FuNGI

A0A194SCX3

Protein Details

Accession

A0A194SCX3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
383-405	VKSKILTTRDNKRKRGRDSESDT	Hydrophilic
517-543	AAAKAAKKAAKKDKKAAKEGNEGRKSK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
518-549	AAKAAKKAAKKDKKAAKEGNEGRKSKKVKAER

Subcellular Location(s)

cyto 11, cyto_nucl 9.333, cyto_mito 9.333, nucl 6.5, mito 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041178 RPA43_OB
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB

Amino Acid Sequences

MASATAAASLRLSSVSASTSLPQASSSSSSSEGEFITFKATMRLPISPRFAASNHSSSYPGHDQGMDGVREVLAGWVMRYLPPVRAVLLSFSPTPRFLHPAASFPASASPFDSSFSPAKDPRALLSTPQPQAAAADDDDDDDGETVRFKSLPMVQGTGFTLANVEWEGVGWRPRVGMKLLGTLTLASPSHVSLLLHNLFNASIPSSHIPSQDYEFDPECAVPPIVLERRNANVPLRSVVDSVKRRAGAAAAAEDGGEGAVEETVTGEPGSEHLVPQSAAGEADVAKAEADAEEEQDEEDELKEEEDEALLAERGWWVHRTTREPLGGSDGRIEFTLVDLTTTNSLLSCTGSLLADPFSPSALAALSAHHPSSSTKPDPDASLVKSKILTTRDNKRKRGRDSESDTGSSGSDSDDDDDDDRESSASPAPRGAAAASDSSDSELDNDDDDGVGTGIPRHGVDVAKASQRAQHGGRAAVPTVERAQSVASSRSPSPLPAPAHLAVKKGEVKNEADDGAAAAAKAAKKAAKKDKKAAKEGNEGRKSKKVKAER

