FuNGI

A0A0C3E0H8

Protein Details

Accession

A0A0C3E0H8

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1089-1110	VKAKYFRSTRPSKKLSEKNLGP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto_nucl 11.5, cyto 4, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016197 Chromo-like_dom_sf IPR000953 Chromo/chromo_shadow_dom IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR021109 Peptidase_aspartic_dom_sf IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom IPR041373 RT_RNaseH
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF17921 Integrase_H2C2 PF17917 RT_RNaseH PF08284 RVP_2 PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50013 CHROMO_2 PS50994 INTEGRASE PS50878 RT_POL
CDD	cd00303 retropepsin_like cd09274 RNase_HI_RT_Ty3 cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

RGKKRVSSPLDSAQPGSCIDSGSAPMEAHLNASALSDPNALIPHVSVLSYNLENICALVDSGSTHCFVDLQFAHQNKFTTHTISPVTLRLFDGSSNFVITQAVDLSILFPATGDVTPMNFYLAPLDSECKIVLGHNWLTHFNPLIDWVLSSIEFRTFAGSLPVPPSTPSPDPPGKSVPGLPDRSDPGLVPSSPAPPSLAPSVDVLVCTPPHISLVNAVAFTRACKLEGSVKYQLQLRPSGEVKGRSSSTSPAPDLSSVPPEYCDYADVFSKAKASELPPHCNYDLKIDLEEGTSPPLGTLYSLSPVKLSALRTFIDKNLGTGFIRPTASSHAAPVLFVKKKDGSLWLCIDFRGLNKITKKDRYPLPLISNLLDSPSQAKIYSKVDLRHAYHLVRIAPGDEWKTAFHTRYGSYEWLVMPFGLTNAPAAFQRFVNTIFADMLDVCVVMYLDDILIYSGDMKSHQQHVREVLHRLRLHHLFAKLEKCKFHSDSIEYLGYCLSPEGLTMSLDKITTIADWPEPRKVKDIQLFLDFANFYHWFIFNYSDIMVPLTRLTWKDAPWNFSEECCCSFNALKHAFTTAPILTHFIPDTSITMETDASDYAAAGILSITCADGELHLVAFYSQTLTAPELNYDTHDKELLAIFEAFWTWRHYLEGSATPVDVITDHKNLEYFSTSKVLTRWQAWWSEFLSSFNLIICFRPGKLGAKPDTLTRRWDVYPKEGDSGYTRVNPQNLWPVFTQEQLANSLRATYLEFLVLRAVAIMDIETLHSDILTTLPSDPIAQAHVSDTAESRWSVDESGFLRLDQCIYVPDIEDLRLRVLRNKHDHPISGHYGQNRTMDLIRHKYTWPRIRTMVKDYVRSCTTCAQSKAPCHRPYGLLKQLPIPEKPWNSISMDFIEQLPSSSGFTAILVIIDWLSKQSIFIPTHDTITSSELTKLFLLHVFSKHGVPAHVISNRGTEFVSHFFRSLGKALDMRLHFTSSYHPEGDGQTKRANQTLKQYLRSYCNYQQDNCATTGVSPFFANKGYHPNISVYPERDMTSARAREYAVDLDSLHQYLHEEMANTQLRYQGPADAKRSPAPDFKVSNQVYVKAKYFRSTRPSKKLSEKNLGPYPIIAQVGSLSFTLCLPDSMRAVHPVFHVSQLEPAIPNTIPNRTQPPPPPVEVDGEPEFEISEILDSKIDRRHKTCKLLYLVWWSGYEGTDEETLWLLATELGNATELLDEYHSWYLDKPGPMAST

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.36
3	0.33
4	0.24
5	0.18
6	0.17
7	0.16
8	0.17
9	0.17
10	0.18
11	0.14
12	0.14
13	0.15
14	0.14
15	0.14
16	0.13
17	0.11
18	0.1
19	0.11
20	0.12
21	0.11
22	0.13
23	0.12
24	0.11
25	0.13
26	0.14
27	0.13
28	0.12
29	0.11
30	0.12
31	0.11
32	0.11
33	0.1
34	0.11
35	0.15
36	0.15
37	0.17
38	0.15
39	0.15
40	0.15
41	0.15
42	0.13
43	0.09
44	0.09
45	0.07
46	0.07
47	0.08
48	0.1
49	0.11
50	0.12
51	0.11
52	0.11
53	0.12
54	0.11
55	0.18
56	0.17
57	0.21
58	0.27
59	0.3
60	0.32
61	0.35
62	0.37
63	0.3
64	0.34
65	0.31
66	0.29
67	0.28
68	0.3
69	0.3
70	0.31
71	0.32
72	0.31
73	0.31
74	0.27
75	0.27
76	0.24
77	0.22
78	0.2
79	0.21
80	0.19
81	0.18
82	0.18
83	0.17
84	0.16
85	0.15
86	0.14
87	0.13
88	0.1
89	0.1
90	0.08
91	0.08
92	0.08
93	0.08
94	0.08
95	0.06
96	0.05
97	0.06
98	0.08
99	0.08
100	0.08
101	0.08
102	0.09
103	0.11
104	0.11
105	0.13
106	0.11
107	0.11
108	0.13
109	0.13
110	0.14
111	0.14
112	0.17
113	0.15
114	0.17
115	0.16
116	0.14
117	0.13
118	0.13
119	0.14
120	0.18
121	0.21
122	0.22
123	0.24
124	0.26
125	0.27
126	0.29
127	0.28
128	0.21
129	0.18
130	0.18
131	0.18
132	0.16
133	0.15
134	0.13
135	0.13
136	0.12
137	0.13
138	0.12
139	0.11
140	0.11
141	0.11
142	0.13
143	0.12
144	0.12
145	0.16
146	0.16
147	0.17
148	0.19
149	0.2
150	0.17
151	0.19
152	0.21
153	0.23
154	0.25
155	0.26
156	0.31
157	0.37
158	0.39
159	0.42
160	0.44
161	0.4
162	0.39
163	0.4
164	0.39
165	0.41
166	0.42
167	0.4
168	0.39
169	0.4
170	0.41
171	0.38
172	0.31
173	0.27
174	0.27
175	0.25
176	0.23
177	0.21
178	0.22
179	0.22
180	0.22
181	0.2
182	0.16
183	0.19
184	0.2
185	0.19
186	0.17
187	0.17
188	0.18
189	0.16
190	0.16
191	0.13
192	0.12
193	0.12
194	0.12
195	0.11
196	0.1
197	0.11
198	0.11
199	0.11
200	0.12
201	0.15
202	0.16
203	0.16
204	0.15
205	0.15
206	0.14
207	0.15
208	0.16
209	0.13
210	0.12
211	0.12
212	0.15
213	0.22
214	0.26
215	0.32
216	0.35
217	0.36
218	0.38
219	0.43
220	0.43
221	0.37
222	0.39
223	0.34
224	0.32
225	0.32
226	0.35
227	0.34
228	0.37
229	0.36
230	0.36
231	0.36
232	0.33
233	0.34
234	0.32
235	0.33
236	0.33
237	0.31
238	0.28
239	0.28
240	0.26
241	0.27
242	0.25
243	0.25
244	0.21
245	0.2
246	0.2
247	0.2
248	0.2
249	0.18
250	0.17
251	0.13
252	0.14
253	0.15
254	0.15
255	0.15
256	0.14
257	0.16
258	0.14
259	0.14
260	0.16
261	0.17
262	0.25
263	0.3
264	0.38
265	0.38
266	0.43
267	0.43
268	0.43
269	0.4
270	0.37
271	0.35
272	0.29
273	0.27
274	0.23
275	0.23
276	0.21
277	0.21
278	0.15
279	0.13
280	0.11
281	0.1
282	0.09
283	0.09
284	0.08
285	0.07
286	0.09
287	0.07
288	0.12
289	0.12
290	0.12
291	0.12
292	0.13
293	0.14
294	0.16
295	0.17
296	0.16
297	0.18
298	0.18
299	0.21
300	0.23
301	0.22
302	0.26
303	0.23
304	0.21
305	0.2
306	0.22
307	0.19
308	0.2
309	0.2
310	0.17
311	0.17
312	0.16
313	0.16
314	0.2
315	0.23
316	0.21
317	0.21
318	0.2
319	0.2
320	0.2
321	0.21
322	0.23
323	0.23
324	0.23
325	0.26
326	0.25
327	0.26
328	0.28
329	0.32
330	0.28
331	0.3
332	0.33
333	0.32
334	0.3
335	0.29
336	0.29
337	0.22
338	0.2
339	0.21
340	0.19
341	0.21
342	0.26
343	0.34
344	0.4
345	0.46
346	0.49
347	0.5
348	0.55
349	0.56
350	0.56
351	0.55
352	0.52
353	0.5
354	0.48
355	0.41
356	0.36
357	0.29
358	0.26
359	0.2
360	0.15
361	0.13
362	0.12
363	0.12
364	0.11
365	0.12
366	0.14
367	0.17
368	0.21
369	0.23
370	0.24
371	0.3
372	0.36
373	0.38
374	0.39
375	0.4
376	0.36
377	0.34
378	0.34
379	0.29
380	0.23
381	0.21
382	0.16
383	0.14
384	0.16
385	0.16
386	0.13
387	0.14
388	0.13
389	0.18
390	0.2
391	0.2
392	0.19
393	0.2
394	0.2
395	0.22
396	0.25
397	0.22
398	0.2
399	0.21
400	0.19
401	0.17
402	0.16
403	0.13
404	0.1
405	0.08
406	0.08
407	0.06
408	0.06
409	0.05
410	0.05
411	0.06
412	0.06
413	0.08
414	0.09
415	0.09
416	0.1
417	0.11
418	0.12
419	0.13
420	0.13
421	0.12
422	0.11
423	0.11
424	0.1
425	0.08
426	0.08
427	0.06
428	0.05
429	0.04
430	0.04
431	0.04
432	0.03
433	0.03
434	0.03
435	0.03
436	0.03
437	0.03
438	0.03
439	0.03
440	0.03
441	0.04
442	0.04
443	0.04
444	0.06
445	0.07
446	0.1
447	0.18
448	0.22
449	0.23
450	0.25
451	0.3
452	0.35
453	0.37
454	0.39
455	0.35
456	0.4
457	0.4
458	0.4
459	0.4
460	0.36
461	0.36
462	0.35
463	0.34
464	0.28
465	0.3
466	0.37
467	0.36
468	0.37
469	0.36
470	0.34
471	0.39
472	0.39
473	0.38
474	0.34
475	0.32
476	0.31
477	0.33
478	0.32
479	0.25
480	0.23
481	0.19
482	0.15
483	0.12
484	0.09
485	0.06
486	0.04
487	0.04
488	0.05
489	0.05
490	0.06
491	0.06
492	0.07
493	0.07
494	0.07
495	0.07
496	0.06
497	0.06
498	0.06
499	0.06
500	0.06
501	0.08
502	0.11
503	0.13
504	0.21
505	0.23
506	0.24
507	0.27
508	0.29
509	0.33
510	0.37
511	0.38
512	0.33
513	0.33
514	0.33
515	0.29
516	0.29
517	0.21
518	0.15
519	0.16
520	0.14
521	0.12
522	0.12
523	0.12
524	0.1
525	0.11
526	0.13
527	0.1
528	0.1
529	0.1
530	0.09
531	0.09
532	0.09
533	0.08
534	0.07
535	0.06
536	0.06
537	0.07
538	0.08
539	0.12
540	0.14
541	0.15
542	0.23
543	0.25
544	0.27
545	0.27
546	0.31
547	0.27
548	0.25
549	0.27
550	0.2
551	0.2
552	0.18
553	0.17
554	0.15
555	0.16
556	0.18
557	0.23
558	0.24
559	0.21
560	0.21
561	0.22
562	0.2
563	0.19
564	0.19
565	0.12
566	0.1
567	0.1
568	0.12
569	0.1
570	0.11
571	0.11
572	0.08
573	0.08
574	0.08
575	0.08
576	0.07
577	0.08
578	0.07
579	0.07
580	0.07
581	0.07
582	0.07
583	0.06
584	0.05
585	0.04
586	0.04
587	0.04
588	0.04
589	0.04
590	0.03
591	0.03
592	0.03
593	0.03
594	0.03
595	0.03
596	0.02
597	0.03
598	0.03
599	0.03
600	0.04
601	0.04
602	0.04
603	0.04
604	0.04
605	0.03
606	0.04
607	0.04
608	0.04
609	0.04
610	0.04
611	0.05
612	0.06
613	0.07
614	0.07
615	0.07
616	0.08
617	0.08
618	0.09
619	0.11
620	0.11
621	0.11
622	0.11
623	0.1
624	0.1
625	0.11
626	0.09
627	0.08
628	0.07
629	0.07
630	0.06
631	0.07
632	0.06
633	0.06
634	0.09
635	0.08
636	0.08
637	0.09
638	0.1
639	0.1
640	0.12
641	0.14
642	0.13
643	0.12
644	0.12
645	0.11
646	0.1
647	0.1
648	0.08
649	0.08
650	0.09
651	0.1
652	0.1
653	0.11
654	0.11
655	0.11
656	0.12
657	0.12
658	0.1
659	0.1
660	0.13
661	0.13
662	0.13
663	0.14
664	0.16
665	0.16
666	0.17
667	0.18
668	0.18
669	0.22
670	0.21
671	0.23
672	0.2
673	0.2
674	0.19
675	0.17
676	0.17
677	0.13
678	0.13
679	0.11
680	0.11
681	0.09
682	0.09
683	0.1
684	0.09
685	0.09
686	0.1
687	0.11
688	0.14
689	0.16
690	0.22
691	0.23
692	0.26
693	0.27
694	0.3
695	0.35
696	0.33
697	0.34
698	0.3
699	0.3
700	0.28
701	0.33
702	0.3
703	0.3
704	0.34
705	0.32
706	0.32
707	0.29
708	0.28
709	0.26
710	0.26
711	0.21
712	0.18
713	0.19
714	0.19
715	0.21
716	0.2
717	0.19
718	0.26
719	0.24
720	0.24
721	0.22
722	0.25
723	0.24
724	0.25
725	0.24
726	0.15
727	0.16
728	0.17
729	0.18
730	0.14
731	0.13
732	0.12
733	0.11
734	0.11
735	0.11
736	0.08
737	0.07
738	0.08
739	0.08
740	0.08
741	0.08
742	0.08
743	0.06
744	0.05
745	0.05
746	0.03
747	0.03
748	0.03
749	0.03
750	0.03
751	0.03
752	0.04
753	0.04
754	0.04
755	0.04
756	0.04
757	0.04
758	0.04
759	0.04
760	0.05
761	0.05
762	0.05
763	0.06
764	0.06
765	0.06
766	0.06
767	0.08
768	0.07
769	0.07
770	0.08
771	0.09
772	0.09
773	0.09
774	0.09
775	0.09
776	0.1
777	0.1
778	0.1
779	0.09
780	0.09
781	0.09
782	0.09
783	0.12
784	0.12
785	0.16
786	0.15
787	0.14
788	0.14
789	0.14
790	0.14
791	0.11
792	0.1
793	0.07
794	0.08
795	0.08
796	0.08
797	0.09
798	0.09
799	0.1
800	0.11
801	0.1
802	0.12
803	0.14
804	0.14
805	0.19
806	0.24
807	0.32
808	0.38
809	0.42
810	0.47
811	0.47
812	0.49
813	0.46
814	0.47
815	0.44
816	0.4
817	0.38
818	0.35
819	0.34
820	0.34
821	0.33
822	0.26
823	0.23
824	0.21
825	0.23
826	0.26
827	0.3
828	0.3
829	0.3
830	0.32
831	0.37
832	0.45
833	0.49
834	0.47
835	0.45
836	0.5
837	0.54
838	0.57
839	0.57
840	0.57
841	0.51
842	0.54
843	0.51
844	0.5
845	0.46
846	0.42
847	0.37
848	0.34
849	0.34
850	0.33
851	0.35
852	0.35
853	0.38
854	0.46
855	0.53
856	0.56
857	0.56
858	0.53
859	0.53
860	0.52
861	0.54
862	0.55
863	0.54
864	0.48
865	0.45
866	0.47
867	0.5
868	0.48
869	0.43
870	0.36
871	0.35
872	0.35
873	0.37
874	0.33
875	0.3
876	0.3
877	0.3
878	0.29
879	0.23
880	0.22
881	0.2
882	0.18
883	0.18
884	0.14
885	0.14
886	0.13
887	0.11
888	0.1
889	0.1
890	0.1
891	0.08
892	0.08
893	0.08
894	0.07
895	0.06
896	0.05
897	0.05
898	0.05
899	0.05
900	0.05
901	0.05
902	0.05
903	0.05
904	0.06
905	0.08
906	0.15
907	0.16
908	0.17
909	0.23
910	0.23
911	0.26
912	0.26
913	0.25
914	0.19
915	0.2
916	0.2
917	0.15
918	0.17
919	0.15
920	0.16
921	0.15
922	0.14
923	0.13
924	0.13
925	0.15
926	0.15
927	0.17
928	0.19
929	0.2
930	0.2
931	0.21
932	0.2
933	0.18
934	0.17
935	0.18
936	0.2
937	0.21
938	0.22
939	0.21
940	0.24
941	0.24
942	0.22
943	0.2
944	0.15
945	0.16
946	0.19
947	0.23
948	0.2
949	0.2
950	0.2
951	0.21
952	0.23
953	0.22
954	0.2
955	0.17
956	0.18
957	0.18
958	0.24
959	0.24
960	0.25
961	0.24
962	0.24
963	0.21
964	0.21
965	0.26
966	0.24
967	0.28
968	0.24
969	0.23
970	0.24
971	0.27
972	0.34
973	0.32
974	0.3
975	0.31
976	0.34
977	0.35
978	0.39
979	0.39
980	0.35
981	0.41
982	0.48
983	0.49
984	0.51
985	0.54
986	0.54
987	0.57
988	0.58
989	0.56
990	0.53
991	0.56
992	0.55
993	0.52
994	0.54
995	0.52
996	0.5
997	0.43
998	0.36
999	0.27
1000	0.24
1001	0.26
1002	0.19
1003	0.16
1004	0.14
1005	0.13
1006	0.14
1007	0.17
1008	0.18
1009	0.16
1010	0.24
1011	0.26
1012	0.28
1013	0.28
1014	0.3
1015	0.29
1016	0.34
1017	0.37
1018	0.3
1019	0.3
1020	0.3
1021	0.3
1022	0.28
1023	0.27
1024	0.26
1025	0.3
1026	0.31
1027	0.29
1028	0.29
1029	0.28
1030	0.29
1031	0.3
1032	0.29
1033	0.2
1034	0.18
1035	0.17
1036	0.17
1037	0.18
1038	0.17
1039	0.14
1040	0.11
1041	0.11
1042	0.11
1043	0.13
1044	0.12
1045	0.11
1046	0.11
1047	0.2
1048	0.24
1049	0.23
1050	0.23
1051	0.26
1052	0.25
1053	0.27
1054	0.28
1055	0.26
1056	0.28
1057	0.35
1058	0.39
1059	0.38
1060	0.41
1061	0.43
1062	0.45
1063	0.43
1064	0.43
1065	0.42
1066	0.45
1067	0.46
1068	0.46
1069	0.52
1070	0.49
1071	0.52
1072	0.47
1073	0.47
1074	0.44
1075	0.43
1076	0.45
1077	0.41
1078	0.42
1079	0.42
1080	0.45
1081	0.47
1082	0.52
1083	0.59
1084	0.64
1085	0.69
1086	0.73
1087	0.74
1088	0.8
1089	0.81
1090	0.81
1091	0.81
1092	0.77
1093	0.75
1094	0.76
1095	0.7
1096	0.6
1097	0.51
1098	0.44
1099	0.38
1100	0.33
1101	0.23
1102	0.16
1103	0.15
1104	0.15
1105	0.15
1106	0.13
1107	0.09
1108	0.08
1109	0.09
1110	0.1
1111	0.09
1112	0.1
1113	0.1
1114	0.13
1115	0.14
1116	0.17
1117	0.19
1118	0.23
1119	0.23
1120	0.24
1121	0.24
1122	0.26
1123	0.26
1124	0.27
1125	0.27
1126	0.22
1127	0.25
1128	0.24
1129	0.24
1130	0.21
1131	0.2
1132	0.2
1133	0.18
1134	0.21
1135	0.2
1136	0.25
1137	0.25
1138	0.29
1139	0.36
1140	0.35
1141	0.44
1142	0.47
1143	0.53
1144	0.53
1145	0.54
1146	0.54
1147	0.49
1148	0.51
1149	0.44
1150	0.43
1151	0.36
1152	0.32
1153	0.3
1154	0.25
1155	0.22
1156	0.17
1157	0.16
1158	0.1
1159	0.1
1160	0.08
1161	0.09
1162	0.11
1163	0.11
1164	0.15
1165	0.23
1166	0.31
1167	0.36
1168	0.42
1169	0.51
1170	0.58
1171	0.68
1172	0.71
1173	0.72
1174	0.72
1175	0.69
1176	0.68
1177	0.67
1178	0.61
1179	0.53
1180	0.47
1181	0.39
1182	0.33
1183	0.29
1184	0.25
1185	0.16
1186	0.15
1187	0.14
1188	0.14
1189	0.13
1190	0.13
1191	0.12
1192	0.11
1193	0.1
1194	0.08
1195	0.09
1196	0.09
1197	0.09
1198	0.08
1199	0.09
1200	0.09
1201	0.09
1202	0.09
1203	0.08
1204	0.08
1205	0.08
1206	0.09
1207	0.1
1208	0.13
1209	0.16
1210	0.15
1211	0.15
1212	0.16
1213	0.22
1214	0.26
1215	0.28
1216	0.25

A0A0C3E0H8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer