FuNGI

A0A0C3DCI0

Protein Details

Accession

A0A0C3DCI0

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
6-28	AESLLFHKKKPVIKKEPSATPPS	Hydrophilic
166-188	KGAANGKKKMQRKTRQVFKVPED	Hydrophilic
237-261	FVPAHRWYKFHKKPKHRIPDLEEAE	Basic
585-610	AASNGTAPPKPKKRKPLPPGPIDGEL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
165-178	GKGAANGKKKMQRK
592-601	PPKPKKRKPL

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MPPRSAESLLFHKKKPVIKKEPSATPPSGSQGTPTPGSPRKSLPPRPQPAPAGVDADDSSKLPEGEFSEYKLMTSALNGWKYDIMRFDSRKMVDISTWEAPIKLNRRDLRKPEAVSAPVPVAPMLGPDGKPVIGLDGKLVMVDADGRPISNTPGEGTSKDTQQKGKGAANGKKKMQRKTRQVFKVPEDVRQLRKEERYPWVMEDARRNEIWVGQLEEVSRAETHALFMPALQDVFKFVPAHRWYKFHKKPKHRIPDLEEAESLMARIQKNKDPERWLLHRRNGQGPSAATTAMFKADPDSVVAGAPLVYSATQSRGPGGRSLMSVNRGSRGLDEEDGEGASRRPKNDDGEGHLDEQLFEDDVADDDEHEAADMDDEEAKELEERLKREYRMANKQREGYIDESEEEEDGDSQLTKDGKSLKKLMRKLEKNVVYDSDEERNPYASSDENEEEEEPPVASNEPAIQPQPQQAKSRPASQQPSPKPAAGSAMNGSNVASRAVSPAPASGMGGHSVVAKRATSPKAPKPSVSRGNSPLSGPPGTSSQAGSPSGSRATSPVAGASKGASGTPSTNKRKAPDESGTASPAAASNGTAPPKPKKRKPLPPGPIDGELEERMLIEWLQSAPNASTRDCIQHFTPYLTSEAKKTRFTAMVKEVAQLKGGVLILKSALRGESATGSPAPAAAT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.6
2	0.65
3	0.66
4	0.66
5	0.72
6	0.8
7	0.81
8	0.84
9	0.83
10	0.8
11	0.71
12	0.64
13	0.57
14	0.52
15	0.46
16	0.36
17	0.33
18	0.31
19	0.32
20	0.31
21	0.3
22	0.33
23	0.37
24	0.41
25	0.42
26	0.42
27	0.48
28	0.57
29	0.66
30	0.68
31	0.72
32	0.76
33	0.78
34	0.8
35	0.74
36	0.69
37	0.64
38	0.55
39	0.48
40	0.39
41	0.36
42	0.29
43	0.27
44	0.22
45	0.18
46	0.17
47	0.15
48	0.15
49	0.12
50	0.15
51	0.16
52	0.22
53	0.23
54	0.24
55	0.27
56	0.26
57	0.26
58	0.24
59	0.22
60	0.15
61	0.15
62	0.19
63	0.21
64	0.25
65	0.25
66	0.25
67	0.29
68	0.29
69	0.31
70	0.28
71	0.27
72	0.32
73	0.35
74	0.37
75	0.41
76	0.41
77	0.43
78	0.41
79	0.37
80	0.3
81	0.3
82	0.32
83	0.27
84	0.27
85	0.23
86	0.22
87	0.22
88	0.28
89	0.33
90	0.34
91	0.4
92	0.44
93	0.52
94	0.61
95	0.67
96	0.68
97	0.68
98	0.65
99	0.62
100	0.62
101	0.56
102	0.48
103	0.43
104	0.36
105	0.28
106	0.26
107	0.19
108	0.14
109	0.1
110	0.1
111	0.11
112	0.12
113	0.11
114	0.12
115	0.14
116	0.13
117	0.13
118	0.12
119	0.13
120	0.12
121	0.12
122	0.11
123	0.11
124	0.11
125	0.11
126	0.11
127	0.07
128	0.06
129	0.08
130	0.07
131	0.09
132	0.09
133	0.09
134	0.1
135	0.11
136	0.13
137	0.12
138	0.13
139	0.11
140	0.15
141	0.17
142	0.17
143	0.22
144	0.22
145	0.27
146	0.32
147	0.34
148	0.35
149	0.38
150	0.42
151	0.41
152	0.42
153	0.42
154	0.46
155	0.49
156	0.55
157	0.57
158	0.59
159	0.63
160	0.65
161	0.69
162	0.71
163	0.74
164	0.75
165	0.79
166	0.83
167	0.84
168	0.86
169	0.83
170	0.77
171	0.77
172	0.67
173	0.63
174	0.62
175	0.57
176	0.55
177	0.52
178	0.51
179	0.47
180	0.52
181	0.51
182	0.48
183	0.49
184	0.48
185	0.46
186	0.43
187	0.44
188	0.41
189	0.4
190	0.43
191	0.4
192	0.38
193	0.36
194	0.35
195	0.29
196	0.27
197	0.26
198	0.19
199	0.18
200	0.14
201	0.15
202	0.15
203	0.16
204	0.14
205	0.13
206	0.11
207	0.09
208	0.09
209	0.08
210	0.09
211	0.1
212	0.11
213	0.09
214	0.1
215	0.1
216	0.09
217	0.09
218	0.08
219	0.06
220	0.08
221	0.08
222	0.1
223	0.1
224	0.1
225	0.19
226	0.23
227	0.3
228	0.29
229	0.34
230	0.38
231	0.48
232	0.58
233	0.59
234	0.65
235	0.7
236	0.79
237	0.85
238	0.9
239	0.86
240	0.84
241	0.8
242	0.81
243	0.74
244	0.65
245	0.54
246	0.43
247	0.36
248	0.28
249	0.21
250	0.12
251	0.11
252	0.09
253	0.14
254	0.17
255	0.21
256	0.29
257	0.35
258	0.39
259	0.41
260	0.46
261	0.48
262	0.53
263	0.58
264	0.58
265	0.6
266	0.6
267	0.59
268	0.61
269	0.56
270	0.49
271	0.43
272	0.36
273	0.32
274	0.26
275	0.22
276	0.15
277	0.14
278	0.12
279	0.1
280	0.1
281	0.06
282	0.07
283	0.08
284	0.08
285	0.08
286	0.08
287	0.07
288	0.07
289	0.07
290	0.05
291	0.05
292	0.04
293	0.03
294	0.03
295	0.03
296	0.03
297	0.04
298	0.06
299	0.08
300	0.08
301	0.1
302	0.12
303	0.13
304	0.14
305	0.15
306	0.13
307	0.13
308	0.15
309	0.15
310	0.16
311	0.18
312	0.17
313	0.17
314	0.16
315	0.16
316	0.14
317	0.15
318	0.14
319	0.12
320	0.12
321	0.11
322	0.11
323	0.1
324	0.1
325	0.08
326	0.07
327	0.11
328	0.12
329	0.12
330	0.15
331	0.18
332	0.21
333	0.26
334	0.28
335	0.27
336	0.32
337	0.33
338	0.3
339	0.29
340	0.26
341	0.2
342	0.19
343	0.14
344	0.08
345	0.06
346	0.05
347	0.04
348	0.05
349	0.05
350	0.05
351	0.04
352	0.05
353	0.05
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.03
358	0.04
359	0.04
360	0.04
361	0.05
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.06
367	0.06
368	0.1
369	0.12
370	0.14
371	0.19
372	0.23
373	0.24
374	0.29
375	0.35
376	0.38
377	0.46
378	0.54
379	0.57
380	0.57
381	0.59
382	0.56
383	0.52
384	0.47
385	0.38
386	0.32
387	0.24
388	0.2
389	0.18
390	0.17
391	0.15
392	0.11
393	0.09
394	0.07
395	0.06
396	0.06
397	0.05
398	0.04
399	0.07
400	0.08
401	0.08
402	0.1
403	0.18
404	0.21
405	0.25
406	0.33
407	0.37
408	0.44
409	0.5
410	0.57
411	0.59
412	0.62
413	0.64
414	0.66
415	0.66
416	0.6
417	0.57
418	0.5
419	0.41
420	0.38
421	0.34
422	0.29
423	0.23
424	0.22
425	0.2
426	0.19
427	0.17
428	0.16
429	0.14
430	0.11
431	0.12
432	0.16
433	0.16
434	0.15
435	0.17
436	0.17
437	0.17
438	0.16
439	0.15
440	0.1
441	0.09
442	0.09
443	0.08
444	0.07
445	0.07
446	0.08
447	0.09
448	0.1
449	0.11
450	0.12
451	0.13
452	0.2
453	0.27
454	0.29
455	0.33
456	0.36
457	0.45
458	0.46
459	0.52
460	0.51
461	0.52
462	0.54
463	0.55
464	0.61
465	0.57
466	0.62
467	0.57
468	0.53
469	0.45
470	0.4
471	0.38
472	0.29
473	0.25
474	0.2
475	0.19
476	0.18
477	0.17
478	0.17
479	0.13
480	0.13
481	0.11
482	0.09
483	0.07
484	0.1
485	0.1
486	0.11
487	0.1
488	0.1
489	0.1
490	0.1
491	0.1
492	0.08
493	0.09
494	0.09
495	0.09
496	0.09
497	0.1
498	0.1
499	0.12
500	0.12
501	0.11
502	0.13
503	0.2
504	0.23
505	0.29
506	0.37
507	0.44
508	0.53
509	0.55
510	0.58
511	0.59
512	0.65
513	0.67
514	0.64
515	0.61
516	0.57
517	0.6
518	0.56
519	0.5
520	0.44
521	0.38
522	0.34
523	0.27
524	0.23
525	0.2
526	0.21
527	0.2
528	0.18
529	0.15
530	0.18
531	0.19
532	0.18
533	0.16
534	0.17
535	0.18
536	0.17
537	0.16
538	0.13
539	0.16
540	0.16
541	0.16
542	0.17
543	0.17
544	0.17
545	0.17
546	0.16
547	0.14
548	0.13
549	0.13
550	0.1
551	0.1
552	0.13
553	0.21
554	0.3
555	0.37
556	0.43
557	0.47
558	0.5
559	0.56
560	0.58
561	0.57
562	0.54
563	0.52
564	0.51
565	0.49
566	0.47
567	0.4
568	0.35
569	0.27
570	0.21
571	0.16
572	0.11
573	0.09
574	0.1
575	0.14
576	0.17
577	0.19
578	0.23
579	0.33
580	0.43
581	0.53
582	0.6
583	0.66
584	0.75
585	0.84
586	0.89
587	0.9
588	0.9
589	0.87
590	0.87
591	0.81
592	0.74
593	0.65
594	0.56
595	0.48
596	0.39
597	0.31
598	0.23
599	0.18
600	0.13
601	0.12
602	0.11
603	0.07
604	0.09
605	0.09
606	0.1
607	0.1
608	0.12
609	0.12
610	0.17
611	0.19
612	0.18
613	0.2
614	0.21
615	0.29
616	0.29
617	0.32
618	0.28
619	0.34
620	0.36
621	0.37
622	0.36
623	0.3
624	0.33
625	0.33
626	0.33
627	0.32
628	0.39
629	0.4
630	0.42
631	0.43
632	0.45
633	0.47
634	0.49
635	0.51
636	0.48
637	0.51
638	0.48
639	0.5
640	0.48
641	0.42
642	0.4
643	0.32
644	0.25
645	0.21
646	0.2
647	0.18
648	0.13
649	0.13
650	0.14
651	0.15
652	0.15
653	0.13
654	0.12
655	0.12
656	0.12
657	0.13
658	0.16
659	0.15
660	0.18
661	0.17
662	0.17
663	0.16

A0A0C3DCI0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer