FuNGI

A0A0F4YJD6

Protein Details

Accession

A0A0F4YJD6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
34-55	GTGEGLRPRKRARQNVDDLKSE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
560-575	RGRGQAPRGAPQRGGH

Subcellular Location(s)

cyto 11.5, nucl 8, cyto_mito 7, pero 4, cysk 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR025696 rRNA_proc-arch_dom IPR016438 SKI2-like IPR012961 Ski2/MTR4_C IPR040801 Ski2_N
Gene Ontology	GO:0005524 F:ATP binding GO:0016787 F:hydrolase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0006401 P:RNA catabolic process
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF08148 DSHCT PF00271 Helicase_C PF13234 rRNA_proc-arch PF17911 Ski2_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER
CDD	cd18795 SF2_C_Ski2

Amino Acid Sequences

MVDSLASSLAQLRLNADRADAANFDARIAEEEMGTGEGLRPRKRARQNVDDLKSELERDFLTPSPRFSPDWLNRLQRRWEVSTDYRDLFEIAPTQTRTIIRFTREGLEGRVTGYHEVTVPANSATAKNSTSMLRRPAGRADFVRGAAGFFPFAPGGLEGVEAIAEMESDAQAAEQQKITGKQSGLDRIINFGTEGGLLEVPPGFSRGLKFEKPKSKEAEEDDRDVENTLEQEDDIHLENREPSAEINERVGPHDEGEISEEEEEDIDSLLPVEFPALEPRGPLLTAAAKKVGREWAHVVDVNKEIPNFHELVPDMAKEWPFELDTFQKEAVYHLENGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAAKHMTKAIYTSPIKALSNQKFRDFRNTFDDVGILTGDVQINPEASCLIMTTEILRSMLYRGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDMERGVVWEEVIIMLPEHVTLILLSATVPNTYEFASWVGRTKKKDIYVISTAKRPVPLEHYLWSGKAMHKIVDSNKRFLEKGWKEADDILSGRDKIKAQKAAEAQAQAQASQRGGPQGRGRGQAPRGAPQRGGHQQRGGQQGGPAPRGRGQPATRGTGNIARTGRGDGRTTAAQDRTVWVHLVQHLRKENLLPACIFVFSKKRCEENAESLSNQDFCTASEKSAIHMIIEKSLARLKPEDRVLPQILRLREQLNRGVAVHHGGLLPIMKEIVEILFSKTLVKVLFATETFAMGLNLPTRTVVFSGFRKHDGKGFRDLLPGEYTQMAGRAGRRGLDTVGYVIIVTIGRDEAPPAGTLKRMILGDPTKLRSQFRLTYNMILNLLRVEALKIEEMIKRSFSENATQALLPEHEKQVQLSEASLAKIKREPCSYCDIDLEKCHQAAVEYEKLTRELHLGLLTSPNGIRTAGVIVREGIAGGGEPSIQVLEIGALGDKRHPSDILPFLPIFRHLFRPLPTRSADMTLKTCRIPLADVECATSTMVKVGGPIWYLNIKKGEDVVTISGRGTALTAVTEAIKFGDKELPKYCSSWETPTWDELDWARVKELQVRDILDRRQAQAAIVQSCQCLACPQFLKHFEMQHDEWQVKENISQLKQLMSDQNLQLLPDYEQRVQVLKDLGFIDEECRVQLKGKVACEIHSADELVLTELILENVLAEYEPEEIVALLSAFVFQEKTENEPTLTPRLEKGKEAIIRISEKVNDYQIQHQVIQSSDDANDFTSQPRFGLVEVVYEWAKGMSFNRITDLTDVMEGTIVRTITRLDETLREVKNAAKLVGDPTLYTKMQQAQEMIKRDVIFAASLYM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.25
3	0.23
4	0.23
5	0.22
6	0.24
7	0.21
8	0.2
9	0.21
10	0.21
11	0.2
12	0.18
13	0.17
14	0.18
15	0.2
16	0.17
17	0.12
18	0.12
19	0.13
20	0.13
21	0.12
22	0.09
23	0.1
24	0.15
25	0.22
26	0.26
27	0.32
28	0.38
29	0.48
30	0.58
31	0.66
32	0.7
33	0.74
34	0.81
35	0.85
36	0.84
37	0.78
38	0.69
39	0.63
40	0.55
41	0.47
42	0.36
43	0.27
44	0.23
45	0.2
46	0.22
47	0.21
48	0.26
49	0.26
50	0.3
51	0.33
52	0.35
53	0.35
54	0.35
55	0.43
56	0.44
57	0.49
58	0.53
59	0.58
60	0.61
61	0.66
62	0.7
63	0.66
64	0.65
65	0.63
66	0.59
67	0.57
68	0.58
69	0.59
70	0.57
71	0.52
72	0.46
73	0.41
74	0.38
75	0.31
76	0.26
77	0.22
78	0.18
79	0.23
80	0.24
81	0.24
82	0.27
83	0.29
84	0.28
85	0.31
86	0.35
87	0.33
88	0.35
89	0.37
90	0.37
91	0.39
92	0.39
93	0.35
94	0.34
95	0.3
96	0.28
97	0.27
98	0.24
99	0.22
100	0.21
101	0.18
102	0.14
103	0.16
104	0.16
105	0.14
106	0.14
107	0.12
108	0.13
109	0.13
110	0.13
111	0.14
112	0.16
113	0.15
114	0.15
115	0.17
116	0.2
117	0.25
118	0.3
119	0.34
120	0.36
121	0.39
122	0.41
123	0.47
124	0.47
125	0.48
126	0.44
127	0.45
128	0.44
129	0.41
130	0.4
131	0.32
132	0.29
133	0.23
134	0.21
135	0.15
136	0.11
137	0.12
138	0.1
139	0.1
140	0.1
141	0.09
142	0.09
143	0.08
144	0.09
145	0.06
146	0.06
147	0.06
148	0.05
149	0.05
150	0.04
151	0.03
152	0.03
153	0.04
154	0.04
155	0.04
156	0.04
157	0.04
158	0.07
159	0.09
160	0.11
161	0.11
162	0.13
163	0.17
164	0.21
165	0.24
166	0.26
167	0.25
168	0.27
169	0.32
170	0.38
171	0.38
172	0.38
173	0.36
174	0.34
175	0.34
176	0.3
177	0.25
178	0.17
179	0.14
180	0.1
181	0.1
182	0.08
183	0.07
184	0.07
185	0.07
186	0.08
187	0.08
188	0.08
189	0.09
190	0.08
191	0.09
192	0.11
193	0.16
194	0.23
195	0.29
196	0.36
197	0.44
198	0.54
199	0.58
200	0.64
201	0.65
202	0.63
203	0.63
204	0.63
205	0.64
206	0.58
207	0.57
208	0.52
209	0.46
210	0.42
211	0.36
212	0.29
213	0.19
214	0.16
215	0.12
216	0.1
217	0.08
218	0.09
219	0.09
220	0.1
221	0.11
222	0.12
223	0.12
224	0.12
225	0.14
226	0.14
227	0.14
228	0.13
229	0.11
230	0.16
231	0.2
232	0.2
233	0.21
234	0.24
235	0.24
236	0.26
237	0.29
238	0.23
239	0.2
240	0.2
241	0.18
242	0.15
243	0.17
244	0.15
245	0.13
246	0.12
247	0.11
248	0.1
249	0.1
250	0.09
251	0.07
252	0.06
253	0.05
254	0.05
255	0.05
256	0.05
257	0.05
258	0.05
259	0.05
260	0.05
261	0.05
262	0.1
263	0.11
264	0.11
265	0.12
266	0.13
267	0.14
268	0.14
269	0.13
270	0.11
271	0.16
272	0.18
273	0.19
274	0.23
275	0.23
276	0.23
277	0.26
278	0.31
279	0.26
280	0.28
281	0.31
282	0.3
283	0.33
284	0.35
285	0.33
286	0.29
287	0.29
288	0.28
289	0.24
290	0.21
291	0.18
292	0.17
293	0.19
294	0.18
295	0.16
296	0.17
297	0.16
298	0.19
299	0.2
300	0.18
301	0.16
302	0.17
303	0.17
304	0.14
305	0.14
306	0.13
307	0.12
308	0.12
309	0.14
310	0.16
311	0.19
312	0.21
313	0.2
314	0.2
315	0.19
316	0.2
317	0.2
318	0.18
319	0.17
320	0.15
321	0.15
322	0.14
323	0.14
324	0.14
325	0.1
326	0.07
327	0.06
328	0.05
329	0.05
330	0.05
331	0.05
332	0.05
333	0.06
334	0.06
335	0.07
336	0.07
337	0.06
338	0.07
339	0.07
340	0.07
341	0.07
342	0.06
343	0.07
344	0.07
345	0.07
346	0.06
347	0.05
348	0.07
349	0.07
350	0.08
351	0.08
352	0.08
353	0.08
354	0.1
355	0.11
356	0.18
357	0.19
358	0.21
359	0.23
360	0.26
361	0.26
362	0.3
363	0.38
364	0.38
365	0.47
366	0.47
367	0.52
368	0.54
369	0.55
370	0.61
371	0.53
372	0.48
373	0.45
374	0.46
375	0.4
376	0.35
377	0.33
378	0.22
379	0.21
380	0.17
381	0.1
382	0.06
383	0.07
384	0.07
385	0.06
386	0.07
387	0.07
388	0.07
389	0.07
390	0.07
391	0.06
392	0.05
393	0.05
394	0.05
395	0.05
396	0.05
397	0.05
398	0.06
399	0.07
400	0.07
401	0.08
402	0.07
403	0.07
404	0.08
405	0.11
406	0.1
407	0.09
408	0.1
409	0.11
410	0.11
411	0.11
412	0.11
413	0.09
414	0.09
415	0.1
416	0.08
417	0.07
418	0.07
419	0.09
420	0.07
421	0.06
422	0.08
423	0.08
424	0.08
425	0.09
426	0.09
427	0.07
428	0.09
429	0.09
430	0.07
431	0.07
432	0.08
433	0.09
434	0.08
435	0.08
436	0.06
437	0.06
438	0.06
439	0.06
440	0.05
441	0.04
442	0.04
443	0.04
444	0.04
445	0.03
446	0.03
447	0.03
448	0.03
449	0.03
450	0.03
451	0.03
452	0.04
453	0.05
454	0.05
455	0.05
456	0.06
457	0.06
458	0.07
459	0.07
460	0.07
461	0.07
462	0.09
463	0.1
464	0.1
465	0.16
466	0.22
467	0.26
468	0.29
469	0.34
470	0.37
471	0.4
472	0.45
473	0.41
474	0.41
475	0.44
476	0.47
477	0.44
478	0.43
479	0.41
480	0.37
481	0.37
482	0.31
483	0.25
484	0.25
485	0.27
486	0.25
487	0.25
488	0.27
489	0.25
490	0.25
491	0.24
492	0.2
493	0.18
494	0.21
495	0.2
496	0.18
497	0.18
498	0.21
499	0.27
500	0.35
501	0.36
502	0.34
503	0.35
504	0.36
505	0.35
506	0.33
507	0.37
508	0.29
509	0.34
510	0.35
511	0.33
512	0.32
513	0.34
514	0.33
515	0.24
516	0.22
517	0.17
518	0.15
519	0.14
520	0.14
521	0.15
522	0.16
523	0.18
524	0.25
525	0.3
526	0.28
527	0.33
528	0.35
529	0.36
530	0.37
531	0.33
532	0.27
533	0.24
534	0.24
535	0.18
536	0.17
537	0.15
538	0.12
539	0.12
540	0.12
541	0.14
542	0.14
543	0.17
544	0.19
545	0.25
546	0.28
547	0.29
548	0.3
549	0.31
550	0.32
551	0.33
552	0.31
553	0.32
554	0.33
555	0.32
556	0.33
557	0.28
558	0.34
559	0.37
560	0.41
561	0.36
562	0.35
563	0.37
564	0.41
565	0.45
566	0.39
567	0.31
568	0.27
569	0.28
570	0.28
571	0.27
572	0.22
573	0.17
574	0.21
575	0.22
576	0.22
577	0.25
578	0.24
579	0.29
580	0.31
581	0.34
582	0.3
583	0.29
584	0.29
585	0.27
586	0.27
587	0.24
588	0.22
589	0.18
590	0.18
591	0.2
592	0.21
593	0.18
594	0.18
595	0.14
596	0.16
597	0.16
598	0.17
599	0.18
600	0.17
601	0.16
602	0.15
603	0.15
604	0.14
605	0.14
606	0.13
607	0.1
608	0.11
609	0.14
610	0.21
611	0.2
612	0.24
613	0.26
614	0.26
615	0.27
616	0.26
617	0.26
618	0.21
619	0.21
620	0.16
621	0.14
622	0.14
623	0.14
624	0.13
625	0.1
626	0.16
627	0.16
628	0.23
629	0.24
630	0.26
631	0.26
632	0.33
633	0.35
634	0.36
635	0.4
636	0.35
637	0.33
638	0.32
639	0.31
640	0.26
641	0.21
642	0.14
643	0.09
644	0.07
645	0.11
646	0.11
647	0.1
648	0.14
649	0.14
650	0.14
651	0.16
652	0.16
653	0.12
654	0.15
655	0.15
656	0.12
657	0.13
658	0.12
659	0.1
660	0.14
661	0.14
662	0.12
663	0.14
664	0.14
665	0.19
666	0.22
667	0.24
668	0.22
669	0.27
670	0.27
671	0.25
672	0.29
673	0.28
674	0.26
675	0.25
676	0.25
677	0.22
678	0.24
679	0.26
680	0.25
681	0.21
682	0.21
683	0.19
684	0.18
685	0.16
686	0.15
687	0.12
688	0.09
689	0.08
690	0.07
691	0.07
692	0.07
693	0.06
694	0.05
695	0.05
696	0.04
697	0.04
698	0.04
699	0.04
700	0.04
701	0.05
702	0.06
703	0.07
704	0.07
705	0.08
706	0.08
707	0.1
708	0.08
709	0.08
710	0.08
711	0.08
712	0.09
713	0.09
714	0.1
715	0.09
716	0.09
717	0.08
718	0.08
719	0.07
720	0.06
721	0.07
722	0.07
723	0.07
724	0.07
725	0.06
726	0.07
727	0.07
728	0.07
729	0.08
730	0.1
731	0.12
732	0.18
733	0.19
734	0.24
735	0.25
736	0.25
737	0.28
738	0.31
739	0.31
740	0.34
741	0.35
742	0.32
743	0.33
744	0.33
745	0.29
746	0.26
747	0.23
748	0.17
749	0.14
750	0.13
751	0.1
752	0.11
753	0.09
754	0.08
755	0.09
756	0.11
757	0.11
758	0.12
759	0.12
760	0.12
761	0.12
762	0.12
763	0.11
764	0.09
765	0.09
766	0.08
767	0.07
768	0.06
769	0.06
770	0.05
771	0.04
772	0.04
773	0.04
774	0.04
775	0.04
776	0.05
777	0.05
778	0.06
779	0.06
780	0.08
781	0.08
782	0.09
783	0.1
784	0.09
785	0.11
786	0.11
787	0.11
788	0.15
789	0.16
790	0.2
791	0.23
792	0.25
793	0.26
794	0.28
795	0.29
796	0.27
797	0.31
798	0.33
799	0.33
800	0.37
801	0.36
802	0.38
803	0.38
804	0.36
805	0.32
806	0.25
807	0.22
808	0.15
809	0.13
810	0.09
811	0.07
812	0.06
813	0.05
814	0.06
815	0.06
816	0.07
817	0.09
818	0.11
819	0.13
820	0.14
821	0.14
822	0.15
823	0.16
824	0.18
825	0.17
826	0.2
827	0.2
828	0.2
829	0.21
830	0.2
831	0.19
832	0.17
833	0.17
834	0.15
835	0.15
836	0.15
837	0.16
838	0.16
839	0.16
840	0.17
841	0.17
842	0.14
843	0.12
844	0.12
845	0.11
846	0.12
847	0.15
848	0.13
849	0.14
850	0.18
851	0.2
852	0.23
853	0.28
854	0.29
855	0.29
856	0.37
857	0.37
858	0.34
859	0.36
860	0.33
861	0.3
862	0.3
863	0.31
864	0.25
865	0.23
866	0.22
867	0.18
868	0.16
869	0.16
870	0.19
871	0.2
872	0.19
873	0.2
874	0.21
875	0.22
876	0.22
877	0.2
878	0.16
879	0.11
880	0.11
881	0.11
882	0.11
883	0.1
884	0.12
885	0.12
886	0.11
887	0.1
888	0.1
889	0.1
890	0.09
891	0.08
892	0.07
893	0.1
894	0.1
895	0.11
896	0.11
897	0.1
898	0.11
899	0.11
900	0.1
901	0.07
902	0.05
903	0.04
904	0.04
905	0.04
906	0.03
907	0.03
908	0.03
909	0.04
910	0.03
911	0.03
912	0.03
913	0.03
914	0.03
915	0.03
916	0.04
917	0.05
918	0.05
919	0.08
920	0.1
921	0.11
922	0.12
923	0.12
924	0.13
925	0.19
926	0.24
927	0.23
928	0.25
929	0.24
930	0.23
931	0.24
932	0.25
933	0.22
934	0.19
935	0.22
936	0.22
937	0.26
938	0.28
939	0.35
940	0.35
941	0.36
942	0.36
943	0.35
944	0.34
945	0.35
946	0.34
947	0.3
948	0.32
949	0.32
950	0.32
951	0.29
952	0.28
953	0.24
954	0.23
955	0.2
956	0.2
957	0.21
958	0.22
959	0.22
960	0.23
961	0.23
962	0.22
963	0.21
964	0.17
965	0.11
966	0.09
967	0.09
968	0.07
969	0.07
970	0.07
971	0.09
972	0.09
973	0.09
974	0.1
975	0.16
976	0.16
977	0.2
978	0.23
979	0.22
980	0.21
981	0.23
982	0.23
983	0.19
984	0.2
985	0.2
986	0.17
987	0.17
988	0.16
989	0.15
990	0.13
991	0.12
992	0.1
993	0.08
994	0.06
995	0.06
996	0.06
997	0.06
998	0.07
999	0.07
1000	0.06
1001	0.07
1002	0.09
1003	0.09
1004	0.1
1005	0.17
1006	0.18
1007	0.23
1008	0.27
1009	0.31
1010	0.3
1011	0.31
1012	0.32
1013	0.3
1014	0.32
1015	0.33
1016	0.32
1017	0.34
1018	0.34
1019	0.35
1020	0.35
1021	0.3
1022	0.28
1023	0.23
1024	0.26
1025	0.23
1026	0.22
1027	0.21
1028	0.21
1029	0.22
1030	0.27
1031	0.29
1032	0.26
1033	0.26
1034	0.28
1035	0.32
1036	0.35
1037	0.37
1038	0.37
1039	0.37
1040	0.36
1041	0.36
1042	0.34
1043	0.3
1044	0.28
1045	0.31
1046	0.26
1047	0.25
1048	0.23
1049	0.2
1050	0.2
1051	0.2
1052	0.16
1053	0.14
1054	0.13
1055	0.18
1056	0.22
1057	0.24
1058	0.31
1059	0.35
1060	0.4
1061	0.41
1062	0.44
1063	0.4
1064	0.43
1065	0.43
1066	0.41
1067	0.43
1068	0.38
1069	0.34
1070	0.34
1071	0.33
1072	0.27
1073	0.25
1074	0.24
1075	0.27
1076	0.28
1077	0.31
1078	0.27
1079	0.28
1080	0.28
1081	0.3
1082	0.3
1083	0.26
1084	0.3
1085	0.27
1086	0.31
1087	0.29
1088	0.28
1089	0.26
1090	0.22
1091	0.21
1092	0.21
1093	0.25
1094	0.21
1095	0.23
1096	0.24
1097	0.26
1098	0.25
1099	0.26
1100	0.25
1101	0.2
1102	0.23
1103	0.21
1104	0.21
1105	0.19
1106	0.19
1107	0.17
1108	0.16
1109	0.16
1110	0.13
1111	0.14
1112	0.14
1113	0.15
1114	0.19
1115	0.25
1116	0.27
1117	0.29
1118	0.35
1119	0.34
1120	0.35
1121	0.37
1122	0.35
1123	0.29
1124	0.26
1125	0.24
1126	0.17
1127	0.17
1128	0.16
1129	0.13
1130	0.11
1131	0.09
1132	0.07
1133	0.07
1134	0.07
1135	0.06
1136	0.05
1137	0.04
1138	0.04
1139	0.05
1140	0.04
1141	0.04
1142	0.05
1143	0.06
1144	0.06
1145	0.06
1146	0.06
1147	0.06
1148	0.06
1149	0.06
1150	0.06
1151	0.04
1152	0.04
1153	0.05
1154	0.05
1155	0.05
1156	0.06
1157	0.05
1158	0.1
1159	0.11
1160	0.17
1161	0.21
1162	0.23
1163	0.24
1164	0.27
1165	0.31
1166	0.33
1167	0.35
1168	0.31
1169	0.32
1170	0.38
1171	0.39
1172	0.38
1173	0.37
1174	0.39
1175	0.41
1176	0.42
1177	0.41
1178	0.38
1179	0.39
1180	0.38
1181	0.39
1182	0.34
1183	0.33
1184	0.33
1185	0.34
1186	0.32
1187	0.32
1188	0.37
1189	0.4
1190	0.4
1191	0.38
1192	0.36
1193	0.34
1194	0.31
1195	0.3
1196	0.24
1197	0.2
1198	0.17
1199	0.16
1200	0.16
1201	0.15
1202	0.16
1203	0.14
1204	0.16
1205	0.18
1206	0.18
1207	0.17
1208	0.18
1209	0.17
1210	0.16
1211	0.2
1212	0.17
1213	0.17
1214	0.17
1215	0.2
1216	0.18
1217	0.17
1218	0.17
1219	0.12
1220	0.12
1221	0.1
1222	0.12
1223	0.18
1224	0.21
1225	0.22
1226	0.25
1227	0.26
1228	0.28
1229	0.28
1230	0.28
1231	0.2
1232	0.18
1233	0.17
1234	0.14
1235	0.14
1236	0.12
1237	0.11
1238	0.13
1239	0.11
1240	0.1
1241	0.11
1242	0.12
1243	0.13
1244	0.16
1245	0.17
1246	0.16
1247	0.2
1248	0.26
1249	0.34
1250	0.35
1251	0.34
1252	0.32
1253	0.34
1254	0.38
1255	0.37
1256	0.31
1257	0.25
1258	0.25
1259	0.26
1260	0.3
1261	0.26
1262	0.2
1263	0.22
1264	0.27
1265	0.26
1266	0.26
1267	0.27
1268	0.3
1269	0.33
1270	0.36
1271	0.35
1272	0.38
1273	0.45
1274	0.51
1275	0.48
1276	0.45
1277	0.42
1278	0.4
1279	0.38
1280	0.3
1281	0.23

A0A0F4YJD6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer