Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E9DHM3

Protein Details
Accession E9DHM3    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-60ETMLVSSPVKKRKNKDEDHKLSKKRKHHDPGTHSSPEHKKKEKHHRKHKSNAEPLHPEFBasic
365-390DDRAAGSAEKEKKKRKKKSHSYGIEVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-51KKRKNKDEDHKLSKKRKHHDPGTHSSPEHKKKEKHHRKHKS
372-383AEKEKKKRKKKS
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences METMLVSSPVKKRKNKDEDHKLSKKRKHHDPGTHSSPEHKKKEKHHRKHKSNAEPLHPEFSLEHTKPLSKSQGSQTDSQDPIDSSPFHLVETTLYLPLSPISLSPTHALSCLISEHVAPLLLTYYPPVRGIVLAFSNPSISSTPPHHSSSSHQSATTPQPLTLAVTAGEYGVLYVYLTITLLVFRPERGQTLEGWINVQSEGFLGAVVLNLFSVGIERKRLPPDWKWVAPGQQPESTPTTTQDEDDSDTNSDTEIFRPLKGDKHIPDEHDDEASAAMGYFQTRSGKRVRGMIKFRVRDVDVIPGSEWDKGFLSLEGTMLSPVEEGKLITEEKRRILGYQKGVTIVQSSDGDVEMSGGLVAEESRDDRAAGSAEKEKKKRKKKSHSYGIEV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.82
3 0.86
4 0.88
5 0.9
6 0.92
7 0.93
8 0.92
9 0.92
10 0.9
11 0.88
12 0.86
13 0.86
14 0.86
15 0.87
16 0.87
17 0.86
18 0.87
19 0.86
20 0.82
21 0.72
22 0.7
23 0.7
24 0.69
25 0.7
26 0.69
27 0.69
28 0.73
29 0.84
30 0.87
31 0.87
32 0.89
33 0.91
34 0.91
35 0.95
36 0.95
37 0.94
38 0.93
39 0.89
40 0.87
41 0.84
42 0.76
43 0.71
44 0.6
45 0.5
46 0.4
47 0.38
48 0.38
49 0.31
50 0.31
51 0.28
52 0.32
53 0.32
54 0.37
55 0.4
56 0.32
57 0.37
58 0.41
59 0.48
60 0.47
61 0.51
62 0.5
63 0.5
64 0.49
65 0.45
66 0.38
67 0.3
68 0.28
69 0.26
70 0.22
71 0.16
72 0.2
73 0.19
74 0.17
75 0.17
76 0.15
77 0.13
78 0.16
79 0.16
80 0.12
81 0.11
82 0.11
83 0.11
84 0.11
85 0.11
86 0.07
87 0.06
88 0.09
89 0.1
90 0.11
91 0.13
92 0.14
93 0.14
94 0.14
95 0.14
96 0.11
97 0.11
98 0.1
99 0.09
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.07
111 0.08
112 0.08
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.1
119 0.1
120 0.1
121 0.1
122 0.09
123 0.1
124 0.09
125 0.1
126 0.09
127 0.08
128 0.11
129 0.14
130 0.18
131 0.22
132 0.24
133 0.24
134 0.24
135 0.28
136 0.35
137 0.38
138 0.35
139 0.31
140 0.29
141 0.32
142 0.36
143 0.37
144 0.28
145 0.21
146 0.21
147 0.21
148 0.22
149 0.18
150 0.13
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.06
155 0.06
156 0.04
157 0.04
158 0.03
159 0.03
160 0.02
161 0.02
162 0.02
163 0.02
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.04
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.09
173 0.1
174 0.11
175 0.13
176 0.13
177 0.12
178 0.17
179 0.18
180 0.16
181 0.16
182 0.15
183 0.13
184 0.12
185 0.12
186 0.07
187 0.05
188 0.05
189 0.04
190 0.04
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.02
198 0.02
199 0.02
200 0.03
201 0.05
202 0.05
203 0.08
204 0.1
205 0.14
206 0.18
207 0.22
208 0.26
209 0.29
210 0.38
211 0.42
212 0.42
213 0.41
214 0.4
215 0.42
216 0.41
217 0.42
218 0.36
219 0.32
220 0.31
221 0.31
222 0.33
223 0.28
224 0.25
225 0.22
226 0.22
227 0.2
228 0.2
229 0.18
230 0.16
231 0.17
232 0.17
233 0.16
234 0.13
235 0.13
236 0.12
237 0.11
238 0.11
239 0.09
240 0.09
241 0.13
242 0.13
243 0.13
244 0.16
245 0.17
246 0.21
247 0.25
248 0.31
249 0.28
250 0.35
251 0.38
252 0.37
253 0.41
254 0.38
255 0.36
256 0.29
257 0.26
258 0.19
259 0.16
260 0.13
261 0.09
262 0.06
263 0.05
264 0.04
265 0.05
266 0.05
267 0.07
268 0.13
269 0.14
270 0.17
271 0.23
272 0.28
273 0.3
274 0.38
275 0.43
276 0.47
277 0.53
278 0.6
279 0.64
280 0.61
281 0.6
282 0.58
283 0.52
284 0.45
285 0.4
286 0.39
287 0.3
288 0.28
289 0.27
290 0.23
291 0.23
292 0.22
293 0.21
294 0.13
295 0.14
296 0.13
297 0.14
298 0.12
299 0.13
300 0.11
301 0.11
302 0.1
303 0.09
304 0.09
305 0.08
306 0.07
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.07
313 0.1
314 0.11
315 0.15
316 0.23
317 0.26
318 0.28
319 0.32
320 0.32
321 0.32
322 0.38
323 0.42
324 0.43
325 0.45
326 0.44
327 0.42
328 0.41
329 0.39
330 0.34
331 0.26
332 0.2
333 0.16
334 0.15
335 0.13
336 0.13
337 0.13
338 0.1
339 0.11
340 0.07
341 0.07
342 0.06
343 0.05
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.06
349 0.07
350 0.09
351 0.1
352 0.1
353 0.11
354 0.13
355 0.15
356 0.15
357 0.19
358 0.25
359 0.34
360 0.44
361 0.52
362 0.61
363 0.7
364 0.79
365 0.86
366 0.88
367 0.91
368 0.93
369 0.95
370 0.95