Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A0C2ZC30

Protein Details
Accession A0A0C2ZC30    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
208-227NHRAGKKARARRERAQNAKFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
209-221HRAGKKARARRER
Subcellular Location(s) cyto_nucl 15.5, cyto 13.5, nucl 12.5
Family & Domain DBs
Pfam View protein in Pfam  
PF14223  Retrotran_gag_2  
Amino Acid Sequences ADEFDSWDEHNEKALGNITLRISPSIQTAIADLATVKEVWDHLKENYGAPSIGSAYAELSRLLTTTIPAGSHPAPAITKMLSHFAYLKDAGFEFPANVQAMIILCKLPPTMEVVAQILSQTSPSEIKTLKPDGIVKAATLSFEQKGASRGAGGKAPQANKLSAVKCKQADPKFAQQQQQQPQRQQQQQGGSNSSGSGNAPAQGQGGHNHRAGKKARARRERAQNAKFATYIHYEDGPVPTVNPHALAHTTGATNYGPPAFDNTVKAFNLAHRLGVEPSCQTIRTLDQVISTASASLDQPEASPSSLKRPCLKERIAMDVEEDTISLGDEEERPFIYEDFADSKFNEFNEMQASSSTRRRAPML
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.19
3 0.19
4 0.22
5 0.21
6 0.23
7 0.24
8 0.23
9 0.21
10 0.2
11 0.21
12 0.2
13 0.19
14 0.16
15 0.16
16 0.15
17 0.14
18 0.13
19 0.1
20 0.08
21 0.09
22 0.09
23 0.08
24 0.08
25 0.09
26 0.12
27 0.16
28 0.17
29 0.17
30 0.24
31 0.25
32 0.26
33 0.28
34 0.26
35 0.23
36 0.2
37 0.2
38 0.15
39 0.15
40 0.13
41 0.1
42 0.1
43 0.11
44 0.11
45 0.1
46 0.1
47 0.09
48 0.09
49 0.1
50 0.08
51 0.08
52 0.09
53 0.1
54 0.09
55 0.09
56 0.14
57 0.14
58 0.15
59 0.15
60 0.15
61 0.14
62 0.15
63 0.17
64 0.13
65 0.14
66 0.13
67 0.17
68 0.16
69 0.17
70 0.18
71 0.17
72 0.2
73 0.19
74 0.18
75 0.15
76 0.15
77 0.15
78 0.14
79 0.13
80 0.1
81 0.1
82 0.12
83 0.11
84 0.11
85 0.1
86 0.09
87 0.09
88 0.1
89 0.1
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.08
94 0.07
95 0.07
96 0.1
97 0.11
98 0.12
99 0.13
100 0.13
101 0.14
102 0.13
103 0.13
104 0.09
105 0.07
106 0.07
107 0.06
108 0.06
109 0.07
110 0.08
111 0.11
112 0.12
113 0.13
114 0.19
115 0.21
116 0.21
117 0.22
118 0.24
119 0.23
120 0.25
121 0.24
122 0.18
123 0.17
124 0.16
125 0.14
126 0.12
127 0.13
128 0.1
129 0.1
130 0.11
131 0.1
132 0.11
133 0.12
134 0.11
135 0.1
136 0.11
137 0.12
138 0.14
139 0.13
140 0.15
141 0.19
142 0.2
143 0.23
144 0.23
145 0.22
146 0.23
147 0.28
148 0.26
149 0.28
150 0.29
151 0.3
152 0.29
153 0.34
154 0.4
155 0.38
156 0.43
157 0.42
158 0.49
159 0.52
160 0.55
161 0.56
162 0.53
163 0.57
164 0.59
165 0.64
166 0.59
167 0.55
168 0.59
169 0.61
170 0.61
171 0.57
172 0.53
173 0.49
174 0.51
175 0.48
176 0.43
177 0.35
178 0.3
179 0.26
180 0.22
181 0.16
182 0.11
183 0.09
184 0.07
185 0.07
186 0.08
187 0.07
188 0.07
189 0.08
190 0.08
191 0.11
192 0.15
193 0.17
194 0.19
195 0.23
196 0.24
197 0.3
198 0.32
199 0.37
200 0.42
201 0.47
202 0.56
203 0.61
204 0.68
205 0.7
206 0.78
207 0.79
208 0.81
209 0.76
210 0.72
211 0.65
212 0.59
213 0.51
214 0.4
215 0.33
216 0.26
217 0.24
218 0.19
219 0.17
220 0.16
221 0.16
222 0.17
223 0.16
224 0.13
225 0.11
226 0.1
227 0.11
228 0.11
229 0.11
230 0.1
231 0.09
232 0.1
233 0.11
234 0.11
235 0.11
236 0.11
237 0.09
238 0.11
239 0.1
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.08
244 0.08
245 0.13
246 0.14
247 0.15
248 0.18
249 0.19
250 0.22
251 0.22
252 0.23
253 0.19
254 0.18
255 0.24
256 0.22
257 0.2
258 0.17
259 0.18
260 0.2
261 0.2
262 0.2
263 0.13
264 0.16
265 0.16
266 0.16
267 0.15
268 0.15
269 0.16
270 0.19
271 0.2
272 0.18
273 0.17
274 0.18
275 0.18
276 0.17
277 0.15
278 0.11
279 0.09
280 0.09
281 0.08
282 0.09
283 0.09
284 0.08
285 0.08
286 0.1
287 0.11
288 0.11
289 0.14
290 0.14
291 0.23
292 0.27
293 0.32
294 0.38
295 0.44
296 0.52
297 0.58
298 0.61
299 0.59
300 0.58
301 0.62
302 0.56
303 0.49
304 0.42
305 0.34
306 0.31
307 0.24
308 0.2
309 0.11
310 0.09
311 0.09
312 0.07
313 0.06
314 0.07
315 0.09
316 0.1
317 0.12
318 0.13
319 0.14
320 0.15
321 0.15
322 0.16
323 0.14
324 0.16
325 0.18
326 0.19
327 0.2
328 0.19
329 0.22
330 0.22
331 0.22
332 0.25
333 0.2
334 0.21
335 0.23
336 0.24
337 0.21
338 0.21
339 0.25
340 0.24
341 0.31
342 0.35
343 0.34