16
373	0.16
374	0.15
375	0.15
376	0.11
377	0.09
378	0.08
379	0.08
380	0.08
381	0.08
382	0.09
383	0.09
384	0.12
385	0.12
386	0.13
387	0.13
388	0.13
389	0.15
390	0.16
391	0.16
392	0.14
393	0.15
394	0.14
395	0.18
396	0.2
397	0.18
398	0.19
399	0.19
400	0.19
401	0.19
402	0.19
403	0.14
404	0.14
405	0.15
406	0.15
407	0.16
408	0.18
409	0.17
410	0.18
411	0.19
412	0.2
413	0.17
414	0.15
415	0.14
416	0.14
417	0.15
418	0.14
419	0.12
420	0.1
421	0.09
422	0.09
423	0.09
424	0.06
425	0.05
426	0.04
427	0.05
428	0.05
429	0.06
430	0.06
431	0.05
432	0.06
433	0.06
434	0.08
435	0.1
436	0.12
437	0.12
438	0.14
439	0.15
440	0.15
441	0.14
442	0.12
443	0.1
444	0.07
445	0.07
446	0.05
447	0.05
448	0.05
449	0.04
450	0.05
451	0.05
452	0.05
453	0.06
454	0.06
455	0.06
456	0.06
457	0.07
458	0.08
459	0.11
460	0.11
461	0.11
462	0.13
463	0.14
464	0.16
465	0.16
466	0.15
467	0.12
468	0.12
469	0.13
470	0.12
471	0.11
472	0.12
473	0.11
474	0.1
475	0.12
476	0.12
477	0.1
478	0.08
479	0.07
480	0.06
481	0.05
482	0.04
483	0.03
484	0.03
485	0.03
486	0.03
487	0.03
488	0.03
489	0.04
490	0.06
491	0.09
492	0.14
493	0.2
494	0.24
495	0.27
496	0.34
497	0.44
498	0.52
499	0.59
500	0.6
501	0.61
502	0.64
503	0.67
504	0.63
505	0.57
506	0.49
507	0.45
508	0.41
509	0.34
510	0.28
511	0.21
512	0.19
513	0.15
514	0.12
515	0.07
516	0.05
517	0.04
518	0.03
519	0.03
520	0.03
521	0.04
522	0.04
523	0.05
524	0.06
525	0.07
526	0.07
527	0.09
528	0.12
529	0.11
530	0.11
531	0.11
532	0.1
533	0.1
534	0.1
535	0.09
536	0.1
537	0.14
538	0.15
539	0.14
540	0.15
541	0.16
542	0.17
543	0.15
544	0.13
545	0.09
546	0.09
547	0.1
548	0.09
549	0.08
550	0.07
551	0.06
552	0.06
553	0.05
554	0.04
555	0.02
556	0.02
557	0.02
558	0.02
559	0.02
560	0.02
561	0.02
562	0.02
563	0.02
564	0.03
565	0.04
566	0.04
567	0.05
568	0.05
569	0.05
570	0.05
571	0.05
572	0.05
573	0.06
574	0.07
575	0.09
576	0.14
577	0.24
578	0.26
579	0.27
580	0.28
581	0.29
582	0.28
583	0.27
584	0.25
585	0.18
586	0.17
587	0.16
588	0.15
589	0.13
590	0.12
591	0.11
592	0.07
593	0.04
594	0.03
595	0.04
596	0.03
597	0.04
598	0.05
599	0.05
600	0.05
601	0.05
602	0.08
603	0.08
604	0.09
605	0.1
606	0.09
607	0.09
608	0.1
609	0.1
610	0.07
611	0.07
612	0.08
613	0.09
614	0.09
615	0.12
616	0.12
617	0.13
618	0.13
619	0.12
620	0.12
621	0.13
622	0.15
623	0.13
624	0.13
625	0.12
626	0.13
627	0.14
628	0.13
629	0.15
630	0.14
631	0.16
632	0.22
633	0.28
634	0.3
635	0.29
636	0.29
637	0.27
638	0.27
639	0.24
640	0.18
641	0.13
642	0.09
643	0.1
644	0.1
645	0.08
646	0.07
647	0.07
648	0.07
649	0.08
650	0.1
651	0.1
652	0.13
653	0.14
654	0.14
655	0.15
656	0.15
657	0.16
658	0.16
659	0.17
660	0.19
661	0.23
662	0.22
663	0.23
664	0.32
665	0.37
666	0.4
667	0.48
668	0.49
669	0.5
670	0.56
671	0.55
672	0.47
673	0.45
674	0.4
675	0.35
676	0.3
677	0.25
678	0.2
679	0.21
680	0.21
681	0.16
682	0.14
683	0.11
684	0.09
685	0.09
686	0.07
687	0.06
688	0.05
689	0.06
690	0.06
691	0.09
692	0.09
693	0.09
694	0.1
695	0.11
696	0.11
697	0.11
698	0.11
699	0.09
700	0.09
701	0.1
702	0.11
703	0.14
704	0.15
705	0.16
706	0.19
707	0.18
708	0.18
709	0.18
710	0.2
711	0.19
712	0.21
713	0.21
714	0.18
715	0.18
716	0.17
717	0.16
718	0.13
719	0.08
720	0.07
721	0.06
722	0.06
723	0.06
724	0.06
725	0.06
726	0.06
727	0.06
728	0.05
729	0.05
730	0.06
731	0.06
732	0.06
733	0.07
734	0.07
735	0.07
736	0.07
737	0.06
738	0.06
739	0.06
740	0.06
741	0.05
742	0.05
743	0.05
744	0.05
745	0.07
746	0.09
747	0.09
748	0.08
749	0.08
750	0.08
751	0.08
752	0.08
753	0.06
754	0.04
755	0.03
756	0.03
757	0.03
758	0.03
759	0.03
760	0.03
761	0.03
762	0.03
763	0.05
764	0.06
765	0.07
766	0.08
767	0.09
768	0.09
769	0.12
770	0.17
771	0.15
772	0.16
773	0.15
774	0.18
775	0.18
776	0.18
777	0.17
778	0.14
779	0.16
780	0.17
781	0.19
782	0.24
783	0.29
784	0.31
785	0.38
786	0.43
787	0.49
788	0.54
789	0.56
790	0.49
791	0.49
792	0.5
793	0.44
794	0.42
795	0.33
796	0.28
797	0.23
798	0.21
799	0.16
800	0.14
801	0.12
802	0.09
803	0.13
804	0.13
805	0.14
806	0.14
807	0.15
808	0.16
809	0.15
810	0.15
811	0.13
812	0.14
813	0.13
814	0.13
815	0.13
816	0.12
817	0.12
818	0.1
819	0.09
820	0.07
821	0.07
822	0.07
823	0.06
824	0.07
825	0.07
826	0.07
827	0.06
828	0.06
829	0.06
830	0.06
831	0.06
832	0.06
833	0.04
834	0.04
835	0.04
836	0.04
837	0.03
838	0.03
839	0.03
840	0.03
841	0.03
842	0.02
843	0.02
844	0.02
845	0.02
846	0.02
847	0.03
848	0.04
849	0.05
850	0.11
851	0.13
852	0.13
853	0.15
854	0.18
855	0.18
856	0.21
857	0.23
858	0.23
859	0.23
860	0.24
861	0.27
862	0.28
863	0.33
864	0.36
865	0.44
866	0.45
867	0.5
868	0.52
869	0.58
870	0.58
871	0.57
872	0.54
873	0.52
874	0.49
875	0.43
876	0.41
877	0.35
878	0.32
879	0.27
880	0.24
881	0.15
882	0.12
883	0.12
884	0.1
885	0.08
886	0.08
887	0.1
888	0.09
889	0.13
890	0.12
891	0.12
892	0.13
893	0.15
894	0.16
895	0.18
896	0.18
897	0.16
898	0.23
899	0.23
900	0.22
901	0.2
902	0.18
903	0.21
904	0.2
905	0.21
906	0.15
907	0.18
908	0.21
909	0.21
910	0.24
911	0.21
912	0.26
913	0.33
914	0.42
915	0.47
916	0.46
917	0.51
918	0.56
919	0.61
920	0.56
921	0.49
922	0.41
923	0.33
924	0.3
925	0.25
926	0.18
927	0.12
928	0.12
929	0.13
930	0.12
931	0.13
932	0.12
933	0.12
934	0.12
935	0.12
936	0.1
937	0.09
938	0.08
939	0.09
940	0.1
941	0.1
942	0.13
943	0.14
944	0.15
945	0.17
946	0.26
947	0.31
948	0.37
949	0.41
950	0.41
951	0.41
952	0.41
953	0.4
954	0.32
955	0.29
956	0.23
957	0.19
958	0.14
959	0.12
960	0.12
961	0.11
962	0.1
963	0.05
964	0.05
965	0.05
966	0.07
967	0.07
968	0.08
969	0.1
970	0.11
971	0.11
972	0.13
973	0.18
974	0.19
975	0.2
976	0.22
977	0.22
978	0.22
979	0.23
980	0.23
981	0.21
982	0.21
983	0.24
984	0.22
985	0.22
986	0.22
987	0.21
988	0.2
989	0.18
990	0.16
991	0.13
992	0.14
993	0.16
994	0.16
995	0.16
996	0.16
997	0.15
998	0.16
999	0.15
1000	0.16
1001	0.13
1002	0.11
1003	0.12
1004	0.11
1005	0.12
1006	0.11
1007	0.1
1008	0.07
1009	0.08
1010	0.08
1011	0.07
1012	0.07
1013	0.06
1014	0.05
1015	0.05
1016	0.05
1017	0.05
1018	0.06
1019	0.07
1020	0.07
1021	0.07
1022	0.11
1023	0.14
1024	0.16
1025	0.2
1026	0.19
1027	0.19
1028	0.21
1029	0.27
1030	0.27
1031	0.25
1032	0.26
1033	0.22
1034	0.22
1035	0.23
1036	0.23
1037	0.17
1038	0.13
1039	0.12
1040	0.1
1041	0.09
1042	0.08
1043	0.07
1044	0.06
1045	0.06
1046	0.06
1047	0.05
1048	0.06
1049	0.07
1050	0.08
1051	0.08
1052	0.08
1053	0.08
1054	0.14
1055	0.2
1056	0.19
1057	0.19
1058	0.18
1059	0.22
1060	0.22
1061	0.22
1062	0.18
1063	0.19
1064	0.26
1065	0.27
1066	0.26
1067	0.24
1068	0.23
1069	0.22
1070	0.22
1071	0.17
1072	0.09
1073	0.07
1074	0.07
1075	0.06
1076	0.06
1077	0.06
1078	0.05
1079	0.03
1080	0.03
1081	0.04
1082	0.05
1083	0.04
1084	0.04
1085	0.04
1086	0.05
1087	0.05
1088	0.05
1089	0.06
1090	0.07
1091	0.07
1092	0.08
1093	0.08
1094	0.07
1095	0.14
1096	0.18
1097	0.23
1098	0.29
1099	0.33
1100	0.38
1101	0.43
1102	0.46
1103	0.44
1104	0.51
1105	0.52
1106	0.5
1107	0.56
1108	0.54
1109	0.51
1110	0.49
1111	0.46
1112	0.37
1113	0.34
1114	0.29
1115	0.19
1116	0.16
1117	0.14
1118	0.12
1119	0.11
1120	0.09
1121	0.07
1122	0.07
1123	0.07
1124	0.06
1125	0.07
1126	0.07
1127	0.07
1128	0.08
1129	0.09
1130	0.11
1131	0.11
1132	0.13
1133	0.17
1134	0.17
1135	0.17
1136	0.21
1137	0.2
1138	0.21
1139	0.29
1140	0.28
1141	0.29

A0A0C3E1U6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer