FuNGI

A0A0F4YUC4

Protein Details

Accession

A0A0F4YUC4

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
352-371	GTPVRRKKRKGALTNPSTYS	Hydrophilic
467-492	QDRGAQAKRKGAKGKRGRNGNEKIGM	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
117-127	KPAKGKGKGKK
356-361	RRKKRK
473-486	AKRKGAKGKRGRNG

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 12.5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPRRQWIDPKTATKYQLFHRSQNDPLIHDPEADDRVLHQVSGPRQPAASSSSSSSSKKTSRNLADLEKEFGSENIRKNEGEAANYGIFFDDTKYDYMQHLKELGTGGGNSHFVEAKPAKGKGKGKKLEDALREVSLDDSASQFGGSAYGSEYGGRGYARSTASSYVRKPSYQDQQDIPDAIAGFQPNMDPRLREVLEALDDEAYVDDEDSEDVFGELTKNPEEMDQAEWEDTLFDEEDEDGWESDVTEKAYPQKETTDVQSSSVEEKKEQEQEKEKESTQEGSTENKDHPELPDHDKPVPDMKPEDAEWMREFAKYKKDVKAQKAQKGRAAAADEASERRTAASTLFTIGGTPVRRKKRKGALTNPSTYSMTSSSLARTEHMRLLDDRFERIEALYKLDEEGEEYDDGASMVSGMTGMTGMTGMTGVSGVSSQAPSLISQGGRRYHDVPLRSDFDEVMDSFLSGWQDRGAQAKRKGAKGKRGRNGNEKIGMQMLDEIRKELGPARIPSGKVSGKA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.67
2	0.63
3	0.61
4	0.63
5	0.6
6	0.59
7	0.6
8	0.6
9	0.6
10	0.64
11	0.58
12	0.51
13	0.51
14	0.48
15	0.42
16	0.37
17	0.34
18	0.29
19	0.29
20	0.25
21	0.2
22	0.16
23	0.21
24	0.21
25	0.19
26	0.17
27	0.21
28	0.26
29	0.35
30	0.36
31	0.31
32	0.31
33	0.31
34	0.31
35	0.3
36	0.28
37	0.21
38	0.22
39	0.26
40	0.3
41	0.31
42	0.32
43	0.34
44	0.38
45	0.43
46	0.47
47	0.52
48	0.55
49	0.6
50	0.62
51	0.62
52	0.64
53	0.59
54	0.56
55	0.46
56	0.4
57	0.33
58	0.29
59	0.28
60	0.25
61	0.3
62	0.31
63	0.33
64	0.32
65	0.33
66	0.41
67	0.36
68	0.33
69	0.28
70	0.27
71	0.25
72	0.25
73	0.24
74	0.16
75	0.14
76	0.12
77	0.12
78	0.09
79	0.1
80	0.12
81	0.13
82	0.14
83	0.16
84	0.22
85	0.22
86	0.22
87	0.23
88	0.21
89	0.22
90	0.22
91	0.2
92	0.15
93	0.14
94	0.13
95	0.12
96	0.13
97	0.11
98	0.11
99	0.12
100	0.1
101	0.18
102	0.18
103	0.22
104	0.26
105	0.3
106	0.32
107	0.39
108	0.48
109	0.49
110	0.59
111	0.61
112	0.61
113	0.64
114	0.68
115	0.68
116	0.63
117	0.6
118	0.52
119	0.45
120	0.41
121	0.33
122	0.27
123	0.19
124	0.15
125	0.1
126	0.08
127	0.07
128	0.07
129	0.07
130	0.06
131	0.06
132	0.06
133	0.05
134	0.05
135	0.05
136	0.06
137	0.07
138	0.07
139	0.07
140	0.06
141	0.08
142	0.07
143	0.07
144	0.06
145	0.11
146	0.11
147	0.13
148	0.14
149	0.16
150	0.21
151	0.26
152	0.28
153	0.31
154	0.32
155	0.32
156	0.34
157	0.37
158	0.43
159	0.43
160	0.45
161	0.4
162	0.42
163	0.43
164	0.4
165	0.33
166	0.24
167	0.19
168	0.15
169	0.14
170	0.1
171	0.08
172	0.07
173	0.08
174	0.08
175	0.1
176	0.11
177	0.1
178	0.11
179	0.19
180	0.19
181	0.18
182	0.18
183	0.16
184	0.17
185	0.17
186	0.15
187	0.08
188	0.08
189	0.08
190	0.07
191	0.06
192	0.05
193	0.04
194	0.04
195	0.04
196	0.04
197	0.04
198	0.04
199	0.04
200	0.04
201	0.04
202	0.04
203	0.05
204	0.05
205	0.07
206	0.07
207	0.08
208	0.08
209	0.08
210	0.09
211	0.09
212	0.1
213	0.1
214	0.1
215	0.1
216	0.1
217	0.09
218	0.08
219	0.07
220	0.06
221	0.05
222	0.04
223	0.04
224	0.05
225	0.05
226	0.06
227	0.06
228	0.05
229	0.05
230	0.05
231	0.05
232	0.06
233	0.07
234	0.07
235	0.07
236	0.07
237	0.12
238	0.15
239	0.16
240	0.16
241	0.17
242	0.18
243	0.19
244	0.21
245	0.22
246	0.2
247	0.21
248	0.2
249	0.2
250	0.21
251	0.23
252	0.2
253	0.14
254	0.16
255	0.18
256	0.25
257	0.26
258	0.28
259	0.34
260	0.36
261	0.4
262	0.41
263	0.38
264	0.34
265	0.33
266	0.31
267	0.22
268	0.23
269	0.19
270	0.2
271	0.21
272	0.2
273	0.2
274	0.18
275	0.19
276	0.16
277	0.16
278	0.18
279	0.2
280	0.25
281	0.3
282	0.31
283	0.32
284	0.31
285	0.32
286	0.32
287	0.3
288	0.25
289	0.22
290	0.2
291	0.21
292	0.21
293	0.26
294	0.2
295	0.21
296	0.2
297	0.21
298	0.2
299	0.19
300	0.21
301	0.18
302	0.25
303	0.28
304	0.33
305	0.37
306	0.45
307	0.51
308	0.56
309	0.63
310	0.64
311	0.67
312	0.7
313	0.67
314	0.63
315	0.59
316	0.52
317	0.45
318	0.4
319	0.32
320	0.24
321	0.22
322	0.19
323	0.17
324	0.17
325	0.13
326	0.1
327	0.1
328	0.1
329	0.09
330	0.09
331	0.1
332	0.09
333	0.11
334	0.11
335	0.11
336	0.1
337	0.1
338	0.13
339	0.13
340	0.19
341	0.26
342	0.36
343	0.43
344	0.47
345	0.57
346	0.63
347	0.71
348	0.76
349	0.78
350	0.78
351	0.79
352	0.81
353	0.73
354	0.66
355	0.56
356	0.46
357	0.38
358	0.28
359	0.22
360	0.18
361	0.16
362	0.14
363	0.16
364	0.16
365	0.15
366	0.17
367	0.18
368	0.2
369	0.2
370	0.21
371	0.21
372	0.24
373	0.3
374	0.28
375	0.27
376	0.24
377	0.24
378	0.22
379	0.21
380	0.24
381	0.18
382	0.21
383	0.19
384	0.18
385	0.18
386	0.18
387	0.17
388	0.12
389	0.13
390	0.11
391	0.11
392	0.11
393	0.1
394	0.1
395	0.1
396	0.08
397	0.06
398	0.04
399	0.04
400	0.03
401	0.03
402	0.03
403	0.03
404	0.03
405	0.03
406	0.03
407	0.03
408	0.03
409	0.03
410	0.03
411	0.03
412	0.03
413	0.03
414	0.03
415	0.03
416	0.03
417	0.04
418	0.05
419	0.06
420	0.06
421	0.07
422	0.08
423	0.08
424	0.1
425	0.13
426	0.13
427	0.16
428	0.22
429	0.27
430	0.3
431	0.33
432	0.34
433	0.38
434	0.43
435	0.43
436	0.42
437	0.42
438	0.43
439	0.41
440	0.39
441	0.32
442	0.28
443	0.27
444	0.23
445	0.19
446	0.15
447	0.13
448	0.13
449	0.14
450	0.15
451	0.12
452	0.12
453	0.11
454	0.13
455	0.14
456	0.22
457	0.27
458	0.34
459	0.4
460	0.49
461	0.54
462	0.61
463	0.7
464	0.7
465	0.74
466	0.76
467	0.8
468	0.81
469	0.85
470	0.85
471	0.85
472	0.85
473	0.82
474	0.79
475	0.69
476	0.62
477	0.55
478	0.47
479	0.37
480	0.34
481	0.29
482	0.27
483	0.27
484	0.26
485	0.24
486	0.24
487	0.24
488	0.23
489	0.27
490	0.29
491	0.31
492	0.36
493	0.4
494	0.41
495	0.43
496	0.46

A0A0F4YUC4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer