FuNGI

B5RTK0

Protein Details

Accession

B5RTK0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
105-128	ARLVEEQERKNKKQRTNKSTIDEE	Hydrophilic
244-263	DLDWLKLRRRRMKDNEPAED	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR034482 Mrd1_RRM3 IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding
KEGG	dha:DEHA2D17358g -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12565 RRM1_MRD1 cd12568 RRM3_MRD1

Amino Acid Sequences

MSRLIVKGLPKYFTEQKLREHFSKKGDVTDVKLMKKRNGESRRFAFIGYKSFEDAEKSARFFDKSFIDTARIDVELAKTFSDPSVPLSFKEKRRLNDEKLREQEARLVEEQERKNKKQRTNKSTIDEEIENNPKLREFMEVMKPSHQVKSWANFDVADGTGAPSTQALADELARQDGNELSTESNKPNVLQAPEGESDDEYEDFKPTDANKGEVEEEEEEEKMISLSDLPEEENKLANDENVTDLDWLKLRRRRMKDNEPAEDPQAREAVSKDEIIPAEVERLPERYLEEPQQSPEEITIAKISETGRLFVRNILYTSTEQEFRELFETYGPLEEVHVAIDTRTGKSKGFVYIQFFKSENAVSAYHALDKQIFQGRLLHILPAEKKKDHRLDEFDLKNLPLKKQRELKRKDHASKTQFSWNSLYMNSDAVLDSVAAKMGVSKSQLIDAQSSNSAVKQALAEAHVIGDVRKYFENKGVDLTTFDKKERDDKVILVKNFPYGTTIEEIGELFSEYGQLKRMLMPPAGTIAIVEFRDAPSARAAFQKLAYRRFGKSIIYLEKGPKDLFTREPSSDENNEISEKPDEKAVEVKVTANDIMGESKVEEDEDTIDGPTVSIFVKNLNFATTSQRLTEAFQALPGFIVAKVKVKPDPKKSGSTLSMGFGFVEFRTKEQANVAISTMNDYVLDGHKLQLKLSHRQSGSTSTSSKSEKSNKSNKIIIKNLPFEATRKDVLELFGAFGQLKSVRVPKKFDKSARGFAFVEFSLLKEAENAMNQLEGVHLLGRRLVMQYAEQDAGDAEAEIDRMTKKVKKQVATQQLASARLAGKGKNIDLEEESGDEFDIAN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.56
2	0.53
3	0.58
4	0.65
5	0.7
6	0.71
7	0.69
8	0.67
9	0.64
10	0.69
11	0.62
12	0.58
13	0.58
14	0.53
15	0.52
16	0.56
17	0.55
18	0.53
19	0.56
20	0.55
21	0.54
22	0.59
23	0.61
24	0.62
25	0.66
26	0.68
27	0.72
28	0.73
29	0.75
30	0.67
31	0.61
32	0.56
33	0.5
34	0.49
35	0.43
36	0.39
37	0.33
38	0.33
39	0.33
40	0.31
41	0.28
42	0.27
43	0.28
44	0.27
45	0.29
46	0.31
47	0.33
48	0.29
49	0.33
50	0.31
51	0.29
52	0.31
53	0.29
54	0.3
55	0.28
56	0.29
57	0.26
58	0.21
59	0.19
60	0.17
61	0.18
62	0.19
63	0.19
64	0.18
65	0.16
66	0.17
67	0.17
68	0.17
69	0.15
70	0.16
71	0.22
72	0.22
73	0.23
74	0.3
75	0.38
76	0.43
77	0.53
78	0.55
79	0.53
80	0.61
81	0.69
82	0.7
83	0.73
84	0.75
85	0.75
86	0.74
87	0.75
88	0.67
89	0.59
90	0.56
91	0.49
92	0.45
93	0.37
94	0.34
95	0.33
96	0.4
97	0.45
98	0.49
99	0.54
100	0.55
101	0.63
102	0.69
103	0.74
104	0.76
105	0.81
106	0.81
107	0.82
108	0.84
109	0.81
110	0.78
111	0.71
112	0.65
113	0.56
114	0.49
115	0.46
116	0.44
117	0.39
118	0.35
119	0.32
120	0.27
121	0.26
122	0.24
123	0.21
124	0.18
125	0.22
126	0.31
127	0.35
128	0.37
129	0.39
130	0.42
131	0.4
132	0.41
133	0.36
134	0.33
135	0.34
136	0.4
137	0.4
138	0.39
139	0.38
140	0.34
141	0.33
142	0.29
143	0.23
144	0.16
145	0.12
146	0.11
147	0.1
148	0.09
149	0.09
150	0.06
151	0.06
152	0.06
153	0.06
154	0.06
155	0.07
156	0.08
157	0.1
158	0.11
159	0.12
160	0.12
161	0.11
162	0.12
163	0.12
164	0.12
165	0.1
166	0.11
167	0.11
168	0.15
169	0.18
170	0.18
171	0.2
172	0.19
173	0.19
174	0.22
175	0.25
176	0.23
177	0.22
178	0.22
179	0.24
180	0.25
181	0.25
182	0.22
183	0.17
184	0.16
185	0.16
186	0.15
187	0.12
188	0.11
189	0.12
190	0.11
191	0.11
192	0.13
193	0.12
194	0.2
195	0.2
196	0.22
197	0.21
198	0.23
199	0.24
200	0.21
201	0.24
202	0.17
203	0.17
204	0.16
205	0.15
206	0.13
207	0.12
208	0.12
209	0.08
210	0.07
211	0.05
212	0.05
213	0.05
214	0.06
215	0.07
216	0.08
217	0.1
218	0.12
219	0.12
220	0.14
221	0.14
222	0.15
223	0.15
224	0.14
225	0.13
226	0.12
227	0.12
228	0.1
229	0.11
230	0.1
231	0.1
232	0.1
233	0.12
234	0.14
235	0.21
236	0.25
237	0.33
238	0.42
239	0.49
240	0.58
241	0.65
242	0.74
243	0.76
244	0.81
245	0.77
246	0.73
247	0.68
248	0.61
249	0.55
250	0.44
251	0.36
252	0.28
253	0.22
254	0.18
255	0.17
256	0.17
257	0.14
258	0.15
259	0.14
260	0.15
261	0.15
262	0.15
263	0.15
264	0.11
265	0.13
266	0.13
267	0.14
268	0.12
269	0.14
270	0.14
271	0.14
272	0.16
273	0.14
274	0.17
275	0.2
276	0.23
277	0.23
278	0.24
279	0.25
280	0.23
281	0.22
282	0.18
283	0.15
284	0.11
285	0.11
286	0.1
287	0.08
288	0.08
289	0.09
290	0.1
291	0.14
292	0.14
293	0.15
294	0.15
295	0.17
296	0.17
297	0.18
298	0.19
299	0.15
300	0.15
301	0.15
302	0.17
303	0.16
304	0.18
305	0.18
306	0.18
307	0.17
308	0.18
309	0.17
310	0.16
311	0.17
312	0.14
313	0.13
314	0.11
315	0.11
316	0.1
317	0.1
318	0.09
319	0.07
320	0.07
321	0.07
322	0.06
323	0.06
324	0.06
325	0.05
326	0.05
327	0.08
328	0.09
329	0.09
330	0.13
331	0.13
332	0.13
333	0.15
334	0.17
335	0.18
336	0.2
337	0.22
338	0.25
339	0.31
340	0.31
341	0.32
342	0.31
343	0.27
344	0.25
345	0.23
346	0.18
347	0.13
348	0.12
349	0.11
350	0.12
351	0.12
352	0.12
353	0.12
354	0.12
355	0.1
356	0.1
357	0.13
358	0.17
359	0.17
360	0.16
361	0.19
362	0.19
363	0.22
364	0.22
365	0.19
366	0.14
367	0.16
368	0.2
369	0.22
370	0.25
371	0.23
372	0.25
373	0.33
374	0.4
375	0.42
376	0.43
377	0.43
378	0.46
379	0.52
380	0.51
381	0.44
382	0.38
383	0.33
384	0.33
385	0.28
386	0.26
387	0.25
388	0.27
389	0.32
390	0.4
391	0.49
392	0.55
393	0.61
394	0.66
395	0.68
396	0.76
397	0.77
398	0.76
399	0.76
400	0.71
401	0.68
402	0.63
403	0.61
404	0.51
405	0.46
406	0.4
407	0.32
408	0.28
409	0.23
410	0.22
411	0.14
412	0.13
413	0.11
414	0.09
415	0.08
416	0.06
417	0.06
418	0.05
419	0.05
420	0.04
421	0.04
422	0.03
423	0.03
424	0.04
425	0.05
426	0.06
427	0.06
428	0.07
429	0.08
430	0.09
431	0.11
432	0.11
433	0.12
434	0.11
435	0.12
436	0.11
437	0.12
438	0.11
439	0.1
440	0.1
441	0.08
442	0.08
443	0.06
444	0.07
445	0.07
446	0.07
447	0.07
448	0.06
449	0.06
450	0.06
451	0.06
452	0.06
453	0.06
454	0.06
455	0.07
456	0.09
457	0.1
458	0.11
459	0.17
460	0.19
461	0.18
462	0.2
463	0.2
464	0.19
465	0.19
466	0.21
467	0.2
468	0.19
469	0.19
470	0.18
471	0.19
472	0.25
473	0.27
474	0.28
475	0.26
476	0.26
477	0.35
478	0.4
479	0.4
480	0.35
481	0.33
482	0.3
483	0.29
484	0.26
485	0.19
486	0.12
487	0.13
488	0.13
489	0.13
490	0.1
491	0.1
492	0.1
493	0.09
494	0.08
495	0.07
496	0.05
497	0.04
498	0.06
499	0.06
500	0.06
501	0.09
502	0.09
503	0.09
504	0.12
505	0.16
506	0.17
507	0.17