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.09
2	0.1
3	0.11
4	0.12
5	0.13
6	0.16
7	0.16
8	0.15
9	0.15
10	0.15
11	0.16
12	0.18
13	0.18
14	0.18
15	0.2
16	0.2
17	0.2
18	0.21
19	0.18
20	0.17
21	0.16
22	0.14
23	0.15
24	0.15
25	0.14
26	0.17
27	0.18
28	0.21
29	0.24
30	0.3
31	0.3
32	0.36
33	0.42
34	0.39
35	0.39
36	0.37
37	0.35
38	0.35
39	0.36
40	0.34
41	0.3
42	0.31
43	0.31
44	0.28
45	0.35
46	0.34
47	0.3
48	0.27
49	0.25
50	0.24
51	0.28
52	0.33
53	0.25
54	0.21
55	0.19
56	0.17
57	0.17
58	0.17
59	0.12
60	0.08
61	0.07
62	0.07
63	0.08
64	0.09
65	0.09
66	0.13
67	0.14
68	0.15
69	0.18
70	0.18
71	0.18
72	0.19
73	0.19
74	0.19
75	0.19
76	0.2
77	0.19
78	0.2
79	0.21
80	0.21
81	0.23
82	0.23
83	0.26
84	0.23
85	0.3
86	0.29
87	0.32
88	0.34
89	0.34
90	0.31
91	0.26
92	0.31
93	0.23
94	0.22
95	0.19
96	0.18
97	0.16
98	0.17
99	0.18
100	0.17
101	0.18
102	0.2
103	0.23
104	0.23
105	0.27
106	0.3
107	0.3
108	0.28
109	0.3
110	0.29
111	0.26
112	0.32
113	0.36
114	0.33
115	0.34
116	0.32
117	0.27
118	0.27
119	0.26
120	0.2
121	0.12
122	0.12
123	0.1
124	0.11
125	0.11
126	0.1
127	0.09
128	0.07
129	0.07
130	0.06
131	0.07
132	0.06
133	0.07
134	0.07
135	0.07
136	0.12
137	0.15
138	0.2
139	0.21
140	0.23
141	0.22
142	0.24
143	0.25
144	0.22
145	0.18
146	0.13
147	0.11
148	0.09
149	0.09
150	0.08
151	0.07
152	0.05
153	0.05
154	0.06
155	0.07
156	0.1
157	0.1
158	0.1
159	0.11
160	0.12
161	0.14
162	0.15
163	0.18
164	0.16
165	0.21
166	0.21
167	0.2
168	0.19
169	0.18
170	0.16
171	0.14
172	0.13
173	0.08
174	0.08
175	0.08
176	0.09
177	0.09
178	0.09
179	0.07
180	0.14
181	0.15
182	0.15
183	0.14
184	0.14
185	0.13
186	0.13
187	0.13
188	0.07
189	0.06
190	0.08
191	0.09
192	0.12
193	0.13
194	0.14
195	0.15
196	0.15
197	0.18
198	0.19
199	0.19
200	0.2
201	0.19
202	0.19
203	0.18
204	0.17
205	0.15
206	0.12
207	0.11
208	0.08
209	0.07
210	0.11
211	0.14
212	0.16
213	0.16
214	0.17
215	0.19
216	0.21
217	0.23
218	0.21
219	0.2
220	0.2
221	0.21
222	0.21
223	0.2
224	0.18
225	0.19
226	0.24
227	0.25
228	0.26
229	0.28
230	0.26
231	0.25
232	0.24
233	0.23
234	0.16
235	0.13
236	0.11
237	0.08
238	0.08
239	0.07
240	0.07
241	0.06
242	0.04
243	0.03
244	0.02
245	0.02
246	0.02
247	0.02
248	0.02
249	0.03
250	0.03
251	0.03
252	0.03
253	0.03
254	0.03
255	0.04
256	0.07
257	0.06
258	0.06
259	0.06
260	0.07
261	0.07
262	0.07
263	0.07
264	0.05
265	0.05
266	0.05
267	0.05
268	0.04
269	0.05
270	0.04
271	0.04
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.03
276	0.05
277	0.04
278	0.05
279	0.05
280	0.05
281	0.05
282	0.05
283	0.06
284	0.04
285	0.04
286	0.05
287	0.05
288	0.05
289	0.05
290	0.05
291	0.05
292	0.04
293	0.04
294	0.04
295	0.04
296	0.04
297	0.04
298	0.04
299	0.04
300	0.05
301	0.06
302	0.07
303	0.08
304	0.13
305	0.17
306	0.21
307	0.25
308	0.3
309	0.31
310	0.3
311	0.29
312	0.32
313	0.29
314	0.25
315	0.25
316	0.2
317	0.18
318	0.17
319	0.17
320	0.09
321	0.09
322	0.1
323	0.06
324	0.07
325	0.06
326	0.07
327	0.08
328	0.08
329	0.07
330	0.06
331	0.06
332	0.06
333	0.07
334	0.06
335	0.05
336	0.06
337	0.06
338	0.06
339	0.06
340	0.07
341	0.06
342	0.07
343	0.07
344	0.06
345	0.06
346	0.06
347	0.06
348	0.05
349	0.05
350	0.05
351	0.06
352	0.08
353	0.09
354	0.09
355	0.09
356	0.1
357	0.11
358	0.16
359	0.22
360	0.23
361	0.24
362	0.26
363	0.28
364	0.28
365	0.3
366	0.29
367	0.25
368	0.3
369	0.29
370	0.28
371	0.27
372	0.26
373	0.28
374	0.28
375	0.32
376	0.31
377	0.42
378	0.51
379	0.59
380	0.68
381	0.73
382	0.79
383	0.8
384	0.84
385	0.81
386	0.8
387	0.8
388	0.79
389	0.73
390	0.65
391	0.56
392	0.46
393	0.38
394	0.28
395	0.2
396	0.12
397	0.08
398	0.07
399	0.09
400	0.09
401	0.1
402	0.1
403	0.11
404	0.11
405	0.11
406	0.11
407	0.09
408	0.09
409	0.1
410	0.13
411	0.15
412	0.15
413	0.16
414	0.16
415	0.16
416	0.16
417	0.15
418	0.12
419	0.11
420	0.11
421	0.11
422	0.11
423	0.11
424	0.11
425	0.11
426	0.1
427	0.09
428	0.1
429	0.1
430	0.1
431	0.1
432	0.09
433	0.08
434	0.09
435	0.08
436	0.06
437	0.06
438	0.05
439	0.06
440	0.07
441	0.08
442	0.07
443	0.08
444	0.1
445	0.11
446	0.12
447	0.16
448	0.2
449	0.24
450	0.25
451	0.25
452	0.27
453	0.29
454	0.33
455	0.29
456	0.31
457	0.29
458	0.3
459	0.33
460	0.31
461	0.29
462	0.26
463	0.24
464	0.22
465	0.22
466	0.22
467	0.18
468	0.16
469	0.17
470	0.17
471	0.2
472	0.2
473	0.2
474	0.23
475	0.23
476	0.26
477	0.26
478	0.26
479	0.26
480	0.3
481	0.31
482	0.29
483	0.35
484	0.34
485	0.4
486	0.4
487	0.39
488	0.32
489	0.35
490	0.41
491	0.38
492	0.41
493	0.38
494	0.39
495	0.41
496	0.43
497	0.37
498	0.29
499	0.26
500	0.21
501	0.17
502	0.14
503	0.1
504	0.08
505	0.1
506	0.11
507	0.12
508	0.15
509	0.18
510	0.24
511	0.34
512	0.45
513	0.53
514	0.61
515	0.7
516	0.77
517	0.82
518	0.87
519	0.86
520	0.83
521	0.84
522	0.84
523	0.85
524	0.84
525	0.79
526	0.75
527	0.75
528	0.72
529	0.69

A0A194SCX3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer