FuNGI

A0A0C3DWT9

Protein Details

Accession

A0A0C3DWT9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
275-297	TLRASRTQKKELKRKWKSKGDLD	Hydrophilic
340-360	PEPSVPRKKAKPKRGAGNVRL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
283-292	KKELKRKWKS
345-355	PRKKAKPKRGA

Subcellular Location(s)

extr 10, mito 6.5, cyto_mito 6.333, cyto 5, cyto_nucl 4.833, nucl 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR032847 PRPF17 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0071013 C:catalytic step 2 spliceosome GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome

Amino Acid Sequences

MFLVSPFVLQRLKARFPTDAWGPSNQATVQPWLPPSKIFVALVHLKRLKARFPTDAWSPRHLQRLKVRFPTDVWGSSKRWCARILWDQAHTSHCNGVLCAIHATPADSPPTHDDDAAYMALLIQLLSDSFSTHNTWVHSWILEHPPWGPCSIHLLTASITLTLVSQGPPHPSIDQPDSPLLLPHTQMNVNIPYADMVRPLQGSENPFGDQNRFLNQNALAGHVEEQAMSDHAFKAQHLTHAILGYSANPSVDPNASALVGSLDKARENGFTTIDTLRASRTQKKELKRKWKSKGDLDVIDGEDAYVGPWAAWDGEHQAGFLDSVEELPEGQAQEEEEEGPEPSVPRKKAKPKRGAGNVRLPWQVHDRLSAPHLHASSPHGGTSSRISQTRPARGHLHPEGHLLLSGSMDTKIKEYDQHLGPANTIMFVDKNRRFVMTSDDKMIWAQWDFDIPVVIKYIAELHMHSMTGVTLHPSKRYFAAQSLDNQILVYSTDNFQQNWKKWFAEHSVIIGYACQVGFSPDGKWISSGDSTGDVVFWDWKTGRMKARLKAHSKVVVAHEWLPHETDGVFHAFEGATLNGYLPLSLATVTAPSPCLFRTPILVSALIA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.43
3	0.43
4	0.49
5	0.48
6	0.47
7	0.44
8	0.42
9	0.42
10	0.4
11	0.41
12	0.35
13	0.31
14	0.27
15	0.28
16	0.27
17	0.26
18	0.29
19	0.3
20	0.31
21	0.28
22	0.3
23	0.3
24	0.31
25	0.29
26	0.25
27	0.28
28	0.36
29	0.38
30	0.43
31	0.42
32	0.4
33	0.45
34	0.49
35	0.48
36	0.48
37	0.51
38	0.48
39	0.48
40	0.52
41	0.55
42	0.6
43	0.58
44	0.55
45	0.54
46	0.53
47	0.6
48	0.57
49	0.56
50	0.58
51	0.63
52	0.66
53	0.7
54	0.68
55	0.61
56	0.6
57	0.59
58	0.54
59	0.5
60	0.45
61	0.42
62	0.41
63	0.43
64	0.5
65	0.47
66	0.45
67	0.41
68	0.39
69	0.42
70	0.49
71	0.53
72	0.5
73	0.49
74	0.49
75	0.49
76	0.52
77	0.45
78	0.37
79	0.3
80	0.27
81	0.24
82	0.22
83	0.22
84	0.17
85	0.17
86	0.17
87	0.14
88	0.13
89	0.13
90	0.14
91	0.13
92	0.14
93	0.16
94	0.15
95	0.17
96	0.2
97	0.26
98	0.25
99	0.24
100	0.22
101	0.2
102	0.22
103	0.19
104	0.15
105	0.09
106	0.08
107	0.08
108	0.08
109	0.06
110	0.03
111	0.03
112	0.03
113	0.05
114	0.05
115	0.05
116	0.06
117	0.08
118	0.11
119	0.12
120	0.15
121	0.16
122	0.17
123	0.19
124	0.19
125	0.18
126	0.17
127	0.2
128	0.24
129	0.23
130	0.23
131	0.22
132	0.23
133	0.24
134	0.25
135	0.2
136	0.14
137	0.21
138	0.21
139	0.21
140	0.19
141	0.19
142	0.17
143	0.19
144	0.18
145	0.11
146	0.1
147	0.08
148	0.07
149	0.07
150	0.08
151	0.06
152	0.08
153	0.09
154	0.13
155	0.14
156	0.16
157	0.16
158	0.17
159	0.22
160	0.26
161	0.26
162	0.25
163	0.25
164	0.25
165	0.23
166	0.23
167	0.2
168	0.16
169	0.15
170	0.14
171	0.16
172	0.15
173	0.16
174	0.18
175	0.17
176	0.16
177	0.15
178	0.13
179	0.12
180	0.12
181	0.12
182	0.1
183	0.09
184	0.1
185	0.1
186	0.1
187	0.12
188	0.13
189	0.16
190	0.17
191	0.18
192	0.17
193	0.18
194	0.19
195	0.19
196	0.18
197	0.17
198	0.18
199	0.19
200	0.19
201	0.2
202	0.19
203	0.21
204	0.18
205	0.19
206	0.15
207	0.13
208	0.14
209	0.12
210	0.12
211	0.09
212	0.09
213	0.07
214	0.08
215	0.08
216	0.07
217	0.07
218	0.08
219	0.09
220	0.08
221	0.12
222	0.12
223	0.14
224	0.15
225	0.16
226	0.15
227	0.16
228	0.16
229	0.12
230	0.11
231	0.09
232	0.09
233	0.08
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.07
238	0.08
239	0.07
240	0.07
241	0.07
242	0.07
243	0.07
244	0.07
245	0.06
246	0.06
247	0.06
248	0.06
249	0.06
250	0.07
251	0.07
252	0.08
253	0.09
254	0.11
255	0.12
256	0.12
257	0.11
258	0.14
259	0.13
260	0.14
261	0.13
262	0.1
263	0.11
264	0.14
265	0.18
266	0.24
267	0.28
268	0.36
269	0.43
270	0.51
271	0.61
272	0.66
273	0.73
274	0.76
275	0.81
276	0.82
277	0.85
278	0.82
279	0.79
280	0.79
281	0.72
282	0.63
283	0.55
284	0.47
285	0.38
286	0.31
287	0.23
288	0.14
289	0.08
290	0.07
291	0.05
292	0.03
293	0.03
294	0.02
295	0.02
296	0.03
297	0.03
298	0.03
299	0.03
300	0.06
301	0.07
302	0.07
303	0.07
304	0.07
305	0.07
306	0.07
307	0.07
308	0.05
309	0.03
310	0.04
311	0.04
312	0.04
313	0.04
314	0.04
315	0.05
316	0.05
317	0.05
318	0.05
319	0.05
320	0.05
321	0.06
322	0.06
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.05
327	0.06
328	0.06
329	0.1
330	0.16
331	0.18
332	0.23
333	0.31
334	0.42
335	0.52
336	0.62
337	0.68
338	0.7
339	0.77
340	0.82
341	0.83
342	0.79
343	0.79
344	0.72
345	0.66
346	0.61
347	0.51
348	0.43
349	0.38
350	0.36
351	0.26
352	0.25
353	0.22
354	0.21
355	0.23
356	0.23
357	0.19
358	0.19
359	0.19
360	0.17
361	0.16
362	0.18
363	0.21
364	0.19
365	0.18
366	0.15
367	0.15
368	0.16
369	0.19
370	0.2
371	0.19
372	0.2
373	0.21
374	0.28
375	0.34
376	0.42
377	0.4
378	0.39
379	0.42
380	0.42
381	0.49
382	0.46
383	0.44
384	0.36
385	0.36
386	0.33
387	0.27
388	0.26
389	0.18
390	0.13
391	0.09
392	0.09
393	0.07
394	0.07
395	0.07
396	0.07
397	0.08
398	0.09
399	0.1
400	0.13
401	0.15
402	0.21
403	0.22
404	0.25
405	0.28
406	0.27
407	0.27
408	0.25
409	0.22
410	0.16
411	0.14
412	0.11
413	0.09
414	0.11
415	0.2
416	0.21
417	0.25
418	0.26
419	0.27
420	0.28
421	0.27
422	0.35
423	0.34
424	0.33
425	0.33
426	0.33
427	0.32
428	0.31
429	0.3
430	0.23
431	0.15
432	0.13
433	0.1
434	0.11
435	0.11
436	0.11
437	0.12
438	0.1
439	0.1
440	0.11
441	0.11
442	0.09
443	0.09
444	0.11
445	0.11
446	0.11
447	0.11
448	0.13
449	0.14
450	0.14
451	0.13
452	0.11
453	0.09
454	0.09
455	0.09
456	0.09
457	0.13
458	0.15
459	0.19
460	0.2
461	0.22
462	0.24
463	0.27
464	0.27
465	0.27
466	0.29
467	0.28
468	0.31
469	0.34
470	0.33
471	0.29
472	0.26
473	0.21
474	0.18
475	0.16
476	0.13
477	0.09
478	0.09
479	0.14
480	0.16
481	0.17
482	0.24
483	0.32
484	0.36
485	0.4
486	0.43
487	0.4
488	0.39
489	0.45
490	0.44
491	0.42
492	0.37
493	0.34
494	0.32
495	0.31
496	0.29
497	0.23
498	0.17
499	0.12
500	0.11
501	0.08
502	0.07
503	0.09
504	0.11
505	0.12
506	0.12
507	0.15
508	0.17
509	0.17
510	0.18
511	0.17
512	0.19
513	0.19
514	0.19
515	0.15
516	0.15
517	0.15
518	0.15
519	0.14
520	0.1
521	0.1
522	0.13
523	0.12
524	0.14
525	0.14
526	0.2
527	0.25
528	0.3
529	0.38
530	0.44
531	0.51
532	0.55
533	0.65
534	0.69
535	0.71
536	0.71
537	0.71
538	0.68
539	0.63
540	0.6
541	0.54
542	0.49
543	0.46
544	0.44
545	0.39
546	0.34
547	0.34
548	0.31
549	0.26
550	0.22
551	0.18
552	0.16
553	0.15
554	0.15
555	0.13
556	0.11
557	0.12
558	0.11
559	0.11
560	0.13
561	0.11
562	0.1
563	0.1
564	0.11
565	0.11
566	0.11
567	0.1
568	0.08
569	0.08
570	0.08
571	0.08
572	0.07
573	0.06
574	0.08
575	0.08
576	0.09
577	0.11
578	0.11
579	0.13
580	0.13
581	0.17
582	0.17
583	0.18
584	0.23
585	0.25
586	0.29
587	0.3

A0A0C3DWT9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer