Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0F4YXZ2

Protein Details
Accession A0A0F4YXZ2    Localization Confidence High Confidence Score 22.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-47VSAPEPPSKKALRKAKKKGISPESLKTHydrophilic
61-85SETETKTETTKKKKSTKQRSEYGVWHydrophilic
272-299DAEEKPAKTKTKKSKTKKIWVNRFLGRQHydrophilic
307-326DPTTRYKKRFGKGAKGKAKSBasic
348-379DGSQPNHATKERRKKDKQQNQKQPRYSKETVQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
27-40PSKKALRKAKKKGI
277-289PAKTKTKKSKTKK
312-327YKKRFGKGAKGKAKSK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MPEENTKKRKLDDVPEIEIDVSAPEPPSKKALRKAKKKGISPESLKTEAKTETKTENKTDSETETKTETTKKKKSTKQRSEYGVWIGNLAFTVTKDDLRKFLTSNCSFSEATITRIHLPMGPSKNGTSQNKGFAYIDFSNKKAMDEAIGLSEQLLSGRRVLIKGAQDFEGRPEQHQQPGASKSSGNPPSRKIFIGNLAFDTTKELLEEHFSRCGTVTNVHVATFEDSGKCKGFAWVEFETLEAAEAAVKGFVKVKEEEEDDEEEEEEQTGSDAEEKPAKTKTKKSKTKKIWVNRFLGRQLRMEFAEDPTTRYKKRFGKGAKGKAKSKGETSDEAIVEENDAVNGDSGDGSQPNHATKERRKKDKQQNQKQPRYSKETVQRLTGAIVEPQGKKITFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.6
3 0.58
4 0.49
5 0.41
6 0.31
7 0.21
8 0.15
9 0.1
10 0.1
11 0.13
12 0.15
13 0.17
14 0.24
15 0.3
16 0.38
17 0.46
18 0.56
19 0.63
20 0.73
21 0.82
22 0.85
23 0.87
24 0.87
25 0.88
26 0.86
27 0.85
28 0.81
29 0.78
30 0.75
31 0.71
32 0.64
33 0.54
34 0.49
35 0.44
36 0.42
37 0.37
38 0.34
39 0.37
40 0.44
41 0.48
42 0.49
43 0.5
44 0.48
45 0.48
46 0.47
47 0.44
48 0.42
49 0.39
50 0.36
51 0.33
52 0.31
53 0.31
54 0.37
55 0.4
56 0.44
57 0.51
58 0.59
59 0.66
60 0.75
61 0.83
62 0.86
63 0.88
64 0.87
65 0.87
66 0.84
67 0.79
68 0.74
69 0.68
70 0.62
71 0.5
72 0.42
73 0.33
74 0.26
75 0.21
76 0.17
77 0.11
78 0.06
79 0.11
80 0.11
81 0.15
82 0.18
83 0.19
84 0.22
85 0.25
86 0.26
87 0.23
88 0.28
89 0.34
90 0.34
91 0.35
92 0.34
93 0.35
94 0.33
95 0.32
96 0.35
97 0.25
98 0.26
99 0.25
100 0.25
101 0.22
102 0.23
103 0.23
104 0.17
105 0.19
106 0.23
107 0.25
108 0.25
109 0.25
110 0.26
111 0.31
112 0.37
113 0.38
114 0.38
115 0.36
116 0.41
117 0.4
118 0.41
119 0.36
120 0.28
121 0.31
122 0.27
123 0.31
124 0.26
125 0.26
126 0.28
127 0.28
128 0.28
129 0.22
130 0.19
131 0.14
132 0.13
133 0.13
134 0.1
135 0.1
136 0.09
137 0.08
138 0.08
139 0.06
140 0.06
141 0.07
142 0.06
143 0.07
144 0.08
145 0.09
146 0.09
147 0.1
148 0.13
149 0.16
150 0.18
151 0.19
152 0.19
153 0.19
154 0.19
155 0.22
156 0.24
157 0.2
158 0.19
159 0.24
160 0.24
161 0.26
162 0.29
163 0.27
164 0.25
165 0.28
166 0.29
167 0.24
168 0.22
169 0.2
170 0.26
171 0.33
172 0.33
173 0.32
174 0.33
175 0.36
176 0.38
177 0.37
178 0.3
179 0.24
180 0.27
181 0.28
182 0.25
183 0.21
184 0.21
185 0.2
186 0.18
187 0.19
188 0.13
189 0.1
190 0.09
191 0.08
192 0.07
193 0.11
194 0.13
195 0.12
196 0.14
197 0.14
198 0.14
199 0.14
200 0.15
201 0.12
202 0.12
203 0.12
204 0.14
205 0.14
206 0.14
207 0.14
208 0.14
209 0.14
210 0.13
211 0.13
212 0.09
213 0.1
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.11
218 0.13
219 0.14
220 0.14
221 0.19
222 0.18
223 0.18
224 0.18
225 0.18
226 0.15
227 0.13
228 0.12
229 0.06
230 0.05
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.05
237 0.08
238 0.09
239 0.12
240 0.13
241 0.15
242 0.17
243 0.19
244 0.2
245 0.2
246 0.22
247 0.2
248 0.19
249 0.17
250 0.15
251 0.13
252 0.12
253 0.08
254 0.06
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.07
259 0.08
260 0.09
261 0.14
262 0.15
263 0.17
264 0.23
265 0.31
266 0.34
267 0.43
268 0.52
269 0.59
270 0.69
271 0.77
272 0.82
273 0.85
274 0.9
275 0.91
276 0.9
277 0.9
278 0.88
279 0.85
280 0.81
281 0.75
282 0.72
283 0.68
284 0.6
285 0.54
286 0.48
287 0.43
288 0.38
289 0.35
290 0.3
291 0.26
292 0.31
293 0.26
294 0.27
295 0.32
296 0.37
297 0.36
298 0.38
299 0.44
300 0.45
301 0.5
302 0.57
303 0.57
304 0.63
305 0.71
306 0.79
307 0.8
308 0.79
309 0.79
310 0.79
311 0.79
312 0.71
313 0.66
314 0.63
315 0.58
316 0.54
317 0.52
318 0.49
319 0.41
320 0.38
321 0.34
322 0.26
323 0.21
324 0.18
325 0.14
326 0.07
327 0.08
328 0.07
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.08
335 0.08
336 0.09
337 0.12
338 0.15
339 0.17
340 0.21
341 0.25
342 0.32
343 0.42
344 0.53
345 0.6
346 0.68
347 0.76
348 0.83
349 0.9
350 0.92
351 0.93
352 0.93
353 0.94
354 0.95
355 0.95
356 0.94
357 0.92
358 0.9
359 0.88
360 0.81
361 0.79
362 0.78
363 0.78
364 0.72
365 0.67
366 0.61
367 0.52
368 0.49
369 0.42
370 0.33
371 0.24
372 0.25
373 0.27
374 0.26
375 0.28
376 0.32