Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0F4YXC0

Protein Details
Accession A0A0F4YXC0    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
186-234EHDPREKLRRQLAERRRQARRDDSNGDYRRRRFDEREHRRRRRDESFAABasic
256-277DAEGRHRPRRGRQKELFPDHGPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
189-228PREKLRRQLAERRRQARRDDSNGDYRRRRFDEREHRRRRR
260-269RHRPRRGRQK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006594  LisH  
IPR019416  NCBP3  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
Amino Acid Sequences MEVASLQQPSLQPQPSNDANPPPSAVDGSMDIDMDIDLGPIPEPETVETETLEPTAAPQDGTVDPLTAEAQYEKVHIRGVDELTTDDLKRFAAEHFPVEEPTRIEWIDDTSANFVYSSEEVGLQALKAFSQLGEEDVSSFPSLRLRTAKSLSTHPESVLQVRSAVKTDRKKPRAHEASRFYLLHPEHDPREKLRRQLAERRRQARRDDSNGDYRRRRFDEREHRRRRRDESFAANMYDDMDGSDRRRGGSSEDFSDAEGRHRPRRGRQKELFPDHGPEPGRLRDRSASPGRNDLNGMRRSDDERQDSRRRFRERSPQLGSSRANEGKELFPSKLSGDGDSQKRELFPNKTVDSYLKKELFPNKTSSNHRRSDAFDAADETADLFSKRIHVSLMDGARDRADVGESGEASGISIRGAASNGQGISIRGSANGISIKGSASASVRELFPSKYNPNAGKELFSDKLEVIIITTSLIIMTMPQSTNGGSSSSSSSSIPLASLLVARFLRYNNYAATLETFIREAGLPPDAGSASTEQNGRGGRYEYDDWTLEGVIQEKKTFDQSLRFERYGDDDDDDGRKRDRWSVPAPSKPTLVDTPGSSNLLSVSVEPWQQQEEQDDVGSYLVATAADKSLNLFDVGRSNQVVASLSGLSDSPILSYVSIRGGRYQLATSMSGQLLLIKNAEVLDRRKDHSKYAVKVVAYEDEDEDDRVWIVTAGWDAKVLIYRMTLSSSSPTTIGQPVATIKLPTNPESILIVRNPDSRELMLLVSRHDSTYIYYYALEPLRSSEENQQQQQQQQCECVLRGKQNLAPHSNAWIAFSPSCMAPSPHDPGLLAVALSTLPHMKVMIVRLLFPSSDSVDNTAAATATATAEPAASSSSSSTQETHLSQALAALSLQNREDAAIVIQANTFAPQTAYSTPQVVWRPDGSGLWVNGDDGVIRGIEAKTGKVVAMLKDGHEAGSKVRSIWAGWVSCSADSGSSSEGKEDNKKEEWVVSGGFDKRLVVWRI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.4
3 0.45
4 0.45
5 0.46
6 0.43
7 0.43
8 0.43
9 0.37
10 0.33
11 0.29
12 0.25
13 0.18
14 0.18
15 0.18
16 0.17
17 0.15
18 0.13
19 0.12
20 0.11
21 0.1
22 0.08
23 0.06
24 0.05
25 0.06
26 0.06
27 0.06
28 0.08
29 0.08
30 0.09
31 0.11
32 0.14
33 0.16
34 0.16
35 0.17
36 0.17
37 0.17
38 0.16
39 0.14
40 0.1
41 0.1
42 0.13
43 0.12
44 0.11
45 0.1
46 0.14
47 0.14
48 0.17
49 0.16
50 0.13
51 0.13
52 0.14
53 0.14
54 0.11
55 0.12
56 0.09
57 0.11
58 0.11
59 0.14
60 0.15
61 0.15
62 0.18
63 0.17
64 0.19
65 0.22
66 0.23
67 0.23
68 0.22
69 0.22
70 0.22
71 0.24
72 0.22
73 0.19
74 0.17
75 0.15
76 0.15
77 0.15
78 0.13
79 0.19
80 0.2
81 0.23
82 0.26
83 0.27
84 0.29
85 0.3
86 0.31
87 0.25
88 0.25
89 0.26
90 0.22
91 0.22
92 0.2
93 0.21
94 0.22
95 0.2
96 0.2
97 0.18
98 0.19
99 0.18
100 0.18
101 0.14
102 0.14
103 0.13
104 0.13
105 0.11
106 0.11
107 0.11
108 0.12
109 0.12
110 0.09
111 0.1
112 0.09
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.07
117 0.09
118 0.09
119 0.09
120 0.1
121 0.11
122 0.12
123 0.12
124 0.14
125 0.12
126 0.12
127 0.11
128 0.15
129 0.16
130 0.19
131 0.24
132 0.27
133 0.33
134 0.36
135 0.41
136 0.39
137 0.45
138 0.47
139 0.48
140 0.45
141 0.39
142 0.41
143 0.37
144 0.38
145 0.34
146 0.28
147 0.25
148 0.26
149 0.26
150 0.24
151 0.28
152 0.33
153 0.39
154 0.48
155 0.56
156 0.62
157 0.67
158 0.7
159 0.76
160 0.78
161 0.76
162 0.76
163 0.73
164 0.73
165 0.72
166 0.67
167 0.56
168 0.53
169 0.46
170 0.4
171 0.37
172 0.35
173 0.34
174 0.4
175 0.42
176 0.4
177 0.5
178 0.5
179 0.53
180 0.56
181 0.6
182 0.61
183 0.69
184 0.74
185 0.75
186 0.8
187 0.82
188 0.83
189 0.8
190 0.8
191 0.8
192 0.78
193 0.76
194 0.72
195 0.69
196 0.7
197 0.71
198 0.71
199 0.69
200 0.64
201 0.64
202 0.64
203 0.65
204 0.61
205 0.65
206 0.69
207 0.72
208 0.79
209 0.81
210 0.86
211 0.89
212 0.9
213 0.88
214 0.85
215 0.83
216 0.79
217 0.76
218 0.73
219 0.66
220 0.59
221 0.51
222 0.42
223 0.34
224 0.26
225 0.17
226 0.1
227 0.09
228 0.1
229 0.12
230 0.16
231 0.15
232 0.16
233 0.18
234 0.18
235 0.22
236 0.28
237 0.3
238 0.29
239 0.31
240 0.3
241 0.29
242 0.31
243 0.26
244 0.21
245 0.25
246 0.26
247 0.31
248 0.37
249 0.42
250 0.5
251 0.61
252 0.66
253 0.7
254 0.73
255 0.77
256 0.81
257 0.84
258 0.8
259 0.71
260 0.66
261 0.56
262 0.54
263 0.44
264 0.36
265 0.32
266 0.31
267 0.35
268 0.31
269 0.34
270 0.33
271 0.34
272 0.4
273 0.45
274 0.45
275 0.42
276 0.49
277 0.47
278 0.44
279 0.43
280 0.39
281 0.39
282 0.37
283 0.36
284 0.29
285 0.3
286 0.33
287 0.38
288 0.41
289 0.39
290 0.41
291 0.48
292 0.56
293 0.61
294 0.66
295 0.68
296 0.69
297 0.66
298 0.69
299 0.72
300 0.71
301 0.73
302 0.71
303 0.69
304 0.64
305 0.65
306 0.59
307 0.5
308 0.49
309 0.42
310 0.36
311 0.29
312 0.29
313 0.24
314 0.27
315 0.27
316 0.2
317 0.18
318 0.18
319 0.18
320 0.2
321 0.19
322 0.16
323 0.17
324 0.24
325 0.27
326 0.29
327 0.29
328 0.25
329 0.26
330 0.28
331 0.31
332 0.29
333 0.29
334 0.34
335 0.34
336 0.35
337 0.35
338 0.36
339 0.35
340 0.35
341 0.37
342 0.32
343 0.32
344 0.36
345 0.43
346 0.45
347 0.42
348 0.43
349 0.41
350 0.45
351 0.53
352 0.57
353 0.57
354 0.55
355 0.54
356 0.51
357 0.5
358 0.51
359 0.46
360 0.37
361 0.29
362 0.27
363 0.26
364 0.23
365 0.19
366 0.12
367 0.08
368 0.08
369 0.07
370 0.05
371 0.05
372 0.08
373 0.09
374 0.09
375 0.09
376 0.09
377 0.11
378 0.16
379 0.18
380 0.17
381 0.17
382 0.17
383 0.16
384 0.16
385 0.14
386 0.09
387 0.08
388 0.06
389 0.07
390 0.08
391 0.07
392 0.07
393 0.07
394 0.07
395 0.06
396 0.06
397 0.05
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.05
403 0.05
404 0.05
405 0.07
406 0.07
407 0.07
408 0.07
409 0.07
410 0.08
411 0.09
412 0.08
413 0.07
414 0.07
415 0.07
416 0.08
417 0.08
418 0.07
419 0.07
420 0.07
421 0.07
422 0.08
423 0.08
424 0.07
425 0.07
426 0.08
427 0.09
428 0.09
429 0.09
430 0.1
431 0.11
432 0.11
433 0.13
434 0.17
435 0.17
436 0.2
437 0.24
438 0.26
439 0.28
440 0.31
441 0.29
442 0.26
443 0.26
444 0.26
445 0.23
446 0.21
447 0.19
448 0.14
449 0.14
450 0.13
451 0.11
452 0.07
453 0.06
454 0.05
455 0.04
456 0.04
457 0.03
458 0.03
459 0.03
460 0.03
461 0.03
462 0.04
463 0.05
464 0.05
465 0.05
466 0.06
467 0.06
468 0.07
469 0.07
470 0.07
471 0.06
472 0.07
473 0.09
474 0.09
475 0.1
476 0.1
477 0.1
478 0.09
479 0.09
480 0.08
481 0.07
482 0.06
483 0.05
484 0.06
485 0.05
486 0.08
487 0.08
488 0.08
489 0.09
490 0.09
491 0.11
492 0.12
493 0.13
494 0.1
495 0.13
496 0.13
497 0.13
498 0.14
499 0.13
500 0.11
501 0.1
502 0.1
503 0.07
504 0.08
505 0.07
506 0.06
507 0.06
508 0.07
509 0.06
510 0.06
511 0.07
512 0.06
513 0.06
514 0.06
515 0.07
516 0.07
517 0.09
518 0.09
519 0.09
520 0.11
521 0.12
522 0.12
523 0.12
524 0.13
525 0.12
526 0.15
527 0.17
528 0.15
529 0.17
530 0.17
531 0.15
532 0.14
533 0.14
534 0.1
535 0.09
536 0.1
537 0.1
538 0.1
539 0.1
540 0.1
541 0.11
542 0.13
543 0.14
544 0.13
545 0.18
546 0.22
547 0.3
548 0.35
549 0.35
550 0.33
551 0.32
552 0.35
553 0.31
554 0.28
555 0.2
556 0.15
557 0.16
558 0.19
559 0.2
560 0.17
561 0.15
562 0.17
563 0.17
564 0.24
565 0.26
566 0.29
567 0.33
568 0.42
569 0.48
570 0.51
571 0.55
572 0.48
573 0.46
574 0.41
575 0.38
576 0.29
577 0.25
578 0.19
579 0.16
580 0.18
581 0.18
582 0.19
583 0.15
584 0.14
585 0.12
586 0.11
587 0.1
588 0.07
589 0.06
590 0.07
591 0.08
592 0.09
593 0.09
594 0.1
595 0.11
596 0.11
597 0.13
598 0.12
599 0.12
600 0.12
601 0.11
602 0.1
603 0.09
604 0.08
605 0.06
606 0.04
607 0.04
608 0.04
609 0.03
610 0.04
611 0.04
612 0.05
613 0.05
614 0.05
615 0.06
616 0.06
617 0.07
618 0.06
619 0.06
620 0.11
621 0.12
622 0.13
623 0.13
624 0.12
625 0.12
626 0.12
627 0.13
628 0.08
629 0.09
630 0.08
631 0.07
632 0.07
633 0.07
634 0.07
635 0.06
636 0.06
637 0.05
638 0.06
639 0.06
640 0.06
641 0.06
642 0.07
643 0.11
644 0.13
645 0.13
646 0.14
647 0.15
648 0.16
649 0.17
650 0.16
651 0.14
652 0.14
653 0.15
654 0.14
655 0.16
656 0.14
657 0.13
658 0.13
659 0.14
660 0.13
661 0.12
662 0.12
663 0.09
664 0.09
665 0.1
666 0.11
667 0.11
668 0.13
669 0.2
670 0.23
671 0.25
672 0.32
673 0.33
674 0.36
675 0.43
676 0.48
677 0.45
678 0.49
679 0.5
680 0.43
681 0.43
682 0.41
683 0.34
684 0.27
685 0.25
686 0.18
687 0.15
688 0.16
689 0.15
690 0.13
691 0.1
692 0.09
693 0.08
694 0.07
695 0.06
696 0.05
697 0.06
698 0.07
699 0.08
700 0.07
701 0.08
702 0.08
703 0.08
704 0.1
705 0.1
706 0.09
707 0.09
708 0.1
709 0.1
710 0.12
711 0.12
712 0.11
713 0.13
714 0.13
715 0.14
716 0.13
717 0.13
718 0.13
719 0.15
720 0.15
721 0.12
722 0.12
723 0.13
724 0.14
725 0.15
726 0.14
727 0.12
728 0.17
729 0.2
730 0.21
731 0.22
732 0.19
733 0.2
734 0.21
735 0.22
736 0.19
737 0.17
738 0.18
739 0.19
740 0.23
741 0.23
742 0.23
743 0.24
744 0.21
745 0.21
746 0.19
747 0.18
748 0.16
749 0.15
750 0.15
751 0.15
752 0.16
753 0.14
754 0.14
755 0.13
756 0.13
757 0.16
758 0.16
759 0.13
760 0.13
761 0.14
762 0.18
763 0.19
764 0.17
765 0.14
766 0.15
767 0.19
768 0.2
769 0.22
770 0.26
771 0.34
772 0.4
773 0.43
774 0.47
775 0.47
776 0.51
777 0.55
778 0.52
779 0.44
780 0.4
781 0.4
782 0.36
783 0.33
784 0.34
785 0.32
786 0.33
787 0.35
788 0.37
789 0.37
790 0.41
791 0.46
792 0.44
793 0.42
794 0.37
795 0.37
796 0.35
797 0.32
798 0.28
799 0.24
800 0.23
801 0.2
802 0.2
803 0.17
804 0.15
805 0.16
806 0.15
807 0.15
808 0.15
809 0.2
810 0.25
811 0.25
812 0.25
813 0.23
814 0.23
815 0.23
816 0.2
817 0.14
818 0.09
819 0.08
820 0.07
821 0.07
822 0.07
823 0.06
824 0.06
825 0.07
826 0.07
827 0.08
828 0.11
829 0.13
830 0.18
831 0.17
832 0.18
833 0.19
834 0.21
835 0.2
836 0.18
837 0.18
838 0.15
839 0.17
840 0.17
841 0.18
842 0.17
843 0.18
844 0.17
845 0.15
846 0.12
847 0.1
848 0.09
849 0.07
850 0.07
851 0.07
852 0.07
853 0.06
854 0.06
855 0.06
856 0.06
857 0.07
858 0.06
859 0.07
860 0.09
861 0.12
862 0.14
863 0.16
864 0.17
865 0.18
866 0.21
867 0.22
868 0.24
869 0.23
870 0.21
871 0.19
872 0.2
873 0.18
874 0.14
875 0.13
876 0.13
877 0.12
878 0.13
879 0.14
880 0.13
881 0.12
882 0.12
883 0.13
884 0.11
885 0.1
886 0.12
887 0.12
888 0.11
889 0.12
890 0.12
891 0.11
892 0.12
893 0.11
894 0.08
895 0.08
896 0.08
897 0.12
898 0.14
899 0.18
900 0.18
901 0.2
902 0.2
903 0.27
904 0.31
905 0.3
906 0.32
907 0.29
908 0.3
909 0.3
910 0.3
911 0.28
912 0.28
913 0.26
914 0.25
915 0.23
916 0.21
917 0.2
918 0.19
919 0.14
920 0.09
921 0.09
922 0.06
923 0.06
924 0.08
925 0.08
926 0.12
927 0.13
928 0.13
929 0.15
930 0.15
931 0.15
932 0.17
933 0.2
934 0.18
935 0.23
936 0.24
937 0.23
938 0.26
939 0.27
940 0.24
941 0.23
942 0.22
943 0.19
944 0.23
945 0.23
946 0.2
947 0.22
948 0.22
949 0.21
950 0.26
951 0.29
952 0.25
953 0.25
954 0.29
955 0.28
956 0.27
957 0.27
958 0.22
959 0.16
960 0.16
961 0.16
962 0.15
963 0.16
964 0.16
965 0.18
966 0.2
967 0.24
968 0.32
969 0.36
970 0.39
971 0.4
972 0.42
973 0.42
974 0.42
975 0.4
976 0.34
977 0.3
978 0.26
979 0.28
980 0.28
981 0.28
982 0.25
983 0.23
984 0.22