Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C2ZI40

Protein Details
Accession A0A0C2ZI40    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
203-223ETVQTQRREQKRKKLDKVEVDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
70-91RGDGRGRGRGRGRGRGGETRGA
Subcellular Location(s) cyto 12, cyto_nucl 12, nucl 10, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007811  RPC4  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
Pfam View protein in Pfam  
PF05132  RNA_pol_Rpc4  
Amino Acid Sequences MTDNGAAGSQQAGPSSAPKAIGSLAKKQSDVTRQGTQRLKFVPTLPARRKKDEVKQEAPTENVQATPPARGDGRGRGRGRGRGRGGETRGAAPRPAQTEMIASGPFAMGPALAGTSARRTAPRSNFTSIVPLGLATGASLGNNLSNTPAPQLKRDKQHENSLGSTAEKESKRESDEEIYSEPDEGVEIVDMEDVGKLDWMAPETVQTQRREQKRKKLDKVEVDEPSIPSESKGKGREVTKNEDIANALDPSEEIELEDLIEDFAFHVNIGQEEGVRQERIYLFQFPDPFFTFVSNVAPLSATPMDTDTPEPGLSDTRQRTVSFAADVKPPAPMTTASTMAPANDAPTQTEPPKVDGIIGQLEVYRSGAVKMRLGNDILLDVSGATQASFLQQAAHLDMDHKQLHVLGEVNKRFVVSPDVDTLLAAMEAEDTVNAMNLDDPNLIRMDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.17
3 0.17
4 0.17
5 0.16
6 0.17
7 0.19
8 0.25
9 0.26
10 0.33
11 0.39
12 0.4
13 0.4
14 0.42
15 0.47
16 0.49
17 0.52
18 0.49
19 0.5
20 0.51
21 0.6
22 0.64
23 0.59
24 0.57
25 0.54
26 0.51
27 0.45
28 0.45
29 0.46
30 0.47
31 0.56
32 0.59
33 0.66
34 0.69
35 0.72
36 0.77
37 0.76
38 0.77
39 0.78
40 0.77
41 0.74
42 0.75
43 0.75
44 0.71
45 0.64
46 0.56
47 0.48
48 0.39
49 0.32
50 0.25
51 0.23
52 0.2
53 0.2
54 0.19
55 0.18
56 0.18
57 0.2
58 0.23
59 0.29
60 0.37
61 0.43
62 0.44
63 0.5
64 0.54
65 0.6
66 0.63
67 0.63
68 0.6
69 0.58
70 0.62
71 0.62
72 0.61
73 0.58
74 0.53
75 0.49
76 0.48
77 0.41
78 0.37
79 0.3
80 0.31
81 0.28
82 0.29
83 0.25
84 0.21
85 0.21
86 0.21
87 0.21
88 0.17
89 0.13
90 0.11
91 0.1
92 0.09
93 0.07
94 0.06
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.04
101 0.05
102 0.08
103 0.1
104 0.11
105 0.13
106 0.17
107 0.26
108 0.34
109 0.4
110 0.42
111 0.45
112 0.45
113 0.44
114 0.45
115 0.36
116 0.29
117 0.22
118 0.17
119 0.12
120 0.11
121 0.1
122 0.04
123 0.05
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.05
129 0.05
130 0.06
131 0.06
132 0.07
133 0.08
134 0.1
135 0.15
136 0.15
137 0.22
138 0.31
139 0.36
140 0.45
141 0.51
142 0.58
143 0.58
144 0.67
145 0.67
146 0.61
147 0.56
148 0.48
149 0.42
150 0.33
151 0.29
152 0.21
153 0.22
154 0.19
155 0.19
156 0.2
157 0.22
158 0.24
159 0.25
160 0.26
161 0.24
162 0.25
163 0.26
164 0.23
165 0.22
166 0.2
167 0.19
168 0.15
169 0.1
170 0.09
171 0.07
172 0.06
173 0.04
174 0.04
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.04
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.04
185 0.04
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.07
190 0.08
191 0.14
192 0.18
193 0.2
194 0.25
195 0.32
196 0.41
197 0.5
198 0.56
199 0.61
200 0.67
201 0.76
202 0.79
203 0.82
204 0.81
205 0.79
206 0.78
207 0.75
208 0.65
209 0.57
210 0.49
211 0.4
212 0.33
213 0.25
214 0.18
215 0.12
216 0.14
217 0.13
218 0.17
219 0.19
220 0.19
221 0.23
222 0.27
223 0.34
224 0.36
225 0.41
226 0.39
227 0.4
228 0.38
229 0.34
230 0.31
231 0.24
232 0.21
233 0.13
234 0.1
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.06
240 0.05
241 0.05
242 0.04
243 0.05
244 0.05
245 0.04
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.05
255 0.05
256 0.06
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.08
261 0.09
262 0.09
263 0.09
264 0.11
265 0.12
266 0.14
267 0.17
268 0.17
269 0.17
270 0.2
271 0.23
272 0.21
273 0.25
274 0.24
275 0.23
276 0.2
277 0.2
278 0.18
279 0.16
280 0.17
281 0.13
282 0.11
283 0.1
284 0.09
285 0.08
286 0.11
287 0.11
288 0.09
289 0.09
290 0.1
291 0.11
292 0.12
293 0.13
294 0.1
295 0.11
296 0.11
297 0.11
298 0.1
299 0.12
300 0.12
301 0.2
302 0.21
303 0.23
304 0.26
305 0.26
306 0.27
307 0.26
308 0.27
309 0.22
310 0.21
311 0.2
312 0.21
313 0.22
314 0.2
315 0.2
316 0.18
317 0.16
318 0.15
319 0.14
320 0.15
321 0.17
322 0.18
323 0.16
324 0.18
325 0.17
326 0.16
327 0.16
328 0.12
329 0.11
330 0.12
331 0.12
332 0.13
333 0.16
334 0.2
335 0.21
336 0.26
337 0.25
338 0.25
339 0.27
340 0.24
341 0.22
342 0.19
343 0.2
344 0.17
345 0.16
346 0.14
347 0.13
348 0.13
349 0.12
350 0.12
351 0.09
352 0.08
353 0.09
354 0.13
355 0.14
356 0.17
357 0.2
358 0.22
359 0.24
360 0.25
361 0.24
362 0.2
363 0.19
364 0.16
365 0.12
366 0.09
367 0.07
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.06
375 0.07
376 0.07
377 0.08
378 0.09
379 0.11
380 0.13
381 0.13
382 0.12
383 0.13
384 0.16
385 0.21
386 0.2
387 0.19
388 0.18
389 0.19
390 0.19
391 0.2
392 0.21
393 0.22
394 0.31
395 0.33
396 0.35
397 0.33
398 0.33
399 0.32
400 0.3
401 0.29
402 0.22
403 0.23
404 0.25
405 0.27
406 0.26
407 0.25
408 0.23
409 0.17
410 0.14
411 0.1
412 0.06
413 0.05
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.05
418 0.05
419 0.06
420 0.06
421 0.06
422 0.08
423 0.09
424 0.11
425 0.13
426 0.13
427 0.14