Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A0P9F9F3

Protein Details
Accession A0A0P9F9F3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
107-127DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQHydrophilic
994-1014ASRSLSRRHKGPPQQPPQQAYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
421-427RTEKRRR
Subcellular Location(s) mito 18, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSRRYPRIVSNVVEDHPVTVVRDGVEVTIPVDTSGPNPNGEEFDCLYLDMNGIVHPCTHPEGKPAPKTEEDMMLEVFLYTERVVAMVRPRKLLMMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQEAKEKEDDRQRAIQELESMGKEVSDEYRNDKGWDSNAITPGTPFMDLLAKSLRYWVRKKLNEDPGWAGLEVIISDASVPGEGEHKIMDFIRRQRVQPSHDPNTKHVIYGLDADLIMLSLATHEPHFKVLREDVFADDKKKRGCHRCGEPGHHSSQCTGQVKKPEADLTPKGAPSVPKPFIFLDVAVLREYLAVELSAPTHSFPFSLERALDDWVFLIFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDTLMNIWKTNLDRMGGYLTEHGKVRLERAQIILEQLAMREDEIFRKRREAEERQDRTEKRRRIDREQRETPQQRSARSIQASAPPVNEYVPVNANGTAAVTAAVTAAAPGPGGLPTKPQWAADEAKKDEDKDQAAKAMTGGNKSIVQNRMALRMANLSAAEMMKAQLAGDEDPSSTDAPTAAAAAAGDDVDDPEMQREQEAEEAGRAEAARNADAAAKLKAELLASSDVDVSPRGTKRTADTDAVESQDTTADEEAGEREDDASPPPLKLMGNNVVEQDDTVKLWEPGYKERYYRSKFGVELSDAEFRKKVVKCYVEGLCWVLEYYYQGTPSWQWYYPYHFSPFASDFVDLASLDIKFDKGQPFKPYEQLMGVFPAASRIHLPEPFQQLMIGEDSPILDFYPEEFHIDMNGKKMLWQGVALLPFIDQKRLLEAMDTKYPELTDFEHYRNTLGTDAIIVGSKHPLYDYLEGLYGKKKASEPVPLDTKRSKGIAGAVLPDESVPGSTFDSPLPSQPDIVNDESISASFSFPPQKTPHRSVLLPGAKLERNVLTPYDKDQVDNRGGAGGRGGYGGGGGYGGGQGGQGGYGSGYSTPGSGYGTPTGYGTPNGGRDPYAGYSGYPGGGGGGYCASRSLSRRHKGPPQQPPQQAYGGYGPPTGYMAPPLPGGYRPPPPAAYGAGYAPPPPQAGPGGARYPGQPQQPPPPGYGGYGGYQGGGQGQGQGGYGGGYGGQHTRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.61
3 0.64
4 0.64
5 0.58
6 0.56
7 0.54
8 0.49
9 0.45
10 0.39
11 0.31
12 0.26
13 0.25
14 0.19
15 0.15
16 0.15
17 0.13
18 0.13
19 0.13
20 0.13
21 0.13
22 0.11
23 0.11
24 0.1
25 0.1
26 0.09
27 0.1
28 0.09
29 0.1
30 0.18
31 0.19
32 0.19
33 0.2
34 0.22
35 0.24
36 0.25
37 0.27
38 0.21
39 0.22
40 0.21
41 0.2
42 0.19
43 0.16
44 0.15
45 0.11
46 0.1
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.1
51 0.1
52 0.13
53 0.17
54 0.2
55 0.2
56 0.27
57 0.35
58 0.43
59 0.5
60 0.52
61 0.54
62 0.53
63 0.57
64 0.52
65 0.51
66 0.44
67 0.38
68 0.33
69 0.27
70 0.24
71 0.2
72 0.17
73 0.1
74 0.09
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.07
79 0.07
80 0.1
81 0.2
82 0.27
83 0.29
84 0.32
85 0.33
86 0.34
87 0.34
88 0.35
89 0.27
90 0.25
91 0.23
92 0.21
93 0.22
94 0.2
95 0.2
96 0.18
97 0.15
98 0.1
99 0.13
100 0.19
101 0.26
102 0.37
103 0.46
104 0.55
105 0.66
106 0.74
107 0.8
108 0.82
109 0.79
110 0.76
111 0.77
112 0.77
113 0.75
114 0.77
115 0.72
116 0.68
117 0.72
118 0.66
119 0.62
120 0.61
121 0.57
122 0.51
123 0.54
124 0.5
125 0.47
126 0.47
127 0.42
128 0.36
129 0.33
130 0.31
131 0.24
132 0.24
133 0.19
134 0.17
135 0.15
136 0.13
137 0.15
138 0.16
139 0.17
140 0.21
141 0.27
142 0.29
143 0.3
144 0.31
145 0.3
146 0.28
147 0.33
148 0.31
149 0.3
150 0.33
151 0.32
152 0.3
153 0.27
154 0.27
155 0.21
156 0.17
157 0.13
158 0.1
159 0.14
160 0.14
161 0.16
162 0.19
163 0.18
164 0.18
165 0.25
166 0.29
167 0.32
168 0.37
169 0.44
170 0.5
171 0.56
172 0.64
173 0.67
174 0.73
175 0.69
176 0.69
177 0.64
178 0.56
179 0.51
180 0.44
181 0.34
182 0.23
183 0.19
184 0.14
185 0.1
186 0.06
187 0.04
188 0.04
189 0.05
190 0.05
191 0.04
192 0.05
193 0.04
194 0.07
195 0.07
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.1
200 0.11
201 0.15
202 0.2
203 0.27
204 0.36
205 0.39
206 0.41
207 0.48
208 0.54
209 0.56
210 0.6
211 0.63
212 0.62
213 0.65
214 0.67
215 0.61
216 0.63
217 0.56
218 0.46
219 0.38
220 0.3
221 0.25
222 0.25
223 0.22
224 0.14
225 0.14
226 0.13
227 0.11
228 0.09
229 0.08
230 0.04
231 0.03
232 0.03
233 0.04
234 0.05
235 0.06
236 0.08
237 0.09
238 0.14
239 0.16
240 0.16
241 0.2
242 0.24
243 0.26
244 0.27
245 0.27
246 0.26
247 0.3
248 0.31
249 0.32
250 0.31
251 0.34
252 0.36
253 0.42
254 0.48
255 0.51
256 0.58
257 0.62
258 0.67
259 0.73
260 0.75
261 0.76
262 0.74
263 0.69
264 0.67
265 0.6
266 0.51
267 0.42
268 0.39
269 0.39
270 0.37
271 0.35
272 0.33
273 0.39
274 0.42
275 0.42
276 0.41
277 0.36
278 0.34
279 0.38
280 0.37
281 0.34
282 0.33
283 0.32
284 0.3
285 0.29
286 0.28
287 0.26
288 0.33
289 0.31
290 0.28
291 0.31
292 0.3
293 0.31
294 0.3
295 0.25
296 0.2
297 0.18
298 0.18
299 0.16
300 0.15
301 0.12
302 0.11
303 0.11
304 0.07
305 0.06
306 0.04
307 0.04
308 0.05
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.07
313 0.07
314 0.08
315 0.07
316 0.08
317 0.12
318 0.12
319 0.14
320 0.14
321 0.14
322 0.15
323 0.17
324 0.16
325 0.11
326 0.11
327 0.09
328 0.08
329 0.07
330 0.06
331 0.04
332 0.04
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.07
338 0.07
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.07
343 0.08
344 0.12
345 0.12
346 0.12
347 0.11
348 0.12
349 0.11
350 0.11
351 0.1
352 0.07
353 0.05
354 0.07
355 0.09
356 0.08
357 0.08
358 0.08
359 0.11
360 0.12
361 0.14
362 0.14
363 0.13
364 0.13
365 0.14
366 0.16
367 0.13
368 0.13
369 0.14
370 0.13
371 0.14
372 0.15
373 0.14
374 0.15
375 0.15
376 0.18
377 0.2
378 0.2
379 0.2
380 0.21
381 0.22
382 0.2
383 0.21
384 0.17
385 0.13
386 0.11
387 0.1
388 0.09
389 0.07
390 0.07
391 0.06
392 0.07
393 0.12
394 0.18
395 0.23
396 0.23
397 0.28
398 0.3
399 0.36
400 0.44
401 0.46
402 0.51
403 0.57
404 0.61
405 0.62
406 0.68
407 0.64
408 0.64
409 0.66
410 0.61
411 0.57
412 0.61
413 0.62
414 0.65
415 0.74
416 0.76
417 0.76
418 0.78
419 0.76
420 0.77
421 0.76
422 0.69
423 0.67
424 0.59
425 0.51
426 0.48
427 0.47
428 0.43
429 0.38
430 0.37
431 0.3
432 0.32
433 0.34
434 0.3
435 0.27
436 0.21
437 0.2
438 0.19
439 0.18
440 0.12
441 0.11
442 0.11
443 0.11
444 0.12
445 0.11
446 0.11
447 0.1
448 0.09
449 0.07
450 0.06
451 0.05
452 0.04
453 0.03
454 0.03
455 0.03
456 0.03
457 0.03
458 0.03
459 0.03
460 0.03
461 0.03
462 0.03
463 0.04
464 0.05
465 0.05
466 0.08
467 0.09
468 0.13
469 0.14
470 0.14
471 0.15
472 0.17
473 0.21
474 0.23
475 0.28
476 0.26
477 0.29
478 0.29
479 0.29
480 0.28
481 0.27
482 0.26
483 0.21
484 0.21
485 0.2
486 0.2
487 0.19
488 0.17
489 0.17
490 0.16
491 0.14
492 0.14
493 0.12
494 0.14
495 0.15
496 0.19
497 0.18
498 0.17
499 0.2
500 0.21
501 0.23
502 0.21
503 0.2
504 0.16
505 0.16
506 0.15
507 0.11
508 0.11
509 0.07
510 0.07
511 0.07
512 0.07
513 0.05
514 0.05
515 0.05
516 0.05
517 0.04
518 0.04
519 0.05
520 0.05
521 0.06
522 0.06
523 0.06
524 0.07
525 0.08
526 0.07
527 0.07
528 0.06
529 0.06
530 0.05
531 0.05
532 0.05
533 0.04
534 0.04
535 0.03
536 0.03
537 0.03
538 0.03
539 0.03
540 0.02
541 0.03
542 0.03
543 0.03
544 0.03
545 0.04
546 0.05
547 0.05
548 0.05
549 0.05
550 0.05
551 0.07
552 0.07
553 0.06
554 0.06
555 0.07
556 0.07
557 0.07
558 0.06
559 0.05
560 0.07
561 0.08
562 0.07
563 0.07
564 0.08
565 0.08
566 0.09
567 0.1
568 0.09
569 0.08
570 0.08
571 0.08
572 0.09
573 0.08
574 0.07
575 0.07
576 0.08
577 0.08
578 0.08
579 0.08
580 0.07
581 0.08
582 0.08
583 0.07
584 0.1
585 0.11
586 0.13
587 0.13
588 0.14
589 0.17
590 0.23
591 0.25
592 0.23
593 0.23
594 0.25
595 0.25
596 0.25
597 0.22
598 0.16
599 0.13
600 0.12
601 0.11
602 0.08
603 0.07
604 0.06
605 0.06
606 0.06
607 0.06
608 0.06
609 0.06
610 0.05
611 0.06
612 0.06
613 0.07
614 0.08
615 0.11
616 0.11
617 0.11
618 0.11
619 0.11
620 0.11
621 0.11
622 0.15
623 0.19
624 0.2
625 0.21
626 0.21
627 0.2
628 0.2
629 0.19
630 0.16
631 0.09
632 0.07
633 0.07
634 0.08
635 0.08
636 0.08
637 0.11
638 0.11
639 0.17
640 0.22
641 0.24
642 0.25
643 0.3
644 0.39
645 0.41
646 0.43
647 0.4
648 0.39
649 0.37
650 0.39
651 0.36
652 0.28
653 0.25
654 0.24
655 0.27
656 0.23
657 0.24
658 0.21
659 0.19
660 0.25
661 0.25
662 0.27
663 0.28
664 0.3
665 0.31
666 0.36
667 0.38
668 0.31
669 0.3
670 0.27
671 0.19
672 0.16
673 0.15
674 0.09
675 0.07
676 0.07
677 0.09
678 0.09
679 0.1
680 0.1
681 0.11
682 0.12
683 0.15
684 0.17
685 0.16
686 0.18
687 0.19
688 0.26
689 0.29
690 0.31
691 0.3
692 0.28
693 0.27
694 0.29
695 0.29
696 0.23
697 0.21
698 0.18
699 0.15
700 0.14
701 0.14
702 0.1
703 0.08
704 0.07
705 0.06
706 0.06
707 0.06
708 0.07
709 0.06
710 0.1
711 0.17
712 0.19
713 0.24
714 0.29
715 0.34
716 0.36
717 0.4
718 0.38
719 0.33
720 0.31
721 0.28
722 0.23
723 0.2
724 0.17
725 0.13
726 0.11
727 0.13
728 0.11
729 0.11
730 0.11
731 0.12
732 0.15
733 0.16
734 0.19
735 0.21
736 0.28
737 0.28
738 0.27
739 0.24
740 0.22
741 0.21
742 0.2
743 0.14
744 0.08
745 0.08
746 0.08
747 0.08
748 0.08
749 0.06
750 0.05
751 0.05
752 0.05
753 0.09
754 0.09
755 0.11
756 0.11
757 0.11
758 0.13
759 0.16
760 0.16
761 0.15
762 0.16
763 0.14
764 0.15
765 0.17
766 0.17
767 0.15
768 0.14
769 0.14
770 0.15
771 0.16
772 0.15
773 0.13
774 0.11
775 0.15
776 0.15
777 0.15
778 0.12
779 0.12
780 0.15
781 0.16
782 0.15
783 0.14
784 0.18
785 0.2
786 0.25
787 0.26
788 0.23
789 0.22
790 0.22
791 0.2
792 0.18
793 0.17
794 0.18
795 0.2
796 0.22
797 0.25
798 0.25
799 0.25
800 0.24
801 0.23
802 0.17
803 0.13
804 0.11
805 0.08
806 0.08
807 0.08
808 0.09
809 0.08
810 0.08
811 0.1
812 0.1
813 0.1
814 0.1
815 0.11
816 0.14
817 0.16
818 0.16
819 0.15
820 0.17
821 0.18
822 0.19
823 0.21
824 0.19
825 0.17
826 0.19
827 0.19
828 0.21
829 0.24
830 0.33
831 0.33
832 0.37
833 0.47
834 0.45
835 0.49
836 0.48
837 0.47
838 0.41
839 0.38
840 0.32
841 0.24
842 0.27
843 0.26
844 0.23
845 0.24
846 0.21
847 0.2
848 0.19
849 0.17
850 0.13
851 0.09
852 0.08
853 0.06
854 0.07
855 0.09
856 0.1
857 0.11
858 0.11
859 0.15
860 0.15
861 0.18
862 0.22
863 0.21
864 0.22
865 0.21
866 0.25
867 0.25
868 0.26
869 0.24
870 0.18
871 0.19
872 0.17
873 0.16
874 0.15
875 0.11
876 0.1
877 0.09
878 0.12
879 0.19
880 0.19
881 0.24
882 0.29
883 0.38
884 0.45
885 0.51
886 0.56
887 0.54
888 0.54
889 0.52
890 0.56
891 0.53
892 0.46
893 0.42
894 0.39
895 0.35
896 0.35
897 0.35
898 0.26
899 0.23
900 0.23
901 0.24
902 0.22
903 0.22
904 0.26
905 0.29
906 0.28
907 0.27
908 0.29
909 0.33
910 0.33
911 0.32
912 0.28
913 0.26
914 0.25
915 0.23
916 0.21
917 0.15
918 0.11
919 0.11
920 0.1
921 0.06
922 0.06
923 0.06
924 0.04
925 0.04
926 0.03
927 0.03
928 0.03
929 0.03
930 0.03
931 0.03
932 0.03
933 0.03
934 0.04
935 0.03
936 0.03
937 0.04
938 0.04
939 0.05
940 0.05
941 0.06
942 0.06
943 0.07
944 0.07
945 0.07
946 0.1
947 0.1
948 0.13
949 0.14
950 0.15
951 0.15
952 0.16
953 0.17
954 0.16
955 0.16
956 0.16
957 0.16
958 0.19
959 0.2
960 0.2
961 0.19
962 0.19
963 0.22
964 0.21
965 0.21
966 0.18
967 0.16
968 0.18
969 0.18
970 0.17
971 0.13
972 0.11
973 0.09
974 0.09
975 0.08
976 0.07
977 0.08
978 0.08
979 0.08
980 0.09
981 0.1
982 0.14
983 0.17
984 0.26
985 0.35
986 0.42
987 0.48
988 0.56
989 0.65
990 0.71
991 0.78
992 0.79
993 0.79
994 0.82
995 0.83
996 0.8
997 0.73
998 0.67
999 0.57
1000 0.49
1001 0.44
1002 0.38
1003 0.31
1004 0.28
1005 0.24
1006 0.2
1007 0.21
1008 0.18
1009 0.14
1010 0.14
1011 0.14
1012 0.14
1013 0.15
1014 0.16
1015 0.16
1016 0.17
1017 0.22
1018 0.24
1019 0.3
1020 0.33
1021 0.36
1022 0.36
1023 0.37
1024 0.38
1025 0.35
1026 0.32
1027 0.27
1028 0.25
1029 0.23
1030 0.22
1031 0.21
1032 0.2
1033 0.19
1034 0.17
1035 0.16
1036 0.16
1037 0.16
1038 0.19
1039 0.21
1040 0.25
1041 0.26
1042 0.27
1043 0.27
1044 0.26
1045 0.31
1046 0.33
1047 0.37
1048 0.38
1049 0.4
1050 0.49
1051 0.58
1052 0.58
1053 0.54
1054 0.53
1055 0.47
1056 0.43
1057 0.41
1058 0.33
1059 0.25
1060 0.25
1061 0.22
1062 0.18
1063 0.16
1064 0.14
1065 0.12
1066 0.11
1067 0.09
1068 0.09
1069 0.1
1070 0.1
1071 0.1
1072 0.1
1073 0.09
1074 0.08
1075 0.08
1076 0.06
1077 0.05
1078 0.05
1079 0.07