Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3E542

Protein Details
Accession A0A0C3E542    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
113-137GGKAGQRPKRKWKGHGKGKSKDKADBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
114-135GKAGQRPKRKWKGHGKGKSKDK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13.333, cyto 7, cyto_mito 4.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF14223  Retrotran_gag_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences LITLREELASLGHSINPDDFTAMLISSVPASYDSTISAMTTSAKITRLDLTPDVIMTTLIDDYDQRQTKSSKKSSNSGEDAAYSASSSKKFSGNCHNCQKKGHKAEDCWEEGGGKAGQRPKRKWKGHGKGKSKDKADDDPRSSYSSALLAGEDLQTGQQMVLFDSGASRHMSSYRNQFMNFRSIVPKAITAADKHTFDAIEKGDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.13
3 0.14
4 0.13
5 0.13
6 0.12
7 0.11
8 0.11
9 0.1
10 0.09
11 0.07
12 0.07
13 0.07
14 0.07
15 0.06
16 0.07
17 0.08
18 0.09
19 0.09
20 0.1
21 0.1
22 0.1
23 0.1
24 0.09
25 0.08
26 0.08
27 0.09
28 0.09
29 0.1
30 0.12
31 0.13
32 0.14
33 0.17
34 0.17
35 0.21
36 0.2
37 0.21
38 0.19
39 0.18
40 0.17
41 0.13
42 0.12
43 0.08
44 0.08
45 0.05
46 0.05
47 0.05
48 0.05
49 0.07
50 0.16
51 0.18
52 0.18
53 0.21
54 0.24
55 0.31
56 0.4
57 0.47
58 0.46
59 0.48
60 0.54
61 0.57
62 0.61
63 0.58
64 0.5
65 0.42
66 0.34
67 0.31
68 0.25
69 0.18
70 0.11
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.09
75 0.1
76 0.13
77 0.15
78 0.18
79 0.29
80 0.35
81 0.42
82 0.51
83 0.55
84 0.53
85 0.58
86 0.61
87 0.59
88 0.59
89 0.59
90 0.53
91 0.5
92 0.55
93 0.54
94 0.48
95 0.39
96 0.32
97 0.24
98 0.2
99 0.2
100 0.14
101 0.1
102 0.11
103 0.16
104 0.22
105 0.3
106 0.36
107 0.45
108 0.55
109 0.61
110 0.67
111 0.73
112 0.78
113 0.81
114 0.85
115 0.84
116 0.82
117 0.86
118 0.84
119 0.76
120 0.71
121 0.64
122 0.63
123 0.63
124 0.62
125 0.56
126 0.53
127 0.51
128 0.49
129 0.44
130 0.35
131 0.27
132 0.19
133 0.16
134 0.12
135 0.1
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.06
140 0.06
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.06
146 0.06
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.1
155 0.09
156 0.1
157 0.13
158 0.15
159 0.2
160 0.29
161 0.36
162 0.37
163 0.38
164 0.41
165 0.41
166 0.46
167 0.42
168 0.36
169 0.32
170 0.3
171 0.32
172 0.3
173 0.28
174 0.23
175 0.26
176 0.25
177 0.23
178 0.28
179 0.3
180 0.3
181 0.3
182 0.29
183 0.26
184 0.25
185 0.28