FuNGI

A0A0C2YQF0

Protein Details

Accession

A0A0C2YQF0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
72-99	DHFRWGSDSSKKQKRQKAKSSGMDQDTC	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 13.833, cyto 5.5, cyto_mito 4.166

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005824 KOW IPR039659 SPT5
Gene Ontology	GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II

Amino Acid Sequences

MEVVFGPRFIHAEWMDILSTMINVWENDEDGSKTRALFKKIVTDHNLSLPPLPSQECHLVVHDLLPLGQDDDHFRWGSDSSKKQKRQKAKSSGMDQDTCLLHLDLGVIDLTGLEDADETPKAGPSKVSQKRKRDGDGDSVEARSLKVSQSQEQRLDTRKRGSDKDGPSKAPQNRFLDVSALDGEDEEDDEDEEDYGGDDVPTVGHSQLLSSGQASFASRVDNICRRYESGCGGDPSNDTPHPSAFALSIPDATVCVYKVDIMTNSAAHYIREVLKRKSFKVTHRYHQSLYIEAASPRAINTSVPPSHRSIIRRITLVPPEEVTLLYSPREVFASAFWVRFKRGIYKNDIGYVLSRDGDRVDILVTPRDRPYDSDLRKLFFDADAAQLAEYTVTVEKQALEVVEVPHPDDLAFHSLVGINPSLVSQTIKIFSVQLWREGDLVHVVEGELRNTPGRIISVDLENKSAAVEIDYRGLVNYSCPIFKLQRVYKHGDSVKIFAGPEKGTSGCVLDHRGENLILTVSRHGEMTEVCSKYT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.21
3	0.2
4	0.19
5	0.12
6	0.12
7	0.09
8	0.08
9	0.08
10	0.08
11	0.1
12	0.11
13	0.12
14	0.13
15	0.15
16	0.15
17	0.16
18	0.19
19	0.18
20	0.18
21	0.27
22	0.31
23	0.35
24	0.38
25	0.38
26	0.46
27	0.5
28	0.57
29	0.54
30	0.54
31	0.51
32	0.53
33	0.52
34	0.43
35	0.41
36	0.34
37	0.29
38	0.27
39	0.26
40	0.2
41	0.23
42	0.27
43	0.26
44	0.27
45	0.27
46	0.26
47	0.24
48	0.25
49	0.21
50	0.16
51	0.14
52	0.13
53	0.11
54	0.1
55	0.1
56	0.1
57	0.14
58	0.16
59	0.2
60	0.2
61	0.2
62	0.2
63	0.21
64	0.26
65	0.29
66	0.36
67	0.42
68	0.53
69	0.62
70	0.7
71	0.79
72	0.84
73	0.86
74	0.87
75	0.88
76	0.88
77	0.88
78	0.86
79	0.85
80	0.8
81	0.71
82	0.61
83	0.54
84	0.44
85	0.35
86	0.29
87	0.2
88	0.14
89	0.12
90	0.12
91	0.07
92	0.08
93	0.07
94	0.05
95	0.04
96	0.05
97	0.04
98	0.04
99	0.04
100	0.03
101	0.03
102	0.04
103	0.06
104	0.06
105	0.07
106	0.08
107	0.11
108	0.12
109	0.12
110	0.14
111	0.17
112	0.28
113	0.37
114	0.48
115	0.54
116	0.63
117	0.71
118	0.77
119	0.78
120	0.73
121	0.68
122	0.67
123	0.62
124	0.57
125	0.49
126	0.42
127	0.36
128	0.31
129	0.26
130	0.17
131	0.14
132	0.11
133	0.15
134	0.18
135	0.24
136	0.32
137	0.38
138	0.41
139	0.43
140	0.47
141	0.49
142	0.53
143	0.52
144	0.51
145	0.51
146	0.52
147	0.53
148	0.56
149	0.57
150	0.58
151	0.63
152	0.61
153	0.59
154	0.57
155	0.62
156	0.62
157	0.6
158	0.59
159	0.53
160	0.49
161	0.47
162	0.44
163	0.37
164	0.3
165	0.25
166	0.18
167	0.13
168	0.11
169	0.09
170	0.09
171	0.07
172	0.07
173	0.05
174	0.04
175	0.04
176	0.05
177	0.05
178	0.05
179	0.05
180	0.04
181	0.05
182	0.05
183	0.05
184	0.04
185	0.04
186	0.04
187	0.04
188	0.04
189	0.05
190	0.05
191	0.05
192	0.05
193	0.05
194	0.07
195	0.08
196	0.07
197	0.07
198	0.07
199	0.07
200	0.08
201	0.08
202	0.08
203	0.07
204	0.08
205	0.08
206	0.09
207	0.14
208	0.19
209	0.21
210	0.22
211	0.23
212	0.24
213	0.25
214	0.26
215	0.24
216	0.21
217	0.21
218	0.2
219	0.19
220	0.18
221	0.18
222	0.18
223	0.18
224	0.15
225	0.15
226	0.14
227	0.14
228	0.15
229	0.14
230	0.12
231	0.09
232	0.1
233	0.09
234	0.09
235	0.09
236	0.07
237	0.07
238	0.06
239	0.06
240	0.06
241	0.05
242	0.05
243	0.05
244	0.05
245	0.06
246	0.07
247	0.06
248	0.08
249	0.08
250	0.08
251	0.08
252	0.1
253	0.09
254	0.08
255	0.08
256	0.09
257	0.13
258	0.19
259	0.22
260	0.24
261	0.31
262	0.34
263	0.36
264	0.43
265	0.44
266	0.46
267	0.52
268	0.55
269	0.57
270	0.63
271	0.64
272	0.56
273	0.57
274	0.5
275	0.41
276	0.36
277	0.28
278	0.2
279	0.17
280	0.16
281	0.11
282	0.1
283	0.08
284	0.08
285	0.07
286	0.06
287	0.08
288	0.14
289	0.17
290	0.19
291	0.21
292	0.23
293	0.25
294	0.29
295	0.29
296	0.29
297	0.34
298	0.34
299	0.33
300	0.32
301	0.34
302	0.35
303	0.34
304	0.28
305	0.22
306	0.2
307	0.19
308	0.17
309	0.14
310	0.1
311	0.09
312	0.09
313	0.09
314	0.08
315	0.08
316	0.09
317	0.08
318	0.07
319	0.07
320	0.13
321	0.13
322	0.14
323	0.16
324	0.16
325	0.17
326	0.19
327	0.2
328	0.24
329	0.3
330	0.34
331	0.4
332	0.44
333	0.44
334	0.45
335	0.44
336	0.35
337	0.29
338	0.26
339	0.19
340	0.15
341	0.14
342	0.11
343	0.11
344	0.11
345	0.1
346	0.08
347	0.07
348	0.08
349	0.09
350	0.15
351	0.15
352	0.17
353	0.19
354	0.21
355	0.21
356	0.21
357	0.28
358	0.33
359	0.35
360	0.42
361	0.42
362	0.42
363	0.42
364	0.4
365	0.34
366	0.23
367	0.21
368	0.14
369	0.13
370	0.12
371	0.12
372	0.11
373	0.09
374	0.09
375	0.07
376	0.06
377	0.06
378	0.05
379	0.05
380	0.06
381	0.07
382	0.07
383	0.07
384	0.08
385	0.07
386	0.07
387	0.09
388	0.11
389	0.13
390	0.13
391	0.14
392	0.13
393	0.13
394	0.12
395	0.1
396	0.11
397	0.12
398	0.12
399	0.11
400	0.12
401	0.13
402	0.13
403	0.14
404	0.12
405	0.08
406	0.08
407	0.08
408	0.08
409	0.08
410	0.09
411	0.08
412	0.1
413	0.12
414	0.13
415	0.13
416	0.13
417	0.14
418	0.22
419	0.22
420	0.25
421	0.25
422	0.25
423	0.25
424	0.25
425	0.25
426	0.18
427	0.18
428	0.12
429	0.1
430	0.09
431	0.12
432	0.13
433	0.12
434	0.11
435	0.12
436	0.13
437	0.13
438	0.14
439	0.12
440	0.13
441	0.13
442	0.14
443	0.15
444	0.21
445	0.26
446	0.26
447	0.26
448	0.25
449	0.24
450	0.21
451	0.2
452	0.13
453	0.09
454	0.1
455	0.1
456	0.13
457	0.13
458	0.13
459	0.12
460	0.13
461	0.11
462	0.11
463	0.15
464	0.14
465	0.15
466	0.16
467	0.2
468	0.23
469	0.27
470	0.36
471	0.39
472	0.47
473	0.53
474	0.6
475	0.59
476	0.65
477	0.64
478	0.62
479	0.57
480	0.51
481	0.46
482	0.41
483	0.37
484	0.3
485	0.31
486	0.24
487	0.23
488	0.23
489	0.21
490	0.19
491	0.2
492	0.19
493	0.16
494	0.19
495	0.21
496	0.21
497	0.23
498	0.24
499	0.26
500	0.24
501	0.22
502	0.21
503	0.19
504	0.17
505	0.16
506	0.17
507	0.17
508	0.17
509	0.17
510	0.16
511	0.16
512	0.15
513	0.21
514	0.26

A0A0C2YQF0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer