FuNGI

A0A0C3EQS6

Protein Details

Accession

A0A0C3EQS6

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
482-522	KTTTTRPRDESKEDKRARKQTVKAERQAKRVEKKTTKELYN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
493-515	KEDKRARKQTVKAERQAKRVEKK

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto 3, mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPSKSIYRQPGAKHFQLVHRSQRDPLIYDPDAGQHVLREIIRGNEKKGKSRADLEGALDPQEIAQDVCVNAGEAALYGIYFDDTEYDYMQHLRTVGAEEEGVESILIEAPSTSQKKTQRDVKTNESLYDLPPEAFPSKDEMPRNFESQQAVPESISGFQPDMDPHLRQVLEALEDDAFVDDSLEDGFFSELVAGGERNEQELDYEFDEDGDPSGMDNDHKEAGDADSWEARFARFKKESKRVPPHSDSDGEIGSEGRDTVGNLPRLPVIGGKQRRKGSSVASGYSMSSSSMYRTEALLTLDERFDQLMLKEYDPDEGEGVDGEAMTSSDLSDSDEAPELITTREDFAAIVDDFMENYELVGRKLKQVLPGDSGVDKLDALRRAMGHDERVTISTAQDADADDDEKLFASYHANEKQDRWDCETILTTHSNLENHPRIICAGMSKPVPRIRLDPRTGLPSVDTCNQKRCDTLPKNDEKQQVIKTTTTRPRDESKEDKRARKQTVKAERQAKRVEKKTTKELYNDEARRQSQGLSHKAKNIGIRKL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.59
2	0.61
3	0.64
4	0.64
5	0.64
6	0.64
7	0.62
8	0.59
9	0.61
10	0.57
11	0.51
12	0.48
13	0.46
14	0.39
15	0.38
16	0.36
17	0.31
18	0.29
19	0.27
20	0.23
21	0.15
22	0.15
23	0.17
24	0.17
25	0.16
26	0.16
27	0.22
28	0.31
29	0.33
30	0.39
31	0.44
32	0.47
33	0.55
34	0.6
35	0.61
36	0.57
37	0.6
38	0.6
39	0.58
40	0.56
41	0.5
42	0.48
43	0.42
44	0.38
45	0.31
46	0.24
47	0.18
48	0.16
49	0.13
50	0.08
51	0.08
52	0.08
53	0.08
54	0.09
55	0.09
56	0.09
57	0.08
58	0.08
59	0.07
60	0.05
61	0.05
62	0.04
63	0.04
64	0.04
65	0.04
66	0.04
67	0.04
68	0.04
69	0.05
70	0.07
71	0.08
72	0.09
73	0.1
74	0.11
75	0.13
76	0.13
77	0.13
78	0.12
79	0.11
80	0.11
81	0.13
82	0.13
83	0.12
84	0.11
85	0.11
86	0.12
87	0.12
88	0.11
89	0.08
90	0.07
91	0.06
92	0.08
93	0.07
94	0.06
95	0.06
96	0.07
97	0.14
98	0.17
99	0.18
100	0.23
101	0.3
102	0.37
103	0.45
104	0.53
105	0.57
106	0.64
107	0.69
108	0.71
109	0.73
110	0.68
111	0.62
112	0.56
113	0.47
114	0.39
115	0.36
116	0.29
117	0.2
118	0.18
119	0.2
120	0.18
121	0.17
122	0.16
123	0.17
124	0.21
125	0.26
126	0.32
127	0.31
128	0.37
129	0.4
130	0.44
131	0.39
132	0.38
133	0.35
134	0.31
135	0.31
136	0.27
137	0.25
138	0.2
139	0.2
140	0.17
141	0.15
142	0.14
143	0.11
144	0.09
145	0.08
146	0.09
147	0.09
148	0.13
149	0.15
150	0.15
151	0.15
152	0.2
153	0.19
154	0.18
155	0.19
156	0.15
157	0.13
158	0.13
159	0.13
160	0.09
161	0.09
162	0.09
163	0.08
164	0.07
165	0.05
166	0.05
167	0.04
168	0.04
169	0.04
170	0.04
171	0.04
172	0.04
173	0.04
174	0.04
175	0.04
176	0.04
177	0.04
178	0.04
179	0.05
180	0.04
181	0.05
182	0.08
183	0.08
184	0.09
185	0.08
186	0.08
187	0.08
188	0.1
189	0.11
190	0.1
191	0.11
192	0.1
193	0.1
194	0.1
195	0.1
196	0.09
197	0.07
198	0.06
199	0.05
200	0.06
201	0.06
202	0.06
203	0.07
204	0.08
205	0.09
206	0.08
207	0.09
208	0.09
209	0.09
210	0.1
211	0.1
212	0.09
213	0.1
214	0.1
215	0.11
216	0.1
217	0.1
218	0.14
219	0.15
220	0.23
221	0.27
222	0.33
223	0.42
224	0.51
225	0.59
226	0.64
227	0.73
228	0.73
229	0.74
230	0.73
231	0.68
232	0.62
233	0.55
234	0.46
235	0.37
236	0.29
237	0.21
238	0.16
239	0.12
240	0.09
241	0.07
242	0.06
243	0.04
244	0.04
245	0.04
246	0.09
247	0.14
248	0.15
249	0.15
250	0.16
251	0.15
252	0.16
253	0.15
254	0.12
255	0.1
256	0.17
257	0.25
258	0.3
259	0.37
260	0.41
261	0.41
262	0.43
263	0.42
264	0.37
265	0.37
266	0.34
267	0.29
268	0.26
269	0.26
270	0.24
271	0.22
272	0.19
273	0.1
274	0.08
275	0.08
276	0.07
277	0.07
278	0.08
279	0.08
280	0.09
281	0.09
282	0.09
283	0.1
284	0.1
285	0.09
286	0.09
287	0.09
288	0.09
289	0.08
290	0.07
291	0.07
292	0.06
293	0.06
294	0.11
295	0.12
296	0.12
297	0.14
298	0.14
299	0.15
300	0.15
301	0.15
302	0.1
303	0.08
304	0.08
305	0.06
306	0.06
307	0.04
308	0.04
309	0.03
310	0.03
311	0.03
312	0.03
313	0.03
314	0.03
315	0.03
316	0.03
317	0.05
318	0.06
319	0.06
320	0.07
321	0.08
322	0.08
323	0.08
324	0.08
325	0.07
326	0.07
327	0.07
328	0.06
329	0.07
330	0.07
331	0.07
332	0.07
333	0.07
334	0.1
335	0.09
336	0.08
337	0.07
338	0.07
339	0.07
340	0.08
341	0.08
342	0.04
343	0.05
344	0.07
345	0.08
346	0.08
347	0.13
348	0.14
349	0.16
350	0.21
351	0.23
352	0.27
353	0.32
354	0.34
355	0.33
356	0.33
357	0.32
358	0.28
359	0.26
360	0.2
361	0.15
362	0.12
363	0.09
364	0.13
365	0.13
366	0.14
367	0.15
368	0.15
369	0.16
370	0.22
371	0.22
372	0.22
373	0.21
374	0.22
375	0.22
376	0.22
377	0.23
378	0.18
379	0.16
380	0.14
381	0.13
382	0.11
383	0.11
384	0.1
385	0.1
386	0.11
387	0.11
388	0.09
389	0.09
390	0.09
391	0.08
392	0.08
393	0.07
394	0.06
395	0.09
396	0.11
397	0.18
398	0.23
399	0.26
400	0.27
401	0.29
402	0.38
403	0.42
404	0.43
405	0.44
406	0.41
407	0.39
408	0.39
409	0.41
410	0.32
411	0.28
412	0.27
413	0.2
414	0.2
415	0.22
416	0.21
417	0.19
418	0.27
419	0.28
420	0.28
421	0.28
422	0.25
423	0.24
424	0.24
425	0.23
426	0.18
427	0.15
428	0.18
429	0.21
430	0.23
431	0.29
432	0.32
433	0.34
434	0.33
435	0.38
436	0.43
437	0.5
438	0.52
439	0.51
440	0.5
441	0.53
442	0.51
443	0.45
444	0.37
445	0.3
446	0.3
447	0.31
448	0.35
449	0.33
450	0.41
451	0.44
452	0.43
453	0.43
454	0.43
455	0.48
456	0.48
457	0.56
458	0.57
459	0.63
460	0.68
461	0.73
462	0.76
463	0.7
464	0.69
465	0.64
466	0.61
467	0.55
468	0.52
469	0.49
470	0.52
471	0.56
472	0.57
473	0.55
474	0.53
475	0.57
476	0.61
477	0.65
478	0.66
479	0.67
480	0.71
481	0.75
482	0.8
483	0.82
484	0.85
485	0.86
486	0.85
487	0.83
488	0.83
489	0.86
490	0.86
491	0.85
492	0.86
493	0.82
494	0.81
495	0.83
496	0.82
497	0.81
498	0.8
499	0.81
500	0.81
501	0.81
502	0.83
503	0.82
504	0.78
505	0.74
506	0.71
507	0.68
508	0.69
509	0.67
510	0.63
511	0.62
512	0.58
513	0.55
514	0.51
515	0.45
516	0.41
517	0.45
518	0.48
519	0.48
520	0.51
521	0.54
522	0.57
523	0.59
524	0.62

A0A0C3EQS6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer