Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0F4YIM5

Protein Details
Accession A0A0F4YIM5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
377-398VVDEKPRGTKRRKRSSAGDEGYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
382-390PRGTKRRKR
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 11, nucl 8.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001926  TrpB-like_PALP  
IPR036052  TrpB-like_PALP_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00291  PALP  
Amino Acid Sequences MHGTDGKVGISFPAGNEASALPFPRKAVSYRKVLNKLSIYMYSTRQADVTNTAMDRDASSGVGCVVEGSGMNISETGESSTRRVVQVPFCTSDRLTPSSLSTSAMGNLILHHISNPANAGRKLHFYASSGGNAGLAAVCAARSLSYPCTVVLPTSTSPLMVQKLRAAGATEVIQHGETIAAAGEYMKNVVMKEEKHGPGSDDDVVKIALHPFDHEAIWEGNSTIVDELAYQLPPADDEGDARALPVDAVICSVGGGGLMNGLVRGIERHRQRRGDKQQKDIHILAAETEGTASLALAMSRKALVSLPKITSLATSLGCVRVSAQTLEYALSPPPGLAIHSVVLSDADAARGVLRLVDDERLLVELACGVCVETAVGVVDEKPRGTKRRKRSSAGDEGYGDDRDDDARSSRSSRNGSSTADGPSSAASFADSAVGSDEETEMIPPRQLTRLKQLVPDLTPESR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.16
3 0.17
4 0.17
5 0.17
6 0.19
7 0.21
8 0.16
9 0.18
10 0.19
11 0.21
12 0.23
13 0.26
14 0.34
15 0.38
16 0.45
17 0.51
18 0.6
19 0.65
20 0.66
21 0.69
22 0.63
23 0.6
24 0.55
25 0.49
26 0.43
27 0.38
28 0.38
29 0.36
30 0.33
31 0.3
32 0.26
33 0.24
34 0.23
35 0.23
36 0.23
37 0.21
38 0.2
39 0.2
40 0.2
41 0.2
42 0.18
43 0.16
44 0.14
45 0.1
46 0.1
47 0.1
48 0.09
49 0.09
50 0.08
51 0.06
52 0.05
53 0.05
54 0.05
55 0.06
56 0.06
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.08
63 0.09
64 0.11
65 0.12
66 0.13
67 0.17
68 0.19
69 0.2
70 0.23
71 0.25
72 0.3
73 0.37
74 0.4
75 0.4
76 0.38
77 0.4
78 0.38
79 0.38
80 0.35
81 0.31
82 0.28
83 0.25
84 0.26
85 0.27
86 0.27
87 0.23
88 0.19
89 0.17
90 0.16
91 0.15
92 0.13
93 0.09
94 0.09
95 0.1
96 0.09
97 0.08
98 0.08
99 0.1
100 0.1
101 0.1
102 0.12
103 0.13
104 0.18
105 0.19
106 0.22
107 0.21
108 0.26
109 0.27
110 0.27
111 0.26
112 0.22
113 0.26
114 0.25
115 0.24
116 0.2
117 0.18
118 0.15
119 0.14
120 0.12
121 0.08
122 0.05
123 0.04
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.04
129 0.05
130 0.07
131 0.09
132 0.11
133 0.12
134 0.12
135 0.14
136 0.13
137 0.13
138 0.11
139 0.13
140 0.12
141 0.14
142 0.13
143 0.12
144 0.12
145 0.15
146 0.17
147 0.15
148 0.16
149 0.15
150 0.17
151 0.17
152 0.17
153 0.16
154 0.12
155 0.13
156 0.12
157 0.11
158 0.1
159 0.1
160 0.09
161 0.08
162 0.07
163 0.06
164 0.05
165 0.04
166 0.04
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.04
173 0.04
174 0.05
175 0.05
176 0.07
177 0.1
178 0.1
179 0.14
180 0.21
181 0.22
182 0.23
183 0.23
184 0.23
185 0.21
186 0.24
187 0.23
188 0.15
189 0.14
190 0.13
191 0.13
192 0.11
193 0.11
194 0.09
195 0.07
196 0.06
197 0.07
198 0.08
199 0.09
200 0.09
201 0.08
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.05
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.06
222 0.05
223 0.04
224 0.05
225 0.06
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.06
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.04
234 0.03
235 0.04
236 0.04
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.02
244 0.02
245 0.02
246 0.02
247 0.02
248 0.02
249 0.02
250 0.02
251 0.04
252 0.06
253 0.13
254 0.2
255 0.28
256 0.35
257 0.43
258 0.47
259 0.57
260 0.67
261 0.71
262 0.7
263 0.72
264 0.73
265 0.7
266 0.71
267 0.61
268 0.51
269 0.41
270 0.34
271 0.25
272 0.19
273 0.14
274 0.08
275 0.07
276 0.05
277 0.04
278 0.04
279 0.03
280 0.03
281 0.03
282 0.03
283 0.04
284 0.04
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.06
289 0.07
290 0.11
291 0.14
292 0.19
293 0.2
294 0.21
295 0.21
296 0.21
297 0.2
298 0.18
299 0.16
300 0.11
301 0.11
302 0.11
303 0.12
304 0.12
305 0.11
306 0.11
307 0.11
308 0.12
309 0.12
310 0.12
311 0.11
312 0.12
313 0.12
314 0.12
315 0.11
316 0.09
317 0.09
318 0.08
319 0.07
320 0.08
321 0.07
322 0.08
323 0.08
324 0.09
325 0.08
326 0.09
327 0.09
328 0.08
329 0.08
330 0.07
331 0.07
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.05
340 0.06
341 0.07
342 0.08
343 0.1
344 0.1
345 0.1
346 0.1
347 0.1
348 0.1
349 0.08
350 0.07
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.07
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.06
365 0.09
366 0.11
367 0.11
368 0.16
369 0.23
370 0.32
371 0.42
372 0.51
373 0.58
374 0.69
375 0.77
376 0.79
377 0.82
378 0.83
379 0.84
380 0.78
381 0.71
382 0.61
383 0.55
384 0.5
385 0.41
386 0.32
387 0.21
388 0.17
389 0.14
390 0.14
391 0.13
392 0.14
393 0.16
394 0.19
395 0.23
396 0.27
397 0.34
398 0.38
399 0.4
400 0.44
401 0.45
402 0.46
403 0.44
404 0.42
405 0.38
406 0.33
407 0.3
408 0.23
409 0.2
410 0.18
411 0.14
412 0.12
413 0.09
414 0.08
415 0.08
416 0.1
417 0.08
418 0.08
419 0.1
420 0.1
421 0.09
422 0.1
423 0.1
424 0.08
425 0.09
426 0.1
427 0.11
428 0.12
429 0.14
430 0.15
431 0.18
432 0.24
433 0.3
434 0.34
435 0.41
436 0.49
437 0.51
438 0.55
439 0.59
440 0.58
441 0.54
442 0.54