Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0F4YJS4

Protein Details
Accession A0A0F4YJS4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
742-769QRARLQIPRRLRRRVFCRARYLRRQAPGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
750-753RRLR
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 9, mito 6, cyto 5.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005607  BSD_dom  
IPR011993  PH-like_dom_sf  
IPR027079  Tfb1/GTF2H1  
IPR013876  TFIIH_BTF_p62_N  
Gene Ontology GO:0000439  C:transcription factor TFIIH core complex  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF03909  BSD  
PF08567  PH_TFIIH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50858  BSD  
CDD cd13229  PH_TFIIH  
Amino Acid Sequences MAPPPPSGSAAYKKKDGTLTMSKDRQSLSWIPAAGGAAGALTIEVKNITNLQQTPASNPKVMLRIFAQQPANGNAQEQYVFTFTSATNARGEADAIKDALSAAIQAAKAAAAPTAVPGEGVSPAMAMAHAISSAGMGRPAWDDDNKLIADAELQQSLLKSDANLQRMFMESLRTKPDTLSGAQFVSQFWSTRVHLLRAHAIEKAQTRGSYNVLSTLKPRVEDNVTKLNISKEQIQLIFTQHPLVKRVYDENVPKLSEQQFWSRFFQSRLFKKLRGERISDTDPTDNILDKYLKIDEHAGRSLEAHVPHFIDLAGNEVNHSQRQGNRPDVDMRPAPMDKVPIIRTLNSLSEKIMANVAPADRDPTAPVGMDEITFSELQLRDLRGDEEQNRIRLNIRDQSRFFSQAKEKDESENQMFANVDPTQIIISLQTDVDQTFPPDGSSSHLGRLVEPEEDDSDEEEGKQSQQVGSKANLHRASAQLFDAIRERRTQTETTAAGSGTCGLSPALFDRLTLTHATTTEFLHQFWQAFLSGNPDRAGELASLVESLNRAMERVKAVAADAEAERQAEIEKLKQHARDVLAATGKKIRVNLAGVGGGEKVVNQLLGPTMKALDLAISKYKEALAEATAAEAAREEAPQSLAVGSPATSASCTSHASCLISASAPLLSSSPAVGRLPASLSDQQTRWKQRPHRHLSPAIVSLPLSSLRRRHTPVACDLSLQYRVSSSYGLLVIRKDALVRFRQRARLQIPRRLRRRVFCRARYLRRQAPGPHPGQSASMEVWAAVARAAVAGGRTFLVTTLPYTTIITPLLLALVLRPLSFNTLNYLPSGPTATIFALLAQYHAAVPHTFKYRISTSSSSNNNTPSLTILLSDKSTTYLVAAQLALSQFPATLLPAAVGWAVGVAWRADILPTSRRGGGGGWRVPAWLVGEKEPVRRRSPAGATASSSGASISGGDSERYEDLRRRLDAASAAAAAQAAASSGVEASQQRQRRPLLERFRGVF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.53
3 0.5
4 0.48
5 0.49
6 0.52
7 0.55
8 0.6
9 0.57
10 0.56
11 0.55
12 0.47
13 0.44
14 0.41
15 0.36
16 0.35
17 0.34
18 0.3
19 0.31
20 0.3
21 0.23
22 0.17
23 0.12
24 0.07
25 0.06
26 0.06
27 0.04
28 0.04
29 0.04
30 0.05
31 0.06
32 0.07
33 0.09
34 0.11
35 0.14
36 0.2
37 0.21
38 0.25
39 0.29
40 0.3
41 0.35
42 0.41
43 0.42
44 0.37
45 0.38
46 0.39
47 0.4
48 0.39
49 0.36
50 0.3
51 0.34
52 0.35
53 0.4
54 0.38
55 0.33
56 0.37
57 0.38
58 0.39
59 0.31
60 0.29
61 0.23
62 0.23
63 0.22
64 0.18
65 0.16
66 0.14
67 0.14
68 0.13
69 0.14
70 0.12
71 0.17
72 0.19
73 0.18
74 0.18
75 0.18
76 0.19
77 0.17
78 0.19
79 0.15
80 0.15
81 0.15
82 0.14
83 0.14
84 0.12
85 0.12
86 0.11
87 0.09
88 0.07
89 0.06
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.08
98 0.05
99 0.06
100 0.07
101 0.08
102 0.08
103 0.07
104 0.07
105 0.08
106 0.08
107 0.09
108 0.07
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.05
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.06
121 0.06
122 0.07
123 0.06
124 0.08
125 0.1
126 0.12
127 0.15
128 0.16
129 0.18
130 0.19
131 0.24
132 0.23
133 0.21
134 0.19
135 0.16
136 0.16
137 0.16
138 0.16
139 0.12
140 0.12
141 0.12
142 0.12
143 0.13
144 0.13
145 0.1
146 0.08
147 0.16
148 0.22
149 0.26
150 0.26
151 0.26
152 0.26
153 0.29
154 0.3
155 0.22
156 0.24
157 0.21
158 0.25
159 0.31
160 0.31
161 0.29
162 0.28
163 0.32
164 0.28
165 0.28
166 0.28
167 0.24
168 0.23
169 0.24
170 0.24
171 0.2
172 0.2
173 0.19
174 0.16
175 0.15
176 0.19
177 0.18
178 0.25
179 0.27
180 0.27
181 0.28
182 0.31
183 0.37
184 0.35
185 0.35
186 0.29
187 0.27
188 0.29
189 0.29
190 0.29
191 0.25
192 0.23
193 0.24
194 0.25
195 0.27
196 0.24
197 0.22
198 0.25
199 0.24
200 0.24
201 0.24
202 0.28
203 0.27
204 0.26
205 0.26
206 0.24
207 0.29
208 0.33
209 0.36
210 0.39
211 0.38
212 0.38
213 0.39
214 0.37
215 0.34
216 0.32
217 0.32
218 0.25
219 0.28
220 0.29
221 0.28
222 0.27
223 0.26
224 0.27
225 0.21
226 0.23
227 0.21
228 0.22
229 0.24
230 0.24
231 0.21
232 0.22
233 0.25
234 0.24
235 0.29
236 0.32
237 0.35
238 0.37
239 0.37
240 0.34
241 0.36
242 0.35
243 0.33
244 0.31
245 0.34
246 0.36
247 0.38
248 0.42
249 0.4
250 0.41
251 0.39
252 0.44
253 0.44
254 0.45
255 0.51
256 0.52
257 0.52
258 0.57
259 0.63
260 0.66
261 0.62
262 0.6
263 0.55
264 0.57
265 0.57
266 0.51
267 0.46
268 0.37
269 0.32
270 0.29
271 0.26
272 0.2
273 0.16
274 0.17
275 0.15
276 0.13
277 0.16
278 0.15
279 0.14
280 0.14
281 0.2
282 0.2
283 0.23
284 0.25
285 0.24
286 0.22
287 0.23
288 0.24
289 0.21
290 0.19
291 0.16
292 0.15
293 0.16
294 0.15
295 0.15
296 0.13
297 0.09
298 0.08
299 0.1
300 0.09
301 0.08
302 0.09
303 0.1
304 0.11
305 0.11
306 0.13
307 0.13
308 0.17
309 0.24
310 0.29
311 0.35
312 0.35
313 0.37
314 0.41
315 0.4
316 0.4
317 0.35
318 0.31
319 0.28
320 0.27
321 0.26
322 0.21
323 0.21
324 0.17
325 0.21
326 0.2
327 0.22
328 0.23
329 0.23
330 0.23
331 0.24
332 0.27
333 0.24
334 0.23
335 0.18
336 0.19
337 0.19
338 0.17
339 0.17
340 0.12
341 0.1
342 0.11
343 0.11
344 0.09
345 0.09
346 0.11
347 0.09
348 0.1
349 0.11
350 0.11
351 0.11
352 0.1
353 0.1
354 0.09
355 0.09
356 0.08
357 0.08
358 0.07
359 0.08
360 0.08
361 0.07
362 0.1
363 0.1
364 0.12
365 0.14
366 0.14
367 0.13
368 0.14
369 0.16
370 0.13
371 0.17
372 0.17
373 0.23
374 0.26
375 0.27
376 0.27
377 0.26
378 0.28
379 0.26
380 0.29
381 0.28
382 0.3
383 0.34
384 0.35
385 0.38
386 0.39
387 0.41
388 0.37
389 0.36
390 0.38
391 0.38
392 0.41
393 0.4
394 0.38
395 0.37
396 0.39
397 0.38
398 0.33
399 0.29
400 0.24
401 0.22
402 0.22
403 0.18
404 0.18
405 0.13
406 0.11
407 0.09
408 0.09
409 0.08
410 0.08
411 0.08
412 0.04
413 0.05
414 0.05
415 0.05
416 0.06
417 0.06
418 0.06
419 0.07
420 0.07
421 0.07
422 0.07
423 0.08
424 0.07
425 0.07
426 0.08
427 0.09
428 0.13
429 0.13
430 0.14
431 0.16
432 0.16
433 0.15
434 0.17
435 0.15
436 0.12
437 0.11
438 0.11
439 0.09
440 0.1
441 0.1
442 0.09
443 0.08
444 0.08
445 0.08
446 0.07
447 0.07
448 0.07
449 0.07
450 0.07
451 0.08
452 0.11
453 0.13
454 0.15
455 0.16
456 0.24
457 0.24
458 0.31
459 0.31
460 0.28
461 0.27
462 0.26
463 0.26
464 0.19
465 0.18
466 0.13
467 0.12
468 0.12
469 0.15
470 0.15
471 0.15
472 0.16
473 0.17
474 0.17
475 0.21
476 0.21
477 0.18
478 0.22
479 0.22
480 0.21
481 0.2
482 0.18
483 0.14
484 0.13
485 0.12
486 0.07
487 0.06
488 0.05
489 0.04
490 0.04
491 0.04
492 0.05
493 0.07
494 0.07
495 0.07
496 0.08
497 0.09
498 0.1
499 0.11
500 0.1
501 0.09
502 0.09
503 0.1
504 0.1
505 0.1
506 0.13
507 0.13
508 0.13
509 0.13
510 0.14
511 0.13
512 0.12
513 0.12
514 0.08
515 0.08
516 0.08
517 0.13
518 0.13
519 0.14
520 0.14
521 0.14
522 0.13
523 0.13
524 0.13
525 0.07
526 0.07
527 0.05
528 0.05
529 0.05
530 0.05
531 0.05
532 0.04
533 0.04
534 0.05
535 0.05
536 0.05
537 0.05
538 0.07
539 0.08
540 0.09
541 0.09
542 0.08
543 0.08
544 0.09
545 0.08
546 0.08
547 0.07
548 0.07
549 0.07
550 0.07
551 0.07
552 0.06
553 0.06
554 0.06
555 0.07
556 0.09
557 0.12
558 0.15
559 0.19
560 0.21
561 0.21
562 0.24
563 0.25
564 0.25
565 0.23
566 0.23
567 0.24
568 0.22
569 0.23
570 0.23
571 0.22
572 0.2
573 0.2
574 0.18
575 0.16
576 0.18
577 0.18
578 0.15
579 0.14
580 0.13
581 0.13
582 0.11
583 0.09
584 0.07
585 0.06
586 0.05
587 0.04
588 0.04
589 0.04
590 0.04
591 0.05
592 0.06
593 0.06
594 0.06
595 0.06
596 0.06
597 0.06
598 0.06
599 0.06
600 0.07
601 0.08
602 0.12
603 0.12
604 0.12
605 0.13
606 0.13
607 0.12
608 0.12
609 0.11
610 0.08
611 0.08
612 0.08
613 0.08
614 0.08
615 0.07
616 0.07
617 0.06
618 0.06
619 0.05
620 0.05
621 0.06
622 0.06
623 0.07
624 0.07
625 0.07
626 0.07
627 0.06
628 0.06
629 0.06
630 0.06
631 0.05
632 0.06
633 0.05
634 0.05
635 0.06
636 0.07
637 0.09
638 0.11
639 0.11
640 0.12
641 0.13
642 0.14
643 0.13
644 0.13
645 0.11
646 0.1
647 0.09
648 0.08
649 0.07
650 0.06
651 0.06
652 0.06
653 0.06
654 0.06
655 0.06
656 0.06
657 0.08
658 0.08
659 0.08
660 0.08
661 0.08
662 0.09
663 0.1
664 0.14
665 0.16
666 0.19
667 0.21
668 0.22
669 0.28
670 0.35
671 0.41
672 0.43
673 0.48
674 0.55
675 0.61
676 0.71
677 0.75
678 0.76
679 0.77
680 0.77
681 0.72
682 0.68
683 0.61
684 0.5
685 0.41
686 0.31
687 0.24
688 0.19
689 0.17
690 0.15
691 0.15
692 0.19
693 0.23
694 0.29
695 0.33
696 0.4
697 0.42
698 0.45
699 0.51
700 0.53
701 0.49
702 0.44
703 0.4
704 0.36
705 0.35
706 0.3
707 0.22
708 0.15
709 0.16
710 0.15
711 0.15
712 0.11
713 0.1
714 0.11
715 0.12
716 0.12
717 0.12
718 0.12
719 0.12
720 0.12
721 0.11
722 0.12
723 0.17
724 0.24
725 0.3
726 0.36
727 0.41
728 0.5
729 0.51
730 0.57
731 0.58
732 0.61
733 0.62
734 0.65
735 0.7
736 0.71
737 0.77
738 0.79
739 0.79
740 0.78
741 0.79
742 0.8
743 0.8
744 0.78
745 0.81
746 0.81
747 0.84
748 0.85
749 0.86
750 0.82
751 0.77
752 0.76
753 0.72
754 0.7
755 0.69
756 0.62
757 0.57
758 0.51
759 0.46
760 0.41
761 0.36
762 0.29
763 0.21
764 0.18
765 0.13
766 0.12
767 0.11
768 0.09
769 0.08
770 0.06
771 0.05
772 0.04
773 0.04
774 0.04
775 0.04
776 0.04
777 0.05
778 0.05
779 0.06
780 0.06
781 0.06
782 0.06
783 0.07
784 0.07
785 0.08
786 0.1
787 0.11
788 0.11
789 0.13
790 0.13
791 0.14
792 0.14
793 0.13
794 0.1
795 0.09
796 0.08
797 0.07
798 0.06
799 0.05
800 0.08
801 0.08
802 0.08
803 0.08
804 0.09
805 0.14
806 0.15
807 0.15
808 0.17
809 0.18
810 0.19
811 0.2
812 0.21
813 0.16
814 0.16
815 0.17
816 0.13
817 0.11
818 0.13
819 0.11
820 0.11
821 0.11
822 0.1
823 0.1
824 0.1
825 0.1
826 0.08
827 0.08
828 0.08
829 0.08
830 0.09
831 0.08
832 0.11
833 0.15
834 0.21
835 0.22
836 0.22
837 0.27
838 0.29
839 0.31
840 0.36
841 0.35
842 0.33
843 0.41
844 0.47
845 0.46
846 0.46
847 0.46
848 0.4
849 0.37
850 0.33
851 0.27
852 0.22
853 0.18
854 0.15
855 0.14
856 0.15
857 0.15
858 0.15
859 0.13
860 0.14
861 0.14
862 0.13
863 0.12
864 0.13
865 0.12
866 0.14
867 0.13
868 0.11
869 0.14
870 0.14
871 0.12
872 0.1
873 0.09
874 0.08
875 0.08
876 0.08
877 0.07
878 0.08
879 0.07
880 0.07
881 0.07
882 0.08
883 0.07
884 0.07
885 0.05
886 0.04
887 0.04
888 0.04
889 0.06
890 0.05
891 0.05
892 0.06
893 0.06
894 0.06
895 0.09
896 0.12
897 0.16
898 0.2
899 0.23
900 0.24
901 0.24
902 0.25
903 0.25
904 0.29
905 0.33
906 0.34
907 0.32
908 0.31
909 0.32
910 0.31
911 0.3
912 0.25
913 0.22
914 0.2
915 0.2
916 0.28
917 0.31
918 0.4
919 0.47
920 0.49
921 0.49
922 0.5
923 0.52
924 0.53
925 0.56
926 0.56
927 0.54
928 0.51
929 0.5
930 0.47
931 0.44
932 0.35
933 0.29
934 0.21
935 0.14
936 0.11
937 0.08
938 0.07
939 0.09
940 0.1
941 0.1
942 0.11
943 0.14
944 0.16
945 0.18
946 0.23
947 0.26
948 0.32
949 0.39
950 0.4
951 0.41
952 0.39
953 0.4
954 0.39
955 0.34
956 0.3
957 0.23
958 0.21
959 0.18
960 0.17
961 0.13
962 0.1
963 0.07
964 0.05
965 0.04
966 0.04
967 0.04
968 0.04
969 0.05
970 0.08
971 0.09
972 0.13
973 0.21
974 0.28
975 0.32
976 0.4
977 0.45
978 0.49
979 0.56
980 0.62
981 0.65
982 0.68