FuNGI

A0A0F4YS50

Protein Details

Accession

A0A0F4YS50

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
20-52	PVMRIRRPRPADPLVRPKKKPPPKPVTGQPAKA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
23-51	RIRRPRPADPLVRPKKKPPPKPVTGQPAK
418-439	ERREREARRILGRKVRKALQRR

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MDTTTDSNAVRTPTGADGPPVMRIRRPRPADPLVRPKKKPPPKPVTGQPAKAPTNGVAAPRPPPAAPAAPAASKTLPGSQSDRIQPIPGRDDVTVNGFSGPLLSQTYVDYPLVTTKRAWREGLKHHVAKFASKKNIDPRDESQFTRPVRLQRRDPRAKPGSIKAENANKVPTEGGNGLDDAEREELEARKAAREKEREENLAQIAPSVATTQKRTNVPKQKTQYVPKADMTPEEIAKARIKYEEALPWHLEDFDNKNTWVGNYEAALSETYAMFVLEDTGKMRMVPIDKWYRFNAKNPFKTLTIEEAEKFMAKKIKDPRWFMEKQQEMMQQKELEAYAKQRKVYRGKAAAPTLGETLEADEMDFEEDRFADDEEVDNSLFEEDEEAKAAEKRIKQDQLKANVFNLKDERDYEEEEERERREREARRILGRKVRKALQRREKNYDYSSGSDVNPYSDDESSDDSEDEGMREEERKAEEDKALKEKGKESGTSTKGTSTPSGRTKHTDALKKATNAAARKRTGSPNLSDASGTDSSRKKPKHVSSSQPTAQPGSRPMSPSPSSALPVGKKRIRNVGPGGAGSGSDVDGGAGSGGDMSDGGKTKKLKLNQPLSSSQNGTPQGSRSGSPAPNAGTSEGGPSAKGPAKGSTPRSAAQQGFPTPAEIHAAIPPSGILSRDLLKIFHPRIGDSKENHRKFIAIVKEVGVYGKEDRLLRPGVLKDTQQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.22
3	0.21
4	0.23
5	0.23
6	0.3
7	0.32
8	0.31
9	0.33
10	0.42
11	0.48
12	0.54
13	0.6
14	0.6
15	0.64
16	0.71
17	0.75
18	0.76
19	0.79
20	0.8
21	0.83
22	0.81
23	0.82
24	0.84
25	0.84
26	0.85
27	0.85
28	0.84
29	0.83
30	0.87
31	0.87
32	0.87
33	0.85
34	0.8
35	0.76
36	0.74
37	0.68
38	0.6
39	0.53
40	0.43
41	0.4
42	0.37
43	0.33
44	0.28
45	0.28
46	0.3
47	0.31
48	0.32
49	0.26
50	0.26
51	0.28
52	0.27
53	0.26
54	0.27
55	0.27
56	0.27
57	0.28
58	0.29
59	0.25
60	0.23
61	0.23
62	0.23
63	0.22
64	0.24
65	0.28
66	0.29
67	0.35
68	0.39
69	0.41
70	0.37
71	0.4
72	0.4
73	0.41
74	0.4
75	0.36
76	0.34
77	0.3
78	0.31
79	0.28
80	0.29
81	0.24
82	0.2
83	0.18
84	0.15
85	0.14
86	0.13
87	0.12
88	0.09
89	0.09
90	0.09
91	0.1
92	0.11
93	0.13
94	0.15
95	0.15
96	0.13
97	0.12
98	0.19
99	0.2
100	0.2
101	0.21
102	0.27
103	0.35
104	0.39
105	0.41
106	0.41
107	0.48
108	0.56
109	0.64
110	0.65
111	0.62
112	0.6
113	0.63
114	0.56
115	0.56
116	0.56
117	0.54
118	0.54
119	0.51
120	0.55
121	0.59
122	0.68
123	0.64
124	0.61
125	0.57
126	0.58
127	0.59
128	0.55
129	0.5
130	0.48
131	0.46
132	0.46
133	0.45
134	0.45
135	0.52
136	0.57
137	0.62
138	0.65
139	0.74
140	0.79
141	0.78
142	0.8
143	0.76
144	0.75
145	0.7
146	0.69
147	0.68
148	0.61
149	0.6
150	0.57
151	0.58
152	0.56
153	0.52
154	0.46
155	0.36
156	0.33
157	0.3
158	0.24
159	0.19
160	0.16
161	0.16
162	0.14
163	0.14
164	0.13
165	0.13
166	0.13
167	0.1
168	0.1
169	0.08
170	0.08
171	0.1
172	0.11
173	0.12
174	0.15
175	0.14
176	0.18
177	0.22
178	0.27
179	0.34
180	0.39
181	0.43
182	0.49
183	0.54
184	0.53
185	0.5
186	0.48
187	0.41
188	0.36
189	0.31
190	0.22
191	0.17
192	0.13
193	0.12
194	0.09
195	0.11
196	0.11
197	0.15
198	0.19
199	0.24
200	0.31
201	0.38
202	0.47
203	0.54
204	0.58
205	0.64
206	0.67
207	0.7
208	0.71
209	0.73
210	0.72
211	0.68
212	0.67
213	0.59
214	0.57
215	0.49
216	0.42
217	0.38
218	0.31
219	0.24
220	0.21
221	0.2
222	0.18
223	0.21
224	0.2
225	0.17
226	0.16
227	0.17
228	0.17
229	0.19
230	0.22
231	0.21
232	0.24
233	0.24
234	0.23
235	0.23
236	0.22
237	0.19
238	0.17
239	0.18
240	0.18
241	0.19
242	0.18
243	0.19
244	0.18
245	0.18
246	0.17
247	0.13
248	0.1
249	0.09
250	0.1
251	0.09
252	0.1
253	0.1
254	0.08
255	0.07
256	0.06
257	0.06
258	0.06
259	0.05
260	0.04
261	0.04
262	0.05
263	0.05
264	0.05
265	0.06
266	0.07
267	0.07
268	0.07
269	0.07
270	0.08
271	0.1
272	0.11
273	0.17
274	0.27
275	0.28
276	0.31
277	0.34
278	0.4
279	0.4
280	0.45
281	0.49
282	0.49
283	0.53
284	0.54
285	0.54
286	0.47
287	0.47
288	0.42
289	0.36
290	0.29
291	0.25
292	0.21
293	0.19
294	0.18
295	0.17
296	0.15
297	0.13
298	0.16
299	0.14
300	0.21
301	0.29
302	0.38
303	0.44
304	0.49
305	0.5
306	0.54
307	0.56
308	0.52
309	0.53
310	0.46
311	0.41
312	0.41
313	0.43
314	0.37
315	0.37
316	0.37
317	0.27
318	0.24
319	0.24
320	0.18
321	0.13
322	0.12
323	0.17
324	0.22
325	0.24
326	0.26
327	0.29
328	0.36
329	0.42
330	0.47
331	0.49
332	0.47
333	0.49
334	0.52
335	0.5
336	0.44
337	0.37
338	0.32
339	0.24
340	0.18
341	0.14
342	0.08
343	0.08
344	0.06
345	0.06
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.05
350	0.05
351	0.04
352	0.04
353	0.04
354	0.05
355	0.05
356	0.06
357	0.05
358	0.05
359	0.06
360	0.06
361	0.07
362	0.07
363	0.06
364	0.06
365	0.06
366	0.05
367	0.04
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.06
372	0.06
373	0.07
374	0.08
375	0.1
376	0.12
377	0.14
378	0.17
379	0.24
380	0.31
381	0.33
382	0.4
383	0.46
384	0.51
385	0.53
386	0.5
387	0.46
388	0.43
389	0.41
390	0.35
391	0.3
392	0.22
393	0.19
394	0.19
395	0.21
396	0.19
397	0.21
398	0.21
399	0.22
400	0.21
401	0.22
402	0.24
403	0.22
404	0.24
405	0.23
406	0.23
407	0.28
408	0.33
409	0.4
410	0.47
411	0.51
412	0.55
413	0.6
414	0.63
415	0.65
416	0.66
417	0.63
418	0.59
419	0.6
420	0.6
421	0.63
422	0.68
423	0.7
424	0.73
425	0.73
426	0.76
427	0.73
428	0.71
429	0.63
430	0.58
431	0.5
432	0.42
433	0.38
434	0.31
435	0.27
436	0.24
437	0.22
438	0.17
439	0.15
440	0.14
441	0.13
442	0.11
443	0.11
444	0.11
445	0.14
446	0.14
447	0.14
448	0.13
449	0.11
450	0.12
451	0.11
452	0.1
453	0.08
454	0.08
455	0.07
456	0.09
457	0.09
458	0.11
459	0.13
460	0.15
461	0.16
462	0.18
463	0.21
464	0.24
465	0.28
466	0.31
467	0.33
468	0.34
469	0.34
470	0.34
471	0.36
472	0.35
473	0.32
474	0.32
475	0.37
476	0.37
477	0.37
478	0.35
479	0.31
480	0.3
481	0.3
482	0.29
483	0.23
484	0.27
485	0.32
486	0.35
487	0.35
488	0.39
489	0.41
490	0.44
491	0.49
492	0.5
493	0.47
494	0.51
495	0.53
496	0.49
497	0.48
498	0.45
499	0.43
500	0.4
501	0.45
502	0.45
503	0.42
504	0.44
505	0.47
506	0.49
507	0.5
508	0.49
509	0.43
510	0.4
511	0.4
512	0.37
513	0.32
514	0.26
515	0.25
516	0.22
517	0.2
518	0.21
519	0.23
520	0.27
521	0.36
522	0.38
523	0.38
524	0.46
525	0.55
526	0.6
527	0.65
528	0.7
529	0.7
530	0.77
531	0.75
532	0.69
533	0.62
534	0.54
535	0.48
536	0.4
537	0.36
538	0.31
539	0.3
540	0.29
541	0.29
542	0.33
543	0.33
544	0.32
545	0.31
546	0.29
547	0.28
548	0.27
549	0.3
550	0.27
551	0.33
552	0.4
553	0.42
554	0.45
555	0.47
556	0.55
557	0.54
558	0.56
559	0.55
560	0.53
561	0.5
562	0.45
563	0.42
564	0.32
565	0.28
566	0.21
567	0.16
568	0.09
569	0.07
570	0.06
571	0.05
572	0.04
573	0.05
574	0.04
575	0.03
576	0.03
577	0.03
578	0.03
579	0.03
580	0.03
581	0.03
582	0.06
583	0.09
584	0.1
585	0.15
586	0.18
587	0.25
588	0.32
589	0.39
590	0.46
591	0.53
592	0.63
593	0.65
594	0.69
595	0.68
596	0.65
597	0.63
598	0.58
599	0.49
600	0.46
601	0.42
602	0.39
603	0.35
604	0.32
605	0.33
606	0.31
607	0.3
608	0.26
609	0.31
610	0.31
611	0.3
612	0.31
613	0.28
614	0.28
615	0.29
616	0.27
617	0.2
618	0.19
619	0.2
620	0.19
621	0.16
622	0.14
623	0.13
624	0.18
625	0.21
626	0.23
627	0.22
628	0.24
629	0.31
630	0.38
631	0.43
632	0.45
633	0.44
634	0.44
635	0.48
636	0.51
637	0.47
638	0.44
639	0.45
640	0.4
641	0.4
642	0.39
643	0.36
644	0.29
645	0.28
646	0.27
647	0.21
648	0.19
649	0.18
650	0.21
651	0.18
652	0.17
653	0.16
654	0.14
655	0.14
656	0.13
657	0.12
658	0.12
659	0.15
660	0.19
661	0.2
662	0.19
663	0.22
664	0.3
665	0.31
666	0.32
667	0.31
668	0.29
669	0.36
670	0.42
671	0.46
672	0.41
673	0.5
674	0.58
675	0.6
676	0.61
677	0.55
678	0.49
679	0.44
680	0.47
681	0.45
682	0.38
683	0.36
684	0.35
685	0.35
686	0.34
687	0.33
688	0.25
689	0.19
690	0.18
691	0.19
692	0.21
693	0.22
694	0.23
695	0.27
696	0.29
697	0.28
698	0.32
699	0.33
700	0.35

A0A0F4YS50

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer