Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0F4YQ11

Protein Details
Accession A0A0F4YQ11    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
118-137GVAPRAKMNQQRSRRFRSAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
429-458VEERKLANERRRKQEEKMRNEERARKRRRS
Subcellular Location(s) cyto 9.5, nucl 8, cyto_mito 8, mito 5.5, plas 1, extr 1, E.R. 1, golg 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSAKYPKIISPVIEEQPYEVGGQVIPVDATRPNPNGEEMDNLYLDFNGIVHPCTHPEGKPAPANEQEMMLEIFKYTDRIVNMVRPRKLLMIAVVFDCGEMLTCIACLDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQEAKETDEKREEFRKMLAKQNGTNLDEELQEHVIKKTWDSNVITPGTPFMDILAASLRYWVAYKLNTDPAWEKLKVIISDATVPGEGEHKIMEFIRSQRASPEHDPNTRHVMYGLDADLIMLGLATHEPHFRVLREDVFFQESKPRTCQLCGQTGHKAEECRGQAKEKSGEYDEKHKSTSLKPFIWLHVSVLREYLAAELYVPRQPFPFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDIRENGIDTLIAIWRDNIPLMDGYVTKDGIVNFKRAQLILQGLAKQEDAIFRRRHEVEERKLANERRRKQEEKMRNEERARKRRRSSPSYESYESPTGNKSHGHGGDFAVPTDVPLITPSRGELSRETRELTHSLVVNRGAVYKANMANKSAAAVLKSQLLKGSQGDADPANGALNGNDASDDTPEQTSPSILGKRKAEIMEDEEDEETVTPPKDEDELPPDTVRLWEEGYADRYYEQKFHVDPKDIEFRHKVARAYAEGLQWVLLYYFQGCPSWTWYYPYHYAPFAADFVDIGNMEVHFEKGKPFRPFEQLMGVLPASSSHALPEIFHDLMHDPNSEIIDFYPEDFEIDLNGKKFAWQGVVLLPFIDEKRLLAAMEKKYPLLSEEEKARNTAGKDILLVSDRHPLYKELAANFYSKKQGAPKYKLNPRITGGLAGKVERNENYIPHGSLVAPFEDENMPGLDEDRTITVNYEIPKSVHAHKSMLLRGVKFPPPKLNQAEIQMVKSKAQNSGRSFGGAPLHNGNGGKGGRINYMADRPNPFAAHLDPSFVPPASVGGVPVPAPGWAPPPPGYAGYSWGPPPPPRGGGPDSYRPQYSSGPPPPPQVHQNAGFYGQASGYSYQQQGSHGYSGQSYYQQGSYYGGQQAGSSYNDRRESSNYRGGYYGGSRQGRDSYPPRRSDGYGRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.41
3 0.44
4 0.44
5 0.4
6 0.4
7 0.42
8 0.42
9 0.4
10 0.37
11 0.33
12 0.32
13 0.3
14 0.23
15 0.16
16 0.12
17 0.1
18 0.1
19 0.09
20 0.08
21 0.07
22 0.07
23 0.09
24 0.1
25 0.14
26 0.19
27 0.21
28 0.24
29 0.25
30 0.28
31 0.29
32 0.29
33 0.31
34 0.28
35 0.28
36 0.26
37 0.24
38 0.22
39 0.19
40 0.18
41 0.12
42 0.09
43 0.09
44 0.09
45 0.1
46 0.11
47 0.12
48 0.15
49 0.2
50 0.23
51 0.21
52 0.28
53 0.31
54 0.37
55 0.41
56 0.41
57 0.43
58 0.45
59 0.48
60 0.41
61 0.38
62 0.32
63 0.28
64 0.26
65 0.2
66 0.15
67 0.11
68 0.11
69 0.1
70 0.12
71 0.11
72 0.14
73 0.14
74 0.18
75 0.2
76 0.28
77 0.37
78 0.44
79 0.46
80 0.45
81 0.46
82 0.45
83 0.44
84 0.38
85 0.33
86 0.29
87 0.28
88 0.26
89 0.25
90 0.22
91 0.19
92 0.17
93 0.12
94 0.08
95 0.06
96 0.06
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.04
103 0.05
104 0.08
105 0.12
106 0.14
107 0.15
108 0.16
109 0.2
110 0.27
111 0.34
112 0.42
113 0.48
114 0.56
115 0.66
116 0.74
117 0.8
118 0.82
119 0.78
120 0.75
121 0.76
122 0.76
123 0.73
124 0.74
125 0.67
126 0.63
127 0.67
128 0.61
129 0.55
130 0.52
131 0.46
132 0.43
133 0.48
134 0.47
135 0.4
136 0.45
137 0.49
138 0.46
139 0.54
140 0.56
141 0.54
142 0.55
143 0.61
144 0.61
145 0.54
146 0.5
147 0.42
148 0.35
149 0.3
150 0.27
151 0.21
152 0.17
153 0.16
154 0.17
155 0.16
156 0.18
157 0.18
158 0.19
159 0.23
160 0.24
161 0.3
162 0.32
163 0.35
164 0.38
165 0.4
166 0.38
167 0.31
168 0.3
169 0.24
170 0.21
171 0.17
172 0.11
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.11
177 0.1
178 0.09
179 0.11
180 0.1
181 0.09
182 0.1
183 0.11
184 0.12
185 0.13
186 0.16
187 0.2
188 0.26
189 0.26
190 0.29
191 0.3
192 0.31
193 0.35
194 0.33
195 0.29
196 0.26
197 0.31
198 0.28
199 0.28
200 0.25
201 0.21
202 0.23
203 0.23
204 0.2
205 0.15
206 0.15
207 0.13
208 0.13
209 0.12
210 0.09
211 0.09
212 0.08
213 0.09
214 0.1
215 0.11
216 0.13
217 0.16
218 0.24
219 0.25
220 0.25
221 0.29
222 0.32
223 0.37
224 0.4
225 0.46
226 0.44
227 0.49
228 0.51
229 0.5
230 0.55
231 0.48
232 0.42
233 0.33
234 0.27
235 0.22
236 0.22
237 0.19
238 0.11
239 0.1
240 0.1
241 0.09
242 0.08
243 0.06
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.04
249 0.05
250 0.07
251 0.08
252 0.11
253 0.13
254 0.13
255 0.18
256 0.2
257 0.23
258 0.25
259 0.26
260 0.25
261 0.27
262 0.27
263 0.23
264 0.3
265 0.28
266 0.29
267 0.31
268 0.33
269 0.31
270 0.33
271 0.4
272 0.36
273 0.41
274 0.41
275 0.42
276 0.44
277 0.45
278 0.46
279 0.42
280 0.38
281 0.31
282 0.35
283 0.34
284 0.31
285 0.29
286 0.31
287 0.31
288 0.36
289 0.4
290 0.34
291 0.35
292 0.35
293 0.39
294 0.37
295 0.44
296 0.44
297 0.4
298 0.4
299 0.38
300 0.38
301 0.37
302 0.45
303 0.42
304 0.38
305 0.4
306 0.41
307 0.42
308 0.42
309 0.37
310 0.29
311 0.26
312 0.25
313 0.21
314 0.2
315 0.17
316 0.13
317 0.13
318 0.11
319 0.07
320 0.06
321 0.06
322 0.07
323 0.08
324 0.12
325 0.12
326 0.12
327 0.12
328 0.13
329 0.14
330 0.18
331 0.21
332 0.19
333 0.21
334 0.22
335 0.23
336 0.23
337 0.23
338 0.17
339 0.13
340 0.11
341 0.09
342 0.08
343 0.07
344 0.06
345 0.05
346 0.05
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.07
352 0.07
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.07
357 0.08
358 0.12
359 0.15
360 0.15
361 0.15
362 0.16
363 0.15
364 0.15
365 0.14
366 0.1
367 0.05
368 0.06
369 0.07
370 0.06
371 0.06
372 0.07
373 0.07
374 0.08
375 0.08
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.08
381 0.07
382 0.09
383 0.1
384 0.1
385 0.09
386 0.1
387 0.1
388 0.16
389 0.17
390 0.19
391 0.18
392 0.21
393 0.22
394 0.21
395 0.21
396 0.17
397 0.17
398 0.16
399 0.17
400 0.16
401 0.15
402 0.16
403 0.15
404 0.13
405 0.11
406 0.13
407 0.13
408 0.19
409 0.2
410 0.21
411 0.27
412 0.28
413 0.3
414 0.35
415 0.42
416 0.42
417 0.5
418 0.5
419 0.47
420 0.52
421 0.55
422 0.54
423 0.55
424 0.56
425 0.56
426 0.63
427 0.64
428 0.65
429 0.7
430 0.72
431 0.71
432 0.74
433 0.69
434 0.69
435 0.71
436 0.73
437 0.73
438 0.74
439 0.74
440 0.73
441 0.74
442 0.75
443 0.79
444 0.77
445 0.74
446 0.73
447 0.72
448 0.7
449 0.66
450 0.58
451 0.53
452 0.47
453 0.4
454 0.32
455 0.26
456 0.2
457 0.18
458 0.18
459 0.15
460 0.18
461 0.19
462 0.19
463 0.18
464 0.18
465 0.22
466 0.21
467 0.2
468 0.14
469 0.13
470 0.12
471 0.11
472 0.1
473 0.05
474 0.06
475 0.07
476 0.07
477 0.07
478 0.07
479 0.09
480 0.1
481 0.11
482 0.14
483 0.19
484 0.22
485 0.23
486 0.23
487 0.21
488 0.23
489 0.23
490 0.2
491 0.17
492 0.15
493 0.15
494 0.16
495 0.15
496 0.14
497 0.13
498 0.12
499 0.1
500 0.08
501 0.09
502 0.11
503 0.14
504 0.17
505 0.18
506 0.18
507 0.18
508 0.18
509 0.17
510 0.15
511 0.12
512 0.08
513 0.09
514 0.08
515 0.12
516 0.12
517 0.11
518 0.12
519 0.12
520 0.12
521 0.12
522 0.13
523 0.09
524 0.09
525 0.1
526 0.09
527 0.09
528 0.08
529 0.08
530 0.06
531 0.05
532 0.05
533 0.04
534 0.05
535 0.04
536 0.04
537 0.04
538 0.04
539 0.05
540 0.05
541 0.06
542 0.06
543 0.06
544 0.06
545 0.07
546 0.07
547 0.06
548 0.07
549 0.1
550 0.14
551 0.16
552 0.21
553 0.21
554 0.22
555 0.26
556 0.25
557 0.23
558 0.2
559 0.21
560 0.19
561 0.19
562 0.19
563 0.15
564 0.14
565 0.13
566 0.12
567 0.09
568 0.07
569 0.07
570 0.06
571 0.06
572 0.07
573 0.08
574 0.09
575 0.1
576 0.13
577 0.16
578 0.17
579 0.17
580 0.17
581 0.15
582 0.15
583 0.14
584 0.1
585 0.08
586 0.08
587 0.09
588 0.11
589 0.14
590 0.13
591 0.13
592 0.12
593 0.14
594 0.14
595 0.15
596 0.14
597 0.14
598 0.16
599 0.22
600 0.25
601 0.28
602 0.28
603 0.3
604 0.38
605 0.36
606 0.38
607 0.34
608 0.33
609 0.34
610 0.37
611 0.33
612 0.26
613 0.28
614 0.26
615 0.26
616 0.26
617 0.21
618 0.18
619 0.17
620 0.15
621 0.11
622 0.1
623 0.07
624 0.04
625 0.04
626 0.05
627 0.06
628 0.07
629 0.07
630 0.08
631 0.08
632 0.13
633 0.17
634 0.16
635 0.19
636 0.2
637 0.25
638 0.28
639 0.3
640 0.28
641 0.24
642 0.24
643 0.21
644 0.2
645 0.15
646 0.12
647 0.09
648 0.07
649 0.07
650 0.07
651 0.07
652 0.06
653 0.06
654 0.05
655 0.06
656 0.07
657 0.07
658 0.07
659 0.07
660 0.11
661 0.15
662 0.23
663 0.26
664 0.29
665 0.32
666 0.38
667 0.4
668 0.37
669 0.38
670 0.32
671 0.28
672 0.26
673 0.23
674 0.16
675 0.13
676 0.12
677 0.09
678 0.09
679 0.08
680 0.06
681 0.08
682 0.08
683 0.09
684 0.11
685 0.13
686 0.13
687 0.13
688 0.14
689 0.13
690 0.15
691 0.16
692 0.14
693 0.1
694 0.11
695 0.12
696 0.11
697 0.1
698 0.08
699 0.1
700 0.09
701 0.1
702 0.1
703 0.09
704 0.09
705 0.09
706 0.09
707 0.07
708 0.09
709 0.11
710 0.11
711 0.11
712 0.11
713 0.12
714 0.13
715 0.12
716 0.12
717 0.11
718 0.11
719 0.14
720 0.16
721 0.15
722 0.14
723 0.13
724 0.12
725 0.12
726 0.12
727 0.08
728 0.07
729 0.09
730 0.09
731 0.09
732 0.12
733 0.19
734 0.22
735 0.27
736 0.28
737 0.27
738 0.26
739 0.27
740 0.24
741 0.23
742 0.22
743 0.19
744 0.27
745 0.32
746 0.32
747 0.33
748 0.32
749 0.29
750 0.28
751 0.29
752 0.23
753 0.18
754 0.19
755 0.18
756 0.19
757 0.18
758 0.17
759 0.14
760 0.2
761 0.2
762 0.2
763 0.2
764 0.2
765 0.22
766 0.25
767 0.28
768 0.22
769 0.25
770 0.25
771 0.27
772 0.27
773 0.26
774 0.26
775 0.23
776 0.24
777 0.29
778 0.36
779 0.43
780 0.49
781 0.56
782 0.61
783 0.7
784 0.77
785 0.73
786 0.68
787 0.61
788 0.59
789 0.5
790 0.46
791 0.39
792 0.33
793 0.3
794 0.27
795 0.26
796 0.23
797 0.25
798 0.19
799 0.22
800 0.19
801 0.19
802 0.23
803 0.24
804 0.23
805 0.21
806 0.21
807 0.17
808 0.18
809 0.19
810 0.14
811 0.12
812 0.11
813 0.13
814 0.13
815 0.13
816 0.11
817 0.11
818 0.1
819 0.09
820 0.1
821 0.08
822 0.08
823 0.09
824 0.09
825 0.09
826 0.09
827 0.1
828 0.11
829 0.14
830 0.15
831 0.17
832 0.17
833 0.17
834 0.19
835 0.21
836 0.27
837 0.3
838 0.31
839 0.3
840 0.33
841 0.38
842 0.39
843 0.43
844 0.39
845 0.35
846 0.37
847 0.41
848 0.44
849 0.43
850 0.44
851 0.46
852 0.47
853 0.54
854 0.55
855 0.53
856 0.49
857 0.5
858 0.54
859 0.46
860 0.45
861 0.42
862 0.38
863 0.36
864 0.36
865 0.33
866 0.33
867 0.38
868 0.44
869 0.42
870 0.45
871 0.44
872 0.42
873 0.41
874 0.36
875 0.35
876 0.28
877 0.26
878 0.26
879 0.25
880 0.25
881 0.25
882 0.22
883 0.22
884 0.21
885 0.19
886 0.19
887 0.2
888 0.2
889 0.21
890 0.23
891 0.2
892 0.27
893 0.3
894 0.32
895 0.34
896 0.35
897 0.37
898 0.36
899 0.33
900 0.29
901 0.27
902 0.29
903 0.25
904 0.25
905 0.22
906 0.24
907 0.25
908 0.22
909 0.2
910 0.14
911 0.15
912 0.13
913 0.13
914 0.11
915 0.09
916 0.1
917 0.1
918 0.1
919 0.09
920 0.08
921 0.08
922 0.09
923 0.12
924 0.13
925 0.18
926 0.19
927 0.21
928 0.23
929 0.24
930 0.25
931 0.21
932 0.24
933 0.21
934 0.22
935 0.21
936 0.23
937 0.25
938 0.26
939 0.3
940 0.31
941 0.32
942 0.32
943 0.37
944 0.38
945 0.42
946 0.46
947 0.51
948 0.51
949 0.52
950 0.51
951 0.46
952 0.45
953 0.43
954 0.43
955 0.43
956 0.46
957 0.5
958 0.51
959 0.58
960 0.59
961 0.58
962 0.59
963 0.55
964 0.53
965 0.5
966 0.5
967 0.44
968 0.43
969 0.38
970 0.32
971 0.27
972 0.2
973 0.15
974 0.15
975 0.14
976 0.14
977 0.18
978 0.18
979 0.19
980 0.2
981 0.21
982 0.22
983 0.24
984 0.25
985 0.23
986 0.23
987 0.22
988 0.23
989 0.23
990 0.23
991 0.21
992 0.21
993 0.21
994 0.21
995 0.2
996 0.22
997 0.22
998 0.23
999 0.24
1000 0.22
1001 0.21
1002 0.2
1003 0.21
1004 0.2
1005 0.21
1006 0.21
1007 0.23
1008 0.29
1009 0.34
1010 0.36
1011 0.37
1012 0.42
1013 0.46
1014 0.5
1015 0.54
1016 0.48
1017 0.45
1018 0.45
1019 0.42
1020 0.39
1021 0.36
1022 0.35
1023 0.35
1024 0.37
1025 0.36
1026 0.38
1027 0.43
1028 0.41
1029 0.45
1030 0.48
1031 0.49
1032 0.54
1033 0.58
1034 0.6
1035 0.6
1036 0.62