FuNGI

A0A0C2YQH0

Protein Details

Accession

A0A0C2YQH0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
246-268	GGRYRRGGKKAHTRRERAQNAEF	Basic
864-884	VNLPQRPQRNHRVPLRPRNVY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
248-260	RYRRGGKKAHTRR
847-858	QRPGRAERRQNA

Subcellular Location(s)

mito 10.5, cyto_mito 9, cyto 6.5, nucl 5, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF14223 Retrotran_gag_2 PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE

Amino Acid Sequences

MSSALDKMVPVFTGSNWQQWHTAMQAYLRAQGQWFVFSTPRPTDEFDSWDEHNEKALSNITLHISPSIQTAITNLAMVKEVWDHLKENYGAPSIGSAYTKLSRLLTMTIPAGSHPAPAITKMLSHFAYLKDAGFEFPANVQAMIILCKLPPTMEVVAQILSQTSPSEIKTLKPDGIVKAATLSFEQKGASCGASGKAPQANKLSTVKRKQADPKFAQQQQQPQRQQQQQGGSNGSGSGNAPAQGQGGRYRRGGKKAHTRRERAQNAEFATYIHYEDGPVPTVDPRALAHTTGATNYGPPAFDNTIKAFDLAHRLGMEPSCQTICTLDQVISTASASLDQPEAGPSSLKRPRLKERITMDVEEDTVSLGDEEERPFIYEDFADSEFNDIDKMVLDRYNAVLMLHMPGASARLISMGEMLLRNYRVAGDKKGISLIGKTDRLWFGADPEDERGVIFGIRSIPTIRSNYIASVSKVNYDIMHQRFGHPSKEVLRRARKHTQRFPDIHFPTEDCVCPGCALGKMPNQAFPENERRATKPFELVHSDLKSFLVTSYRKFKYIITFYNDFTSHAWTMALRSKAAAITAAKDFLEMVCVQHNAHIIGWMSDAGGEYKSDLFDRALLEKGIKIYQSAPRTPMQNGRAERLGRTLMDKAESMRHQACIPDSWWEFAFAHATHLYNRTSVARLKWRTPHEMLKGEMPNIDHLCVFGCGAFVYLPATARANKMAPKSELMTYIGVAPGNERNFLFMRSTNAVFTAAHAVFDERGVIPIPPTGRPGNTPDDIDGDDDVDHDHGYPCHQAQDDDPKREEPQAPEEEPREPNPPRTPSPDVPPPAPRTPSLARNPPPPALQRPGRAERRQNAPRPPMVNLPQRPQRNHRVPLRPRNVYGERRHPVEQLWDIESASRWRQTVGEASRPPQTDTPEQIPGGFPNTSATPSEEDVQKMCEEGGANLVGYLMGKALTTQDPQTENVRNWSYKDIARLPQAEQKLWRLACQEELDVLHKRKVFELVDCPRDRKVIKNRWVFDVKSDGRKKARLVAKGFSQVEGLDFDQVFSPVVRFETVRLMLALATLENWYITGLNVRSAYLYGKLDEEIYMEQPEGFAAPGQELKVLRLWRALYGLKQAGLAWWHTLNESLKELGFERLKSEAGIFFYKKKGTNVVVGIIYVDDALFCGPNKAIVDSIKAQFMCKWECRDLGEPKEFLRMHITRKGRAIHLDQCVYLQKVIERCGMLNAKSASTPLPAGYYAAKNTEPVDAELRSRFQTVIGSLLYLMLGTRPDIAFAVTHLSCHSANPLQDHLNKALYICRYLIGTSTYSLTLPLASRKQVST

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.28
3	0.29
4	0.3
5	0.3
6	0.31
7	0.33
8	0.26
9	0.27
10	0.23
11	0.23
12	0.27
13	0.26
14	0.3
15	0.28
16	0.27
17	0.24
18	0.27
19	0.26
20	0.22
21	0.22
22	0.2
23	0.21
24	0.23
25	0.29
26	0.28
27	0.3
28	0.3
29	0.34
30	0.37
31	0.38
32	0.4
33	0.37
34	0.38
35	0.36
36	0.4
37	0.37
38	0.31
39	0.32
40	0.29
41	0.25
42	0.23
43	0.26
44	0.2
45	0.19
46	0.21
47	0.2
48	0.2
49	0.21
50	0.2
51	0.17
52	0.16
53	0.17
54	0.16
55	0.13
56	0.12
57	0.13
58	0.15
59	0.14
60	0.15
61	0.13
62	0.12
63	0.13
64	0.13
65	0.13
66	0.11
67	0.13
68	0.15
69	0.17
70	0.19
71	0.19
72	0.26
73	0.26
74	0.26
75	0.28
76	0.26
77	0.24
78	0.22
79	0.22
80	0.17
81	0.18
82	0.16
83	0.13
84	0.16
85	0.19
86	0.2
87	0.21
88	0.2
89	0.2
90	0.21
91	0.23
92	0.2
93	0.21
94	0.21
95	0.19
96	0.18
97	0.18
98	0.2
99	0.17
100	0.16
101	0.13
102	0.14
103	0.14
104	0.15
105	0.17
106	0.14
107	0.16
108	0.17
109	0.21
110	0.19
111	0.2
112	0.22
113	0.21
114	0.25
115	0.23
116	0.22
117	0.19
118	0.19
119	0.18
120	0.18
121	0.17
122	0.13
123	0.13
124	0.16
125	0.15
126	0.14
127	0.13
128	0.12
129	0.12
130	0.13
131	0.13
132	0.1
133	0.09
134	0.1
135	0.11
136	0.1
137	0.1
138	0.13
139	0.15
140	0.15
141	0.17
142	0.17
143	0.18
144	0.17
145	0.17
146	0.12
147	0.1
148	0.09
149	0.08
150	0.09
151	0.1
152	0.11
153	0.16
154	0.16
155	0.19
156	0.26
157	0.29
158	0.29
159	0.31
160	0.34
161	0.32
162	0.37
163	0.34
164	0.27
165	0.26
166	0.25
167	0.22
168	0.19
169	0.19
170	0.15
171	0.16
172	0.16
173	0.13
174	0.15
175	0.15
176	0.14
177	0.11
178	0.12
179	0.12
180	0.15
181	0.15
182	0.18
183	0.21
184	0.22
185	0.26
186	0.3
187	0.3
188	0.33
189	0.39
190	0.43
191	0.48
192	0.56
193	0.6
194	0.58
195	0.65
196	0.71
197	0.73
198	0.75
199	0.71
200	0.73
201	0.74
202	0.76
203	0.75
204	0.7
205	0.71
206	0.7
207	0.74
208	0.72
209	0.71
210	0.75
211	0.75
212	0.76
213	0.72
214	0.7
215	0.66
216	0.64
217	0.58
218	0.48
219	0.42
220	0.36
221	0.29
222	0.21
223	0.15
224	0.13
225	0.1
226	0.1
227	0.1
228	0.1
229	0.11
230	0.11
231	0.13
232	0.19
233	0.23
234	0.25
235	0.28
236	0.37
237	0.41
238	0.49
239	0.53
240	0.55
241	0.61
242	0.69
243	0.76
244	0.78
245	0.8
246	0.81
247	0.85
248	0.84
249	0.8
250	0.75
251	0.7
252	0.63
253	0.57
254	0.48
255	0.37
256	0.32
257	0.25
258	0.21
259	0.15
260	0.12
261	0.11
262	0.13
263	0.14
264	0.13
265	0.12
266	0.12
267	0.13
268	0.14
269	0.13
270	0.13
271	0.11
272	0.14
273	0.15
274	0.15
275	0.14
276	0.15
277	0.16
278	0.15
279	0.17
280	0.12
281	0.11
282	0.12
283	0.12
284	0.1
285	0.1
286	0.15
287	0.15
288	0.17
289	0.2
290	0.2
291	0.23
292	0.23
293	0.22
294	0.18
295	0.17
296	0.22
297	0.19
298	0.19
299	0.17
300	0.17
301	0.19
302	0.19
303	0.19
304	0.12
305	0.14
306	0.13
307	0.13
308	0.12
309	0.12
310	0.13
311	0.14
312	0.14
313	0.12
314	0.12
315	0.12
316	0.12
317	0.11
318	0.1
319	0.08
320	0.07
321	0.07
322	0.07
323	0.08
324	0.08
325	0.07
326	0.07
327	0.08
328	0.09
329	0.09
330	0.1
331	0.09
332	0.18
333	0.24
334	0.31
335	0.36
336	0.41
337	0.51
338	0.6
339	0.64
340	0.64
341	0.63
342	0.65
343	0.63
344	0.58
345	0.5
346	0.4
347	0.36
348	0.27
349	0.22
350	0.13
351	0.09
352	0.08
353	0.06
354	0.05
355	0.06
356	0.07
357	0.08
358	0.09
359	0.09
360	0.1
361	0.11
362	0.11
363	0.11
364	0.1
365	0.1
366	0.12
367	0.13
368	0.12
369	0.11
370	0.13
371	0.12
372	0.12
373	0.11
374	0.08
375	0.07
376	0.07
377	0.08
378	0.07
379	0.08
380	0.08
381	0.09
382	0.1
383	0.11
384	0.1
385	0.09
386	0.09
387	0.08
388	0.09
389	0.08
390	0.07
391	0.06
392	0.06
393	0.07
394	0.07
395	0.06
396	0.05
397	0.05
398	0.05
399	0.05
400	0.06
401	0.05
402	0.06
403	0.06
404	0.07
405	0.09
406	0.09
407	0.09
408	0.09
409	0.1
410	0.15
411	0.17
412	0.19
413	0.22
414	0.22
415	0.23
416	0.24
417	0.23
418	0.18
419	0.17
420	0.18
421	0.19
422	0.2
423	0.2
424	0.23
425	0.23
426	0.23
427	0.24
428	0.19
429	0.16
430	0.19
431	0.19
432	0.16
433	0.18
434	0.17
435	0.16
436	0.15
437	0.13
438	0.09
439	0.08
440	0.07
441	0.06
442	0.08
443	0.08
444	0.09
445	0.1
446	0.12
447	0.16
448	0.18
449	0.17
450	0.17
451	0.18
452	0.18
453	0.2
454	0.2
455	0.18
456	0.19
457	0.19
458	0.18
459	0.19
460	0.18
461	0.15
462	0.15
463	0.22
464	0.2
465	0.25
466	0.24
467	0.25
468	0.31
469	0.33
470	0.33
471	0.27
472	0.28
473	0.3
474	0.38
475	0.43
476	0.45
477	0.53
478	0.57
479	0.63
480	0.7
481	0.72
482	0.73
483	0.76
484	0.76
485	0.75
486	0.73
487	0.72
488	0.72
489	0.65
490	0.57
491	0.48
492	0.4
493	0.33
494	0.3
495	0.24
496	0.15
497	0.13
498	0.12
499	0.11
500	0.1
501	0.09
502	0.08
503	0.09
504	0.12
505	0.15
506	0.19
507	0.19
508	0.24
509	0.25
510	0.26
511	0.26
512	0.27
513	0.32
514	0.31
515	0.35
516	0.32
517	0.32
518	0.35
519	0.38
520	0.35
521	0.32
522	0.3
523	0.3
524	0.33
525	0.33
526	0.35
527	0.32
528	0.31
529	0.25
530	0.23
531	0.2
532	0.15
533	0.13
534	0.13
535	0.13
536	0.16
537	0.25
538	0.25
539	0.27
540	0.27
541	0.29
542	0.31
543	0.36
544	0.37
545	0.35
546	0.36
547	0.35
548	0.38
549	0.36
550	0.29
551	0.24
552	0.23
553	0.16
554	0.14
555	0.14
556	0.1
557	0.12
558	0.16
559	0.16
560	0.12
561	0.12
562	0.13
563	0.13
564	0.13
565	0.13
566	0.08
567	0.09
568	0.1
569	0.1
570	0.1
571	0.09
572	0.09
573	0.07
574	0.08
575	0.06
576	0.06
577	0.07
578	0.08
579	0.08
580	0.1
581	0.11
582	0.1
583	0.09
584	0.1
585	0.09
586	0.08
587	0.09
588	0.07
589	0.06
590	0.06
591	0.06
592	0.05
593	0.05
594	0.05
595	0.05
596	0.05
597	0.06
598	0.06
599	0.07
600	0.06
601	0.07
602	0.09
603	0.09
604	0.1
605	0.1
606	0.1
607	0.1
608	0.11
609	0.11
610	0.09
611	0.09
612	0.11
613	0.16
614	0.2
615	0.2
616	0.22
617	0.23
618	0.25
619	0.26
620	0.31
621	0.28
622	0.31
623	0.31
624	0.31
625	0.33
626	0.31
627	0.3
628	0.25
629	0.23
630	0.17
631	0.17
632	0.17
633	0.13
634	0.13
635	0.13
636	0.12
637	0.16
638	0.16
639	0.18
640	0.17
641	0.17
642	0.16
643	0.17
644	0.17
645	0.14
646	0.14
647	0.15
648	0.15
649	0.15
650	0.15
651	0.16
652	0.15
653	0.13
654	0.15
655	0.1
656	0.12
657	0.11
658	0.11
659	0.11
660	0.13
661	0.13
662	0.11
663	0.12
664	0.11
665	0.13
666	0.14
667	0.17
668	0.24
669	0.26
670	0.3
671	0.36
672	0.39
673	0.43
674	0.44
675	0.47
676	0.44
677	0.44
678	0.41
679	0.4
680	0.37
681	0.31
682	0.29
683	0.23
684	0.2
685	0.18
686	0.18
687	0.11
688	0.1
689	0.1
690	0.09
691	0.09
692	0.05
693	0.05
694	0.04
695	0.05
696	0.05
697	0.04
698	0.04
699	0.05
700	0.05
701	0.06
702	0.07
703	0.08
704	0.08
705	0.1
706	0.11
707	0.15
708	0.17
709	0.2
710	0.2
711	0.2
712	0.22
713	0.21
714	0.21
715	0.19
716	0.17
717	0.13
718	0.13
719	0.12
720	0.1
721	0.08
722	0.08
723	0.1
724	0.1
725	0.11
726	0.11
727	0.13
728	0.13
729	0.15
730	0.15
731	0.12
732	0.15
733	0.17
734	0.18
735	0.15
736	0.15
737	0.15
738	0.13
739	0.13
740	0.15
741	0.12
742	0.11
743	0.11
744	0.11
745	0.1
746	0.1
747	0.11
748	0.05
749	0.06
750	0.06
751	0.06
752	0.06
753	0.08
754	0.09
755	0.09
756	0.12
757	0.13
758	0.13
759	0.15
760	0.19
761	0.22
762	0.22
763	0.22
764	0.2
765	0.2
766	0.2
767	0.19
768	0.15
769	0.1
770	0.09
771	0.08
772	0.08
773	0.06
774	0.06
775	0.05
776	0.06
777	0.06
778	0.07
779	0.09
780	0.09
781	0.11
782	0.12
783	0.12
784	0.14
785	0.25
786	0.3
787	0.32
788	0.33
789	0.32
790	0.33
791	0.37
792	0.38
793	0.29
794	0.31
795	0.32
796	0.32
797	0.34
798	0.34
799	0.34
800	0.33
801	0.32
802	0.32
803	0.28
804	0.32
805	0.36
806	0.39
807	0.39
808	0.44
809	0.48
810	0.44
811	0.49
812	0.5
813	0.46
814	0.44
815	0.47
816	0.46
817	0.43
818	0.42
819	0.36
820	0.35
821	0.36
822	0.41
823	0.42
824	0.45
825	0.44
826	0.48
827	0.51
828	0.47
829	0.47
830	0.43
831	0.42
832	0.4
833	0.42
834	0.41
835	0.45
836	0.51
837	0.57
838	0.59
839	0.61
840	0.61
841	0.66
842	0.68
843	0.69
844	0.68
845	0.65
846	0.64
847	0.59
848	0.55
849	0.52
850	0.51
851	0.53
852	0.48
853	0.49
854	0.52
855	0.56
856	0.58
857	0.58
858	0.62
859	0.62
860	0.66
861	0.68
862	0.71
863	0.74
864	0.8
865	0.82
866	0.75
867	0.68
868	0.69
869	0.67
870	0.65
871	0.62
872	0.61
873	0.56
874	0.56
875	0.56
876	0.48
877	0.42
878	0.39
879	0.36
880	0.28
881	0.27
882	0.23
883	0.21
884	0.21
885	0.21
886	0.18
887	0.17
888	0.16
889	0.15
890	0.15
891	0.15
892	0.17
893	0.24
894	0.25
895	0.3
896	0.3
897	0.32
898	0.37
899	0.38
900	0.39
901	0.33
902	0.34
903	0.3
904	0.33
905	0.35
906	0.33
907	0.32
908	0.3
909	0.28
910	0.24
911	0.22
912	0.17
913	0.13
914	0.12
915	0.12
916	0.13
917	0.13
918	0.14
919	0.13
920	0.15
921	0.17
922	0.17
923	0.18
924	0.17
925	0.18
926	0.16
927	0.14
928	0.12
929	0.11
930	0.1
931	0.09
932	0.1
933	0.09
934	0.08
935	0.08
936	0.08
937	0.06
938	0.06
939	0.06
940	0.04
941	0.03
942	0.03
943	0.04
944	0.06
945	0.08
946	0.1
947	0.11
948	0.15
949	0.17
950	0.19
951	0.24
952	0.26
953	0.25
954	0.3
955	0.34
956	0.31
957	0.31
958	0.33
959	0.31
960	0.29
961	0.34
962	0.33
963	0.33
964	0.37
965	0.37
966	0.36
967	0.39
968	0.4
969	0.36
970	0.34
971	0.34
972	0.36
973	0.34
974	0.33
975	0.29
976	0.28
977	0.3
978	0.28
979	0.25
980	0.19
981	0.2
982	0.21
983	0.26
984	0.27
985	0.27
986	0.27
987	0.28
988	0.27
989	0.32
990	0.3
991	0.27
992	0.35
993	0.38
994	0.45
995	0.46
996	0.47
997	0.42
998	0.46
999	0.44
1000	0.43
1001	0.47
1002	0.49
1003	0.56
1004	0.63
1005	0.64
1006	0.66
1007	0.7
1008	0.61
1009	0.54
1010	0.53
1011	0.48
1012	0.49
1013	0.52
1014	0.51
1015	0.51
1016	0.55
1017	0.54
1018	0.52
1019	0.55
1020	0.53
1021	0.52
1022	0.5
1023	0.5
1024	0.55
1025	0.53
1026	0.44
1027	0.38
1028	0.3
1029	0.26
1030	0.24
1031	0.19
1032	0.13
1033	0.12
1034	0.12
1035	0.12
1036	0.12
1037	0.12
1038	0.1
1039	0.1
1040	0.07
1041	0.09
1042	0.09
1043	0.09
1044	0.1
1045	0.16
1046	0.17
1047	0.17
1048	0.17
1049	0.16
1050	0.15
1051	0.15
1052	0.13
1053	0.07
1054	0.06
1055	0.06
1056	0.06
1057	0.05
1058	0.05
1059	0.05
1060	0.05
1061	0.06
1062	0.1
1063	0.1
1064	0.13
1065	0.14
1066	0.14
1067	0.14
1068	0.15
1069	0.16
1070	0.15
1071	0.16
1072	0.14
1073	0.14
1074	0.14
1075	0.14
1076	0.14
1077	0.14
1078	0.12
1079	0.13
1080	0.13
1081	0.12
1082	0.11
1083	0.1
1084	0.1
1085	0.09
1086	0.07
1087	0.06
1088	0.06
1089	0.07
1090	0.09
1091	0.09
1092	0.13
1093	0.12
1094	0.14
1095	0.18
1096	0.19
1097	0.19
1098	0.22
1099	0.23
1100	0.21
1101	0.25
1102	0.26
1103	0.23
1104	0.29
1105	0.3
1106	0.26
1107	0.25
1108	0.24
1109	0.21
1110	0.21
1111	0.2
1112	0.15
1113	0.14
1114	0.14
1115	0.14
1116	0.19
1117	0.19
1118	0.2
1119	0.21
1120	0.19
1121	0.18
1122	0.19
1123	0.2
1124	0.23
1125	0.23
1126	0.21
1127	0.21
1128	0.22
1129	0.22
1130	0.21
1131	0.22
1132	0.18
1133	0.18
1134	0.24
1135	0.24
1136	0.26
1137	0.3
1138	0.34
1139	0.36
1140	0.36
1141	0.39
1142	0.37
1143	0.41
1144	0.4
1145	0.39
1146	0.34
1147	0.31
1148	0.28
1149	0.21
1150	0.18
1151	0.11
1152	0.08
1153	0.04
1154	0.04
1155	0.05
1156	0.06
1157	0.06
1158	0.08
1159	0.08
1160	0.11
1161	0.13
1162	0.14
1163	0.16
1164	0.16
1165	0.22
1166	0.25
1167	0.27
1168	0.28
1169	0.27
1170	0.27
1171	0.27
1172	0.31
1173	0.33
1174	0.33
1175	0.38
1176	0.37
1177	0.39
1178	0.43
1179	0.48
1180	0.52
1181	0.53
1182	0.54
1183	0.49
1184	0.46
1185	0.53
1186	0.48
1187	0.41
1188	0.42
1189	0.38
1190	0.38
1191	0.45
1192	0.49
1193	0.44
1194	0.51
1195	0.54
1196	0.48
1197	0.51
1198	0.52
1199	0.51
1200	0.54
1201	0.51
1202	0.45
1203	0.43
1204	0.44
1205	0.39
1206	0.33
1207	0.27
1208	0.24
1209	0.25
1210	0.28
1211	0.3
1212	0.27
1213	0.26
1214	0.32
1215	0.35
1216	0.32
1217	0.35
1218	0.33
1219	0.3
1220	0.29
1221	0.3
1222	0.23
1223	0.21
1224	0.21
1225	0.15
1226	0.15
1227	0.14
1228	0.16
1229	0.19
1230	0.21
1231	0.2
1232	0.23
1233	0.23
1234	0.22
1235	0.23
1236	0.26
1237	0.23
1238	0.23
1239	0.25
1240	0.23
1241	0.26
1242	0.28
1243	0.3
1244	0.28
1245	0.27
1246	0.25
1247	0.21
1248	0.24
1249	0.21
1250	0.21
1251	0.19
1252	0.17
1253	0.15
1254	0.15
1255	0.14
1256	0.1
1257	0.09
1258	0.06
1259	0.07
1260	0.07
1261	0.1
1262	0.1
1263	0.11
1264	0.12
1265	0.12
1266	0.11
1267	0.12
1268	0.18
1269	0.14
1270	0.15
1271	0.15
1272	0.18
1273	0.17
1274	0.18
1275	0.23
1276	0.21
1277	0.24
1278	0.27
1279	0.31
1280	0.35
1281	0.39
1282	0.42
1283	0.4
1284	0.38
1285	0.36
1286	0.33
1287	0.35
1288	0.3
1289	0.29
1290	0.25
1291	0.22
1292	0.2
1293	0.21
1294	0.22
1295	0.19
1296	0.18
1297	0.17
1298	0.18
1299	0.18
1300	0.17
1301	0.17
1302	0.15
1303	0.14
1304	0.15
1305	0.22
1306	0.24
1307	0.27

A0A0C2YQH0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer