Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0F4YZ84

Protein Details
Accession A0A0F4YZ84    Localization Confidence High Confidence Score 17.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
148-167SSEAKPAKRGRPRKNPEAAVHydrophilic
206-248DAESKPAKRGRKPAASKEQGETEAAPEKRKRGRPKKQTTTSDEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
113-119KAKKRSR
131-188PAKKAKKEKAAAAKDDTSSEAKPAKRGRPRKNPEAAVAKAEKETEDAPKKAGRGRKKK
210-241KPAKRGRKPAASKEQGETEAAPEKRKRGRPKK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 14, cyto 12.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000116  HMGA  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Amino Acid Sequences MALGSILNDSRTGSGVTELTVLSRGCVTPRIIANINETLGEDKDYSLLDGFDELPEEEKAKVRRALEQGHVDDTDWRGDIELNRPGKTGFRLKGSKKEATEDAADEAEEEKTKAKKRSRGEDDGEESEDVPAKKAKKEKAAAAKDDTSSEAKPAKRGRPRKNPEAAVAKAEKETEDAPKKAGRGRKKKVVEGENGDATAEANGADDAESKPAKRGRKPAASKEQGETEAAPEKRKRGRPKKQTTTSDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.12
3 0.13
4 0.13
5 0.12
6 0.11
7 0.14
8 0.13
9 0.11
10 0.12
11 0.12
12 0.12
13 0.17
14 0.18
15 0.2
16 0.22
17 0.27
18 0.29
19 0.3
20 0.34
21 0.32
22 0.31
23 0.26
24 0.24
25 0.2
26 0.17
27 0.17
28 0.13
29 0.1
30 0.11
31 0.11
32 0.11
33 0.1
34 0.09
35 0.07
36 0.08
37 0.09
38 0.07
39 0.08
40 0.08
41 0.09
42 0.1
43 0.11
44 0.11
45 0.16
46 0.19
47 0.23
48 0.27
49 0.27
50 0.33
51 0.37
52 0.41
53 0.42
54 0.46
55 0.42
56 0.4
57 0.39
58 0.33
59 0.29
60 0.26
61 0.2
62 0.14
63 0.12
64 0.1
65 0.11
66 0.12
67 0.15
68 0.21
69 0.22
70 0.22
71 0.23
72 0.23
73 0.23
74 0.26
75 0.29
76 0.25
77 0.3
78 0.37
79 0.39
80 0.49
81 0.53
82 0.53
83 0.47
84 0.48
85 0.42
86 0.37
87 0.35
88 0.27
89 0.22
90 0.16
91 0.15
92 0.12
93 0.11
94 0.08
95 0.07
96 0.07
97 0.09
98 0.13
99 0.19
100 0.26
101 0.32
102 0.39
103 0.45
104 0.56
105 0.6
106 0.63
107 0.62
108 0.59
109 0.57
110 0.51
111 0.46
112 0.35
113 0.28
114 0.2
115 0.19
116 0.13
117 0.1
118 0.12
119 0.12
120 0.16
121 0.22
122 0.27
123 0.33
124 0.36
125 0.42
126 0.49
127 0.53
128 0.53
129 0.51
130 0.48
131 0.4
132 0.37
133 0.32
134 0.24
135 0.19
136 0.18
137 0.19
138 0.18
139 0.24
140 0.3
141 0.37
142 0.44
143 0.55
144 0.62
145 0.69
146 0.76
147 0.8
148 0.82
149 0.76
150 0.73
151 0.7
152 0.61
153 0.54
154 0.48
155 0.39
156 0.31
157 0.29
158 0.22
159 0.16
160 0.17
161 0.2
162 0.24
163 0.24
164 0.26
165 0.28
166 0.3
167 0.33
168 0.4
169 0.42
170 0.47
171 0.55
172 0.62
173 0.66
174 0.71
175 0.75
176 0.74
177 0.72
178 0.68
179 0.64
180 0.56
181 0.49
182 0.43
183 0.33
184 0.26
185 0.18
186 0.11
187 0.06
188 0.05
189 0.04
190 0.05
191 0.05
192 0.06
193 0.07
194 0.11
195 0.13
196 0.13
197 0.2
198 0.25
199 0.33
200 0.39
201 0.48
202 0.54
203 0.63
204 0.72
205 0.76
206 0.82
207 0.82
208 0.78
209 0.72
210 0.67
211 0.58
212 0.51
213 0.41
214 0.33
215 0.34
216 0.32
217 0.35
218 0.33
219 0.4
220 0.48
221 0.56
222 0.64
223 0.67
224 0.77
225 0.81
226 0.89
227 0.92
228 0.93