FuNGI

A0A0F4YQT5

Protein Details

Accession

A0A0F4YQT5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
482-508	EAEAEHKRKLKQKRKEKKDTAKGEPGG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
487-519	HKRKLKQKRKEKKDTAKGEPGGFGRPKKEPPGP
568-592	RGSRGGRGRGFDRGSGRGRGGGGGR

Subcellular Location(s)

extr 14, cyto 3.5, cyto_nucl 3.5, vacu 3, nucl 2.5, mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR038664 Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf IPR007504 H/ACA_rnp_Gar1/Naf1 IPR040309 Naf1 IPR009000 Transl_B-barrel_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005732 C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0000493 P:box H/ACA snoRNP assembly GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0042254 P:ribosome biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04410 Gar1

Amino Acid Sequences

MVGPGLRPQHVLVSETLSTAVMRVTYLGLLREAPCASAGTSTFPLLELDISWLSYNKSRQLDAGVLPDLNKLPGGPQGAPDEPPSKKPCLNTQPSTTAVQDIALTPGDDGSDFYNTPVTAGTPIHPNTSGAVASTDHSEPATPPKSATVIPGLSLFNNSIQAPEPVDGGPSAPDGTKNEAISANDEHMTGTEPHPHGETDEINQGAETIKTKEQGDALESGDAMMADEAVSTNGNKVDAENAAPNGDDSRNDQGTDQEEDSSSEDSSEDSSEDDEEEDEEEHPEWETDSSPIQSSSDDSDEDDGDYPILSAEETARILMQAEAGSDDEDGKMDPKGAHVRTANELPEEALPIPDITVTPDMKIVLLGHVETIVENVVLIKAVTSGEYQVLEANSVLCLEDRTVIGVVADTLGRVEEPLYIIRFQDPAKISEFGLSHGKPIYYVESHSTFVFTQPLKGMKGSDASNFHDEEVGEDEIEFSDDEAEAEHKRKLKQKRKEKKDTAKGEPGGFGRPKKEPPGPSKLSQTELNYDDEAGAGEDGYTPLARPKNYHEVVGNQEAPVEGAPHSNRGSRGGRGRGFDRGSGRGRGGGGGRDNRGGSWGSDHHRNHHSQDSNRQSNHPPGREGSGQGSPVNQQQPPAQPSQPAAPYQGQQPFAFNAPNVPTQQFSPYAFYPQQQQQQQPQPSPPGAHINPAFLAALQQQQQQQQQQQQQQQNQAAPAAAPAATQGQNPPTSNVFDQVKAQLDILRQLSGGAGAPAGAPPPQQRGGSGQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.24
3	0.23
4	0.17
5	0.15
6	0.14
7	0.13
8	0.08
9	0.07
10	0.08
11	0.08
12	0.09
13	0.11
14	0.12
15	0.12
16	0.15
17	0.16
18	0.19
19	0.18
20	0.17
21	0.16
22	0.16
23	0.16
24	0.16
25	0.15
26	0.16
27	0.18
28	0.18
29	0.17
30	0.16
31	0.16
32	0.14
33	0.14
34	0.09
35	0.12
36	0.12
37	0.12
38	0.13
39	0.13
40	0.15
41	0.2
42	0.24
43	0.28
44	0.31
45	0.31
46	0.32
47	0.35
48	0.36
49	0.33
50	0.33
51	0.28
52	0.25
53	0.25
54	0.26
55	0.22
56	0.19
57	0.16
58	0.12
59	0.11
60	0.15
61	0.18
62	0.16
63	0.19
64	0.24
65	0.25
66	0.27
67	0.3
68	0.31
69	0.3
70	0.37
71	0.38
72	0.39
73	0.41
74	0.44
75	0.5
76	0.55
77	0.62
78	0.61
79	0.62
80	0.61
81	0.61
82	0.6
83	0.5
84	0.41
85	0.32
86	0.26
87	0.2
88	0.16
89	0.15
90	0.12
91	0.11
92	0.09
93	0.09
94	0.09
95	0.08
96	0.08
97	0.08
98	0.1
99	0.1
100	0.11
101	0.14
102	0.13
103	0.13
104	0.13
105	0.12
106	0.11
107	0.12
108	0.14
109	0.18
110	0.19
111	0.22
112	0.22
113	0.22
114	0.2
115	0.21
116	0.19
117	0.13
118	0.13
119	0.11
120	0.12
121	0.14
122	0.14
123	0.12
124	0.12
125	0.12
126	0.12
127	0.2
128	0.23
129	0.2
130	0.2
131	0.22
132	0.24
133	0.24
134	0.25
135	0.22
136	0.19
137	0.19
138	0.21
139	0.2
140	0.18
141	0.19
142	0.17
143	0.12
144	0.14
145	0.13
146	0.12
147	0.13
148	0.13
149	0.14
150	0.13
151	0.14
152	0.11
153	0.12
154	0.11
155	0.1
156	0.1
157	0.09
158	0.09
159	0.08
160	0.1
161	0.12
162	0.18
163	0.21
164	0.2
165	0.21
166	0.23
167	0.23
168	0.24
169	0.24
170	0.2
171	0.17
172	0.17
173	0.15
174	0.13
175	0.15
176	0.13
177	0.13
178	0.19
179	0.19
180	0.19
181	0.21
182	0.2
183	0.19
184	0.19
185	0.19
186	0.14
187	0.18
188	0.18
189	0.16
190	0.16
191	0.15
192	0.13
193	0.13
194	0.12
195	0.11
196	0.13
197	0.15
198	0.16
199	0.17
200	0.18
201	0.18
202	0.19
203	0.17
204	0.16
205	0.14
206	0.13
207	0.11
208	0.1
209	0.09
210	0.07
211	0.05
212	0.04
213	0.03
214	0.03
215	0.03
216	0.04
217	0.04
218	0.04
219	0.06
220	0.06
221	0.07
222	0.07
223	0.07
224	0.09
225	0.09
226	0.11
227	0.11
228	0.11
229	0.11
230	0.11
231	0.11
232	0.11
233	0.11
234	0.1
235	0.12
236	0.17
237	0.18
238	0.18
239	0.19
240	0.19
241	0.21
242	0.24
243	0.21
244	0.16
245	0.15
246	0.16
247	0.17
248	0.16
249	0.13
250	0.1
251	0.09
252	0.08
253	0.09
254	0.08
255	0.07
256	0.06
257	0.07
258	0.07
259	0.07
260	0.07
261	0.06
262	0.06
263	0.07
264	0.07
265	0.07
266	0.08
267	0.08
268	0.08
269	0.08
270	0.07
271	0.07
272	0.07
273	0.07
274	0.07
275	0.08
276	0.09
277	0.09
278	0.1
279	0.09
280	0.09
281	0.1
282	0.11
283	0.11
284	0.11
285	0.11
286	0.12
287	0.11
288	0.12
289	0.11
290	0.09
291	0.08
292	0.07
293	0.07
294	0.05
295	0.05
296	0.04
297	0.03
298	0.04
299	0.05
300	0.05
301	0.05
302	0.05
303	0.05
304	0.06
305	0.06
306	0.06
307	0.05
308	0.05
309	0.05
310	0.06
311	0.06
312	0.05
313	0.06
314	0.05
315	0.05
316	0.05
317	0.05
318	0.05
319	0.06
320	0.06
321	0.09
322	0.16
323	0.16
324	0.21
325	0.22
326	0.23
327	0.25
328	0.28
329	0.25
330	0.19
331	0.18
332	0.15
333	0.13
334	0.13
335	0.1
336	0.07
337	0.07
338	0.06
339	0.06
340	0.05
341	0.05
342	0.06
343	0.08
344	0.08
345	0.09
346	0.09
347	0.09
348	0.09
349	0.09
350	0.08
351	0.06
352	0.06
353	0.05
354	0.05
355	0.05
356	0.05
357	0.04
358	0.04
359	0.03
360	0.03
361	0.03
362	0.03
363	0.03
364	0.03
365	0.03
366	0.03
367	0.03
368	0.03
369	0.04
370	0.04
371	0.05
372	0.05
373	0.06
374	0.06
375	0.07
376	0.07
377	0.06
378	0.06
379	0.05
380	0.05
381	0.05
382	0.05
383	0.04
384	0.04
385	0.04
386	0.05
387	0.05
388	0.06
389	0.06
390	0.06
391	0.05
392	0.05
393	0.05
394	0.04
395	0.04
396	0.03
397	0.03
398	0.03
399	0.03
400	0.03
401	0.03
402	0.03
403	0.05
404	0.06
405	0.07
406	0.08
407	0.08
408	0.09
409	0.11
410	0.1
411	0.15
412	0.15
413	0.16
414	0.18
415	0.19
416	0.18
417	0.2
418	0.2
419	0.16
420	0.2
421	0.18
422	0.17
423	0.17
424	0.17
425	0.13
426	0.14
427	0.15
428	0.1
429	0.12
430	0.14
431	0.15
432	0.16
433	0.16
434	0.17
435	0.14
436	0.14
437	0.17
438	0.14
439	0.13
440	0.15
441	0.17
442	0.16
443	0.17
444	0.17
445	0.13
446	0.16
447	0.16
448	0.17
449	0.18
450	0.21
451	0.22
452	0.22
453	0.21
454	0.19
455	0.18
456	0.15
457	0.15
458	0.12
459	0.1
460	0.09
461	0.09
462	0.08
463	0.09
464	0.08
465	0.04
466	0.04
467	0.04
468	0.04
469	0.05
470	0.06
471	0.07
472	0.1
473	0.12
474	0.16
475	0.21
476	0.29
477	0.4
478	0.49
479	0.58
480	0.67
481	0.76
482	0.82
483	0.89
484	0.92
485	0.92
486	0.92
487	0.9
488	0.87
489	0.85
490	0.77
491	0.67
492	0.59
493	0.49
494	0.45
495	0.4
496	0.34
497	0.29
498	0.3
499	0.32
500	0.35
501	0.41
502	0.42
503	0.46
504	0.53
505	0.55
506	0.54
507	0.58
508	0.54
509	0.5
510	0.47
511	0.42
512	0.37
513	0.34
514	0.33
515	0.26
516	0.24
517	0.2
518	0.16
519	0.14
520	0.09
521	0.07
522	0.04
523	0.04
524	0.04
525	0.04
526	0.05
527	0.05
528	0.05
529	0.1
530	0.14
531	0.14
532	0.16
533	0.23
534	0.33
535	0.34
536	0.36
537	0.33
538	0.33
539	0.38
540	0.41
541	0.36
542	0.25
543	0.24
544	0.22
545	0.2
546	0.16
547	0.12
548	0.07
549	0.1
550	0.11
551	0.15
552	0.16
553	0.19
554	0.2
555	0.25
556	0.27
557	0.29
558	0.36
559	0.4
560	0.42
561	0.43
562	0.45
563	0.46
564	0.45
565	0.43
566	0.4
567	0.38
568	0.38
569	0.37
570	0.36
571	0.3
572	0.29
573	0.27
574	0.25
575	0.23
576	0.25
577	0.27
578	0.28
579	0.29
580	0.28
581	0.26
582	0.26
583	0.23
584	0.17
585	0.17
586	0.2
587	0.22
588	0.31
589	0.32
590	0.36
591	0.42
592	0.45
593	0.45
594	0.49
595	0.52
596	0.49
597	0.58
598	0.62
599	0.64
600	0.63
601	0.63
602	0.59
603	0.62
604	0.65
605	0.58
606	0.5
607	0.44
608	0.48
609	0.45
610	0.43
611	0.37
612	0.31
613	0.29
614	0.27
615	0.26
616	0.23
617	0.27
618	0.29
619	0.25
620	0.24
621	0.27
622	0.34
623	0.37
624	0.4
625	0.36
626	0.34
627	0.35
628	0.39
629	0.38
630	0.31
631	0.32
632	0.29
633	0.29
634	0.34
635	0.37
636	0.34
637	0.31
638	0.32
639	0.3
640	0.29
641	0.29
642	0.22
643	0.21
644	0.22
645	0.25
646	0.25
647	0.25
648	0.24
649	0.24
650	0.27
651	0.26
652	0.24
653	0.26
654	0.24
655	0.3
656	0.3
657	0.3
658	0.33
659	0.38
660	0.44
661	0.45
662	0.5
663	0.53
664	0.62
665	0.68
666	0.65
667	0.63
668	0.61
669	0.58
670	0.53
671	0.47
672	0.47
673	0.4
674	0.43
675	0.39
676	0.35
677	0.32
678	0.32
679	0.28
680	0.18
681	0.2
682	0.14
683	0.18
684	0.18
685	0.22
686	0.24
687	0.3
688	0.37
689	0.42
690	0.47
691	0.51
692	0.57
693	0.62
694	0.68
695	0.71
696	0.72
697	0.73
698	0.72
699	0.66
700	0.59
701	0.51
702	0.42
703	0.33
704	0.27
705	0.2
706	0.14
707	0.1
708	0.09
709	0.13
710	0.13
711	0.14
712	0.17
713	0.21
714	0.26
715	0.27
716	0.3
717	0.28
718	0.31
719	0.32
720	0.35
721	0.33
722	0.3
723	0.32
724	0.33
725	0.35
726	0.31
727	0.31
728	0.27
729	0.26
730	0.31
731	0.29
732	0.25
733	0.2
734	0.2
735	0.19
736	0.16
737	0.15
738	0.09
739	0.08
740	0.07
741	0.07
742	0.08
743	0.08
744	0.08
745	0.11
746	0.14
747	0.2
748	0.25
749	0.25

A0A0F4YQT5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer