Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0F4YLY3

Protein Details
Accession A0A0F4YLY3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
167-194EELEEREQRRRERKKRRREEREREDEALBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
174-187QRRRERKKRRREER
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 6, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028083  Spt6_acidic_N_dom  
IPR017072  TF_Spt6  
Gene Ontology GO:0032968  P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF14632  SPT6_acidic  
Amino Acid Sequences MAARDPLRFVRPISVDDSRHPPRASRLFCSEGKTTSEQVEHSPELLALTQPSFHLSPSLTGTVLSTWLRVSRLFWCPSIVLLSGNGAEQTEKTTGIMSANELVEGEALLDEENDVEYDEETGEVNEDETGVAAGAYDDSSEEDEDLDDDEEAAREIREGFIVDEDEEELEEREQRRRERKKRRREEREREDEALDEEDLYLIGEHNPDFQPPTGTEFKRLKRGHKGDADRQASQGIDDMFKSDEEEEADYGRPSDRRRAIHDEMDDFIEEDVFSDEERARAHED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.39
3 0.41
4 0.49
5 0.46
6 0.51
7 0.49
8 0.46
9 0.48
10 0.56
11 0.56
12 0.53
13 0.54
14 0.53
15 0.55
16 0.57
17 0.5
18 0.43
19 0.43
20 0.4
21 0.35
22 0.33
23 0.32
24 0.28
25 0.28
26 0.31
27 0.26
28 0.24
29 0.22
30 0.19
31 0.17
32 0.17
33 0.14
34 0.1
35 0.09
36 0.09
37 0.09
38 0.12
39 0.12
40 0.11
41 0.12
42 0.12
43 0.14
44 0.16
45 0.17
46 0.14
47 0.14
48 0.14
49 0.12
50 0.15
51 0.13
52 0.1
53 0.1
54 0.11
55 0.12
56 0.12
57 0.14
58 0.17
59 0.23
60 0.25
61 0.25
62 0.25
63 0.24
64 0.24
65 0.25
66 0.19
67 0.13
68 0.11
69 0.11
70 0.09
71 0.09
72 0.08
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.09
81 0.09
82 0.1
83 0.1
84 0.08
85 0.1
86 0.09
87 0.09
88 0.09
89 0.08
90 0.07
91 0.06
92 0.06
93 0.03
94 0.03
95 0.03
96 0.03
97 0.03
98 0.03
99 0.03
100 0.03
101 0.03
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.05
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.03
118 0.03
119 0.02
120 0.02
121 0.02
122 0.03
123 0.02
124 0.03
125 0.03
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.05
133 0.05
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.08
158 0.09
159 0.15
160 0.2
161 0.27
162 0.38
163 0.48
164 0.59
165 0.68
166 0.77
167 0.83
168 0.89
169 0.93
170 0.94
171 0.95
172 0.95
173 0.94
174 0.93
175 0.88
176 0.79
177 0.68
178 0.57
179 0.48
180 0.38
181 0.27
182 0.17
183 0.11
184 0.08
185 0.07
186 0.07
187 0.05
188 0.04
189 0.05
190 0.06
191 0.06
192 0.09
193 0.09
194 0.1
195 0.12
196 0.12
197 0.14
198 0.14
199 0.2
200 0.25
201 0.25
202 0.33
203 0.38
204 0.42
205 0.5
206 0.53
207 0.55
208 0.58
209 0.64
210 0.65
211 0.67
212 0.71
213 0.7
214 0.76
215 0.74
216 0.64
217 0.58
218 0.51
219 0.41
220 0.33
221 0.27
222 0.18
223 0.14
224 0.13
225 0.14
226 0.13
227 0.13
228 0.14
229 0.11
230 0.11
231 0.12
232 0.14
233 0.13
234 0.14
235 0.15
236 0.14
237 0.14
238 0.16
239 0.18
240 0.2
241 0.3
242 0.35
243 0.39
244 0.46
245 0.55
246 0.58
247 0.61
248 0.63
249 0.55
250 0.5
251 0.47
252 0.4
253 0.32
254 0.25
255 0.18
256 0.13
257 0.11
258 0.11
259 0.09
260 0.08
261 0.11
262 0.11
263 0.13
264 0.14