Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C2YT21

Protein Details
Accession A0A0C2YT21    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
222-248NALRASRTQKKELKRKRKNKGDLDVIDHydrophilic
656-678AVLEVNKSRKSKKKNVLEELVAYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
228-241RTQKKELKRKRKNK
Subcellular Location(s) cyto 12, nucl 7, cyto_mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032847  PRPF17  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0071013  C:catalytic step 2 spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MTEGTFPYWSTSNWPLHPFYNILIERSWTHALTTFAALVHLQRLEARFPAGPLTGPPFTPSTSLPLSDLVVFFSSDEDGDTIQTDTFGISNLPVTKKVRTDVSGQKIVADATPHVLAEDPLHQTSLVTRPTDTQMNVNIPYADMVRPLQGPENPFGDQNCFLNQNALAGHIEEQAMSNHAFKAQHLTHTILGYSANPSVDPNASTLVGSLDKARENRFTTINALRASRTQKKELKRKRKNKGDLDVIDGEDAYVGPWATWDGEHQAGFLDGVEELPEGQVQEEEEEEPEPSVPCKKAKPKRGAVGQEMSVFHGKSMTDYQGHTYMHPPLVEAPHLANEAGSEETFIPKYDINSGEITQEYDQHLGPVNTITFVDENRRFVTTSDNKMIRAWDFDIPMVIKYIAELHMHLMPAVTLHPSNRYFVAQLLDNQILMYNFWQHRKKQFAGHSVAGYACQIGFSPDGKWISSGDSTGDVVFWDWKTGRMKVQLKAHSKVVIAHEWLPHETSKVVTAAFEGVFRAFGKGATPVNGNTRSRLMEMVCLLGIPTYAHLAENDYAECCVGLMAELDDATRLLHGVHLPIIVPCCEPTISSLMSGHAHSALADLDSDSEDPPESHPSTSTRTTGHATNDLEDVLRTTQLQLDAEKTCNHELEGKNAVLEVNKSRKSKKKNVLEELVAYEVEIKMLTKKYGVMVEMYFPTTEAISQPTPIPMPAFNTADRCASK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.4
3 0.4
4 0.43
5 0.38
6 0.32
7 0.36
8 0.32
9 0.3
10 0.27
11 0.28
12 0.27
13 0.3
14 0.32
15 0.22
16 0.22
17 0.24
18 0.25
19 0.25
20 0.25
21 0.2
22 0.17
23 0.18
24 0.17
25 0.15
26 0.16
27 0.14
28 0.13
29 0.15
30 0.17
31 0.19
32 0.2
33 0.22
34 0.19
35 0.19
36 0.22
37 0.2
38 0.18
39 0.18
40 0.23
41 0.22
42 0.21
43 0.22
44 0.21
45 0.21
46 0.23
47 0.22
48 0.21
49 0.22
50 0.23
51 0.22
52 0.21
53 0.21
54 0.21
55 0.2
56 0.16
57 0.14
58 0.13
59 0.12
60 0.11
61 0.11
62 0.09
63 0.09
64 0.08
65 0.08
66 0.08
67 0.09
68 0.09
69 0.08
70 0.09
71 0.08
72 0.08
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.06
77 0.1
78 0.15
79 0.16
80 0.22
81 0.24
82 0.29
83 0.32
84 0.35
85 0.36
86 0.34
87 0.4
88 0.45
89 0.5
90 0.52
91 0.48
92 0.45
93 0.41
94 0.39
95 0.32
96 0.24
97 0.17
98 0.13
99 0.14
100 0.13
101 0.12
102 0.12
103 0.11
104 0.11
105 0.15
106 0.16
107 0.15
108 0.16
109 0.16
110 0.15
111 0.18
112 0.22
113 0.22
114 0.19
115 0.2
116 0.22
117 0.26
118 0.3
119 0.28
120 0.26
121 0.27
122 0.3
123 0.31
124 0.29
125 0.26
126 0.21
127 0.21
128 0.19
129 0.14
130 0.12
131 0.11
132 0.12
133 0.13
134 0.14
135 0.17
136 0.19
137 0.21
138 0.22
139 0.25
140 0.23
141 0.24
142 0.24
143 0.24
144 0.22
145 0.21
146 0.21
147 0.2
148 0.19
149 0.2
150 0.19
151 0.16
152 0.15
153 0.15
154 0.13
155 0.11
156 0.12
157 0.11
158 0.11
159 0.09
160 0.1
161 0.09
162 0.11
163 0.11
164 0.1
165 0.1
166 0.12
167 0.13
168 0.12
169 0.2
170 0.19
171 0.23
172 0.24
173 0.27
174 0.26
175 0.26
176 0.26
177 0.18
178 0.17
179 0.14
180 0.13
181 0.12
182 0.1
183 0.09
184 0.1
185 0.11
186 0.12
187 0.12
188 0.11
189 0.11
190 0.11
191 0.11
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.09
196 0.1
197 0.11
198 0.14
199 0.17
200 0.19
201 0.23
202 0.26
203 0.29
204 0.29
205 0.29
206 0.31
207 0.33
208 0.35
209 0.31
210 0.28
211 0.26
212 0.3
213 0.36
214 0.39
215 0.4
216 0.43
217 0.49
218 0.58
219 0.68
220 0.74
221 0.78
222 0.8
223 0.86
224 0.88
225 0.92
226 0.92
227 0.91
228 0.88
229 0.87
230 0.77
231 0.73
232 0.64
233 0.53
234 0.43
235 0.33
236 0.24
237 0.14
238 0.12
239 0.06
240 0.04
241 0.04
242 0.03
243 0.04
244 0.04
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.08
249 0.1
250 0.1
251 0.1
252 0.09
253 0.09
254 0.09
255 0.08
256 0.05
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.05
269 0.05
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.11
279 0.12
280 0.15
281 0.22
282 0.32
283 0.4
284 0.5
285 0.58
286 0.62
287 0.68
288 0.74
289 0.72
290 0.67
291 0.61
292 0.53
293 0.47
294 0.39
295 0.33
296 0.26
297 0.21
298 0.16
299 0.13
300 0.11
301 0.1
302 0.12
303 0.12
304 0.12
305 0.12
306 0.15
307 0.17
308 0.18
309 0.17
310 0.17
311 0.17
312 0.17
313 0.16
314 0.15
315 0.12
316 0.13
317 0.13
318 0.12
319 0.1
320 0.1
321 0.1
322 0.1
323 0.07
324 0.06
325 0.07
326 0.07
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.08
336 0.11
337 0.12
338 0.13
339 0.14
340 0.14
341 0.14
342 0.14
343 0.14
344 0.11
345 0.12
346 0.11
347 0.11
348 0.1
349 0.1
350 0.11
351 0.1
352 0.1
353 0.09
354 0.08
355 0.07
356 0.07
357 0.07
358 0.06
359 0.06
360 0.13
361 0.14
362 0.15
363 0.16
364 0.17
365 0.17
366 0.17
367 0.26
368 0.25
369 0.29
370 0.33
371 0.33
372 0.33
373 0.33
374 0.34
375 0.25
376 0.22
377 0.19
378 0.15
379 0.15
380 0.14
381 0.14
382 0.13
383 0.13
384 0.11
385 0.09
386 0.06
387 0.06
388 0.07
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.08
393 0.1
394 0.1
395 0.1
396 0.08
397 0.06
398 0.06
399 0.07
400 0.06
401 0.05
402 0.06
403 0.11
404 0.12
405 0.13
406 0.14
407 0.14
408 0.14
409 0.15
410 0.16
411 0.12
412 0.13
413 0.16
414 0.15
415 0.14
416 0.13
417 0.13
418 0.11
419 0.1
420 0.09
421 0.11
422 0.13
423 0.2
424 0.25
425 0.28
426 0.35
427 0.42
428 0.44
429 0.46
430 0.5
431 0.51
432 0.52
433 0.51
434 0.44
435 0.38
436 0.36
437 0.28
438 0.21
439 0.14
440 0.07
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.07
445 0.07
446 0.08
447 0.11
448 0.13
449 0.13
450 0.13
451 0.13
452 0.14
453 0.14
454 0.13
455 0.1
456 0.11
457 0.11
458 0.1
459 0.1
460 0.07
461 0.07
462 0.09
463 0.08
464 0.09
465 0.09
466 0.14
467 0.17
468 0.2
469 0.23
470 0.31
471 0.36
472 0.4
473 0.48
474 0.52
475 0.55
476 0.56
477 0.54
478 0.47
479 0.43
480 0.4
481 0.35
482 0.29
483 0.26
484 0.25
485 0.24
486 0.23
487 0.24
488 0.22
489 0.18
490 0.16
491 0.14
492 0.12
493 0.12
494 0.11
495 0.1
496 0.09
497 0.09
498 0.1
499 0.1
500 0.1
501 0.08
502 0.08
503 0.09
504 0.09
505 0.1
506 0.08
507 0.08
508 0.08
509 0.11
510 0.12
511 0.13
512 0.14
513 0.15
514 0.21
515 0.27
516 0.27
517 0.26
518 0.28
519 0.28
520 0.27
521 0.28
522 0.22
523 0.19
524 0.19
525 0.18
526 0.15
527 0.13
528 0.12
529 0.09
530 0.09
531 0.06
532 0.06
533 0.06
534 0.06
535 0.07
536 0.07
537 0.1
538 0.11
539 0.12
540 0.12
541 0.11
542 0.11
543 0.11
544 0.1
545 0.07
546 0.06
547 0.04
548 0.04
549 0.04
550 0.04
551 0.05
552 0.05
553 0.05
554 0.05
555 0.05
556 0.05
557 0.04
558 0.04
559 0.04
560 0.06
561 0.07
562 0.08
563 0.09
564 0.09
565 0.1
566 0.11
567 0.13
568 0.12
569 0.12
570 0.11
571 0.12
572 0.12
573 0.12
574 0.13
575 0.15
576 0.15
577 0.15
578 0.15
579 0.15
580 0.17
581 0.17
582 0.15
583 0.12
584 0.11
585 0.1
586 0.1
587 0.09
588 0.07
589 0.07
590 0.06
591 0.06
592 0.08
593 0.09
594 0.08
595 0.09
596 0.09
597 0.1
598 0.12
599 0.18
600 0.18
601 0.18
602 0.2
603 0.23
604 0.28
605 0.31
606 0.31
607 0.26
608 0.28
609 0.3
610 0.32
611 0.33
612 0.34
613 0.32
614 0.31
615 0.3
616 0.27
617 0.24
618 0.2
619 0.18
620 0.13
621 0.12
622 0.11
623 0.11
624 0.14
625 0.16
626 0.17
627 0.16
628 0.19
629 0.21
630 0.23
631 0.25
632 0.26
633 0.27
634 0.26
635 0.26
636 0.3
637 0.28
638 0.32
639 0.35
640 0.3
641 0.28
642 0.27
643 0.27
644 0.21
645 0.23
646 0.25
647 0.29
648 0.36
649 0.41
650 0.5
651 0.58
652 0.67
653 0.74
654 0.76
655 0.78
656 0.82
657 0.86
658 0.85
659 0.8
660 0.73
661 0.66
662 0.57
663 0.46
664 0.35
665 0.27
666 0.19
667 0.15
668 0.12
669 0.09
670 0.12
671 0.15
672 0.16
673 0.16
674 0.18
675 0.21
676 0.24
677 0.25
678 0.23
679 0.21
680 0.24
681 0.25
682 0.25
683 0.21
684 0.18
685 0.18
686 0.15
687 0.14
688 0.12
689 0.15
690 0.15
691 0.16
692 0.17
693 0.2
694 0.21
695 0.21
696 0.22
697 0.18
698 0.22
699 0.27
700 0.29
701 0.29
702 0.32
703 0.32