Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3E7H1

Protein Details
Accession A0A0C3E7H1    Localization Confidence High Confidence Score 19.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
103-134IAKPADQKDKEKKDKRTRRRPGRRGSKPVPGEBasic
153-180VPQTEVAKPKKKKKTNRKPKRRAASADAHydrophilic
202-229TPQAANKRRPYRKFYRPRPRRPIGEDPVHydrophilic
262-283VVSARVVRRRWGQPRKSKGYGFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
109-130QKDKEKKDKRTRRRPGRRGSKP
160-175KPKKKKKTNRKPKRRA
208-223KRRPYRKFYRPRPRRP
Subcellular Location(s) cyto 15, cyto_nucl 14, nucl 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSDAQAAPVTENGVPPATQGPLIEEAPGFKVFIGNLAYSTTDEGLKTFFASVQSDIISVQVIKRGPKSAGYGFVAVSSAEAAQMAIENLAGEELDGRKVIVEIAKPADQKDKEKKDKRTRRRPGRRGSKPVPGEVTEAEANGDIVKVDDADAVPQTEVAKPKKKKKTNRKPKRRAASADAAPDAAGEPYVVDATADALAANTPQAANKRRPYRKFYRPRPRRPIGEDPVGEPSKTMLFVANLGFNIDDEGLSALFTDAEIDVVSARVVRRRWGQPRKSKGYGFVDVGSEEQQQKAIEALQGKEVGGRAIAVKIAVSTHRVDEVDAPAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.14
3 0.15
4 0.14
5 0.14
6 0.13
7 0.15
8 0.18
9 0.18
10 0.18
11 0.16
12 0.16
13 0.18
14 0.19
15 0.15
16 0.11
17 0.12
18 0.11
19 0.14
20 0.15
21 0.13
22 0.13
23 0.14
24 0.15
25 0.14
26 0.15
27 0.13
28 0.11
29 0.11
30 0.11
31 0.11
32 0.11
33 0.11
34 0.1
35 0.1
36 0.11
37 0.13
38 0.14
39 0.14
40 0.14
41 0.13
42 0.13
43 0.12
44 0.1
45 0.09
46 0.08
47 0.11
48 0.13
49 0.16
50 0.19
51 0.22
52 0.22
53 0.25
54 0.3
55 0.29
56 0.32
57 0.31
58 0.29
59 0.26
60 0.25
61 0.22
62 0.16
63 0.13
64 0.08
65 0.06
66 0.05
67 0.05
68 0.04
69 0.04
70 0.04
71 0.04
72 0.04
73 0.04
74 0.04
75 0.04
76 0.04
77 0.03
78 0.03
79 0.04
80 0.05
81 0.06
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.08
87 0.09
88 0.09
89 0.11
90 0.14
91 0.18
92 0.18
93 0.19
94 0.26
95 0.27
96 0.34
97 0.42
98 0.49
99 0.57
100 0.65
101 0.75
102 0.78
103 0.87
104 0.9
105 0.91
106 0.92
107 0.92
108 0.95
109 0.94
110 0.93
111 0.94
112 0.93
113 0.91
114 0.85
115 0.83
116 0.74
117 0.67
118 0.59
119 0.49
120 0.41
121 0.31
122 0.29
123 0.2
124 0.17
125 0.14
126 0.11
127 0.09
128 0.07
129 0.07
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.04
136 0.04
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.06
142 0.06
143 0.08
144 0.13
145 0.18
146 0.27
147 0.33
148 0.43
149 0.53
150 0.61
151 0.7
152 0.77
153 0.83
154 0.86
155 0.91
156 0.92
157 0.93
158 0.94
159 0.93
160 0.9
161 0.84
162 0.79
163 0.76
164 0.68
165 0.59
166 0.5
167 0.39
168 0.31
169 0.25
170 0.19
171 0.1
172 0.07
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.03
184 0.03
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.03
189 0.03
190 0.05
191 0.11
192 0.16
193 0.23
194 0.31
195 0.42
196 0.51
197 0.57
198 0.64
199 0.68
200 0.75
201 0.79
202 0.82
203 0.83
204 0.85
205 0.9
206 0.92
207 0.9
208 0.86
209 0.84
210 0.83
211 0.78
212 0.75
213 0.65
214 0.56
215 0.56
216 0.49
217 0.41
218 0.3
219 0.25
220 0.18
221 0.17
222 0.15
223 0.09
224 0.08
225 0.1
226 0.11
227 0.11
228 0.1
229 0.1
230 0.1
231 0.09
232 0.09
233 0.08
234 0.06
235 0.05
236 0.06
237 0.06
238 0.05
239 0.06
240 0.05
241 0.04
242 0.04
243 0.05
244 0.04
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.06
252 0.08
253 0.13
254 0.14
255 0.19
256 0.27
257 0.37
258 0.48
259 0.57
260 0.66
261 0.72
262 0.81
263 0.85
264 0.84
265 0.77
266 0.75
267 0.71
268 0.66
269 0.58
270 0.49
271 0.41
272 0.35
273 0.33
274 0.27
275 0.23
276 0.19
277 0.17
278 0.18
279 0.16
280 0.16
281 0.16
282 0.15
283 0.15
284 0.18
285 0.19
286 0.2
287 0.21
288 0.2
289 0.21
290 0.2
291 0.17
292 0.13
293 0.13
294 0.1
295 0.1
296 0.11
297 0.09
298 0.09
299 0.09
300 0.11
301 0.12
302 0.13
303 0.15
304 0.16
305 0.19
306 0.2
307 0.2
308 0.22