Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0F4YY28

Protein Details
Accession A0A0F4YY28    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
59-83GTEPVVKRPGNKQKQKSKLRLSFGPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
65-75KRPGNKQKQKS
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 12.5, cyto 5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012890  GCFC2-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF15458  NTR2  
Amino Acid Sequences MNSPFANRRKARKVGGEEEDVEEDKTEQGRYKVYHPATSPSVARTQWCGGMRLTGRKPGTEPVVKRPGNKQKQKSKLRLSFGPGETSMTEDGGETSEVITPKRPSLGRRVLEKNTFQRSSRLSGSFEHLPFRVGQDQDRPSYGEDYLKELRDSTPSTPRNINSLQPDGDETDKVVDVAAKFGEIEKTSTQTVIPSEAEIRMKKERRARLAREQEYISLNGGDEEDYLPLDGKKEKNNTRLVRDDEDFAEGFDEYVEDGRLSLGRKAELEQQRRQREEMRELIEEAENTSEEDDSDVEHKAAYEAAQTRAAIGSDRGDLSTRPRTPPKVTSLPHLANILERLRASLAEMENSKKLLVNRMEELRKEKADIAVREVEIQTLIKEAGEKYEKLRIEAGLAPGEGGLPGDAPPNDRGLESLGTSMPVSRADSDAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.76
3 0.71
4 0.64
5 0.59
6 0.54
7 0.45
8 0.37
9 0.28
10 0.22
11 0.2
12 0.19
13 0.18
14 0.19
15 0.2
16 0.26
17 0.28
18 0.32
19 0.39
20 0.4
21 0.44
22 0.42
23 0.46
24 0.44
25 0.45
26 0.42
27 0.36
28 0.38
29 0.33
30 0.33
31 0.32
32 0.31
33 0.33
34 0.33
35 0.32
36 0.27
37 0.34
38 0.36
39 0.4
40 0.4
41 0.42
42 0.42
43 0.41
44 0.43
45 0.41
46 0.45
47 0.44
48 0.45
49 0.46
50 0.55
51 0.56
52 0.57
53 0.62
54 0.65
55 0.68
56 0.74
57 0.75
58 0.75
59 0.84
60 0.9
61 0.9
62 0.9
63 0.88
64 0.84
65 0.8
66 0.76
67 0.74
68 0.65
69 0.59
70 0.48
71 0.42
72 0.35
73 0.32
74 0.25
75 0.16
76 0.15
77 0.1
78 0.1
79 0.09
80 0.09
81 0.07
82 0.07
83 0.1
84 0.1
85 0.11
86 0.15
87 0.16
88 0.17
89 0.23
90 0.25
91 0.25
92 0.35
93 0.44
94 0.45
95 0.51
96 0.57
97 0.58
98 0.61
99 0.65
100 0.63
101 0.62
102 0.6
103 0.53
104 0.52
105 0.49
106 0.47
107 0.45
108 0.39
109 0.33
110 0.32
111 0.36
112 0.37
113 0.34
114 0.31
115 0.26
116 0.25
117 0.23
118 0.25
119 0.25
120 0.19
121 0.21
122 0.26
123 0.3
124 0.3
125 0.31
126 0.29
127 0.25
128 0.26
129 0.25
130 0.2
131 0.17
132 0.22
133 0.24
134 0.24
135 0.22
136 0.21
137 0.21
138 0.21
139 0.23
140 0.21
141 0.28
142 0.29
143 0.32
144 0.35
145 0.35
146 0.37
147 0.36
148 0.36
149 0.31
150 0.32
151 0.29
152 0.25
153 0.26
154 0.22
155 0.21
156 0.17
157 0.12
158 0.1
159 0.1
160 0.09
161 0.08
162 0.08
163 0.07
164 0.08
165 0.07
166 0.06
167 0.06
168 0.07
169 0.09
170 0.07
171 0.1
172 0.09
173 0.12
174 0.12
175 0.12
176 0.12
177 0.11
178 0.11
179 0.11
180 0.1
181 0.09
182 0.1
183 0.11
184 0.14
185 0.14
186 0.17
187 0.23
188 0.27
189 0.32
190 0.39
191 0.43
192 0.5
193 0.58
194 0.61
195 0.63
196 0.7
197 0.68
198 0.63
199 0.57
200 0.5
201 0.42
202 0.36
203 0.26
204 0.16
205 0.12
206 0.09
207 0.09
208 0.07
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.04
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.06
217 0.1
218 0.12
219 0.17
220 0.26
221 0.32
222 0.38
223 0.48
224 0.5
225 0.52
226 0.56
227 0.54
228 0.5
229 0.45
230 0.4
231 0.32
232 0.3
233 0.24
234 0.18
235 0.15
236 0.1
237 0.09
238 0.07
239 0.06
240 0.04
241 0.04
242 0.05
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.06
247 0.07
248 0.09
249 0.1
250 0.11
251 0.12
252 0.13
253 0.22
254 0.29
255 0.35
256 0.4
257 0.48
258 0.55
259 0.57
260 0.58
261 0.56
262 0.54
263 0.54
264 0.53
265 0.47
266 0.41
267 0.4
268 0.39
269 0.32
270 0.26
271 0.2
272 0.14
273 0.1
274 0.09
275 0.09
276 0.07
277 0.06
278 0.07
279 0.06
280 0.06
281 0.07
282 0.08
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.08
288 0.07
289 0.1
290 0.12
291 0.14
292 0.16
293 0.16
294 0.16
295 0.16
296 0.16
297 0.12
298 0.11
299 0.1
300 0.1
301 0.11
302 0.11
303 0.11
304 0.12
305 0.17
306 0.25
307 0.27
308 0.32
309 0.38
310 0.43
311 0.48
312 0.54
313 0.56
314 0.56
315 0.54
316 0.55
317 0.57
318 0.53
319 0.49
320 0.44
321 0.36
322 0.28
323 0.31
324 0.26
325 0.19
326 0.17
327 0.16
328 0.15
329 0.15
330 0.15
331 0.16
332 0.16
333 0.18
334 0.2
335 0.22
336 0.23
337 0.24
338 0.22
339 0.2
340 0.21
341 0.26
342 0.29
343 0.3
344 0.34
345 0.41
346 0.45
347 0.46
348 0.5
349 0.47
350 0.43
351 0.42
352 0.39
353 0.37
354 0.41
355 0.39
356 0.39
357 0.38
358 0.37
359 0.38
360 0.36
361 0.29
362 0.22
363 0.21
364 0.16
365 0.12
366 0.12
367 0.09
368 0.11
369 0.11
370 0.17
371 0.21
372 0.22
373 0.24
374 0.31
375 0.32
376 0.32
377 0.34
378 0.27
379 0.27
380 0.3
381 0.29
382 0.24
383 0.23
384 0.21
385 0.18
386 0.18
387 0.13
388 0.1
389 0.07
390 0.05
391 0.06
392 0.1
393 0.11
394 0.14
395 0.15
396 0.18
397 0.18
398 0.18
399 0.18
400 0.18
401 0.19
402 0.17
403 0.18
404 0.16
405 0.16
406 0.16
407 0.17
408 0.14
409 0.14
410 0.16
411 0.15