Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6BPA6

Protein Details
Accession Q6BPA6    Localization Confidence High Confidence Score 19.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-41VSNKNKKDKAGVKYPKKFSKKVNMGKVNFHydrophilic
174-195MKNTSGQNRRHYRNTRNDRDMDHydrophilic
208-228RDDKQDRSYKRSDNRENDNRKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-32KKDKAGVKYPKKFSK
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 4, cyto 3.5, cyto_pero 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002483  PWI_dom  
IPR036483  PWI_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG dha:DEHA2E15158g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01480  PWI  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51025  PWI  
Amino Acid Sequences MSYRVQRVDDEFVSNKNKKDKAGVKYPKKFSKKVNMGKVNFAVVEKWIGDTLNEQLPDDDVVIDYVGELLQAEDEPDIKMIHLQMQDFLGQEQAMKFCETLWDLLMSAQDDPDGIPAQLLEQRRKEYEADVDSGKVEKPKTNYNRSGAGQNTLMDAKTNGDKGRSYKDKGRSDMKNTSGQNRRHYRNTRNDRDMDPQDIRASKNTGYRDDKQDRSYKRSDNRENDNRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.45
3 0.48
4 0.49
5 0.46
6 0.54
7 0.57
8 0.56
9 0.63
10 0.68
11 0.71
12 0.77
13 0.84
14 0.84
15 0.84
16 0.82
17 0.79
18 0.8
19 0.8
20 0.8
21 0.81
22 0.81
23 0.76
24 0.76
25 0.68
26 0.59
27 0.49
28 0.39
29 0.29
30 0.2
31 0.19
32 0.13
33 0.12
34 0.11
35 0.1
36 0.1
37 0.11
38 0.13
39 0.15
40 0.15
41 0.14
42 0.14
43 0.14
44 0.15
45 0.13
46 0.11
47 0.06
48 0.06
49 0.06
50 0.06
51 0.05
52 0.04
53 0.04
54 0.03
55 0.03
56 0.03
57 0.03
58 0.03
59 0.04
60 0.04
61 0.05
62 0.05
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.07
67 0.07
68 0.11
69 0.12
70 0.12
71 0.12
72 0.13
73 0.13
74 0.13
75 0.12
76 0.08
77 0.07
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.08
83 0.07
84 0.07
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.08
89 0.08
90 0.07
91 0.08
92 0.08
93 0.07
94 0.06
95 0.06
96 0.05
97 0.05
98 0.04
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.04
103 0.04
104 0.05
105 0.09
106 0.11
107 0.14
108 0.16
109 0.19
110 0.2
111 0.22
112 0.22
113 0.2
114 0.23
115 0.21
116 0.2
117 0.19
118 0.18
119 0.17
120 0.17
121 0.16
122 0.13
123 0.13
124 0.14
125 0.17
126 0.26
127 0.34
128 0.42
129 0.47
130 0.47
131 0.51
132 0.49
133 0.52
134 0.43
135 0.38
136 0.31
137 0.25
138 0.23
139 0.19
140 0.17
141 0.12
142 0.11
143 0.1
144 0.11
145 0.14
146 0.13
147 0.14
148 0.17
149 0.2
150 0.29
151 0.33
152 0.36
153 0.41
154 0.5
155 0.56
156 0.59
157 0.64
158 0.62
159 0.63
160 0.66
161 0.62
162 0.61
163 0.55
164 0.59
165 0.6
166 0.59
167 0.62
168 0.63
169 0.65
170 0.67
171 0.73
172 0.74
173 0.77
174 0.82
175 0.82
176 0.8
177 0.78
178 0.72
179 0.72
180 0.67
181 0.62
182 0.54
183 0.47
184 0.45
185 0.43
186 0.4
187 0.36
188 0.35
189 0.31
190 0.35
191 0.36
192 0.39
193 0.44
194 0.48
195 0.55
196 0.6
197 0.62
198 0.63
199 0.68
200 0.67
201 0.67
202 0.69
203 0.68
204 0.69
205 0.74
206 0.78
207 0.78
208 0.81