Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0F4Z3N6

Protein Details
Accession A0A0F4Z3N6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-26SKPAASQTPKMKRPPPPLSQTHydrophilic
326-346DSPLHRDRPPSPKRRKRTVAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
333-342RPPSPKRRKR
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 12.5, cyto_nucl 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MATAVSKPAASQTPKMKRPPPPLSQTGVNGIKPSQSSSSSPSMTSKRLPGTSQPSSANSASGTAANSANNRPVNRARKDAQKPGEALPSRPQRPSTRTSAELDRRVAKIPPEPYGCLIVKVVDHKSVSAQASKSTSSSTDEKNTPFSIHNYNQHVTPSPLVPYPKQNQIKVDSPKATEKSARKESDSAAESADGKKENEPADKSAEASPEKQPPPKPRVFTTVLHPTPRSLLAELTFLATTPDPRAVNKKQSGSQGTLKTQSSSAASQTSSSSTAAGPPPKRQKMLVEPQELPECESKLIRALAPPLYLEPVDSLEAAQNLLRFLDSPLHRDRPPSPKRRKRTVAELAADEALAAEEERFMLIMDERLEPTASAAAGGPKSAVDEAAGAAPFEPRFSRFKTIESIRIQHEEKAKREHERKLQQEHAKRQQQEQERERRRLLEQRQAEEHAREEARRQQLAAQQAQAQLAAQQQNRHAMAQANGISQVSQGQMSSPVVRNQTPHNTSSPVVGANMGTQAAVSMSMSASAQGAGSPQRPPSTLQHSHPGVMGHPMAPSRSQQSQSRHGTPQMTQGTPAMSHATPVMRNVTPTQRMSHGSPPNTSMTQTPVMGHAMMGTPQMGGGMGLTPQQQQMLLQQRQQQMLAQQGHAGHGQFTPQQLAQMQANAHAQQSIQSHQQQMLQQHQAQQNQHAQQQQQHNMQQLQNQQAYQAQLMRTQLVQMQMAQQKQQQQQQQQQGQGNTPQMTLHQQQQQQMLMAAAQANGGHLSTERTVFAALPATVPAATPPIATRYGPTVDGAIRTTSSVSAAYCAAIWSGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.67
3 0.71
4 0.73
5 0.79
6 0.82
7 0.8
8 0.79
9 0.77
10 0.74
11 0.7
12 0.64
13 0.62
14 0.58
15 0.49
16 0.42
17 0.37
18 0.35
19 0.31
20 0.31
21 0.26
22 0.25
23 0.27
24 0.31
25 0.37
26 0.34
27 0.35
28 0.38
29 0.39
30 0.4
31 0.42
32 0.43
33 0.43
34 0.45
35 0.46
36 0.48
37 0.52
38 0.53
39 0.54
40 0.5
41 0.47
42 0.49
43 0.46
44 0.38
45 0.3
46 0.25
47 0.21
48 0.19
49 0.17
50 0.14
51 0.15
52 0.16
53 0.19
54 0.2
55 0.26
56 0.3
57 0.3
58 0.34
59 0.43
60 0.5
61 0.52
62 0.58
63 0.56
64 0.62
65 0.7
66 0.73
67 0.71
68 0.68
69 0.65
70 0.61
71 0.66
72 0.57
73 0.52
74 0.51
75 0.54
76 0.51
77 0.52
78 0.54
79 0.53
80 0.57
81 0.6
82 0.59
83 0.55
84 0.55
85 0.56
86 0.6
87 0.6
88 0.6
89 0.59
90 0.55
91 0.5
92 0.49
93 0.47
94 0.41
95 0.39
96 0.37
97 0.4
98 0.39
99 0.39
100 0.39
101 0.43
102 0.39
103 0.33
104 0.3
105 0.24
106 0.21
107 0.24
108 0.25
109 0.23
110 0.22
111 0.21
112 0.23
113 0.27
114 0.28
115 0.28
116 0.26
117 0.25
118 0.28
119 0.28
120 0.27
121 0.23
122 0.22
123 0.22
124 0.26
125 0.26
126 0.3
127 0.33
128 0.35
129 0.37
130 0.37
131 0.35
132 0.33
133 0.32
134 0.34
135 0.36
136 0.41
137 0.43
138 0.43
139 0.42
140 0.42
141 0.4
142 0.34
143 0.3
144 0.24
145 0.2
146 0.23
147 0.25
148 0.26
149 0.32
150 0.34
151 0.42
152 0.47
153 0.48
154 0.5
155 0.52
156 0.58
157 0.57
158 0.6
159 0.53
160 0.5
161 0.55
162 0.52
163 0.5
164 0.49
165 0.49
166 0.5
167 0.56
168 0.55
169 0.51
170 0.52
171 0.5
172 0.5
173 0.46
174 0.37
175 0.29
176 0.27
177 0.24
178 0.23
179 0.24
180 0.17
181 0.16
182 0.17
183 0.21
184 0.23
185 0.28
186 0.3
187 0.29
188 0.32
189 0.31
190 0.31
191 0.29
192 0.3
193 0.26
194 0.27
195 0.29
196 0.33
197 0.36
198 0.4
199 0.45
200 0.49
201 0.56
202 0.6
203 0.59
204 0.54
205 0.58
206 0.57
207 0.52
208 0.5
209 0.52
210 0.48
211 0.48
212 0.44
213 0.38
214 0.35
215 0.35
216 0.3
217 0.2
218 0.18
219 0.15
220 0.16
221 0.15
222 0.14
223 0.12
224 0.1
225 0.11
226 0.09
227 0.1
228 0.1
229 0.14
230 0.13
231 0.16
232 0.24
233 0.28
234 0.37
235 0.42
236 0.45
237 0.45
238 0.52
239 0.54
240 0.51
241 0.52
242 0.48
243 0.45
244 0.45
245 0.41
246 0.35
247 0.31
248 0.28
249 0.23
250 0.19
251 0.18
252 0.15
253 0.14
254 0.14
255 0.14
256 0.15
257 0.13
258 0.13
259 0.12
260 0.1
261 0.13
262 0.16
263 0.22
264 0.23
265 0.3
266 0.4
267 0.43
268 0.45
269 0.44
270 0.46
271 0.48
272 0.57
273 0.57
274 0.52
275 0.49
276 0.5
277 0.52
278 0.46
279 0.39
280 0.3
281 0.23
282 0.18
283 0.17
284 0.15
285 0.14
286 0.15
287 0.13
288 0.12
289 0.14
290 0.15
291 0.15
292 0.15
293 0.13
294 0.13
295 0.12
296 0.11
297 0.09
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.07
303 0.08
304 0.08
305 0.08
306 0.07
307 0.06
308 0.07
309 0.06
310 0.06
311 0.07
312 0.13
313 0.13
314 0.18
315 0.23
316 0.27
317 0.28
318 0.3
319 0.35
320 0.39
321 0.48
322 0.54
323 0.6
324 0.66
325 0.75
326 0.82
327 0.85
328 0.79
329 0.79
330 0.79
331 0.75
332 0.68
333 0.6
334 0.51
335 0.42
336 0.37
337 0.26
338 0.16
339 0.08
340 0.05
341 0.04
342 0.03
343 0.03
344 0.03
345 0.03
346 0.03
347 0.03
348 0.03
349 0.04
350 0.05
351 0.07
352 0.08
353 0.08
354 0.09
355 0.09
356 0.08
357 0.08
358 0.07
359 0.06
360 0.05
361 0.05
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.05
367 0.06
368 0.06
369 0.05
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.08
382 0.11
383 0.14
384 0.2
385 0.2
386 0.22
387 0.28
388 0.3
389 0.35
390 0.35
391 0.35
392 0.31
393 0.34
394 0.33
395 0.31
396 0.36
397 0.33
398 0.33
399 0.38
400 0.39
401 0.43
402 0.48
403 0.51
404 0.53
405 0.57
406 0.6
407 0.6
408 0.65
409 0.65
410 0.68
411 0.7
412 0.7
413 0.68
414 0.63
415 0.61
416 0.6
417 0.61
418 0.62
419 0.61
420 0.63
421 0.63
422 0.66
423 0.63
424 0.58
425 0.53
426 0.53
427 0.5
428 0.48
429 0.46
430 0.44
431 0.45
432 0.46
433 0.44
434 0.36
435 0.31
436 0.26
437 0.22
438 0.19
439 0.19
440 0.23
441 0.26
442 0.25
443 0.25
444 0.24
445 0.27
446 0.33
447 0.32
448 0.26
449 0.23
450 0.24
451 0.24
452 0.2
453 0.16
454 0.12
455 0.13
456 0.17
457 0.16
458 0.17
459 0.18
460 0.23
461 0.24
462 0.22
463 0.2
464 0.18
465 0.17
466 0.19
467 0.19
468 0.15
469 0.15
470 0.14
471 0.13
472 0.11
473 0.11
474 0.07
475 0.06
476 0.05
477 0.05
478 0.07
479 0.08
480 0.11
481 0.12
482 0.15
483 0.17
484 0.18
485 0.2
486 0.23
487 0.31
488 0.31
489 0.31
490 0.3
491 0.3
492 0.29
493 0.29
494 0.25
495 0.17
496 0.14
497 0.12
498 0.1
499 0.08
500 0.08
501 0.07
502 0.05
503 0.05
504 0.04
505 0.04
506 0.04
507 0.03
508 0.03
509 0.03
510 0.04
511 0.04
512 0.04
513 0.04
514 0.04
515 0.04
516 0.04
517 0.05
518 0.07
519 0.09
520 0.1
521 0.12
522 0.14
523 0.15
524 0.18
525 0.23
526 0.3
527 0.34
528 0.35
529 0.41
530 0.41
531 0.41
532 0.39
533 0.34
534 0.25
535 0.22
536 0.2
537 0.12
538 0.12
539 0.12
540 0.12
541 0.12
542 0.14
543 0.15
544 0.19
545 0.22
546 0.28
547 0.34
548 0.42
549 0.48
550 0.52
551 0.5
552 0.5
553 0.49
554 0.43
555 0.46
556 0.41
557 0.35
558 0.3
559 0.28
560 0.26
561 0.23
562 0.22
563 0.17
564 0.12
565 0.12
566 0.13
567 0.14
568 0.13
569 0.15
570 0.18
571 0.15
572 0.17
573 0.2
574 0.25
575 0.29
576 0.3
577 0.31
578 0.3
579 0.33
580 0.35
581 0.41
582 0.41
583 0.39
584 0.38
585 0.39
586 0.39
587 0.37
588 0.34
589 0.26
590 0.23
591 0.22
592 0.21
593 0.19
594 0.17
595 0.17
596 0.16
597 0.15
598 0.11
599 0.09
600 0.09
601 0.09
602 0.07
603 0.06
604 0.06
605 0.06
606 0.05
607 0.04
608 0.04
609 0.04
610 0.04
611 0.06
612 0.07
613 0.08
614 0.09
615 0.09
616 0.09
617 0.09
618 0.17
619 0.25
620 0.27
621 0.31
622 0.38
623 0.42
624 0.44
625 0.44
626 0.38
627 0.31
628 0.36
629 0.34
630 0.27
631 0.25
632 0.24
633 0.25
634 0.25
635 0.22
636 0.15
637 0.12
638 0.14
639 0.14
640 0.14
641 0.16
642 0.14
643 0.16
644 0.16
645 0.18
646 0.17
647 0.19
648 0.18
649 0.18
650 0.21
651 0.19
652 0.19
653 0.17
654 0.15
655 0.16
656 0.19
657 0.19
658 0.22
659 0.25
660 0.27
661 0.28
662 0.33
663 0.33
664 0.35
665 0.4
666 0.4
667 0.39
668 0.45
669 0.48
670 0.5
671 0.48
672 0.5
673 0.5
674 0.48
675 0.5
676 0.47
677 0.44
678 0.46
679 0.53
680 0.54
681 0.54
682 0.54
683 0.56
684 0.56
685 0.55
686 0.53
687 0.51
688 0.5
689 0.46
690 0.42
691 0.37
692 0.34
693 0.34
694 0.3
695 0.28
696 0.21
697 0.22
698 0.23
699 0.23
700 0.2
701 0.2
702 0.2
703 0.19
704 0.19
705 0.17
706 0.23
707 0.27
708 0.29
709 0.31
710 0.32
711 0.38
712 0.44
713 0.5
714 0.5
715 0.55
716 0.62
717 0.69
718 0.72
719 0.7
720 0.7
721 0.66
722 0.61
723 0.57
724 0.54
725 0.44
726 0.38
727 0.31
728 0.27
729 0.31
730 0.3
731 0.32
732 0.34
733 0.37
734 0.41
735 0.45
736 0.45
737 0.39
738 0.37
739 0.3
740 0.22
741 0.2
742 0.16
743 0.11
744 0.1
745 0.09
746 0.09
747 0.09
748 0.08
749 0.07
750 0.07
751 0.11
752 0.12
753 0.13
754 0.13
755 0.13
756 0.14
757 0.14
758 0.15
759 0.15
760 0.14
761 0.13
762 0.13
763 0.14
764 0.13
765 0.12
766 0.12
767 0.11
768 0.11
769 0.11
770 0.12
771 0.15
772 0.18
773 0.18
774 0.19
775 0.21
776 0.24
777 0.24
778 0.23
779 0.22
780 0.22
781 0.24
782 0.23
783 0.2
784 0.18
785 0.18
786 0.18
787 0.15
788 0.15
789 0.14
790 0.13
791 0.13
792 0.13
793 0.12
794 0.11
795 0.11