Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0P9F1Y2

Protein Details
Accession A0A0P9F1Y2    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-33SDDPKPARKPTPATKRKAPSADVHydrophilic
40-61SDSDNLKPAKKKLKVKAPIPVDHydrophilic
137-161AASSSKPKAPVKKPKAEPKDNDDVKHydrophilic
818-848SDVTKDKLVKAKKPKAAKKAPAKAKAPTKGKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-20KP
49-53KKKLK
71-104KPAKKPVKKAAAASSSSKPKPKASTAAKGKGKKR
131-173KPKKKAAASSSKPKAPVKKPKAEPKDNDDVKPDKPKWSFKPKA
825-848LVKAKKPKAAKKAPAKAKAPTKGK
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 12, cyto 9, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003593  AAA+_ATPase  
IPR003959  ATPase_AAA_core  
IPR008921  DNA_pol3_clamp-load_cplx_C  
IPR013725  DNA_replication_fac_RFC1_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR012178  RFC1  
Gene Ontology GO:0005663  C:DNA replication factor C complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003689  F:DNA clamp loader activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006271  P:DNA strand elongation involved in DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF00004  AAA  
PF08519  RFC1  
CDD cd00009  AAA  
cd18140  HLD_clamp_RFC  
Amino Acid Sequences MAPRIKHDSDSDDPKPARKPTPATKRKAPSADVVTLSDSSDSDNLKPAKKKLKVKAPIPVDSDEDDDDDLKPAKKPVKKAAAASSSSKPKPKASTAAKGKGKKRDDDYDDDDSSDDGAAMQLDDDEDDDVKPKKKAAASSSKPKAPVKKPKAEPKDNDDVKPDKPKWSFKPKAGPVAPGAPPFAPLARLLGLPTDSPAKKSYVVLGAQGGPKKLEQIAQHKIKTLDEDGFLPLIGSRKSDPHDPQIVQAKKKEEQKVKEAVKAMKGLGKDAPEHLTQLWTTKYAPQRIADICGNKGHVEKLQRWLEAWPKSLACNFKKPGPDAMNSHRCVLISGPPGIGKTTSAHLVAKLLGYDVLELNASDTRSKKMLEEAFRSKTTDTTLAGFVKKEGDEGGASGLSVNRKSLIIMDEVDGMSAGDRGGVGALNAVIKKSKVPIIAIANDAKSVKMKPLLNTTFQMLFKRPTAQEIRSRIMSIAFKEGLKLDGKVVDQLVQGSQSDIRQIINMLATYKLGAQAISFDQGKALVRMNEKNALQTPWTLFSKLFGPQAFSPVSGLSLTDKLEVYFQDFSIMPLFVQENYIKGKFTRAAGASGVEAQIKNLDLVCKAAEAISDGDLVDAMIHGQQQQWSLMPVHGMLSCVRPASLCYGGGGGFPSFPAWLGKNSTQNKLQRALSEIQVRMRLRVSGDKRELRQSYLPTLFPRLVQPLQDQGVDGVEEVIELMDEYYLGRDEWDAIVELGVGEGRGMDEVLKKIPAQTKSAFTRKYNAQDHPIPYHKPEAGKAKAKKLAPQGDAPDLEEAFVEDELPEGDDDDAGDSDSSDVTKDKLVKAKKPKAAKKAPAKAKAPTKGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.57
3 0.57
4 0.56
5 0.55
6 0.61
7 0.63
8 0.72
9 0.76
10 0.77
11 0.8
12 0.82
13 0.83
14 0.81
15 0.74
16 0.71
17 0.68
18 0.66
19 0.58
20 0.5
21 0.44
22 0.37
23 0.34
24 0.26
25 0.19
26 0.16
27 0.17
28 0.17
29 0.16
30 0.23
31 0.27
32 0.34
33 0.4
34 0.46
35 0.53
36 0.61
37 0.7
38 0.72
39 0.78
40 0.81
41 0.81
42 0.82
43 0.79
44 0.77
45 0.71
46 0.64
47 0.56
48 0.49
49 0.45
50 0.36
51 0.3
52 0.24
53 0.2
54 0.18
55 0.18
56 0.19
57 0.18
58 0.2
59 0.25
60 0.32
61 0.37
62 0.44
63 0.52
64 0.59
65 0.62
66 0.66
67 0.69
68 0.68
69 0.66
70 0.63
71 0.6
72 0.59
73 0.59
74 0.6
75 0.54
76 0.53
77 0.56
78 0.58
79 0.6
80 0.59
81 0.65
82 0.68
83 0.75
84 0.77
85 0.78
86 0.79
87 0.79
88 0.77
89 0.74
90 0.72
91 0.72
92 0.7
93 0.69
94 0.69
95 0.66
96 0.6
97 0.53
98 0.46
99 0.36
100 0.29
101 0.21
102 0.14
103 0.07
104 0.06
105 0.06
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.06
113 0.07
114 0.07
115 0.11
116 0.16
117 0.19
118 0.21
119 0.23
120 0.28
121 0.31
122 0.38
123 0.43
124 0.5
125 0.54
126 0.64
127 0.69
128 0.67
129 0.69
130 0.68
131 0.69
132 0.68
133 0.71
134 0.71
135 0.74
136 0.79
137 0.84
138 0.88
139 0.88
140 0.84
141 0.81
142 0.82
143 0.76
144 0.69
145 0.64
146 0.58
147 0.53
148 0.57
149 0.52
150 0.5
151 0.51
152 0.58
153 0.61
154 0.69
155 0.71
156 0.68
157 0.76
158 0.73
159 0.77
160 0.7
161 0.64
162 0.56
163 0.54
164 0.49
165 0.4
166 0.36
167 0.25
168 0.25
169 0.22
170 0.2
171 0.14
172 0.12
173 0.12
174 0.12
175 0.12
176 0.11
177 0.11
178 0.12
179 0.11
180 0.12
181 0.17
182 0.17
183 0.19
184 0.2
185 0.21
186 0.22
187 0.23
188 0.25
189 0.23
190 0.23
191 0.22
192 0.22
193 0.23
194 0.26
195 0.27
196 0.24
197 0.19
198 0.19
199 0.19
200 0.18
201 0.2
202 0.22
203 0.28
204 0.37
205 0.44
206 0.45
207 0.47
208 0.47
209 0.44
210 0.41
211 0.35
212 0.28
213 0.22
214 0.22
215 0.19
216 0.18
217 0.16
218 0.13
219 0.11
220 0.12
221 0.11
222 0.11
223 0.11
224 0.15
225 0.18
226 0.25
227 0.28
228 0.32
229 0.39
230 0.38
231 0.42
232 0.49
233 0.52
234 0.48
235 0.49
236 0.47
237 0.45
238 0.53
239 0.57
240 0.56
241 0.56
242 0.59
243 0.64
244 0.62
245 0.61
246 0.59
247 0.53
248 0.48
249 0.44
250 0.38
251 0.31
252 0.28
253 0.25
254 0.22
255 0.2
256 0.18
257 0.17
258 0.2
259 0.17
260 0.18
261 0.17
262 0.16
263 0.14
264 0.16
265 0.15
266 0.13
267 0.13
268 0.18
269 0.24
270 0.27
271 0.3
272 0.28
273 0.33
274 0.32
275 0.36
276 0.34
277 0.3
278 0.27
279 0.26
280 0.26
281 0.21
282 0.21
283 0.18
284 0.18
285 0.2
286 0.22
287 0.29
288 0.32
289 0.31
290 0.31
291 0.33
292 0.37
293 0.35
294 0.35
295 0.29
296 0.25
297 0.26
298 0.29
299 0.34
300 0.3
301 0.35
302 0.34
303 0.36
304 0.4
305 0.41
306 0.45
307 0.41
308 0.41
309 0.38
310 0.46
311 0.49
312 0.46
313 0.46
314 0.38
315 0.34
316 0.31
317 0.26
318 0.23
319 0.17
320 0.17
321 0.16
322 0.16
323 0.17
324 0.16
325 0.15
326 0.1
327 0.09
328 0.09
329 0.1
330 0.11
331 0.11
332 0.11
333 0.11
334 0.11
335 0.1
336 0.08
337 0.07
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.06
346 0.07
347 0.07
348 0.09
349 0.1
350 0.11
351 0.13
352 0.13
353 0.13
354 0.18
355 0.23
356 0.27
357 0.32
358 0.36
359 0.39
360 0.39
361 0.4
362 0.34
363 0.29
364 0.26
365 0.22
366 0.16
367 0.14
368 0.16
369 0.16
370 0.17
371 0.16
372 0.14
373 0.14
374 0.13
375 0.11
376 0.09
377 0.08
378 0.07
379 0.07
380 0.08
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.07
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.08
392 0.08
393 0.08
394 0.09
395 0.09
396 0.1
397 0.1
398 0.09
399 0.08
400 0.06
401 0.05
402 0.05
403 0.04
404 0.03
405 0.03
406 0.03
407 0.03
408 0.03
409 0.03
410 0.03
411 0.03
412 0.04
413 0.04
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.06
418 0.07
419 0.1
420 0.1
421 0.11
422 0.15
423 0.18
424 0.19
425 0.2
426 0.2
427 0.17
428 0.17
429 0.17
430 0.13
431 0.11
432 0.1
433 0.1
434 0.14
435 0.16
436 0.18
437 0.27
438 0.29
439 0.3
440 0.3
441 0.31
442 0.29
443 0.28
444 0.27
445 0.2
446 0.2
447 0.18
448 0.22
449 0.2
450 0.22
451 0.26
452 0.28
453 0.33
454 0.36
455 0.38
456 0.34
457 0.35
458 0.29
459 0.28
460 0.26
461 0.19
462 0.18
463 0.17
464 0.16
465 0.16
466 0.16
467 0.15
468 0.14
469 0.13
470 0.1
471 0.11
472 0.11
473 0.12
474 0.12
475 0.12
476 0.11
477 0.11
478 0.1
479 0.08
480 0.08
481 0.08
482 0.09
483 0.07
484 0.08
485 0.08
486 0.08
487 0.08
488 0.08
489 0.08
490 0.08
491 0.08
492 0.08
493 0.07
494 0.07
495 0.07
496 0.07
497 0.07
498 0.07
499 0.06
500 0.05
501 0.07
502 0.08
503 0.1
504 0.1
505 0.09
506 0.09
507 0.1
508 0.1
509 0.1
510 0.11
511 0.13
512 0.16
513 0.19
514 0.21
515 0.25
516 0.25
517 0.26
518 0.26
519 0.24
520 0.21
521 0.21
522 0.2
523 0.19
524 0.2
525 0.18
526 0.16
527 0.16
528 0.17
529 0.18
530 0.2
531 0.15
532 0.18
533 0.18
534 0.21
535 0.21
536 0.19
537 0.17
538 0.13
539 0.14
540 0.1
541 0.1
542 0.08
543 0.09
544 0.09
545 0.1
546 0.1
547 0.1
548 0.11
549 0.11
550 0.12
551 0.12
552 0.11
553 0.12
554 0.12
555 0.13
556 0.13
557 0.13
558 0.09
559 0.1
560 0.1
561 0.08
562 0.11
563 0.1
564 0.11
565 0.15
566 0.16
567 0.15
568 0.15
569 0.19
570 0.18
571 0.2
572 0.23
573 0.2
574 0.21
575 0.21
576 0.22
577 0.18
578 0.16
579 0.16
580 0.12
581 0.1
582 0.09
583 0.09
584 0.09
585 0.09
586 0.09
587 0.09
588 0.08
589 0.09
590 0.09
591 0.08
592 0.08
593 0.08
594 0.07
595 0.08
596 0.08
597 0.08
598 0.08
599 0.07
600 0.07
601 0.07
602 0.07
603 0.05
604 0.04
605 0.04
606 0.04
607 0.04
608 0.05
609 0.06
610 0.08
611 0.09
612 0.1
613 0.1
614 0.12
615 0.13
616 0.12
617 0.12
618 0.11
619 0.11
620 0.11
621 0.11
622 0.1
623 0.11
624 0.12
625 0.12
626 0.11
627 0.1
628 0.11
629 0.15
630 0.16
631 0.14
632 0.13
633 0.14
634 0.14
635 0.14
636 0.14
637 0.1
638 0.07
639 0.07
640 0.07
641 0.07
642 0.07
643 0.09
644 0.09
645 0.12
646 0.17
647 0.22
648 0.31
649 0.35
650 0.39
651 0.44
652 0.49
653 0.51
654 0.51
655 0.49
656 0.42
657 0.43
658 0.41
659 0.39
660 0.41
661 0.38
662 0.36
663 0.41
664 0.39
665 0.36
666 0.34
667 0.3
668 0.26
669 0.34
670 0.36
671 0.39
672 0.48
673 0.52
674 0.54
675 0.62
676 0.61
677 0.56
678 0.56
679 0.5
680 0.5
681 0.47
682 0.46
683 0.39
684 0.42
685 0.37
686 0.33
687 0.32
688 0.3
689 0.28
690 0.28
691 0.28
692 0.29
693 0.3
694 0.29
695 0.26
696 0.2
697 0.19
698 0.17
699 0.14
700 0.08
701 0.06
702 0.06
703 0.05
704 0.05
705 0.03
706 0.03
707 0.03
708 0.03
709 0.03
710 0.04
711 0.05
712 0.06
713 0.06
714 0.06
715 0.06
716 0.08
717 0.09
718 0.1
719 0.1
720 0.09
721 0.09
722 0.09
723 0.08
724 0.06
725 0.06
726 0.05
727 0.04
728 0.04
729 0.04
730 0.04
731 0.04
732 0.06
733 0.09
734 0.11
735 0.13
736 0.15
737 0.15
738 0.21
739 0.28
740 0.29
741 0.32
742 0.34
743 0.4
744 0.47
745 0.55
746 0.56
747 0.51
748 0.56
749 0.58
750 0.64
751 0.63
752 0.6
753 0.59
754 0.61
755 0.64
756 0.64
757 0.62
758 0.57
759 0.53
760 0.54
761 0.5
762 0.45
763 0.47
764 0.48
765 0.51
766 0.57
767 0.6
768 0.62
769 0.66
770 0.65
771 0.66
772 0.66
773 0.67
774 0.61
775 0.61
776 0.57
777 0.57
778 0.55
779 0.49
780 0.42
781 0.33
782 0.29
783 0.22
784 0.17
785 0.12
786 0.11
787 0.1
788 0.06
789 0.07
790 0.07
791 0.08
792 0.08
793 0.07
794 0.07
795 0.07
796 0.08
797 0.09
798 0.09
799 0.09
800 0.09
801 0.08
802 0.08
803 0.09
804 0.09
805 0.08
806 0.09
807 0.09
808 0.15
809 0.19
810 0.24
811 0.32
812 0.4
813 0.49
814 0.59
815 0.68
816 0.71
817 0.78
818 0.82
819 0.84
820 0.87
821 0.88
822 0.88
823 0.89
824 0.91
825 0.89
826 0.85
827 0.83
828 0.82