508	0.18
509	0.16
510	0.17
511	0.17
512	0.14
513	0.1
514	0.08
515	0.09
516	0.08
517	0.08
518	0.07
519	0.07
520	0.11
521	0.11
522	0.11
523	0.12
524	0.13
525	0.13
526	0.16
527	0.18
528	0.16
529	0.19
530	0.25
531	0.26
532	0.3
533	0.34
534	0.34
535	0.35
536	0.36
537	0.35
538	0.3
539	0.29
540	0.31
541	0.31
542	0.3
543	0.31
544	0.32
545	0.32
546	0.33
547	0.29
548	0.24
549	0.23
550	0.23
551	0.25
552	0.27
553	0.3
554	0.29
555	0.31
556	0.32
557	0.34
558	0.33
559	0.31
560	0.26
561	0.23
562	0.23
563	0.21
564	0.21
565	0.19
566	0.18
567	0.16
568	0.18
569	0.17
570	0.17
571	0.21
572	0.2
573	0.19
574	0.18
575	0.19
576	0.17
577	0.18
578	0.17
579	0.13
580	0.12
581	0.1
582	0.1
583	0.08
584	0.08
585	0.07
586	0.07
587	0.07
588	0.07
589	0.06
590	0.06
591	0.07
592	0.08
593	0.08
594	0.08
595	0.08
596	0.07
597	0.07
598	0.07
599	0.06
600	0.06
601	0.06
602	0.06
603	0.09
604	0.1
605	0.12
606	0.12
607	0.12
608	0.13
609	0.14
610	0.2
611	0.21
612	0.21
613	0.2
614	0.22
615	0.21
616	0.22
617	0.26
618	0.21
619	0.18
620	0.19
621	0.18
622	0.16
623	0.16
624	0.14
625	0.1
626	0.07
627	0.1
628	0.09
629	0.13
630	0.15
631	0.18
632	0.24
633	0.33
634	0.41
635	0.48
636	0.58
637	0.58
638	0.63
639	0.64
640	0.65
641	0.59
642	0.54
643	0.46
644	0.38
645	0.34
646	0.27
647	0.24
648	0.16
649	0.14
650	0.1
651	0.15
652	0.13
653	0.13
654	0.18
655	0.19
656	0.2
657	0.21
658	0.26
659	0.22
660	0.23
661	0.23
662	0.19
663	0.18
664	0.2
665	0.18
666	0.13
667	0.11
668	0.1
669	0.11
670	0.12
671	0.14
672	0.11
673	0.14
674	0.19
675	0.19
676	0.2
677	0.24
678	0.27
679	0.34
680	0.4
681	0.46
682	0.41
683	0.43
684	0.45
685	0.46
686	0.46
687	0.41
688	0.37
689	0.31
690	0.35
691	0.35
692	0.35
693	0.37
694	0.41
695	0.46
696	0.54
697	0.62
698	0.66
699	0.7
700	0.74
701	0.73
702	0.72
703	0.7
704	0.68
705	0.66
706	0.62
707	0.57
708	0.54
709	0.48
710	0.41
711	0.4
712	0.36
713	0.31
714	0.27
715	0.27
716	0.26
717	0.26
718	0.26
719	0.21
720	0.18
721	0.16
722	0.16
723	0.14
724	0.13
725	0.14
726	0.12
727	0.13
728	0.15
729	0.23
730	0.29
731	0.34
732	0.42
733	0.48
734	0.57
735	0.66
736	0.69
737	0.72
738	0.72
739	0.78
740	0.74
741	0.7
742	0.6
743	0.52
744	0.48
745	0.38
746	0.33
747	0.23
748	0.19
749	0.18
750	0.17
751	0.16
752	0.13
753	0.15
754	0.15
755	0.16
756	0.16
757	0.13
758	0.14
759	0.13
760	0.12
761	0.11
762	0.09
763	0.07
764	0.09
765	0.1
766	0.1
767	0.12
768	0.12
769	0.13
770	0.14
771	0.15
772	0.13
773	0.15
774	0.18
775	0.21
776	0.21
777	0.19
778	0.18
779	0.17
780	0.16
781	0.14
782	0.1
783	0.07
784	0.06
785	0.07
786	0.07
787	0.08
788	0.08
789	0.1
790	0.16
791	0.22
792	0.29
793	0.38
794	0.46
795	0.51
796	0.6
797	0.69
798	0.74
799	0.75
800	0.69
801	0.66
802	0.63
803	0.59
804	0.5
805	0.43
806	0.32
807	0.3
808	0.31
809	0.25
810	0.27
811	0.31
812	0.32
813	0.34
814	0.34
815	0.33
816	0.32
817	0.34
818	0.29
819	0.25
820	0.24
821	0.18
822	0.17

B5RTK0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer