Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0F4YN27

Protein Details
Accession A0A0F4YN27    Localization Confidence High Confidence Score 21.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-48KSSHPTPIKRPQAPARPQGPHydrophilic
440-459EDGTKPKRGRPKRTAPAPPTBasic
555-580QASAPGVPAKPRKRRKGRLGDVTYLEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-21RAPP
23-24GR
28-49LKSSHPTPIKRPQAPARPQGPK
358-366GKGKYRKRK
444-452KPKRGRPKR
562-572PAKPRKRRKGR
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 11, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011665  BRF1_TBP-bd_dom  
IPR013763  Cyclin-like_dom  
IPR036915  Cyclin-like_sf  
IPR000812  TFIIB  
IPR013150  TFIIB_cyclin  
Gene Ontology GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0070897  P:transcription preinitiation complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF07741  BRF1  
PF00382  TFIIB  
CDD cd20554  CYCLIN_TFIIIB90_rpt2  
Amino Acid Sequences MSTANAGARPVPPKTGPRAPPVGRLASLKSSHPTPIKRPQAPARPQGPKPPTHPKTNTCPNPSCPAPNIVEDEGQKVCSGCGTVISEANIVSEVTFGETASGAAIVQGTFVGADQTHTRSYGPGYQRGGGMESREITEQNGNRYIQQLSRALYIPESATKAASQIFKLAVGLNFIQGRRTKTVAAVCLYIACRRQEGNTVMLIDFADVLMINVFKLGRAYKALLDELRLGGTVFLMNPIDPESLIYRFAKQLEFGSATMQVASEAVRIVQRMNRDWMTTGRRPAGICGAALILAARMNNFRRTVREVVYVVKVTEITINQRLNEFSSTESGDLTVDQFRSVHLENAHDPPSFTQAREGKGKYRKRKAPETAAEIEGNQNSTETSQPPEKKKRVDADGFVIPDPPIDPALLNNKPSATPVDETAPEEGQNGMPTPESSVSEDGTKPKRGRPKRTAPAPPTAEELASEEALENEMNELLSKGSDMVESAIAPSQAPVRKPVPESEEIDAAEFEDDPEVANCLLSPAEVEIKERIWVHENKDYLRTQQAKALKLALSQASAPGVPAKPRKRRKGRLGDVTYLEGEEGEDGRSSRASTPAEATRRMLEKRGFSRKINYRLLESLYGEEGAQEAAKAKAESASRSSRSQSIASRRSLSVEPTPPGPTTTKPAVPSTATAAARDTSDAPKEEILGPVPESDRPNGDKPSAYPDEEEGDDLDDLDDEDDAGDDYDEGDDPDGIEAAFAGRYSYADDDYYDEGSDYD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.52
3 0.53
4 0.56
5 0.64
6 0.61
7 0.65
8 0.64
9 0.6
10 0.53
11 0.5
12 0.47
13 0.45
14 0.44
15 0.39
16 0.37
17 0.35
18 0.4
19 0.44
20 0.47
21 0.48
22 0.56
23 0.64
24 0.65
25 0.71
26 0.74
27 0.77
28 0.79
29 0.8
30 0.79
31 0.78
32 0.76
33 0.78
34 0.75
35 0.71
36 0.7
37 0.72
38 0.68
39 0.69
40 0.73
41 0.69
42 0.73
43 0.77
44 0.79
45 0.76
46 0.77
47 0.71
48 0.71
49 0.68
50 0.63
51 0.55
52 0.51
53 0.45
54 0.42
55 0.43
56 0.37
57 0.37
58 0.33
59 0.33
60 0.28
61 0.26
62 0.23
63 0.18
64 0.16
65 0.13
66 0.13
67 0.09
68 0.11
69 0.14
70 0.15
71 0.16
72 0.17
73 0.17
74 0.16
75 0.16
76 0.13
77 0.1
78 0.08
79 0.07
80 0.06
81 0.07
82 0.08
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.05
90 0.05
91 0.06
92 0.05
93 0.05
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.05
99 0.05
100 0.07
101 0.09
102 0.13
103 0.14
104 0.15
105 0.15
106 0.15
107 0.19
108 0.25
109 0.27
110 0.31
111 0.34
112 0.34
113 0.35
114 0.35
115 0.34
116 0.27
117 0.25
118 0.2
119 0.18
120 0.18
121 0.18
122 0.18
123 0.17
124 0.23
125 0.23
126 0.26
127 0.3
128 0.29
129 0.29
130 0.31
131 0.31
132 0.26
133 0.29
134 0.27
135 0.24
136 0.26
137 0.26
138 0.24
139 0.22
140 0.22
141 0.18
142 0.17
143 0.17
144 0.15
145 0.15
146 0.14
147 0.15
148 0.17
149 0.18
150 0.16
151 0.16
152 0.16
153 0.16
154 0.16
155 0.17
156 0.14
157 0.15
158 0.14
159 0.15
160 0.17
161 0.17
162 0.2
163 0.22
164 0.26
165 0.26
166 0.28
167 0.26
168 0.28
169 0.33
170 0.33
171 0.31
172 0.27
173 0.24
174 0.24
175 0.24
176 0.23
177 0.22
178 0.19
179 0.19
180 0.19
181 0.2
182 0.25
183 0.26
184 0.25
185 0.24
186 0.25
187 0.22
188 0.22
189 0.2
190 0.13
191 0.11
192 0.08
193 0.06
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.07
203 0.08
204 0.09
205 0.11
206 0.13
207 0.14
208 0.17
209 0.19
210 0.18
211 0.18
212 0.18
213 0.16
214 0.15
215 0.13
216 0.11
217 0.08
218 0.08
219 0.06
220 0.05
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.08
226 0.08
227 0.07
228 0.09
229 0.1
230 0.1
231 0.13
232 0.14
233 0.13
234 0.15
235 0.17
236 0.16
237 0.15
238 0.15
239 0.16
240 0.18
241 0.16
242 0.16
243 0.15
244 0.14
245 0.13
246 0.12
247 0.08
248 0.06
249 0.06
250 0.05
251 0.04
252 0.05
253 0.06
254 0.06
255 0.08
256 0.1
257 0.13
258 0.15
259 0.2
260 0.21
261 0.21
262 0.22
263 0.27
264 0.32
265 0.33
266 0.35
267 0.32
268 0.33
269 0.32
270 0.32
271 0.3
272 0.23
273 0.19
274 0.15
275 0.13
276 0.11
277 0.1
278 0.09
279 0.04
280 0.04
281 0.05
282 0.05
283 0.08
284 0.1
285 0.14
286 0.16
287 0.17
288 0.21
289 0.26
290 0.29
291 0.29
292 0.31
293 0.28
294 0.29
295 0.31
296 0.27
297 0.22
298 0.18
299 0.16
300 0.12
301 0.13
302 0.11
303 0.11
304 0.17
305 0.18
306 0.18
307 0.18
308 0.19
309 0.18
310 0.19
311 0.15
312 0.11
313 0.12
314 0.12
315 0.11
316 0.11
317 0.09
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.11
327 0.11
328 0.13
329 0.12
330 0.14
331 0.16
332 0.19
333 0.22
334 0.18
335 0.18
336 0.16
337 0.2
338 0.19
339 0.16
340 0.2
341 0.21
342 0.24
343 0.3
344 0.3
345 0.33
346 0.41
347 0.5
348 0.53
349 0.6
350 0.64
351 0.65
352 0.74
353 0.73
354 0.74
355 0.7
356 0.66
357 0.6
358 0.54
359 0.48
360 0.38
361 0.32
362 0.23
363 0.18
364 0.11
365 0.08
366 0.06
367 0.07
368 0.08
369 0.07
370 0.09
371 0.15
372 0.21
373 0.29
374 0.38
375 0.42
376 0.45
377 0.51
378 0.54
379 0.54
380 0.53
381 0.47
382 0.42
383 0.4
384 0.37
385 0.31
386 0.26
387 0.19
388 0.15
389 0.13
390 0.09
391 0.06
392 0.06
393 0.05
394 0.06
395 0.14
396 0.15
397 0.16
398 0.16
399 0.16
400 0.16
401 0.17
402 0.17
403 0.13
404 0.12
405 0.12
406 0.14
407 0.14
408 0.15
409 0.16
410 0.14
411 0.12
412 0.11
413 0.11
414 0.09
415 0.08
416 0.08
417 0.07
418 0.06
419 0.06
420 0.08
421 0.08
422 0.09
423 0.1
424 0.11
425 0.11
426 0.13
427 0.14
428 0.18
429 0.21
430 0.27
431 0.26
432 0.31
433 0.41
434 0.48
435 0.58
436 0.62
437 0.69
438 0.72
439 0.8
440 0.84
441 0.78
442 0.78
443 0.71
444 0.62
445 0.54
446 0.45
447 0.36
448 0.26
449 0.24
450 0.16
451 0.13
452 0.11
453 0.08
454 0.07
455 0.08
456 0.07
457 0.05
458 0.04
459 0.04
460 0.04
461 0.04
462 0.05
463 0.04
464 0.04
465 0.04
466 0.04
467 0.05
468 0.05
469 0.05
470 0.05
471 0.06
472 0.06
473 0.06
474 0.07
475 0.07
476 0.06
477 0.07
478 0.11
479 0.13
480 0.14
481 0.18
482 0.2
483 0.23
484 0.25
485 0.29
486 0.29
487 0.31
488 0.34
489 0.31
490 0.31
491 0.28
492 0.27
493 0.22
494 0.17
495 0.13
496 0.09
497 0.07
498 0.05
499 0.05
500 0.05
501 0.05
502 0.06
503 0.05
504 0.05
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.05
510 0.05
511 0.08
512 0.09
513 0.11
514 0.11
515 0.12
516 0.15
517 0.15
518 0.16
519 0.19
520 0.23
521 0.26
522 0.3
523 0.32
524 0.31
525 0.36
526 0.35
527 0.32
528 0.37
529 0.36
530 0.32
531 0.36
532 0.4
533 0.37
534 0.37
535 0.38
536 0.3
537 0.26
538 0.28
539 0.23
540 0.18
541 0.16
542 0.15
543 0.12
544 0.12
545 0.11
546 0.12
547 0.12
548 0.17
549 0.26
550 0.35
551 0.45
552 0.55
553 0.66
554 0.73
555 0.82
556 0.88
557 0.9
558 0.9
559 0.91
560 0.87
561 0.82
562 0.73
563 0.65
564 0.54
565 0.43
566 0.33
567 0.22
568 0.15
569 0.1
570 0.08
571 0.06
572 0.07
573 0.07
574 0.08
575 0.09
576 0.1
577 0.11
578 0.16
579 0.17
580 0.17
581 0.22
582 0.29
583 0.32
584 0.33
585 0.33
586 0.33
587 0.37
588 0.37
589 0.39
590 0.36
591 0.4
592 0.48
593 0.56
594 0.56
595 0.54
596 0.63
597 0.66
598 0.7
599 0.7
600 0.63
601 0.57
602 0.55
603 0.55
604 0.48
605 0.4
606 0.33
607 0.25
608 0.24
609 0.19
610 0.15
611 0.12
612 0.09
613 0.08
614 0.06
615 0.07
616 0.07
617 0.09
618 0.1
619 0.1
620 0.14
621 0.16
622 0.19
623 0.23
624 0.3
625 0.32
626 0.35
627 0.37
628 0.37
629 0.38
630 0.4
631 0.42
632 0.45
633 0.48
634 0.5
635 0.51
636 0.47
637 0.48
638 0.45
639 0.42
640 0.4
641 0.39
642 0.36
643 0.35
644 0.37
645 0.33
646 0.35
647 0.32
648 0.27
649 0.28
650 0.32
651 0.34
652 0.34
653 0.36
654 0.37
655 0.36
656 0.35
657 0.34
658 0.36
659 0.31
660 0.29
661 0.28
662 0.25
663 0.24
664 0.24
665 0.21
666 0.18
667 0.21
668 0.23
669 0.23
670 0.23
671 0.24
672 0.24
673 0.23
674 0.21
675 0.19
676 0.18
677 0.19
678 0.2
679 0.22
680 0.23
681 0.24
682 0.27
683 0.3
684 0.35
685 0.36
686 0.38
687 0.36
688 0.35
689 0.42
690 0.41
691 0.38
692 0.34
693 0.32
694 0.33
695 0.31
696 0.3
697 0.22
698 0.19
699 0.17
700 0.15
701 0.13
702 0.09
703 0.09
704 0.08
705 0.08
706 0.05
707 0.05
708 0.05
709 0.06
710 0.06
711 0.06
712 0.05
713 0.06
714 0.07
715 0.07
716 0.07
717 0.08
718 0.08
719 0.08
720 0.08
721 0.08
722 0.07
723 0.07
724 0.06
725 0.06
726 0.06
727 0.06
728 0.06
729 0.06
730 0.07
731 0.1
732 0.12
733 0.13
734 0.14
735 0.15
736 0.17
737 0.2
738 0.2
739 0.18