Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C2YLU8

Protein Details
Accession A0A0C2YLU8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
240-259SSSKGKSKEKDNKSKGSNNKHydrophilic
311-333AKDCPKSTSKSTKTKTRVARVETHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
244-254GKSKEKDNKSK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10.833, cyto 10, cyto_mito 8.999, nucl 8.5, mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032567  LDOC1-rel  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MSSGGGGGNSNPPSPGPPSIPFPNSPTLSNNTLTPDPLLLFTQAVQVLTRVALASADHNSSSGKTKVHEPDTFDGTDPHKLHTFLILCMLNFQNCPKAFAMDHAKVTYVQSYLRGMALKWFKLDLLNISNPNACPIWMDNYHQFISKLKSNFGPHDLIRDMEHQLDNLSMKEGQKINNLPDCIKDEISHVGKPHTLNGYHTLMQTIDARYWECKFKISHQTKNSVTTSLSSNSRGSASSSSSKGKSKEKDNKSKGSNNKSKSSSGSSGTSKSTTSNAPSHLGKDGKLTEEECQRCIKEKLCMFCSQPGHMAKDCPKSTSKSTKTKTRVARVETPTTAESKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.27
3 0.25
4 0.27
5 0.33
6 0.4
7 0.43
8 0.43
9 0.43
10 0.47
11 0.44
12 0.42
13 0.4
14 0.38
15 0.38
16 0.37
17 0.34
18 0.31
19 0.3
20 0.29
21 0.25
22 0.22
23 0.18
24 0.18
25 0.18
26 0.14
27 0.13
28 0.12
29 0.15
30 0.14
31 0.14
32 0.13
33 0.12
34 0.11
35 0.11
36 0.11
37 0.07
38 0.06
39 0.06
40 0.07
41 0.09
42 0.11
43 0.12
44 0.12
45 0.12
46 0.13
47 0.14
48 0.19
49 0.19
50 0.18
51 0.18
52 0.26
53 0.34
54 0.4
55 0.42
56 0.42
57 0.44
58 0.46
59 0.46
60 0.38
61 0.34
62 0.29
63 0.34
64 0.29
65 0.28
66 0.26
67 0.26
68 0.25
69 0.28
70 0.27
71 0.2
72 0.24
73 0.22
74 0.2
75 0.22
76 0.23
77 0.17
78 0.17
79 0.18
80 0.2
81 0.19
82 0.22
83 0.2
84 0.21
85 0.2
86 0.26
87 0.33
88 0.28
89 0.3
90 0.27
91 0.27
92 0.25
93 0.26
94 0.22
95 0.14
96 0.12
97 0.12
98 0.13
99 0.12
100 0.13
101 0.13
102 0.11
103 0.17
104 0.21
105 0.19
106 0.19
107 0.19
108 0.18
109 0.18
110 0.19
111 0.15
112 0.16
113 0.19
114 0.19
115 0.2
116 0.21
117 0.2
118 0.21
119 0.18
120 0.13
121 0.1
122 0.11
123 0.14
124 0.14
125 0.17
126 0.18
127 0.22
128 0.23
129 0.22
130 0.22
131 0.19
132 0.22
133 0.24
134 0.22
135 0.2
136 0.25
137 0.27
138 0.28
139 0.29
140 0.29
141 0.23
142 0.26
143 0.25
144 0.21
145 0.19
146 0.19
147 0.17
148 0.15
149 0.15
150 0.11
151 0.11
152 0.11
153 0.1
154 0.08
155 0.09
156 0.08
157 0.08
158 0.12
159 0.14
160 0.14
161 0.18
162 0.2
163 0.23
164 0.25
165 0.26
166 0.22
167 0.23
168 0.24
169 0.22
170 0.2
171 0.17
172 0.15
173 0.19
174 0.21
175 0.21
176 0.18
177 0.17
178 0.19
179 0.19
180 0.21
181 0.18
182 0.17
183 0.17
184 0.21
185 0.23
186 0.22
187 0.22
188 0.19
189 0.16
190 0.17
191 0.18
192 0.14
193 0.11
194 0.11
195 0.12
196 0.13
197 0.15
198 0.18
199 0.16
200 0.19
201 0.2
202 0.26
203 0.36
204 0.42
205 0.49
206 0.49
207 0.56
208 0.55
209 0.59
210 0.53
211 0.44
212 0.37
213 0.3
214 0.28
215 0.24
216 0.24
217 0.2
218 0.19
219 0.19
220 0.19
221 0.18
222 0.17
223 0.15
224 0.18
225 0.19
226 0.22
227 0.25
228 0.27
229 0.31
230 0.34
231 0.4
232 0.42
233 0.49
234 0.57
235 0.63
236 0.71
237 0.74
238 0.79
239 0.78
240 0.81
241 0.79
242 0.8
243 0.78
244 0.73
245 0.73
246 0.68
247 0.64
248 0.59
249 0.56
250 0.49
251 0.44
252 0.43
253 0.38
254 0.37
255 0.36
256 0.33
257 0.26
258 0.24
259 0.23
260 0.21
261 0.23
262 0.25
263 0.25
264 0.28
265 0.29
266 0.29
267 0.33
268 0.31
269 0.27
270 0.29
271 0.28
272 0.27
273 0.28
274 0.27
275 0.26
276 0.34
277 0.36
278 0.32
279 0.35
280 0.34
281 0.37
282 0.4
283 0.38
284 0.38
285 0.42
286 0.48
287 0.47
288 0.5
289 0.48
290 0.51
291 0.51
292 0.44
293 0.46
294 0.43
295 0.44
296 0.41
297 0.45
298 0.45
299 0.51
300 0.5
301 0.46
302 0.46
303 0.47
304 0.54
305 0.59
306 0.6
307 0.61
308 0.67
309 0.74
310 0.77
311 0.8
312 0.81
313 0.8
314 0.8
315 0.77
316 0.79
317 0.76
318 0.77
319 0.69
320 0.64
321 0.56