Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A0F4Z3N6

Protein Details
Accession A0A0F4Z3N6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-26SKPAASQTPKMKRPPPPLSQTHydrophilic
326-346DSPLHRDRPPSPKRRKRTVAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
333-342RPPSPKRRKR
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 12.5, cyto_nucl 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MATAVSKPAASQTPKMKRPPPPLSQTGVNGIKPSQSSSSSPSMTSKRLPGTSQPSSANSASGTAANSANNRPVNRARKDAQKPGEALPSRPQRPSTRTSAELDRRVAKIPPEPYGCLIVKVVDHKSVSAQASKSTSSSTDEKNTPFSIHNYNQHVTPSPLVPYPKQNQIKVDSPKATEKSARKESDSAAESADGKKENEPADKSAEASPEKQPPPKPRVFTTVLHPTPRSLLAELTFLATTPDPRAVNKKQSGSQGTLKTQSSSAASQTSSSSTAAGPPPKRQKMLVEPQELPECESKLIRALAPPLYLEPVDSLEAAQNLLRFLDSPLHRDRPPSPKRRKRTVAELAADEALAAEEERFMLIMDERLEPTASAAAGGPKSAVDEAAGAAPFEPRFSRFKTIESIRIQHEEKAKREHERKLQQEHAKRQQQEQERERRRLLEQRQAEEHAREEARRQQLAAQQAQAQLAAQQQNRHAMAQANGISQVSQGQMSSPVVRNQTPHNTSSPVVGANMGTQAAVSMSMSASAQGAGSPQRPPSTLQHSHPGVMGHPMAPSRSQQSQSRHGTPQMTQGTPAMSHATPVMRNVTPTQRMSHGSPPNTSMTQTPVMGHAMMGTPQMGGGMGLTPQQQQMLLQQRQQQMLAQQGHAGHGQFTPQQLAQMQANAHAQQSIQSHQQQMLQQHQAQQNQHAQQQQQHNMQQLQNQQAYQAQLMRTQLVQMQMAQQKQQQQQQQQQGQGNTPQMTLHQQQQQQMLMAAAQANGGHLSTERTVFAALPATVPAATPPIATRYGPTVDGAIRTTSSVSAAYCAAIWSGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.67
3 0.71
4 0.73
5 0.79
6 0.82
7 0.8
8 0.79
9 0.77
10 0.74
11 0.7
12 0.64
13 0.62
14 0.58
15 0.49
16 0.42
17 0.37
18 0.35
19 0.31
20 0.31
21 0.26
22 0.25
23 0.27
24 0.31
25 0.37
26 0.34
27 0.35
28 0.38
29 0.39
30 0.4
31 0.42
32 0.43
33 0.43
34 0.45
35 0.46
36 0.48
37 0.52
38 0.53
39 0.54
40 0.5
41 0.47
42 0.49
43 0.46
44 0.38
45 0.3
46 0.25
47 0.21
48 0.19
49 0.17
50 0.14
51 0.15
52 0.16
53 0.19
54 0.2
55 0.26
56 0.3
57 0.3
58 0.34
59 0.43
60 0.5
61 0.52
62 0.58
63 0.56
64 0.62
65 0.7
66 0.73
67 0.71
68 0.68
69 0.65
70 0.61
71 0.66
72 0.57
73 0.52
74 0.51
75 0.54
76 0.51
77 0.52
78 0.54
79 0.53
80 0.57
81 0.6
82 0.59
83 0.55
84 0.55
85 0.56
86 0.6
87 0.6
88 0.6
89 0.59
90 0.55
91 0.5
92 0.49
93 0.47
94 0.41
95 0.39
96 0.37
97 0.4
98 0.39
99 0.39
100 0.39
101 0.43
102 0.39
103 0.33
104 0.3
105 0.24
106 0.21
107 0.24
108 0.25
109 0.23
110 0.22
111 0.21
112 0.23
113 0.27
114 0.28
115 0.28
116 0.26
117 0.25
118 0.28
119 0.28
120 0.27
121 0.23
122 0.22
123 0.22
124 0.26
125 0.26
126 0.3
127 0.33
128 0.35
129 0.37
130 0.37
131 0.35
132 0.33
133 0.32
134 0.34
135 0.36
136 0.41
137 0.43
138 0.43
139 0.42
140 0.42
141 0.4
142 0.34
143 0.3
144 0.24
145 0.2
146 0.23
147 0.25
148 0.26
149 0.32
150 0.34
151 0.42
152 0.47
153 0.48
154 0.5
155 0.52
156 0.58
157 0.57
158 0.6
159 0.53
160 0.5
161 0.55
162 0.52
163 0.5
164 0.49
165 0.49
166 0.5
167 0.56
168 0.55
169 0.51
170 0.52
171 0.5
172 0.5
173 0.46
174 0.37
175 0.29
176 0.27
177 0.24
178 0.23
179 0.24
180 0.17
181 0.16
182 0.17
183 0.21
184 0.23
185 0.28
186 0.3
187 0.29
188 0.32
189 0.31
190 0.31
191 0.29
192 0.3
193 0.26
194 0.27
195 0.29
196 0.33
197 0.36
198 0.4
199 0.45
200 0.49
201 0.56
202 0.6
203 0.59
204 0.54
205 0.58
206 0.57
207 0.52
208 0.5
209 0.52
210 0.48
211 0.48
212 0.44
213 0.38
214 0.35
215 0.35
216 0.3
217 0.2
218 0.18
219 0.15
220 0.16
221 0.15
222 0.14
223 0.12
224 0.1
225 0.11
226 0.09
227 0.1
228 0.1
229 0.14
230 0.13
231 0.16
232 0.24
233 0.28
234 0.37
235 0.42
236 0.45
237 0.45
238 0.52
239 0.54
240 0.51
241 0.52
242 0.48
243 0.45
244 0.45
245 0.41
246 0.35
247 0.31
248 0.28
249 0.23
250 0.19
251 0.18
252 0.15
253 0.14
254 0.14
255 0.14
256 0.15
257 0.13
258 0.13
259 0.12
260 0.1
261 0.13
262 0.16
263 0.22
264 0.23
265 0.3
266 0.4
267 0.43
268 0.45
269 0.44
270 0.46
271 0.48
272 0.57
273 0.57
274 0.52
275 0.49
276 0.5
277 0.52
278 0.46
279 0.39
280 0.3
281 0.23
282 0.18
283 0.17
284 0.15
285 0.14
286 0.15
287 0.13
288 0.12
289 0.14
290 0.15
291 0.15
292 0.15
293 0.13
294 0.13
295 0.12
296 0.11
297 0.09
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.07
303 0.08
304 0.08
305 0.08
306 0.07
307 0.06
308 0.07
309 0.06
310 0.06
311 0.07
312 0.13
313 0.13
314 0.18
315 0.23
316 0.27
317 0.28
318 0.3
319 0.35
320 0.39
321 0.48
322 0.54
323 0.6
324 0.66
325 0.75
326 0.82
327 0.85
328 0.79
329 0.79
330 0.79
331 0.75
332 0.68
333 0.6
334 0.51
335 0.42
336 0.37
337 0.26
338 0.16
339 0.08
340 0.05
341 0.04
342 0.03
343 0.03
344 0.03
345 0.03
346 0.03
347 0.03
348 0.03
349 0.04
350 0.05
351 0.07
352 0.08
353 0.08
354 0.09
355 0.09
356 0.08
357 0.08
358 0.07
359 0.06
360 0.05
361 0.05
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.05
367 0.06
368 0.06
369 0.05
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.08
382 0.11
383 0.14
384 0.2
385 0.2
386 0.22
387 0.28
388 0.3
389 0.35
390 0.35
391 0.35
392 0.31
393 0.34
394 0.33
395 0.31
396 0.36
397 0.33
398 0.33
399 0.38
400 0.39
401 0.43
402 0.48
403 0.51
404 0.53
405 0.57
406 0.6
407 0.6
408 0.65
409 0.65
410 0.68
411 0.7
412 0.7
413 0.68
414 0.63
415 0.61
416 0.6
417 0.61
418 0.62
419 0.61
420 0.63
421 0.63
422 0.66
423 0.63
424 0.58
425 0.53
426 0.53
427 0.5
428 0.48
429 0.46
430 0.44
431 0.45
432 0.46
433 0.44
434 0.36
435 0.31
436 0.26
437 0.22
438 0.19
439 0.19
440 0.23
441 0.26
442 0.25
443 0.25
444 0.24
445 0.27
446 0.33
447 0.32
448 0.26
449 0.23
450 0.24
451 0.24
452 0.2
453 0.16
454 0.12
455 0.13
456 0.17
457 0.16
458 0.17
459 0.18
460 0.23
461 0.24
462 0.22
463 0.2
464 0.18
465 0.17
466 0.19
467 0.19
468 0.15
469 0.15
470 0.14
471 0.13
472 0.11
473 0.11
474 0.07
475 0.06
476 0.05
477 0.05
478 0.07
479 0.08
480 0.11
481 0.12
482 0.15
483 0.17
484 0.18
485 0.2
486 0.23
487 0.31
488 0.31
489 0.31
490 0.3
491 0.3
492 0.29
493 0.29
494 0.25
495 0.17
496 0.14
497 0.12
498 0.1
499 0.08
500 0.08
501 0.07
502 0.05
503 0.05
504 0.04
505 0.04
506 0.04
507 0.03
508 0.03
509 0.03
510 0.04
511 0.04
512 0.04
513 0.04
514 0.04
515 0.04
516 0.04
517 0.05
518 0.07
519 0.09
520 0.1
521 0.12
522 0.14
523 0.15
524 0.18
525 0.23
526 0.3
527 0.34
528 0.35
529 0.41
530 0.41
531 0.41
532 0.39
533 0.34
534 0.25
535 0.22
536 0.2
537 0.12
538 0.12
539 0.12
540 0.12
541 0.12
542 0.14
543 0.15
544 0.19
545 0.22
546 0.28
547 0.34
548 0.42
549 0.48
550 0.52
551 0.5
552 0.5
553 0.49
554 0.43
555 0.46
556 0.41
557 0.35
558 0.3
559 0.28
560 0.26
561 0.23
562 0.22
563 0.17
564 0.12
565 0.12
566 0.13
567 0.14
568 0.13
569 0.15
570 0.18
571 0.15
572 0.17
573 0.2
574 0.25
575 0.29
576 0.3
577 0.31
578 0.3
579 0.33
580 0.35
581 0.41
582 0.41
583 0.39
584 0.38
585 0.39
586 0.39
587 0.37
588 0.34
589 0.26
590 0.23
591 0.22
592 0.21
593 0.19
594 0.17
595 0.17
596 0.16
597 0.15
598 0.11
599 0.09
600 0.09
601 0.09
602 0.07
603 0.06
604 0.06
605 0.06
606 0.05
607 0.04
608 0.04
609 0.04
610 0.04
611 0.06
612 0.07
613 0.08
614 0.09
615 0.09
616 0.09
617 0.09
618 0.17
619 0.25
620 0.27
621 0.31
622 0.38
623 0.42
624 0.44
625 0.44
626 0.38
627 0.31
628 0.36
629 0.34
630 0.27
631 0.25
632 0.24
633 0.25
634 0.25
635 0.22
636 0.15
637 0.12
638 0.14
639 0.14
640 0.14
641 0.16
642 0.14
643 0.16
644 0.16
645 0.18
646 0.17
647 0.19
648 0.18
649 0.18
650 0.21
651 0.19
652 0.19
653 0.17
654 0.15
655 0.16
656 0.19
657 0.19
658 0.22
659 0.25
660 0.27
661 0.28
662 0.33
663 0.33
664 0.35
665 0.4
666 0.4
667 0.39
668 0.45
669 0.48
670 0.5
671 0.48
672 0.5
673 0.5
674 0.48
675 0.5
676 0.47
677 0.44
678 0.46
679 0.53
680 0.54
681 0.54
682 0.54
683 0.56
684 0.56
685 0.55
686 0.53
687 0.51
688 0.5
689 0.46
690 0.42
691 0.37
692 0.34
693 0.34
694 0.3
695 0.28
696 0.21
697 0.22
698 0.23
699 0.23
700 0.2
701 0.2
702 0.2
703 0.19
704 0.19
705 0.17
706 0.23
707 0.27
708 0.29
709 0.31
710 0.32
711 0.38
712 0.44
713 0.5
714 0.5
715 0.55
716 0.62
717 0.69
718 0.72
719 0.7
720 0.7
721 0.66
722 0.61
723 0.57
724 0.54
725 0.44
726 0.38
727 0.31
728 0.27
729 0.31
730 0.3
731 0.32
732 0.34
733 0.37
734 0.41
735 0.45
736 0.45
737 0.39
738 0.37
739 0.3
740 0.22
741 0.2
742 0.16
743 0.11
744 0.1
745 0.09
746 0.09
747 0.09
748 0.08
749 0.07
750 0.07
751 0.11
752 0.12
753 0.13
754 0.13
755 0.13
756 0.14
757 0.14
758 0.15
759 0.15
760 0.14
761 0.13
762 0.13
763 0.14
764 0.13
765 0.12
766 0.12
767 0.11
768 0.11
769 0.11
770 0.12
771 0.15
772 0.18
773 0.18
774 0.19
775 0.21
776 0.24
777 0.24
778 0.23
779 0.22
780 0.22
781 0.24
782 0.23
783 0.2
784 0.18
785 0.18
786 0.18
787 0.15
788 0.15
789 0.14
790 0.13
791 0.13
792 0.13
793 0.12
794 0.11
795 0.11