Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6BXJ8

Protein Details
Accession Q6BXJ8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
81-106VRAAVQSVRRNRKRSSKTKRGSEMDNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
89-102RRNRKRSSKTKRGS
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000999  RNase_III_dom  
IPR036389  RNase_III_sf  
IPR007147  TF_Vhr  
Gene Ontology GO:0004525  F:ribonuclease III activity  
GO:0006396  P:RNA processing  
KEGG dha:DEHA2B02376g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04001  Vhr1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50142  RNASE_3_2  
Amino Acid Sequences MSNESQTKRIGVTHAIRARLNFLDERLWKRFSARRLELIDTLDLSSKKASEQEESIKNVADALRVEFNYSPEYFRDFDKLVRAAVQSVRRNRKRSSKTKRGSEMDNGDKRRRSDEEYPHSYSRSISPDMHTTENSPSEQYFQRDNSETTPDTGSQKFLSEIARFNSDSQEDVHDMNYSRSKKFTIFDKSRLAIDTMIQPRINNSPPVLPPISNLSFKASIKSPLNSSARRILLHYIEKSKTCSESTSKRNENLEIMGKSIISCCVVYVLEKSFTNSNETSIEYLRSKLNQESYLSKFYKELDTSTTTNYLLSDDIASLSLFTLLGSCVKDFGFDNIMLPLSECLYYSILQDYPLISQHSTVFNGEEHKSSKTCIPMYSDSLNQLNSLAAVATEMKKQDIHNTTKAVTLKFLSSVLEFTYPTTNSAPPKLLELIENAKSAFKLSANSNQTTINLLNIKDGTRINSDSDLETLFRTQEKVELELVTQAAQTIPIYEITSTIRSNKYSDTKIILPPPYQNRSVLPGPLNNLSRMDKANFNDPPPPPPALPNFQPLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.47
3 0.47
4 0.45
5 0.46
6 0.4
7 0.39
8 0.31
9 0.28
10 0.32
11 0.37
12 0.43
13 0.43
14 0.44
15 0.4
16 0.45
17 0.49
18 0.49
19 0.53
20 0.52
21 0.55
22 0.57
23 0.6
24 0.57
25 0.53
26 0.47
27 0.38
28 0.33
29 0.3
30 0.25
31 0.22
32 0.2
33 0.18
34 0.17
35 0.21
36 0.22
37 0.22
38 0.27
39 0.34
40 0.39
41 0.43
42 0.43
43 0.39
44 0.36
45 0.34
46 0.29
47 0.23
48 0.18
49 0.17
50 0.21
51 0.2
52 0.23
53 0.22
54 0.23
55 0.25
56 0.25
57 0.23
58 0.19
59 0.24
60 0.22
61 0.22
62 0.26
63 0.23
64 0.24
65 0.29
66 0.29
67 0.26
68 0.28
69 0.27
70 0.25
71 0.3
72 0.36
73 0.38
74 0.47
75 0.57
76 0.62
77 0.67
78 0.71
79 0.76
80 0.78
81 0.81
82 0.82
83 0.82
84 0.84
85 0.88
86 0.9
87 0.84
88 0.79
89 0.76
90 0.74
91 0.73
92 0.72
93 0.68
94 0.65
95 0.65
96 0.61
97 0.58
98 0.53
99 0.51
100 0.52
101 0.57
102 0.59
103 0.62
104 0.66
105 0.63
106 0.6
107 0.52
108 0.44
109 0.38
110 0.34
111 0.3
112 0.26
113 0.27
114 0.31
115 0.34
116 0.35
117 0.31
118 0.28
119 0.29
120 0.29
121 0.27
122 0.23
123 0.2
124 0.21
125 0.24
126 0.25
127 0.25
128 0.25
129 0.29
130 0.3
131 0.31
132 0.3
133 0.32
134 0.3
135 0.27
136 0.27
137 0.24
138 0.25
139 0.24
140 0.24
141 0.19
142 0.19
143 0.17
144 0.17
145 0.19
146 0.17
147 0.19
148 0.2
149 0.23
150 0.23
151 0.23
152 0.24
153 0.21
154 0.2
155 0.18
156 0.18
157 0.16
158 0.16
159 0.16
160 0.15
161 0.15
162 0.17
163 0.23
164 0.23
165 0.22
166 0.23
167 0.25
168 0.25
169 0.27
170 0.32
171 0.36
172 0.39
173 0.44
174 0.48
175 0.48
176 0.46
177 0.44
178 0.37
179 0.27
180 0.23
181 0.25
182 0.22
183 0.24
184 0.23
185 0.22
186 0.23
187 0.27
188 0.28
189 0.21
190 0.19
191 0.21
192 0.21
193 0.26
194 0.25
195 0.21
196 0.19
197 0.24
198 0.26
199 0.23
200 0.23
201 0.21
202 0.23
203 0.23
204 0.25
205 0.2
206 0.22
207 0.24
208 0.25
209 0.22
210 0.27
211 0.32
212 0.31
213 0.33
214 0.34
215 0.33
216 0.32
217 0.31
218 0.27
219 0.26
220 0.29
221 0.29
222 0.28
223 0.29
224 0.29
225 0.3
226 0.29
227 0.27
228 0.23
229 0.23
230 0.23
231 0.29
232 0.35
233 0.41
234 0.43
235 0.45
236 0.46
237 0.44
238 0.4
239 0.35
240 0.34
241 0.24
242 0.22
243 0.18
244 0.16
245 0.15
246 0.13
247 0.11
248 0.07
249 0.06
250 0.05
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.08
255 0.08
256 0.09
257 0.09
258 0.11
259 0.12
260 0.13
261 0.16
262 0.15
263 0.15
264 0.14
265 0.15
266 0.15
267 0.13
268 0.15
269 0.12
270 0.13
271 0.13
272 0.13
273 0.14
274 0.15
275 0.18
276 0.18
277 0.19
278 0.22
279 0.25
280 0.31
281 0.29
282 0.28
283 0.25
284 0.25
285 0.27
286 0.23
287 0.2
288 0.17
289 0.2
290 0.21
291 0.21
292 0.21
293 0.17
294 0.17
295 0.16
296 0.13
297 0.09
298 0.08
299 0.07
300 0.05
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.05
305 0.05
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.07
315 0.07
316 0.08
317 0.08
318 0.1
319 0.11
320 0.1
321 0.11
322 0.1
323 0.11
324 0.1
325 0.1
326 0.08
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.07
331 0.08
332 0.08
333 0.09
334 0.1
335 0.1
336 0.1
337 0.11
338 0.1
339 0.09
340 0.11
341 0.12
342 0.1
343 0.11
344 0.13
345 0.14
346 0.15
347 0.14
348 0.13
349 0.12
350 0.16
351 0.16
352 0.17
353 0.17
354 0.18
355 0.18
356 0.19
357 0.21
358 0.23
359 0.23
360 0.23
361 0.26
362 0.27
363 0.31
364 0.32
365 0.3
366 0.28
367 0.28
368 0.26
369 0.21
370 0.18
371 0.13
372 0.1
373 0.09
374 0.06
375 0.04
376 0.05
377 0.06
378 0.07
379 0.09
380 0.1
381 0.11
382 0.13
383 0.14
384 0.22
385 0.28
386 0.33
387 0.35
388 0.37
389 0.37
390 0.4
391 0.43
392 0.34
393 0.29
394 0.24
395 0.21
396 0.19
397 0.19
398 0.15
399 0.12
400 0.13
401 0.12
402 0.12
403 0.11
404 0.12
405 0.15
406 0.15
407 0.17
408 0.18
409 0.2
410 0.22
411 0.25
412 0.25
413 0.22
414 0.24
415 0.24
416 0.22
417 0.2
418 0.21
419 0.23
420 0.24
421 0.24
422 0.21
423 0.2
424 0.19
425 0.19
426 0.17
427 0.13
428 0.13
429 0.17
430 0.26
431 0.3
432 0.31
433 0.31
434 0.31
435 0.3
436 0.3
437 0.27
438 0.22
439 0.2
440 0.19
441 0.21
442 0.21
443 0.21
444 0.21
445 0.22
446 0.21
447 0.22
448 0.24
449 0.23
450 0.25
451 0.26
452 0.23
453 0.23
454 0.21
455 0.17
456 0.17
457 0.15
458 0.14
459 0.14
460 0.14
461 0.13
462 0.16
463 0.18
464 0.19
465 0.2
466 0.2
467 0.19
468 0.2
469 0.2
470 0.16
471 0.14
472 0.12
473 0.09
474 0.09
475 0.09
476 0.08
477 0.08
478 0.09
479 0.1
480 0.1
481 0.11
482 0.14
483 0.17
484 0.17
485 0.22
486 0.25
487 0.25
488 0.28
489 0.34
490 0.39
491 0.4
492 0.43
493 0.43
494 0.43
495 0.48
496 0.53
497 0.5
498 0.45
499 0.49
500 0.54
501 0.54
502 0.52
503 0.48
504 0.43
505 0.45
506 0.45
507 0.43
508 0.38
509 0.36
510 0.38
511 0.43
512 0.43
513 0.38
514 0.39
515 0.37
516 0.36
517 0.37
518 0.36
519 0.35
520 0.36
521 0.43
522 0.44
523 0.44
524 0.48
525 0.46
526 0.47
527 0.45
528 0.46
529 0.38
530 0.4
531 0.44
532 0.43
533 0.45