FuNGI

A0A194S8J1

Protein Details

Accession

A0A194S8J1

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
70-91	ESQFLRPVKLNRKDPRTVRRLT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
173-175	KKK
504-509	SSKRKR
529-544	SKRRKGGSGSGKGKSP

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 15, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MDRKPKLEHVDGPPSHTASPADSPLPSTSSYRDFVLRASAPSSSTHTKYNVMKFAVTGGGGDRVIDPQDESQFLRPVKLNRKDPRTVRRLTDEDRERHNQRAIERAARAAGVKMEVDGDGAVKAEDGAAADGGEGDGAAAAQDDKEELDLSLVGKGAGGATNVQRRGPGGMFKKKTRRVFVSSEEARRLKREEWQPWVLEDDEGRERWIGRLEGGAGEIESSAKAPQQQNGNRAGLQGWRPAADSNATGSGGSAYVAFVLSDNQDEFRVLPVSRWYRFNQGPKYLTLAEEEAEEEYARQQKSKDPERWVMHRRIAPPPGSAAAGATASSSSGASTPRGAAASSSAPSASSLRSRMLANSAQGSRLDVANRAGGRPQEETKELEERIRREMRAVERPDEIPDDDEVDALEGEGERLNRTGKEIKKLVKKSDKTGNYESDDDVENPYASDDDDSDASATSHASGARPGSRAASPTRGSSTSRPASRAASPSSSGAAMLARRAASPSSKRKRDAGAGSDSEGGASSSTADGSKRRKGGSGSGKGKSPSPGPSSGLAPGALLSEADLIAFLKARPGQTSPTKDLLRHFGRALKDKRNKEAMGGLLKAVADFKEGSLVLKAGL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.52
2	0.46
3	0.39
4	0.32
5	0.25
6	0.29
7	0.26
8	0.24
9	0.22
10	0.25
11	0.25
12	0.26
13	0.24
14	0.22
15	0.23
16	0.26
17	0.27
18	0.27
19	0.28
20	0.26
21	0.25
22	0.3
23	0.28
24	0.25
25	0.25
26	0.24
27	0.22
28	0.24
29	0.3
30	0.28
31	0.29
32	0.31
33	0.32
34	0.38
35	0.44
36	0.5
37	0.5
38	0.45
39	0.44
40	0.39
41	0.39
42	0.33
43	0.26
44	0.19
45	0.13
46	0.14
47	0.13
48	0.13
49	0.12
50	0.12
51	0.13
52	0.13
53	0.13
54	0.14
55	0.17
56	0.18
57	0.2
58	0.23
59	0.28
60	0.28
61	0.31
62	0.32
63	0.38
64	0.47
65	0.54
66	0.6
67	0.64
68	0.71
69	0.76
70	0.81
71	0.83
72	0.8
73	0.77
74	0.73
75	0.72
76	0.7
77	0.66
78	0.67
79	0.66
80	0.63
81	0.64
82	0.66
83	0.61
84	0.6
85	0.61
86	0.54
87	0.48
88	0.52
89	0.49
90	0.48
91	0.46
92	0.41
93	0.37
94	0.34
95	0.32
96	0.24
97	0.2
98	0.14
99	0.13
100	0.11
101	0.11
102	0.1
103	0.1
104	0.08
105	0.07
106	0.06
107	0.06
108	0.06
109	0.05
110	0.05
111	0.04
112	0.05
113	0.04
114	0.05
115	0.05
116	0.05
117	0.05
118	0.05
119	0.04
120	0.04
121	0.03
122	0.03
123	0.02
124	0.02
125	0.02
126	0.03
127	0.03
128	0.03
129	0.03
130	0.04
131	0.04
132	0.05
133	0.05
134	0.05
135	0.06
136	0.07
137	0.07
138	0.08
139	0.08
140	0.07
141	0.06
142	0.06
143	0.06
144	0.06
145	0.06
146	0.07
147	0.12
148	0.18
149	0.19
150	0.19
151	0.19
152	0.19
153	0.22
154	0.22
155	0.25
156	0.29
157	0.38
158	0.43
159	0.51
160	0.61
161	0.66
162	0.72
163	0.72
164	0.7
165	0.66
166	0.66
167	0.64
168	0.63
169	0.61
170	0.58
171	0.57
172	0.53
173	0.48
174	0.45
175	0.43
176	0.34
177	0.37
178	0.42
179	0.42
180	0.46
181	0.5
182	0.48
183	0.45
184	0.46
185	0.38
186	0.29
187	0.22
188	0.19
189	0.17
190	0.16
191	0.16
192	0.14
193	0.14
194	0.15
195	0.18
196	0.14
197	0.12
198	0.12
199	0.12
200	0.12
201	0.12
202	0.1
203	0.07
204	0.06
205	0.06
206	0.05
207	0.04
208	0.05
209	0.05
210	0.06
211	0.11
212	0.13
213	0.16
214	0.25
215	0.3
216	0.34
217	0.39
218	0.4
219	0.35
220	0.34
221	0.31
222	0.26
223	0.23
224	0.22
225	0.17
226	0.16
227	0.16
228	0.16
229	0.16
230	0.13
231	0.12
232	0.1
233	0.1
234	0.1
235	0.09
236	0.09
237	0.08
238	0.07
239	0.06
240	0.05
241	0.04
242	0.04
243	0.04
244	0.04
245	0.03
246	0.04
247	0.05
248	0.05
249	0.06
250	0.06
251	0.06
252	0.07
253	0.07
254	0.08
255	0.1
256	0.09
257	0.1
258	0.16
259	0.21
260	0.22
261	0.26
262	0.26
263	0.31
264	0.36
265	0.43
266	0.42
267	0.44
268	0.44
269	0.41
270	0.43
271	0.37
272	0.32
273	0.25
274	0.19
275	0.13
276	0.12
277	0.11
278	0.07
279	0.07
280	0.06
281	0.05
282	0.07
283	0.11
284	0.11
285	0.12
286	0.13
287	0.17
288	0.25
289	0.34
290	0.38
291	0.39
292	0.48
293	0.51
294	0.58
295	0.6
296	0.57
297	0.54
298	0.51
299	0.49
300	0.45
301	0.45
302	0.39
303	0.33
304	0.29
305	0.25
306	0.21
307	0.17
308	0.12
309	0.08
310	0.07
311	0.06
312	0.05
313	0.04
314	0.04
315	0.04
316	0.04
317	0.04
318	0.04
319	0.05
320	0.06
321	0.07
322	0.07
323	0.07
324	0.08
325	0.07
326	0.07
327	0.08
328	0.09
329	0.09
330	0.09
331	0.08
332	0.07
333	0.09
334	0.09
335	0.09
336	0.09
337	0.11
338	0.11
339	0.13
340	0.13
341	0.13
342	0.16
343	0.17
344	0.15
345	0.18
346	0.18
347	0.17
348	0.17
349	0.17
350	0.14
351	0.13
352	0.13
353	0.1
354	0.11
355	0.14
356	0.14
357	0.13
358	0.14
359	0.14
360	0.16
361	0.18
362	0.18
363	0.18
364	0.19
365	0.21
366	0.22
367	0.25
368	0.24
369	0.26
370	0.28
371	0.27
372	0.33
373	0.35
374	0.32
375	0.3
376	0.35
377	0.37
378	0.41
379	0.43
380	0.38
381	0.37
382	0.37
383	0.37
384	0.33
385	0.27
386	0.19
387	0.16
388	0.16
389	0.13
390	0.13
391	0.11
392	0.09
393	0.08
394	0.06
395	0.06
396	0.03
397	0.04
398	0.05
399	0.06
400	0.06
401	0.07
402	0.09
403	0.09
404	0.14
405	0.21
406	0.23
407	0.31
408	0.36
409	0.43
410	0.52
411	0.57
412	0.63
413	0.65
414	0.65
415	0.64
416	0.68
417	0.67
418	0.64
419	0.64
420	0.6
421	0.53
422	0.51
423	0.45
424	0.37
425	0.32
426	0.26
427	0.22
428	0.17
429	0.13
430	0.12
431	0.11
432	0.1
433	0.08
434	0.08
435	0.07
436	0.07
437	0.08
438	0.08
439	0.08
440	0.08
441	0.08
442	0.08
443	0.07
444	0.06
445	0.07
446	0.08
447	0.08
448	0.09
449	0.12
450	0.15
451	0.16
452	0.16
453	0.17
454	0.18
455	0.2
456	0.22
457	0.26
458	0.25
459	0.27
460	0.3
461	0.3
462	0.32
463	0.33
464	0.39
465	0.4
466	0.41
467	0.41
468	0.39
469	0.4
470	0.41
471	0.42
472	0.37
473	0.32
474	0.31
475	0.3
476	0.29
477	0.25
478	0.2
479	0.16
480	0.14
481	0.11
482	0.11
483	0.12
484	0.11
485	0.11
486	0.13
487	0.14
488	0.19
489	0.28
490	0.38
491	0.47
492	0.54
493	0.57
494	0.6
495	0.64
496	0.66
497	0.64
498	0.6
499	0.57
500	0.51
501	0.5
502	0.46
503	0.4
504	0.31
505	0.24
506	0.18
507	0.1
508	0.08
509	0.07
510	0.06
511	0.07
512	0.07
513	0.09
514	0.16
515	0.22
516	0.29
517	0.33
518	0.35
519	0.38
520	0.41
521	0.49
522	0.53
523	0.58
524	0.58
525	0.56
526	0.59
527	0.56
528	0.55
529	0.49
530	0.42
531	0.39
532	0.36
533	0.37
534	0.36
535	0.37
536	0.36
537	0.34
538	0.32
539	0.24
540	0.19
541	0.15
542	0.13
543	0.11
544	0.09
545	0.07
546	0.06
547	0.06
548	0.06
549	0.06
550	0.05
551	0.06
552	0.07
553	0.07
554	0.11
555	0.15
556	0.16
557	0.19
558	0.21
559	0.28
560	0.37
561	0.45
562	0.46
563	0.51
564	0.53
565	0.52
566	0.54
567	0.57
568	0.53
569	0.49
570	0.46
571	0.43
572	0.47
573	0.55
574	0.58
575	0.59
576	0.64
577	0.67
578	0.74
579	0.77
580	0.7
581	0.64
582	0.63
583	0.59
584	0.55
585	0.49
586	0.4
587	0.33
588	0.32
589	0.28
590	0.23
591	0.16
592	0.12
593	0.12
594	0.12
595	0.15
596	0.15
597	0.16
598	0.17

A0A194S8J1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer