Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A194SFC6

Protein Details
Accession A0A194SFC6    Localization Confidence High Confidence Score 19.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
80-106DEVDGKKRRAPKEKKVKDPNAPKRPASBasic
207-230DATPKDKKAKTTKKASPPKAATPSHydrophilic
250-269ATPPPKKAPASKKVAKVSKKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
67-73KKRGRKS
84-103GKKRRAPKEKKVKDPNAPKR
191-198KGKRPRKS
210-225PKDKKAKTTKKASPPK
253-269PPKKAPASKKVAKVSKK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 11.666, mito_nucl 9.499, cyto 8.5, cyto_mito 7.499, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MAAQKKTAVVNAIQHVASLHKELAKAHKQATVAVLEYAAELEESGADKSALATFPSLFPLDEGVVPKKRGRKSVAGEDGDEVDGKKRRAPKEKKVKDPNAPKRPASAYLEYQNSVRDDFRTKYPNDTYAEILKRIGQTWQNLPEDEKAPWHAMTAGKTAMYLDAKSEYEKTDPTKVSPAEQDAVAIATEPKGKRPRKSEAAADIPVDATPKDKKAKTTKKASPPKAATPSASSSAAGSSSESGSESESEATPPPKKAPASKKVAKVSKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.24
3 0.23
4 0.22
5 0.18
6 0.17
7 0.16
8 0.18
9 0.21
10 0.3
11 0.35
12 0.38
13 0.38
14 0.39
15 0.38
16 0.38
17 0.38
18 0.31
19 0.24
20 0.2
21 0.18
22 0.14
23 0.13
24 0.11
25 0.08
26 0.05
27 0.04
28 0.04
29 0.05
30 0.06
31 0.06
32 0.06
33 0.06
34 0.06
35 0.07
36 0.09
37 0.09
38 0.09
39 0.1
40 0.1
41 0.11
42 0.13
43 0.13
44 0.11
45 0.1
46 0.11
47 0.11
48 0.12
49 0.15
50 0.18
51 0.22
52 0.24
53 0.28
54 0.34
55 0.37
56 0.43
57 0.45
58 0.49
59 0.52
60 0.6
61 0.65
62 0.59
63 0.56
64 0.49
65 0.45
66 0.36
67 0.29
68 0.19
69 0.15
70 0.18
71 0.17
72 0.2
73 0.26
74 0.34
75 0.45
76 0.54
77 0.6
78 0.67
79 0.76
80 0.83
81 0.86
82 0.86
83 0.85
84 0.87
85 0.88
86 0.86
87 0.82
88 0.72
89 0.65
90 0.6
91 0.54
92 0.49
93 0.41
94 0.35
95 0.34
96 0.35
97 0.32
98 0.29
99 0.27
100 0.22
101 0.19
102 0.16
103 0.13
104 0.15
105 0.17
106 0.21
107 0.24
108 0.25
109 0.29
110 0.31
111 0.34
112 0.32
113 0.32
114 0.29
115 0.29
116 0.3
117 0.24
118 0.23
119 0.2
120 0.18
121 0.17
122 0.18
123 0.15
124 0.16
125 0.19
126 0.25
127 0.24
128 0.24
129 0.25
130 0.24
131 0.23
132 0.21
133 0.18
134 0.14
135 0.14
136 0.14
137 0.13
138 0.13
139 0.13
140 0.14
141 0.14
142 0.13
143 0.11
144 0.11
145 0.11
146 0.11
147 0.1
148 0.08
149 0.08
150 0.09
151 0.1
152 0.11
153 0.12
154 0.12
155 0.12
156 0.15
157 0.17
158 0.22
159 0.22
160 0.23
161 0.28
162 0.27
163 0.28
164 0.28
165 0.28
166 0.23
167 0.22
168 0.2
169 0.14
170 0.14
171 0.11
172 0.09
173 0.06
174 0.06
175 0.11
176 0.11
177 0.19
178 0.28
179 0.34
180 0.41
181 0.48
182 0.56
183 0.59
184 0.64
185 0.64
186 0.62
187 0.62
188 0.57
189 0.5
190 0.42
191 0.33
192 0.28
193 0.22
194 0.14
195 0.11
196 0.13
197 0.18
198 0.25
199 0.27
200 0.36
201 0.46
202 0.57
203 0.63
204 0.71
205 0.75
206 0.78
207 0.87
208 0.86
209 0.85
210 0.8
211 0.8
212 0.77
213 0.7
214 0.62
215 0.56
216 0.53
217 0.46
218 0.41
219 0.32
220 0.24
221 0.22
222 0.2
223 0.16
224 0.13
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.11
231 0.11
232 0.11
233 0.12
234 0.12
235 0.13
236 0.16
237 0.22
238 0.24
239 0.27
240 0.29
241 0.34
242 0.38
243 0.46
244 0.53
245 0.57
246 0.63
247 0.69
248 0.74
249 0.78