Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3E0M0

Protein Details
Accession A0A0C3E0M0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
195-225VEDVTTKKRGRPSKRERKKKAKDSLVALNKWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
201-216KKRGRPSKRERKKKAK
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 9, mito 6, cyto 5.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019188  SNAPC1  
Pfam View protein in Pfam  
PF09808  SNAPC1  
Amino Acid Sequences SMAVAPSSASRGQIIVQPPYFTSSTFVDAVREDVTLLIQSYADQYERARPVQPFTLFKDIWVSQGWTWIHFKIFDARSREIFLKVMMRMFTERTTVAEAPIRRVGALFGLYIFFNTQPSVSVPQLHSVSHIEVTSDLYDAIIHLPDTLDTEYLALLRPHVIYVLSDFSKVGAFHILPHSRVHPLNPRELPRELVVEDVTTKKRGRPSKRERKKKAKDSLVALNKWL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.26
3 0.26
4 0.27
5 0.27
6 0.3
7 0.29
8 0.25
9 0.24
10 0.19
11 0.21
12 0.21
13 0.21
14 0.18
15 0.18
16 0.19
17 0.17
18 0.14
19 0.11
20 0.09
21 0.1
22 0.09
23 0.09
24 0.07
25 0.07
26 0.07
27 0.08
28 0.09
29 0.09
30 0.1
31 0.1
32 0.18
33 0.21
34 0.23
35 0.25
36 0.25
37 0.29
38 0.35
39 0.38
40 0.34
41 0.37
42 0.43
43 0.38
44 0.37
45 0.39
46 0.32
47 0.3
48 0.28
49 0.24
50 0.17
51 0.23
52 0.23
53 0.2
54 0.22
55 0.21
56 0.2
57 0.18
58 0.19
59 0.2
60 0.23
61 0.26
62 0.3
63 0.31
64 0.32
65 0.34
66 0.35
67 0.28
68 0.25
69 0.21
70 0.19
71 0.18
72 0.18
73 0.15
74 0.15
75 0.15
76 0.16
77 0.15
78 0.13
79 0.13
80 0.12
81 0.16
82 0.14
83 0.14
84 0.17
85 0.17
86 0.18
87 0.2
88 0.19
89 0.15
90 0.15
91 0.14
92 0.1
93 0.1
94 0.07
95 0.05
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.07
106 0.1
107 0.1
108 0.13
109 0.13
110 0.16
111 0.17
112 0.16
113 0.17
114 0.14
115 0.15
116 0.13
117 0.13
118 0.09
119 0.09
120 0.1
121 0.09
122 0.08
123 0.07
124 0.06
125 0.05
126 0.06
127 0.06
128 0.05
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.07
134 0.07
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.07
140 0.08
141 0.06
142 0.06
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.08
147 0.08
148 0.06
149 0.08
150 0.12
151 0.11
152 0.12
153 0.11
154 0.12
155 0.13
156 0.13
157 0.12
158 0.11
159 0.1
160 0.13
161 0.21
162 0.22
163 0.22
164 0.24
165 0.25
166 0.27
167 0.28
168 0.3
169 0.32
170 0.34
171 0.42
172 0.46
173 0.5
174 0.5
175 0.51
176 0.49
177 0.41
178 0.41
179 0.32
180 0.28
181 0.23
182 0.19
183 0.2
184 0.22
185 0.22
186 0.24
187 0.25
188 0.28
189 0.36
190 0.45
191 0.53
192 0.59
193 0.68
194 0.75
195 0.85
196 0.92
197 0.94
198 0.95
199 0.96
200 0.95
201 0.95
202 0.94
203 0.9
204 0.86
205 0.86
206 0.83