Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0F4YRW6

Protein Details
Accession A0A0F4YRW6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
166-187AFSLAKYKLRKQKKFLRRFTVLHydrophilic
378-404LQSWKPSKRGIYYRKRNRWVRVRSVVDHydrophilic
560-582RISARGNVSRKKRKVAETTPSTPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10, cyto 9.5, mito 8, nucl 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MHSFVRPHEYVVLRLPSDTSKVIKLVPNTYVSGAFALCLPRNVSLGKYGNFPSNQIIGRPFYLTYEILDHPDEDGHVLRVVPATELHAEALISEGSGEADGEMEDFDMNGDGDVPMRTNRDTIDDSSSQKLTLAEIEELKKQATCAGKEIIARLLQSHTAIDQKTAFSLAKYKLRKQKKFLRRFTVLPMDVSILTQYLLEEKDAPKIMELRDELIALMGCWGNVHHGGNTLLEETVTSKPNGRYLVVDDTGGLVVAAMAERMGILYPHEDDEDDDDTQTNDPGDADEAEQPKDGRTSHPQRRARKQPMSAKGNTLTLIHAHSQPNLSLLKYFSYDQGNPDESHPLYTHLKTLSWLHLVDPNADPIYANEPEKVDEATLQSWKPSKRGIYYRKRNRWVRVRSVVDETRAGGFDGLIVASLMEPASILQHVVPLLAGSAPVVVYSPTIEPLVHLADLYSTARRVAFINRKRELEEKREQQLKERQGQDTSNDNNPPSPDLPPIDLSSEFPVDPTLLVGPTLQTSRVRPWQVLPGRTHPLMMGRGGAEGYIFHATRVIPTQERISARGNVSRKKRKVAETTPSTPGD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.34
3 0.29
4 0.3
5 0.31
6 0.26
7 0.24
8 0.25
9 0.29
10 0.32
11 0.34
12 0.35
13 0.36
14 0.36
15 0.35
16 0.35
17 0.31
18 0.27
19 0.24
20 0.18
21 0.15
22 0.13
23 0.16
24 0.15
25 0.17
26 0.18
27 0.18
28 0.2
29 0.21
30 0.2
31 0.24
32 0.29
33 0.28
34 0.3
35 0.31
36 0.36
37 0.36
38 0.36
39 0.32
40 0.32
41 0.32
42 0.3
43 0.31
44 0.27
45 0.28
46 0.28
47 0.24
48 0.2
49 0.23
50 0.21
51 0.19
52 0.2
53 0.2
54 0.21
55 0.21
56 0.2
57 0.17
58 0.17
59 0.16
60 0.13
61 0.13
62 0.12
63 0.12
64 0.11
65 0.11
66 0.12
67 0.12
68 0.11
69 0.11
70 0.12
71 0.13
72 0.13
73 0.13
74 0.11
75 0.11
76 0.1
77 0.11
78 0.08
79 0.06
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.06
100 0.06
101 0.08
102 0.09
103 0.12
104 0.12
105 0.13
106 0.14
107 0.18
108 0.21
109 0.22
110 0.27
111 0.28
112 0.3
113 0.33
114 0.32
115 0.27
116 0.25
117 0.23
118 0.17
119 0.16
120 0.15
121 0.14
122 0.17
123 0.19
124 0.2
125 0.21
126 0.21
127 0.18
128 0.16
129 0.19
130 0.21
131 0.21
132 0.22
133 0.23
134 0.25
135 0.26
136 0.27
137 0.26
138 0.21
139 0.2
140 0.18
141 0.17
142 0.15
143 0.15
144 0.14
145 0.12
146 0.15
147 0.15
148 0.16
149 0.15
150 0.15
151 0.14
152 0.16
153 0.15
154 0.11
155 0.17
156 0.2
157 0.27
158 0.32
159 0.4
160 0.47
161 0.58
162 0.65
163 0.68
164 0.74
165 0.77
166 0.83
167 0.85
168 0.84
169 0.78
170 0.73
171 0.71
172 0.7
173 0.6
174 0.5
175 0.41
176 0.33
177 0.28
178 0.25
179 0.18
180 0.09
181 0.08
182 0.07
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.07
187 0.09
188 0.1
189 0.14
190 0.15
191 0.16
192 0.15
193 0.18
194 0.17
195 0.2
196 0.2
197 0.17
198 0.16
199 0.16
200 0.15
201 0.13
202 0.12
203 0.07
204 0.08
205 0.06
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.06
210 0.08
211 0.08
212 0.07
213 0.09
214 0.1
215 0.1
216 0.11
217 0.1
218 0.08
219 0.07
220 0.07
221 0.08
222 0.1
223 0.11
224 0.11
225 0.15
226 0.16
227 0.19
228 0.21
229 0.18
230 0.17
231 0.19
232 0.23
233 0.2
234 0.19
235 0.15
236 0.15
237 0.14
238 0.12
239 0.09
240 0.04
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.02
245 0.02
246 0.02
247 0.02
248 0.02
249 0.02
250 0.02
251 0.03
252 0.04
253 0.05
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.09
259 0.11
260 0.11
261 0.1
262 0.1
263 0.1
264 0.1
265 0.1
266 0.07
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.06
273 0.1
274 0.11
275 0.11
276 0.12
277 0.12
278 0.12
279 0.13
280 0.12
281 0.12
282 0.2
283 0.29
284 0.38
285 0.48
286 0.55
287 0.62
288 0.71
289 0.79
290 0.79
291 0.77
292 0.77
293 0.76
294 0.78
295 0.76
296 0.68
297 0.61
298 0.52
299 0.46
300 0.38
301 0.29
302 0.2
303 0.14
304 0.14
305 0.12
306 0.15
307 0.14
308 0.15
309 0.15
310 0.14
311 0.16
312 0.15
313 0.13
314 0.1
315 0.1
316 0.11
317 0.11
318 0.12
319 0.12
320 0.16
321 0.16
322 0.17
323 0.2
324 0.21
325 0.2
326 0.21
327 0.22
328 0.18
329 0.19
330 0.17
331 0.17
332 0.19
333 0.18
334 0.2
335 0.17
336 0.17
337 0.17
338 0.19
339 0.18
340 0.17
341 0.17
342 0.15
343 0.18
344 0.19
345 0.19
346 0.18
347 0.17
348 0.15
349 0.14
350 0.13
351 0.1
352 0.14
353 0.14
354 0.14
355 0.13
356 0.14
357 0.15
358 0.16
359 0.15
360 0.11
361 0.1
362 0.11
363 0.12
364 0.14
365 0.13
366 0.14
367 0.19
368 0.2
369 0.21
370 0.24
371 0.26
372 0.31
373 0.41
374 0.49
375 0.56
376 0.66
377 0.75
378 0.8
379 0.86
380 0.87
381 0.86
382 0.86
383 0.84
384 0.83
385 0.81
386 0.76
387 0.69
388 0.69
389 0.62
390 0.54
391 0.46
392 0.37
393 0.29
394 0.24
395 0.21
396 0.13
397 0.1
398 0.08
399 0.07
400 0.06
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.03
405 0.04
406 0.03
407 0.03
408 0.03
409 0.03
410 0.04
411 0.04
412 0.05
413 0.04
414 0.06
415 0.06
416 0.06
417 0.06
418 0.05
419 0.05
420 0.05
421 0.05
422 0.04
423 0.04
424 0.04
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.06
430 0.06
431 0.07
432 0.08
433 0.08
434 0.08
435 0.1
436 0.12
437 0.1
438 0.1
439 0.08
440 0.08
441 0.1
442 0.11
443 0.1
444 0.09
445 0.1
446 0.11
447 0.12
448 0.13
449 0.21
450 0.3
451 0.36
452 0.46
453 0.5
454 0.52
455 0.54
456 0.61
457 0.59
458 0.57
459 0.59
460 0.57
461 0.61
462 0.67
463 0.64
464 0.64
465 0.66
466 0.66
467 0.65
468 0.63
469 0.57
470 0.54
471 0.56
472 0.51
473 0.5
474 0.46
475 0.43
476 0.41
477 0.39
478 0.37
479 0.36
480 0.37
481 0.3
482 0.28
483 0.26
484 0.25
485 0.27
486 0.27
487 0.28
488 0.26
489 0.25
490 0.24
491 0.24
492 0.23
493 0.2
494 0.17
495 0.17
496 0.14
497 0.13
498 0.12
499 0.1
500 0.08
501 0.09
502 0.09
503 0.09
504 0.11
505 0.12
506 0.13
507 0.15
508 0.18
509 0.25
510 0.34
511 0.36
512 0.36
513 0.38
514 0.46
515 0.51
516 0.55
517 0.53
518 0.52
519 0.55
520 0.54
521 0.51
522 0.41
523 0.39
524 0.34
525 0.3
526 0.25
527 0.18
528 0.19
529 0.18
530 0.17
531 0.11
532 0.09
533 0.11
534 0.13
535 0.13
536 0.12
537 0.14
538 0.15
539 0.17
540 0.23
541 0.25
542 0.23
543 0.26
544 0.31
545 0.35
546 0.38
547 0.39
548 0.38
549 0.39
550 0.41
551 0.46
552 0.49
553 0.51
554 0.6
555 0.67
556 0.69
557 0.73
558 0.77
559 0.79
560 0.82
561 0.83
562 0.82
563 0.81
564 0.8