Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3DCS2

Protein Details
Accession A0A0C3DCS2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
146-186GTASDWKKAKEKRRPRIDDGRKGRRPRYRRRGARRFTPEDSBasic
342-365RSRLRLQKRLYMRRHRAKLRGQHDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
152-180KKAKEKRRPRIDDGRKGRRPRYRRRGARR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10, pero 6, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR039601  Rrn5  
IPR001005  SANT/Myb  
Gene Ontology GO:0000500  C:RNA polymerase I upstream activating factor complex  
GO:0042790  P:nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I  
CDD cd00167  SANT  
Amino Acid Sequences MHPTVPDFLEHLAETRARFGQGTAHHARTPAAWTPAEQNAFFRALAVYSRWRPDLIAAAISTKTTLQVEQYLAALEDGATRLQRIEDGDESSSDLADIDTDQHDSDSGLDAEPAYQVSEAWVAAEEALAAHVIEEENAALLEHHRGTASDWKKAKEKRRPRIDDGRKGRRPRYRRRGARRFTPEDSPTLKHARDASPVREEAQQQDETPPEQPRAKRPRVVVARDDYMSHLDDAHLTELNILIRAAEESSTIVRVPAETGVPTHAQVLDTDDPSDALIDPALLAISRVSSGATPIPTATPPIIFEPPAGTSTNNGLSHFSYSGPIAPSEDPLGLNPDLLSPRSRLRLQKRLYMRRHRAKLRGQHDSAHNPTLTFPGLLTTVHKAREVETTPAPSTSRLPDIEADDQQPAKPKHSKSGLTLPYKIRAIFSELGVDAAYLRAQGMDLIHLRGLACLRRLYNTLEWGPSPNEEVTGPDGVDATLVRQLQAALVVFVTDVMHRAIVWKETQMRLNRRSNYHPHGQARA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.21
3 0.22
4 0.2
5 0.2
6 0.19
7 0.23
8 0.25
9 0.33
10 0.35
11 0.37
12 0.38
13 0.38
14 0.38
15 0.33
16 0.34
17 0.31
18 0.29
19 0.26
20 0.26
21 0.31
22 0.37
23 0.38
24 0.33
25 0.3
26 0.28
27 0.29
28 0.27
29 0.23
30 0.17
31 0.14
32 0.16
33 0.17
34 0.22
35 0.25
36 0.3
37 0.3
38 0.3
39 0.3
40 0.3
41 0.34
42 0.28
43 0.26
44 0.22
45 0.23
46 0.23
47 0.22
48 0.21
49 0.13
50 0.13
51 0.12
52 0.12
53 0.12
54 0.16
55 0.17
56 0.17
57 0.17
58 0.16
59 0.15
60 0.14
61 0.11
62 0.08
63 0.07
64 0.07
65 0.08
66 0.08
67 0.08
68 0.09
69 0.09
70 0.11
71 0.11
72 0.15
73 0.16
74 0.19
75 0.2
76 0.19
77 0.21
78 0.19
79 0.17
80 0.12
81 0.1
82 0.07
83 0.06
84 0.06
85 0.07
86 0.07
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.09
91 0.09
92 0.09
93 0.1
94 0.1
95 0.09
96 0.09
97 0.09
98 0.09
99 0.09
100 0.09
101 0.07
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.05
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.03
117 0.03
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.05
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.09
133 0.11
134 0.21
135 0.23
136 0.28
137 0.32
138 0.35
139 0.43
140 0.51
141 0.58
142 0.6
143 0.68
144 0.7
145 0.78
146 0.83
147 0.84
148 0.87
149 0.87
150 0.87
151 0.87
152 0.87
153 0.84
154 0.83
155 0.83
156 0.81
157 0.81
158 0.81
159 0.82
160 0.82
161 0.85
162 0.89
163 0.91
164 0.89
165 0.89
166 0.87
167 0.83
168 0.76
169 0.72
170 0.63
171 0.57
172 0.54
173 0.45
174 0.4
175 0.38
176 0.35
177 0.3
178 0.32
179 0.29
180 0.33
181 0.35
182 0.34
183 0.33
184 0.34
185 0.33
186 0.33
187 0.32
188 0.27
189 0.28
190 0.25
191 0.21
192 0.22
193 0.21
194 0.19
195 0.21
196 0.2
197 0.19
198 0.23
199 0.25
200 0.33
201 0.42
202 0.47
203 0.48
204 0.48
205 0.54
206 0.58
207 0.6
208 0.55
209 0.49
210 0.46
211 0.41
212 0.4
213 0.31
214 0.25
215 0.21
216 0.15
217 0.11
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.07
223 0.07
224 0.06
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.06
229 0.05
230 0.04
231 0.05
232 0.05
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.05
237 0.06
238 0.06
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.05
246 0.06
247 0.07
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.07
254 0.12
255 0.12
256 0.11
257 0.12
258 0.11
259 0.11
260 0.1
261 0.11
262 0.06
263 0.04
264 0.04
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.02
272 0.03
273 0.03
274 0.03
275 0.04
276 0.04
277 0.05
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.08
283 0.08
284 0.09
285 0.09
286 0.07
287 0.08
288 0.11
289 0.12
290 0.11
291 0.11
292 0.11
293 0.12
294 0.13
295 0.13
296 0.1
297 0.1
298 0.12
299 0.18
300 0.17
301 0.16
302 0.16
303 0.16
304 0.18
305 0.17
306 0.15
307 0.11
308 0.1
309 0.12
310 0.11
311 0.11
312 0.11
313 0.11
314 0.12
315 0.12
316 0.12
317 0.1
318 0.1
319 0.14
320 0.11
321 0.11
322 0.1
323 0.11
324 0.11
325 0.12
326 0.13
327 0.12
328 0.15
329 0.2
330 0.24
331 0.31
332 0.39
333 0.48
334 0.5
335 0.56
336 0.63
337 0.69
338 0.74
339 0.77
340 0.78
341 0.79
342 0.85
343 0.84
344 0.82
345 0.81
346 0.81
347 0.77
348 0.76
349 0.67
350 0.64
351 0.62
352 0.61
353 0.56
354 0.51
355 0.43
356 0.34
357 0.33
358 0.29
359 0.24
360 0.16
361 0.12
362 0.09
363 0.1
364 0.1
365 0.11
366 0.14
367 0.16
368 0.17
369 0.19
370 0.18
371 0.19
372 0.26
373 0.26
374 0.26
375 0.26
376 0.29
377 0.28
378 0.3
379 0.29
380 0.24
381 0.24
382 0.22
383 0.24
384 0.2
385 0.21
386 0.22
387 0.26
388 0.28
389 0.28
390 0.26
391 0.25
392 0.25
393 0.25
394 0.31
395 0.28
396 0.3
397 0.36
398 0.36
399 0.42
400 0.49
401 0.52
402 0.49
403 0.58
404 0.6
405 0.59
406 0.63
407 0.56
408 0.54
409 0.53
410 0.47
411 0.38
412 0.31
413 0.32
414 0.27
415 0.25
416 0.23
417 0.2
418 0.2
419 0.19
420 0.17
421 0.11
422 0.09
423 0.09
424 0.05
425 0.05
426 0.05
427 0.05
428 0.06
429 0.06
430 0.1
431 0.11
432 0.13
433 0.13
434 0.14
435 0.14
436 0.14
437 0.17
438 0.16
439 0.17
440 0.2
441 0.21
442 0.23
443 0.26
444 0.3
445 0.31
446 0.35
447 0.35
448 0.34
449 0.34
450 0.34
451 0.34
452 0.29
453 0.28
454 0.22
455 0.2
456 0.17
457 0.19
458 0.19
459 0.18
460 0.17
461 0.13
462 0.14
463 0.12
464 0.13
465 0.1
466 0.08
467 0.11
468 0.11
469 0.11
470 0.12
471 0.12
472 0.12
473 0.14
474 0.13
475 0.1
476 0.09
477 0.09
478 0.08
479 0.09
480 0.09
481 0.06
482 0.07
483 0.07
484 0.08
485 0.08
486 0.11
487 0.13
488 0.15
489 0.17
490 0.22
491 0.28
492 0.32
493 0.4
494 0.47
495 0.54
496 0.6
497 0.68
498 0.69
499 0.69
500 0.74
501 0.76
502 0.74
503 0.74
504 0.75