Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0F4YY51

Protein Details
Accession A0A0F4YY51    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
269-290QSGWRELEAKRRQKKNEAAALGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
272-283WRELEAKRRQKK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 10.5, cyto 3.5, mito 3, extr 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013921  Mediator_Med20  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF08612  Med20  
Amino Acid Sequences MPITGVFFIPSTPNAPNALATLSERLRSSYGDEAVPVGRWALEHKLMRDTSSCLPASAHAPNPPPQPRYMQFLSLSHYPNHGFIYASESTDQPDTNAPGLAQQPPRKPSTQSGMIMSTIPLPSCSTLFQHFVRACEPLWCHRHTVTAGGTTYDVGDFRVRIGEVRQTQPMARARGTVVEIEWRGPSIASSPLLSPLPTDGDGSGDYADSAVDLSFIPEDSDIDAEYAQTAELIREFWSRFGVTDKGVQEAILVPDVGRELKAKLHQRRQSGWRELEAKRRQKKNEAAALGRSWGWGWNEQDDDPDAGVDLARQYMEIFRFNR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.2
3 0.2
4 0.19
5 0.18
6 0.16
7 0.16
8 0.2
9 0.19
10 0.21
11 0.21
12 0.22
13 0.22
14 0.22
15 0.24
16 0.24
17 0.25
18 0.23
19 0.23
20 0.22
21 0.22
22 0.22
23 0.17
24 0.12
25 0.09
26 0.09
27 0.12
28 0.15
29 0.21
30 0.24
31 0.26
32 0.33
33 0.33
34 0.35
35 0.34
36 0.33
37 0.3
38 0.33
39 0.31
40 0.25
41 0.24
42 0.24
43 0.26
44 0.26
45 0.25
46 0.24
47 0.27
48 0.32
49 0.4
50 0.44
51 0.43
52 0.4
53 0.45
54 0.43
55 0.47
56 0.44
57 0.4
58 0.36
59 0.36
60 0.38
61 0.35
62 0.35
63 0.29
64 0.29
65 0.25
66 0.24
67 0.24
68 0.2
69 0.15
70 0.13
71 0.18
72 0.16
73 0.16
74 0.16
75 0.15
76 0.16
77 0.16
78 0.16
79 0.11
80 0.13
81 0.13
82 0.13
83 0.14
84 0.12
85 0.13
86 0.15
87 0.2
88 0.24
89 0.28
90 0.33
91 0.37
92 0.4
93 0.4
94 0.41
95 0.4
96 0.41
97 0.42
98 0.38
99 0.37
100 0.34
101 0.33
102 0.3
103 0.25
104 0.2
105 0.13
106 0.11
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.1
112 0.1
113 0.12
114 0.16
115 0.16
116 0.22
117 0.22
118 0.23
119 0.23
120 0.22
121 0.2
122 0.2
123 0.21
124 0.21
125 0.25
126 0.25
127 0.26
128 0.25
129 0.28
130 0.24
131 0.26
132 0.2
133 0.19
134 0.18
135 0.16
136 0.16
137 0.13
138 0.12
139 0.09
140 0.08
141 0.06
142 0.06
143 0.05
144 0.05
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.08
149 0.13
150 0.15
151 0.18
152 0.19
153 0.19
154 0.19
155 0.24
156 0.28
157 0.25
158 0.22
159 0.21
160 0.2
161 0.21
162 0.21
163 0.16
164 0.11
165 0.12
166 0.12
167 0.12
168 0.12
169 0.1
170 0.1
171 0.09
172 0.09
173 0.07
174 0.08
175 0.08
176 0.09
177 0.09
178 0.11
179 0.11
180 0.11
181 0.1
182 0.09
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.08
187 0.09
188 0.09
189 0.1
190 0.09
191 0.07
192 0.06
193 0.05
194 0.05
195 0.04
196 0.04
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.04
201 0.04
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.05
214 0.05
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.05
219 0.05
220 0.07
221 0.1
222 0.11
223 0.11
224 0.14
225 0.14
226 0.14
227 0.17
228 0.18
229 0.16
230 0.21
231 0.21
232 0.21
233 0.2
234 0.19
235 0.16
236 0.16
237 0.16
238 0.11
239 0.1
240 0.08
241 0.09
242 0.1
243 0.1
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.14
248 0.22
249 0.31
250 0.41
251 0.51
252 0.56
253 0.62
254 0.69
255 0.73
256 0.75
257 0.74
258 0.68
259 0.65
260 0.66
261 0.63
262 0.66
263 0.67
264 0.68
265 0.68
266 0.74
267 0.74
268 0.76
269 0.81
270 0.81
271 0.8
272 0.77
273 0.71
274 0.67
275 0.61
276 0.53
277 0.44
278 0.34
279 0.25
280 0.23
281 0.21
282 0.22
283 0.24
284 0.26
285 0.29
286 0.28
287 0.31
288 0.29
289 0.27
290 0.22
291 0.19
292 0.15
293 0.12
294 0.12
295 0.1
296 0.09
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.09
301 0.14
302 0.16