Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3DTD9

Protein Details
Accession A0A0C3DTD9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
109-132EANNTQPRKGRKGKKNKKDEATSPHydrophilic
261-285FQSTGQTGSKKKKEPKEKVSFYAFQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
116-126RKGRKGKKNKK
270-276KKKKEPK
Subcellular Location(s) cyto 11.5, cyto_nucl 11.5, nucl 10.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR040447  RRM_Rrp7  
IPR040446  RRP7  
IPR024326  RRP7_C  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF17799  RRM_Rrp7  
PF12923  RRP7  
Amino Acid Sequences MPIPEFVSGFTVIPVGYSHSTHIIYAREHRSSRSTNSAFPSGRTLFLVNVPIDATDRELSLFFKYAGTVERVIFDQYEQGDSGMQEDASSSSDEDEEGAGSSMEVDDSEANNTQPRKGRKGKKNKKDEATSPSVVPLPTVPLRTLRKTGTVAHVIFLDSSSLTNALSPASKARPWPSSEEPRGLAHYRALYDAQRPPLDIVKAHADSSVEFYEFELARSRRKSAYRKGEAIVDEEGFTLVTRGGAYGNTLGGGASVASKPFQSTGQTGSKKKKEPKEKVSFYAFQKAEKQREVIMDLKKSFEADKARIEKMKESRRFKPY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.12
3 0.13
4 0.13
5 0.15
6 0.18
7 0.19
8 0.19
9 0.22
10 0.21
11 0.22
12 0.3
13 0.35
14 0.38
15 0.39
16 0.41
17 0.45
18 0.47
19 0.5
20 0.52
21 0.48
22 0.47
23 0.51
24 0.55
25 0.49
26 0.45
27 0.47
28 0.38
29 0.36
30 0.32
31 0.28
32 0.21
33 0.23
34 0.26
35 0.19
36 0.18
37 0.16
38 0.15
39 0.15
40 0.14
41 0.15
42 0.11
43 0.11
44 0.11
45 0.12
46 0.13
47 0.13
48 0.14
49 0.12
50 0.11
51 0.11
52 0.12
53 0.13
54 0.15
55 0.15
56 0.14
57 0.15
58 0.15
59 0.16
60 0.15
61 0.13
62 0.13
63 0.12
64 0.13
65 0.12
66 0.11
67 0.11
68 0.11
69 0.12
70 0.09
71 0.08
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.08
76 0.08
77 0.07
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.05
94 0.05
95 0.07
96 0.08
97 0.08
98 0.12
99 0.13
100 0.16
101 0.22
102 0.27
103 0.34
104 0.43
105 0.54
106 0.6
107 0.71
108 0.78
109 0.82
110 0.88
111 0.88
112 0.86
113 0.83
114 0.78
115 0.74
116 0.7
117 0.62
118 0.51
119 0.43
120 0.36
121 0.29
122 0.23
123 0.16
124 0.12
125 0.13
126 0.13
127 0.13
128 0.18
129 0.22
130 0.24
131 0.27
132 0.24
133 0.26
134 0.27
135 0.29
136 0.26
137 0.28
138 0.26
139 0.23
140 0.22
141 0.19
142 0.17
143 0.14
144 0.1
145 0.05
146 0.05
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.05
154 0.05
155 0.07
156 0.09
157 0.11
158 0.13
159 0.16
160 0.19
161 0.21
162 0.28
163 0.32
164 0.39
165 0.41
166 0.42
167 0.4
168 0.37
169 0.39
170 0.34
171 0.28
172 0.2
173 0.19
174 0.17
175 0.16
176 0.17
177 0.14
178 0.17
179 0.2
180 0.22
181 0.21
182 0.21
183 0.21
184 0.23
185 0.23
186 0.19
187 0.18
188 0.19
189 0.2
190 0.2
191 0.19
192 0.16
193 0.15
194 0.19
195 0.17
196 0.11
197 0.11
198 0.11
199 0.14
200 0.14
201 0.15
202 0.18
203 0.18
204 0.24
205 0.26
206 0.29
207 0.31
208 0.39
209 0.47
210 0.49
211 0.6
212 0.61
213 0.63
214 0.61
215 0.6
216 0.53
217 0.47
218 0.39
219 0.28
220 0.21
221 0.17
222 0.16
223 0.11
224 0.1
225 0.07
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.04
241 0.05
242 0.06
243 0.06
244 0.07
245 0.07
246 0.08
247 0.09
248 0.11
249 0.13
250 0.15
251 0.2
252 0.29
253 0.36
254 0.43
255 0.52
256 0.58
257 0.64
258 0.71
259 0.76
260 0.77
261 0.81
262 0.85
263 0.86
264 0.85
265 0.82
266 0.81
267 0.77
268 0.71
269 0.7
270 0.6
271 0.52
272 0.55
273 0.57
274 0.57
275 0.54
276 0.51
277 0.45
278 0.48
279 0.48
280 0.46
281 0.44
282 0.44
283 0.41
284 0.42
285 0.39
286 0.37
287 0.34
288 0.33
289 0.34
290 0.3
291 0.39
292 0.41
293 0.47
294 0.5
295 0.51
296 0.54
297 0.57
298 0.64
299 0.64
300 0.66