Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7RYM7

Protein Details
Accession R7RYM7    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-64RELLQNPYGRKHKRMKRDGREDAVYGBasic
374-398KEEKREDAWKRPKKVKTRIEHKTYEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
49-54KHKRMK
79-95RPTRGGAGGAGARKEKR
355-391GGRKGKKGGKKGAKVTKEGKEEKREDAWKRPKKVKTR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR022783  GCFC_dom  
IPR022159  STIP/TFIP11_N  
IPR045211  TFP11/STIP/Ntr1  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000390  P:spliceosomal complex disassembly  
KEGG shs:STEHIDRAFT_150614  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01585  G-patch  
PF07842  GCFC  
PF12457  TIP_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
Amino Acid Sequences MARRKRAFMDDGDSDSSPDSDDGVDQHEHEQDPDERDERELLQNPYGRKHKRMKRDGREDAVYGVFADDSDEDEGFSKRPTRGGAGGAGARKEKRSDWAKAPAFVSSSTKAPPKADNENGNEDGAEKGEKVSGSGEGDSESSEEALEADVDMDKPPSPRVREADDDEDDAELEQRPRFGLGRTAGRGGLGLGAAAAAATTTSKSPASSMSFSGFTKAAPGSSTHPSAIEPTPVPPTTTSSLPSAFGGAPRVQRAFVRDGNGIKPTANGHSTSRSSTPLPSNVAGSFGARMLSKMGWQAGQGLGTTGEGIVNPVESKLRPKNMGIAFKGFTERTKQSKEEARRRGEAVSSDDEDAGGRKGKKGGKKGAKVTKEGKEEKREDAWKRPKKVKTRIEHKTYEQIVSEAGEETGLSGIGIIIDATGATPREVSSIAEVSTASWTPSTDPTRLPEVRYNLRAIVDHSVSEIDRLAREARKGRIRQQAIREEDARLKKRVTEEAELIARLQQVHLVVDDIKVQAKELAMMDGATLEPFAPHFEKLLSQFPQEFDRYRLDSIVVAAIAPVVRRILAYWQPLQEPTLLLSTFRSWRKALRISTPTAAKSPSSQLDVYGTRTTTTTTTTVQNAETVMTPFESLLWTVWLPHVRSALNNEWDARDPAPAVKLYESWAEILPAFVKDNILDQLVLPKVKRAVADWSPRKNNNKVPGVGVGVEKATGAGEEVTLRTLVFPWLGHVGLRMDDILDDAKRKLKSMLRHWRPGEPIPSDLNDWRMLLGAQVWDGLVVSYVLPKLGAELRDGFVVNPRRQEMEALERVLEWGVSVSPTSSSANGKEGGGKEGPLVRESMMGQLLEREFWPKWLDVLHLWLVQGGVRLGEVADWFEWWRGWMDRALAGPGGSGGEKKGKMMEAVEEGFRKGLKMMDEAYRLGDEGRANLTKPDHHRSSSTTAAQQQAQVAAAAAKKKAIRAGSQQPPEVTFKSIVEDYAAKHNLMVIPTGRAHEISRMPLYRVSATADGKGGLVVYVFEDAVYAPDPNAGAGGGEFRAVSLENMVLRAMKGGGGIGTG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.32
3 0.27
4 0.21
5 0.17
6 0.13
7 0.1
8 0.11
9 0.11
10 0.14
11 0.15
12 0.15
13 0.18
14 0.21
15 0.21
16 0.21
17 0.25
18 0.26
19 0.29
20 0.33
21 0.33
22 0.29
23 0.31
24 0.33
25 0.31
26 0.34
27 0.36
28 0.35
29 0.39
30 0.43
31 0.43
32 0.5
33 0.56
34 0.54
35 0.57
36 0.64
37 0.66
38 0.73
39 0.82
40 0.84
41 0.85
42 0.91
43 0.91
44 0.88
45 0.83
46 0.73
47 0.65
48 0.55
49 0.44
50 0.33
51 0.24
52 0.16
53 0.11
54 0.11
55 0.08
56 0.09
57 0.11
58 0.1
59 0.1
60 0.12
61 0.14
62 0.13
63 0.16
64 0.19
65 0.19
66 0.22
67 0.24
68 0.28
69 0.3
70 0.32
71 0.32
72 0.31
73 0.34
74 0.33
75 0.33
76 0.33
77 0.32
78 0.32
79 0.32
80 0.3
81 0.35
82 0.4
83 0.45
84 0.47
85 0.56
86 0.57
87 0.59
88 0.57
89 0.5
90 0.45
91 0.39
92 0.37
93 0.28
94 0.26
95 0.26
96 0.3
97 0.3
98 0.32
99 0.36
100 0.37
101 0.44
102 0.49
103 0.54
104 0.54
105 0.58
106 0.57
107 0.51
108 0.44
109 0.36
110 0.29
111 0.22
112 0.17
113 0.1
114 0.09
115 0.12
116 0.11
117 0.11
118 0.12
119 0.13
120 0.14
121 0.14
122 0.14
123 0.12
124 0.13
125 0.12
126 0.12
127 0.1
128 0.08
129 0.07
130 0.07
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.05
135 0.05
136 0.06
137 0.07
138 0.07
139 0.08
140 0.1
141 0.11
142 0.17
143 0.23
144 0.27
145 0.33
146 0.37
147 0.42
148 0.47
149 0.52
150 0.53
151 0.49
152 0.46
153 0.39
154 0.35
155 0.29
156 0.23
157 0.18
158 0.13
159 0.13
160 0.12
161 0.13
162 0.13
163 0.15
164 0.16
165 0.16
166 0.21
167 0.24
168 0.31
169 0.33
170 0.34
171 0.32
172 0.31
173 0.29
174 0.22
175 0.18
176 0.1
177 0.07
178 0.05
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.03
183 0.02
184 0.02
185 0.03
186 0.04
187 0.04
188 0.07
189 0.07
190 0.08
191 0.09
192 0.13
193 0.18
194 0.19
195 0.21
196 0.22
197 0.23
198 0.23
199 0.25
200 0.21
201 0.16
202 0.17
203 0.15
204 0.13
205 0.12
206 0.14
207 0.16
208 0.2
209 0.22
210 0.19
211 0.2
212 0.2
213 0.23
214 0.22
215 0.22
216 0.18
217 0.18
218 0.23
219 0.23
220 0.24
221 0.2
222 0.24
223 0.23
224 0.24
225 0.24
226 0.21
227 0.21
228 0.21
229 0.2
230 0.18
231 0.15
232 0.15
233 0.16
234 0.17
235 0.19
236 0.21
237 0.22
238 0.2
239 0.21
240 0.25
241 0.27
242 0.27
243 0.28
244 0.29
245 0.31
246 0.32
247 0.33
248 0.29
249 0.23
250 0.22
251 0.2
252 0.2
253 0.19
254 0.18
255 0.19
256 0.24
257 0.26
258 0.27
259 0.27
260 0.26
261 0.26
262 0.29
263 0.31
264 0.29
265 0.3
266 0.28
267 0.28
268 0.25
269 0.26
270 0.21
271 0.17
272 0.14
273 0.11
274 0.11
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.1
280 0.11
281 0.12
282 0.11
283 0.12
284 0.13
285 0.12
286 0.12
287 0.11
288 0.09
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.06
293 0.05
294 0.04
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.07
301 0.08
302 0.15
303 0.21
304 0.26
305 0.28
306 0.29
307 0.37
308 0.41
309 0.48
310 0.43
311 0.4
312 0.36
313 0.35
314 0.37
315 0.29
316 0.24
317 0.24
318 0.26
319 0.29
320 0.33
321 0.33
322 0.37
323 0.45
324 0.54
325 0.58
326 0.62
327 0.62
328 0.6
329 0.6
330 0.56
331 0.49
332 0.41
333 0.36
334 0.31
335 0.27
336 0.24
337 0.22
338 0.2
339 0.18
340 0.16
341 0.13
342 0.14
343 0.13
344 0.14
345 0.2
346 0.25
347 0.32
348 0.39
349 0.48
350 0.53
351 0.6
352 0.68
353 0.71
354 0.71
355 0.7
356 0.68
357 0.65
358 0.64
359 0.64
360 0.62
361 0.62
362 0.6
363 0.58
364 0.58
365 0.58
366 0.54
367 0.57
368 0.61
369 0.61
370 0.66
371 0.71
372 0.72
373 0.75
374 0.81
375 0.79
376 0.79
377 0.8
378 0.82
379 0.81
380 0.77
381 0.7
382 0.68
383 0.61
384 0.52
385 0.42
386 0.33
387 0.26
388 0.21
389 0.19
390 0.1
391 0.08
392 0.06
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.04
397 0.03
398 0.03
399 0.03
400 0.03
401 0.03
402 0.02
403 0.02
404 0.02
405 0.02
406 0.02
407 0.03
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.04
412 0.06
413 0.06
414 0.07
415 0.08
416 0.08
417 0.08
418 0.09
419 0.09
420 0.08
421 0.09
422 0.09
423 0.07
424 0.07
425 0.07
426 0.08
427 0.14
428 0.16
429 0.16
430 0.17
431 0.2
432 0.27
433 0.28
434 0.3
435 0.29
436 0.32
437 0.35
438 0.36
439 0.35
440 0.29
441 0.28
442 0.26
443 0.22
444 0.2
445 0.16
446 0.13
447 0.12
448 0.12
449 0.11
450 0.11
451 0.1
452 0.07
453 0.06
454 0.08
455 0.1
456 0.11
457 0.15
458 0.2
459 0.25
460 0.33
461 0.36
462 0.44
463 0.5
464 0.54
465 0.56
466 0.59
467 0.61
468 0.57
469 0.57
470 0.5
471 0.42
472 0.44
473 0.45
474 0.41
475 0.35
476 0.31
477 0.3
478 0.32
479 0.36
480 0.34
481 0.29
482 0.27
483 0.28
484 0.28
485 0.26
486 0.23
487 0.18
488 0.14
489 0.11
490 0.09
491 0.07
492 0.07
493 0.07
494 0.07
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.08
499 0.07
500 0.08
501 0.07
502 0.08
503 0.08
504 0.07
505 0.08
506 0.07
507 0.07
508 0.06
509 0.06
510 0.06
511 0.05
512 0.05
513 0.04
514 0.03
515 0.03
516 0.03
517 0.03
518 0.05
519 0.06
520 0.06
521 0.07
522 0.07
523 0.09
524 0.11
525 0.16
526 0.16
527 0.16
528 0.17
529 0.17
530 0.2
531 0.21
532 0.19
533 0.17
534 0.19
535 0.2
536 0.19
537 0.19
538 0.16
539 0.14
540 0.14
541 0.11
542 0.08
543 0.06
544 0.05
545 0.05
546 0.04
547 0.04
548 0.04
549 0.03
550 0.04
551 0.04
552 0.04
553 0.08
554 0.12
555 0.16
556 0.18
557 0.19
558 0.2
559 0.2
560 0.21
561 0.17
562 0.13
563 0.11
564 0.11
565 0.09
566 0.09
567 0.09
568 0.11
569 0.16
570 0.17
571 0.19
572 0.18
573 0.21
574 0.27
575 0.33
576 0.34
577 0.37
578 0.39
579 0.4
580 0.43
581 0.42
582 0.37
583 0.31
584 0.3
585 0.22
586 0.19
587 0.2
588 0.18
589 0.18
590 0.17
591 0.16
592 0.18
593 0.19
594 0.2
595 0.18
596 0.17
597 0.14
598 0.14
599 0.15
600 0.12
601 0.13
602 0.12
603 0.12
604 0.14
605 0.15
606 0.16
607 0.15
608 0.15
609 0.13
610 0.12
611 0.11
612 0.09
613 0.08
614 0.07
615 0.07
616 0.06
617 0.06
618 0.06
619 0.05
620 0.05
621 0.06
622 0.06
623 0.06
624 0.09
625 0.12
626 0.12
627 0.14
628 0.16
629 0.15
630 0.16
631 0.21
632 0.24
633 0.24
634 0.24
635 0.23
636 0.23
637 0.24
638 0.25
639 0.2
640 0.15
641 0.12
642 0.12
643 0.13
644 0.13
645 0.12
646 0.11
647 0.11
648 0.12
649 0.13
650 0.12
651 0.12
652 0.11
653 0.11
654 0.1
655 0.1
656 0.09
657 0.08
658 0.08
659 0.07
660 0.07
661 0.07
662 0.08
663 0.09
664 0.09
665 0.08
666 0.07
667 0.12
668 0.13
669 0.15
670 0.13
671 0.14
672 0.16
673 0.17
674 0.18
675 0.15
676 0.2
677 0.26
678 0.37
679 0.43
680 0.49
681 0.55
682 0.61
683 0.66
684 0.65
685 0.65
686 0.64
687 0.63
688 0.55
689 0.5
690 0.46
691 0.41
692 0.35
693 0.28
694 0.2
695 0.13
696 0.12
697 0.09
698 0.07
699 0.06
700 0.04
701 0.04
702 0.04
703 0.04
704 0.05
705 0.05
706 0.06
707 0.06
708 0.06
709 0.06
710 0.06
711 0.07
712 0.07
713 0.06
714 0.08
715 0.09
716 0.09
717 0.09
718 0.1
719 0.1
720 0.1
721 0.1
722 0.08
723 0.07
724 0.06
725 0.07
726 0.08
727 0.08
728 0.09
729 0.1
730 0.16
731 0.16
732 0.18
733 0.23
734 0.26
735 0.34
736 0.43
737 0.54
738 0.56
739 0.65
740 0.66
741 0.66
742 0.65
743 0.62
744 0.58
745 0.49
746 0.44
747 0.37
748 0.36
749 0.33
750 0.3
751 0.27
752 0.22
753 0.19
754 0.16
755 0.14
756 0.13
757 0.1
758 0.1
759 0.08
760 0.07
761 0.07
762 0.06
763 0.06
764 0.06
765 0.05
766 0.04
767 0.04
768 0.04
769 0.05
770 0.05
771 0.05
772 0.05
773 0.05
774 0.07
775 0.1
776 0.11
777 0.12
778 0.14
779 0.15
780 0.16
781 0.17
782 0.15
783 0.19
784 0.27
785 0.27
786 0.29
787 0.29
788 0.31
789 0.31
790 0.33
791 0.29
792 0.3
793 0.32
794 0.29
795 0.27
796 0.25
797 0.25
798 0.23
799 0.18
800 0.09
801 0.06
802 0.05
803 0.05
804 0.06
805 0.06
806 0.06
807 0.08
808 0.09
809 0.11
810 0.13
811 0.14
812 0.16
813 0.17
814 0.17
815 0.2
816 0.2
817 0.22
818 0.2
819 0.19
820 0.19
821 0.22
822 0.22
823 0.18
824 0.18
825 0.14
826 0.15
827 0.16
828 0.16
829 0.14
830 0.13
831 0.12
832 0.15
833 0.15
834 0.14
835 0.14
836 0.15
837 0.14
838 0.16
839 0.19
840 0.16
841 0.16
842 0.17
843 0.19
844 0.16
845 0.21
846 0.21
847 0.2
848 0.19
849 0.18
850 0.17
851 0.15
852 0.15
853 0.1
854 0.07
855 0.06
856 0.06
857 0.06
858 0.07
859 0.06
860 0.07
861 0.07
862 0.08
863 0.09
864 0.1
865 0.1
866 0.1
867 0.13
868 0.13
869 0.15
870 0.16
871 0.17
872 0.19
873 0.2
874 0.21
875 0.18
876 0.16
877 0.14
878 0.12
879 0.11
880 0.09
881 0.08
882 0.09
883 0.15
884 0.15
885 0.16
886 0.18
887 0.19
888 0.2
889 0.21
890 0.22
891 0.2
892 0.22
893 0.24
894 0.22
895 0.22
896 0.21
897 0.2
898 0.17
899 0.14
900 0.15
901 0.14
902 0.16
903 0.18
904 0.23
905 0.26
906 0.26
907 0.26
908 0.24
909 0.22
910 0.19
911 0.19
912 0.14
913 0.14
914 0.18
915 0.18
916 0.18
917 0.22
918 0.24
919 0.28
920 0.35
921 0.42
922 0.42
923 0.43
924 0.46
925 0.48
926 0.52
927 0.52
928 0.49
929 0.45
930 0.45
931 0.47
932 0.45
933 0.41
934 0.36
935 0.3
936 0.26
937 0.21
938 0.16
939 0.15
940 0.16
941 0.17
942 0.16
943 0.19
944 0.2
945 0.22
946 0.27
947 0.28
948 0.31
949 0.37
950 0.47
951 0.52
952 0.57
953 0.58
954 0.54
955 0.54
956 0.53
957 0.46
958 0.39
959 0.32
960 0.27
961 0.28
962 0.27
963 0.23
964 0.21
965 0.21
966 0.2
967 0.27
968 0.28
969 0.24
970 0.23
971 0.26
972 0.25
973 0.24
974 0.25
975 0.17
976 0.19
977 0.21
978 0.23
979 0.21
980 0.2
981 0.21
982 0.24
983 0.26
984 0.27
985 0.33
986 0.34
987 0.35
988 0.36
989 0.39
990 0.34
991 0.32
992 0.31
993 0.3
994 0.3
995 0.3
996 0.28
997 0.25
998 0.23
999 0.21
1000 0.16
1001 0.1
1002 0.09
1003 0.07
1004 0.07
1005 0.07
1006 0.07
1007 0.07
1008 0.07
1009 0.07
1010 0.08
1011 0.09
1012 0.09
1013 0.08
1014 0.1
1015 0.1
1016 0.1
1017 0.1
1018 0.08
1019 0.07
1020 0.07
1021 0.09
1022 0.07
1023 0.08
1024 0.08
1025 0.07
1026 0.09
1027 0.09
1028 0.09
1029 0.09
1030 0.11
1031 0.12
1032 0.12
1033 0.13
1034 0.13
1035 0.12
1036 0.13
1037 0.12
1038 0.1
1039 0.09
1040 0.09