Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3EBM8

Protein Details
Accession A0A0C3EBM8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
177-199DGSMMMVPRRRRRYNCYHTPTTAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 4, mito 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038737  SF3b_su1-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000245  P:spliceosomal complex assembly  
Amino Acid Sequences MSTAAKILPLLMERTLEDQEWHLLVKVIDRVLYRLNDLVRLYVHKILAVIEHFLINEDYYAHMEGHDIISNLAKAAGLAHMISTMHPDLRSMLVTPWLAPSLLSPLRSVSPHFSPSLRLSVSSKSLGKPTTPVFVSNRSQSDGLYCASPLVQPCQHHQPDNDDGPTHRQHQHDDNKDGSMMMVPRRRRRYNCYHTPTTATAWRW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.2
3 0.18
4 0.17
5 0.17
6 0.18
7 0.18
8 0.17
9 0.14
10 0.14
11 0.14
12 0.16
13 0.17
14 0.15
15 0.18
16 0.17
17 0.19
18 0.22
19 0.23
20 0.21
21 0.22
22 0.22
23 0.23
24 0.23
25 0.22
26 0.19
27 0.21
28 0.22
29 0.22
30 0.21
31 0.18
32 0.18
33 0.17
34 0.17
35 0.15
36 0.13
37 0.1
38 0.1
39 0.1
40 0.1
41 0.1
42 0.08
43 0.08
44 0.07
45 0.07
46 0.08
47 0.09
48 0.08
49 0.08
50 0.08
51 0.08
52 0.09
53 0.1
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.07
60 0.06
61 0.04
62 0.05
63 0.05
64 0.04
65 0.04
66 0.04
67 0.05
68 0.05
69 0.05
70 0.07
71 0.07
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.08
76 0.09
77 0.1
78 0.08
79 0.08
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.1
84 0.09
85 0.09
86 0.08
87 0.08
88 0.1
89 0.11
90 0.12
91 0.11
92 0.12
93 0.13
94 0.14
95 0.15
96 0.13
97 0.14
98 0.16
99 0.17
100 0.16
101 0.18
102 0.2
103 0.22
104 0.18
105 0.17
106 0.17
107 0.18
108 0.21
109 0.21
110 0.2
111 0.18
112 0.21
113 0.21
114 0.2
115 0.21
116 0.2
117 0.21
118 0.2
119 0.22
120 0.22
121 0.27
122 0.29
123 0.3
124 0.3
125 0.28
126 0.28
127 0.24
128 0.24
129 0.2
130 0.17
131 0.13
132 0.11
133 0.09
134 0.09
135 0.11
136 0.1
137 0.14
138 0.17
139 0.18
140 0.22
141 0.32
142 0.35
143 0.37
144 0.38
145 0.39
146 0.43
147 0.46
148 0.43
149 0.34
150 0.33
151 0.35
152 0.37
153 0.36
154 0.35
155 0.33
156 0.36
157 0.45
158 0.53
159 0.56
160 0.57
161 0.54
162 0.5
163 0.48
164 0.43
165 0.33
166 0.26
167 0.21
168 0.23
169 0.28
170 0.35
171 0.45
172 0.54
173 0.63
174 0.67
175 0.73
176 0.77
177 0.8
178 0.83
179 0.82
180 0.8
181 0.75
182 0.74
183 0.68
184 0.62