Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3D860

Protein Details
Accession A0A0C3D860    Localization Confidence Low Confidence Score 7.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-26MAAPSRPKPQRRAEPATRNNRPQAWTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 10.5, cyto_nucl 9.333, cyto_mito 8.666, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR009604  LsmAD_domain  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06741  LsmAD  
Amino Acid Sequences MAAPSRPKPQRRAEPATRNNRPQAWTGARPSPTFSPANSPARLPNGPPSSNQGAFPPLAGANGSRPQDGVQQDRIIQSLAGLTNSQRYEGVVSLTSPEGDKPGVTLKDAREISKPGTPLKDTLFIPSSNIDTWQSGPADAKVPNGDSFLIDTEISKGKTGRERELQAWRSSEDAHGSSSAAHNVPEGTGDEITFGAGAGANISWDQFATNEQMFGITTSFNEEVYTTRLDRNAPDFKEKERKAQRIASEIMGATTNNPHMAEERGLTLDDSGVNEEDKYGAVHRGANAYIPPGARKQQQQSAATGAPTTATPAPKAEIPKVSVNGPDGNVMAAQKEPTPPTTKSTSPAPSISSVNKPPADPLPAFRDFVTHERQRLTQKKQALVKSEMDKRKADLVKFSQTFKLNKPIPDDLVPILAKDTGKQQQIREKTSRDASSSCARAIGDAGSLSTSSSASRMPQATAKVAPEVTRKPTTPANVSAKPLAVAAITATPVPSSAKLPATTKPAEPGKTNGKATINMYIQPIPPFKGSKARSPAPQTNGATANAAVVPTSPTTTANRLNANASSFRPNPKANAFTPGPTSPNPSAASASASASPKPKAAEPTSSTPNPFFGNKPLKKSLVNVKDDFNPFKNNKVAEANTITALWPYSGKRYMNMFPPLPHQAPQQPAHMAPPGPPPVVHHVYEEGEQRFGYYYPPGQPMMPGMGPPPPGTYMSVPFMHHMPYPPGMPPNGQPMYAASPIPQIPPQYMQPPPTYAPPPNGAGPRPSMPPTPTPMHAHPYYHQSPQLQHAVPYAMMMPPGGPPPYDSGPAPPMGGVSHA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.89
3 0.91
4 0.9
5 0.87
6 0.85
7 0.8
8 0.73
9 0.66
10 0.65
11 0.62
12 0.6
13 0.58
14 0.58
15 0.56
16 0.54
17 0.55
18 0.49
19 0.46
20 0.41
21 0.36
22 0.37
23 0.42
24 0.48
25 0.44
26 0.42
27 0.42
28 0.47
29 0.47
30 0.41
31 0.42
32 0.43
33 0.43
34 0.43
35 0.46
36 0.46
37 0.46
38 0.44
39 0.36
40 0.32
41 0.3
42 0.29
43 0.24
44 0.16
45 0.15
46 0.15
47 0.14
48 0.15
49 0.22
50 0.23
51 0.21
52 0.21
53 0.22
54 0.28
55 0.32
56 0.33
57 0.32
58 0.33
59 0.36
60 0.36
61 0.36
62 0.3
63 0.24
64 0.19
65 0.17
66 0.15
67 0.13
68 0.13
69 0.13
70 0.19
71 0.19
72 0.2
73 0.16
74 0.16
75 0.18
76 0.18
77 0.19
78 0.14
79 0.14
80 0.15
81 0.15
82 0.15
83 0.13
84 0.13
85 0.12
86 0.12
87 0.11
88 0.11
89 0.18
90 0.18
91 0.2
92 0.25
93 0.24
94 0.33
95 0.35
96 0.35
97 0.32
98 0.34
99 0.35
100 0.35
101 0.36
102 0.32
103 0.36
104 0.36
105 0.35
106 0.35
107 0.38
108 0.34
109 0.37
110 0.34
111 0.29
112 0.29
113 0.27
114 0.26
115 0.21
116 0.22
117 0.18
118 0.17
119 0.18
120 0.2
121 0.19
122 0.17
123 0.18
124 0.18
125 0.2
126 0.19
127 0.2
128 0.18
129 0.2
130 0.2
131 0.2
132 0.19
133 0.15
134 0.16
135 0.15
136 0.14
137 0.12
138 0.11
139 0.13
140 0.17
141 0.17
142 0.17
143 0.17
144 0.21
145 0.28
146 0.33
147 0.37
148 0.4
149 0.44
150 0.48
151 0.58
152 0.58
153 0.54
154 0.52
155 0.45
156 0.39
157 0.36
158 0.31
159 0.25
160 0.21
161 0.18
162 0.16
163 0.16
164 0.15
165 0.15
166 0.17
167 0.13
168 0.12
169 0.11
170 0.11
171 0.11
172 0.11
173 0.11
174 0.1
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.09
179 0.09
180 0.08
181 0.06
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.04
192 0.05
193 0.05
194 0.06
195 0.1
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.11
200 0.11
201 0.11
202 0.1
203 0.06
204 0.06
205 0.1
206 0.11
207 0.1
208 0.1
209 0.1
210 0.11
211 0.13
212 0.16
213 0.13
214 0.15
215 0.17
216 0.18
217 0.2
218 0.26
219 0.31
220 0.31
221 0.37
222 0.37
223 0.42
224 0.51
225 0.5
226 0.54
227 0.56
228 0.6
229 0.58
230 0.63
231 0.59
232 0.54
233 0.55
234 0.46
235 0.38
236 0.31
237 0.26
238 0.2
239 0.16
240 0.11
241 0.11
242 0.1
243 0.09
244 0.1
245 0.09
246 0.1
247 0.12
248 0.13
249 0.11
250 0.12
251 0.12
252 0.12
253 0.11
254 0.1
255 0.09
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.08
268 0.09
269 0.1
270 0.11
271 0.13
272 0.13
273 0.13
274 0.12
275 0.11
276 0.12
277 0.11
278 0.12
279 0.13
280 0.17
281 0.21
282 0.26
283 0.3
284 0.35
285 0.41
286 0.41
287 0.4
288 0.41
289 0.37
290 0.31
291 0.26
292 0.2
293 0.13
294 0.11
295 0.12
296 0.1
297 0.1
298 0.1
299 0.11
300 0.13
301 0.15
302 0.18
303 0.18
304 0.19
305 0.21
306 0.24
307 0.24
308 0.24
309 0.23
310 0.22
311 0.21
312 0.18
313 0.16
314 0.13
315 0.11
316 0.11
317 0.09
318 0.08
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.09
323 0.1
324 0.12
325 0.17
326 0.18
327 0.21
328 0.25
329 0.25
330 0.25
331 0.3
332 0.31
333 0.29
334 0.29
335 0.27
336 0.25
337 0.26
338 0.26
339 0.25
340 0.24
341 0.26
342 0.26
343 0.24
344 0.24
345 0.24
346 0.25
347 0.21
348 0.21
349 0.23
350 0.24
351 0.24
352 0.22
353 0.21
354 0.2
355 0.23
356 0.27
357 0.23
358 0.24
359 0.25
360 0.28
361 0.36
362 0.42
363 0.45
364 0.43
365 0.46
366 0.49
367 0.54
368 0.54
369 0.51
370 0.46
371 0.44
372 0.45
373 0.49
374 0.48
375 0.45
376 0.41
377 0.37
378 0.41
379 0.4
380 0.34
381 0.32
382 0.32
383 0.37
384 0.38
385 0.38
386 0.35
387 0.36
388 0.38
389 0.33
390 0.38
391 0.34
392 0.34
393 0.37
394 0.34
395 0.32
396 0.31
397 0.3
398 0.21
399 0.21
400 0.18
401 0.14
402 0.12
403 0.12
404 0.1
405 0.09
406 0.14
407 0.15
408 0.2
409 0.23
410 0.25
411 0.31
412 0.37
413 0.42
414 0.42
415 0.39
416 0.39
417 0.42
418 0.4
419 0.35
420 0.31
421 0.28
422 0.29
423 0.28
424 0.24
425 0.2
426 0.18
427 0.16
428 0.16
429 0.12
430 0.07
431 0.06
432 0.06
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.04
438 0.04
439 0.05
440 0.06
441 0.06
442 0.09
443 0.1
444 0.11
445 0.14
446 0.15
447 0.16
448 0.17
449 0.17
450 0.15
451 0.15
452 0.16
453 0.18
454 0.19
455 0.22
456 0.24
457 0.24
458 0.25
459 0.28
460 0.3
461 0.29
462 0.34
463 0.35
464 0.35
465 0.36
466 0.35
467 0.31
468 0.28
469 0.24
470 0.17
471 0.09
472 0.07
473 0.06
474 0.05
475 0.05
476 0.05
477 0.05
478 0.04
479 0.05
480 0.06
481 0.06
482 0.07
483 0.1
484 0.12
485 0.14
486 0.16
487 0.18
488 0.23
489 0.24
490 0.23
491 0.27
492 0.29
493 0.3
494 0.29
495 0.31
496 0.34
497 0.37
498 0.38
499 0.35
500 0.32
501 0.32
502 0.32
503 0.34
504 0.27
505 0.23
506 0.25
507 0.23
508 0.22
509 0.23
510 0.23
511 0.18
512 0.2
513 0.2
514 0.19
515 0.27
516 0.28
517 0.33
518 0.39
519 0.41
520 0.45
521 0.51
522 0.56
523 0.51
524 0.57
525 0.5
526 0.46
527 0.44
528 0.38
529 0.31
530 0.25
531 0.21
532 0.13
533 0.12
534 0.08
535 0.06
536 0.07
537 0.06
538 0.07
539 0.07
540 0.09
541 0.11
542 0.16
543 0.2
544 0.22
545 0.24
546 0.25
547 0.26
548 0.26
549 0.26
550 0.24
551 0.22
552 0.25
553 0.25
554 0.28
555 0.31
556 0.31
557 0.33
558 0.36
559 0.39
560 0.34
561 0.39
562 0.35
563 0.32
564 0.35
565 0.32
566 0.3
567 0.25
568 0.31
569 0.25
570 0.28
571 0.28
572 0.24
573 0.24
574 0.21
575 0.23
576 0.17
577 0.17
578 0.17
579 0.17
580 0.18
581 0.19
582 0.2
583 0.2
584 0.2
585 0.22
586 0.25
587 0.27
588 0.33
589 0.35
590 0.4
591 0.45
592 0.45
593 0.44
594 0.38
595 0.36
596 0.31
597 0.29
598 0.24
599 0.27
600 0.36
601 0.38
602 0.44
603 0.48
604 0.48
605 0.48
606 0.51
607 0.53
608 0.51
609 0.53
610 0.48
611 0.46
612 0.5
613 0.53
614 0.52
615 0.44
616 0.44
617 0.38
618 0.42
619 0.44
620 0.38
621 0.37
622 0.38
623 0.37
624 0.34
625 0.36
626 0.32
627 0.27
628 0.27
629 0.23
630 0.17
631 0.16
632 0.11
633 0.1
634 0.11
635 0.16
636 0.21
637 0.21
638 0.24
639 0.29
640 0.33
641 0.38
642 0.43
643 0.39
644 0.36
645 0.41
646 0.44
647 0.41
648 0.39
649 0.36
650 0.35
651 0.4
652 0.41
653 0.4
654 0.35
655 0.34
656 0.35
657 0.34
658 0.29
659 0.25
660 0.3
661 0.29
662 0.27
663 0.27
664 0.27
665 0.32
666 0.36
667 0.34
668 0.28
669 0.27
670 0.28
671 0.31
672 0.34
673 0.27
674 0.23
675 0.22
676 0.21
677 0.19
678 0.18
679 0.17
680 0.14
681 0.17
682 0.21
683 0.24
684 0.25
685 0.24
686 0.24
687 0.24
688 0.25
689 0.21
690 0.17
691 0.15
692 0.18
693 0.19
694 0.19
695 0.19
696 0.17
697 0.18
698 0.2
699 0.22
700 0.22
701 0.25
702 0.26
703 0.25
704 0.25
705 0.24
706 0.23
707 0.23
708 0.22
709 0.22
710 0.22
711 0.23
712 0.24
713 0.26
714 0.26
715 0.27
716 0.26
717 0.32
718 0.31
719 0.29
720 0.26
721 0.26
722 0.3
723 0.29
724 0.27
725 0.18
726 0.21
727 0.23
728 0.25
729 0.25
730 0.21
731 0.22
732 0.25
733 0.29
734 0.3
735 0.33
736 0.35
737 0.35
738 0.38
739 0.38
740 0.4
741 0.42
742 0.39
743 0.4
744 0.4
745 0.4
746 0.42
747 0.44
748 0.4
749 0.38
750 0.39
751 0.37
752 0.38
753 0.38
754 0.37
755 0.36
756 0.39
757 0.42
758 0.42
759 0.44
760 0.46
761 0.46
762 0.49
763 0.48
764 0.47
765 0.44
766 0.48
767 0.47
768 0.46
769 0.46
770 0.43
771 0.43
772 0.46
773 0.51
774 0.43
775 0.41
776 0.38
777 0.36
778 0.31
779 0.29
780 0.23
781 0.15
782 0.14
783 0.13
784 0.11
785 0.11
786 0.14
787 0.14
788 0.13
789 0.14
790 0.2
791 0.24
792 0.26
793 0.25
794 0.26
795 0.29
796 0.3
797 0.29
798 0.22
799 0.2