FuNGI

A0A194SCB2

Protein Details

Accession

A0A194SCB2

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
76-95	SSSSSPAKPHPLKRSRSSHT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
88-90	KRS

Subcellular Location(s)

plas 8, cyto 6.5, cyto_nucl 6, nucl 4.5, mito 3, E.R. 2, vacu 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019321 Nucleoporin_Nup88 IPR037700 NUP88/NUP82
Gene Ontology	GO:0005643 C:nuclear pore GO:0017056 F:structural constituent of nuclear pore GO:0051028 P:mRNA transport GO:0015031 P:protein transport GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus GO:0000056 P:ribosomal small subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF10168 Nup88

Amino Acid Sequences

MAPWLQALAHHPVWTLPPPASSSSSNDLARSTAPGSAAHAAAQAALGRSSSTVAPLSQSNSSRSLFGLANSPSSPSSSSSPAKPHPLKRSRSSHTAGAKSSTERRIKGGRTTRVAVVRGTDLVVAVGSELRMASLAQVKSRAIEAGELPVEDIDLGDYKVLNTPAVTFEIQQLIVNPTSKLLAVVGAHSVVVVVLPRRGWTNTVSKTLECRSLPVGAFYHSLAGSPTIASVLWHPLGHDASSLVVLTSDATLREYTVSESLDEPAQTLSFARAGAGAGAGTARKGGFGLDAVDREAQTAVALCVGEGKGDWGPLTLYALMRNGDVVSMCPFLPKKASLTPNYVHALSAFVSTKVDYLSSASPFPALEKRYSLQQQYVSSLVRQVTTSGPPAFATDLGLDRADDDDDSHDPSTPRDVVSPSRPALAPRLQGPFLLQPAPAELDNGADGAACDLAYLAHAAPSGEAGDGEADGEADGEEEMGEGVGVLAIAYRDGKVDLCLEVEKVEARFVGEAPPPAAPAAALASSSRSGALVLRNRSTPRRGGGFGAANLDSDDDDEPADANADDADDAADLPTLAVFESIDLGLATALSPAGSEHVVARALAHNAPVFARDPLYGADTLYVRHALGAHCLFLGPWLAPMAEALRSAARRGEDGGDEGQDDDEKLERELREGLLGAQGGTEVCWVLKTVGAHGEEDAHEGEGAASAAQPVEGLALLNDVYLGYSLVLVTAALQPVGIELALRIDASATAFDDASAAARSATPAKPAAAAASSTEPAYVSLLSQTPFTVPAILSRPRTAAPLVPRLPSTSSELRVTPDTLRQLGKHVSATQTALRDLVAASGVVSARVELQMRELKRQVDKVRELDERRAELGRSVGAGAGAGAGAGDGAAGGVEARVRAAEERQHALLARTDRVLQRLVESHQPQVSAVERKWFDELERLSDQVDGGVSDDEDRSWSAAVAAAATGGGSGAAPLALRAQRLEAQMELLRPALEELRRKEEVKRAAGTPARNGAGGMGQLQLARVEGLLSDEAKILADAKRKVERLTSALASASLCG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.27
3	0.21
4	0.21
5	0.24
6	0.27
7	0.3
8	0.29
9	0.31
10	0.33
11	0.38
12	0.37
13	0.35
14	0.32
15	0.3
16	0.28
17	0.26
18	0.21
19	0.17
20	0.17
21	0.17
22	0.2
23	0.21
24	0.2
25	0.17
26	0.17
27	0.15
28	0.14
29	0.14
30	0.12
31	0.1
32	0.1
33	0.09
34	0.09
35	0.09
36	0.11
37	0.11
38	0.11
39	0.12
40	0.12
41	0.14
42	0.16
43	0.19
44	0.24
45	0.26
46	0.27
47	0.3
48	0.31
49	0.29
50	0.28
51	0.28
52	0.22
53	0.21
54	0.25
55	0.22
56	0.24
57	0.24
58	0.25
59	0.22
60	0.23
61	0.23
62	0.19
63	0.22
64	0.25
65	0.29
66	0.32
67	0.39
68	0.42
69	0.51
70	0.57
71	0.62
72	0.66
73	0.72
74	0.75
75	0.77
76	0.82
77	0.78
78	0.78
79	0.74
80	0.72
81	0.71
82	0.69
83	0.61
84	0.56
85	0.51
86	0.48
87	0.51
88	0.51
89	0.49
90	0.45
91	0.49
92	0.52
93	0.54
94	0.59
95	0.61
96	0.61
97	0.61
98	0.63
99	0.63
100	0.61
101	0.58
102	0.49
103	0.41
104	0.35
105	0.29
106	0.26
107	0.2
108	0.14
109	0.12
110	0.11
111	0.08
112	0.06
113	0.06
114	0.05
115	0.05
116	0.05
117	0.05
118	0.05
119	0.05
120	0.08
121	0.14
122	0.16
123	0.17
124	0.2
125	0.2
126	0.21
127	0.22
128	0.21
129	0.14
130	0.15
131	0.14
132	0.16
133	0.16
134	0.15
135	0.15
136	0.13
137	0.13
138	0.1
139	0.09
140	0.06
141	0.06
142	0.06
143	0.06
144	0.07
145	0.07
146	0.11
147	0.12
148	0.11
149	0.1
150	0.12
151	0.13
152	0.16
153	0.16
154	0.14
155	0.15
156	0.17
157	0.17
158	0.17
159	0.16
160	0.17
161	0.18
162	0.18
163	0.16
164	0.14
165	0.15
166	0.14
167	0.13
168	0.1
169	0.1
170	0.09
171	0.1
172	0.1
173	0.09
174	0.09
175	0.08
176	0.08
177	0.05
178	0.05
179	0.06
180	0.06
181	0.08
182	0.08
183	0.09
184	0.12
185	0.14
186	0.15
187	0.18
188	0.27
189	0.3
190	0.36
191	0.38
192	0.36
193	0.4
194	0.42
195	0.44
196	0.34
197	0.33
198	0.28
199	0.31
200	0.3
201	0.28
202	0.26
203	0.21
204	0.22
205	0.19
206	0.19
207	0.14
208	0.14
209	0.12
210	0.11
211	0.1
212	0.08
213	0.08
214	0.06
215	0.06
216	0.07
217	0.08
218	0.11
219	0.12
220	0.12
221	0.12
222	0.15
223	0.16
224	0.15
225	0.14
226	0.1
227	0.09
228	0.1
229	0.09
230	0.06
231	0.05
232	0.05
233	0.05
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.07
238	0.07
239	0.08
240	0.09
241	0.09
242	0.1
243	0.12
244	0.12
245	0.12
246	0.12
247	0.13
248	0.14
249	0.13
250	0.12
251	0.1
252	0.1
253	0.09
254	0.08
255	0.08
256	0.08
257	0.08
258	0.07
259	0.07
260	0.07
261	0.07
262	0.07
263	0.05
264	0.04
265	0.05
266	0.05
267	0.04
268	0.05
269	0.05
270	0.05
271	0.05
272	0.05
273	0.05
274	0.06
275	0.08
276	0.09
277	0.1
278	0.11
279	0.12
280	0.12
281	0.12
282	0.11
283	0.09
284	0.08
285	0.08
286	0.06
287	0.06
288	0.06
289	0.05
290	0.07
291	0.07
292	0.07
293	0.06
294	0.08
295	0.07
296	0.08
297	0.08
298	0.06
299	0.07
300	0.07
301	0.09
302	0.08
303	0.08
304	0.09
305	0.1
306	0.1
307	0.1
308	0.1
309	0.09
310	0.08
311	0.07
312	0.07
313	0.08
314	0.09
315	0.09
316	0.12
317	0.12
318	0.13
319	0.16
320	0.16
321	0.17
322	0.24
323	0.3
324	0.31
325	0.36
326	0.36
327	0.38
328	0.39
329	0.36
330	0.28
331	0.22
332	0.2
333	0.14
334	0.16
335	0.11
336	0.09
337	0.1
338	0.1
339	0.1
340	0.09
341	0.09
342	0.06
343	0.08
344	0.1
345	0.11
346	0.12
347	0.11
348	0.11
349	0.11
350	0.13
351	0.16
352	0.15
353	0.16
354	0.18
355	0.19
356	0.25
357	0.29
358	0.29
359	0.28
360	0.3
361	0.3
362	0.3
363	0.31
364	0.25
365	0.21
366	0.22
367	0.19
368	0.15
369	0.14
370	0.13
371	0.13
372	0.14
373	0.18
374	0.15
375	0.15
376	0.14
377	0.15
378	0.14
379	0.12
380	0.11
381	0.08
382	0.09
383	0.09
384	0.09
385	0.08
386	0.08
387	0.08
388	0.07
389	0.06
390	0.06
391	0.08
392	0.08
393	0.11
394	0.11
395	0.12
396	0.12
397	0.13
398	0.16
399	0.15
400	0.14
401	0.14
402	0.15
403	0.17
404	0.22
405	0.26
406	0.23
407	0.24
408	0.24
409	0.23
410	0.26
411	0.27
412	0.24
413	0.23
414	0.26
415	0.24
416	0.24
417	0.25
418	0.21
419	0.19
420	0.18
421	0.14
422	0.11
423	0.11
424	0.12
425	0.1
426	0.09
427	0.07
428	0.07
429	0.07
430	0.07
431	0.06
432	0.04
433	0.04
434	0.04
435	0.04
436	0.03
437	0.03
438	0.03
439	0.03
440	0.03
441	0.04
442	0.03
443	0.04
444	0.04
445	0.04
446	0.04
447	0.04
448	0.05
449	0.04
450	0.04
451	0.04
452	0.04
453	0.04
454	0.04
455	0.03
456	0.03
457	0.03
458	0.03
459	0.03
460	0.03
461	0.03
462	0.03
463	0.03
464	0.02
465	0.02
466	0.02
467	0.02
468	0.02
469	0.02
470	0.02
471	0.02
472	0.02
473	0.02
474	0.02
475	0.02
476	0.03
477	0.03
478	0.03
479	0.04
480	0.04
481	0.05
482	0.06
483	0.06
484	0.07
485	0.07
486	0.07
487	0.07
488	0.07
489	0.07
490	0.07
491	0.07
492	0.06
493	0.06
494	0.06
495	0.06
496	0.09
497	0.09
498	0.09
499	0.1
500	0.1
501	0.1
502	0.1
503	0.09
504	0.06
505	0.05
506	0.05
507	0.04
508	0.04
509	0.04
510	0.05
511	0.06
512	0.06
513	0.06
514	0.05
515	0.05
516	0.06
517	0.11
518	0.16
519	0.18
520	0.19
521	0.22
522	0.24
523	0.27
524	0.29
525	0.26
526	0.24
527	0.25
528	0.25
529	0.24
530	0.25
531	0.24
532	0.21
533	0.21
534	0.18
535	0.14
536	0.13
537	0.12
538	0.08
539	0.07
540	0.07
541	0.05
542	0.05
543	0.05
544	0.05
545	0.05
546	0.05
547	0.04
548	0.04
549	0.03
550	0.03
551	0.03
552	0.03
553	0.03
554	0.03
555	0.03
556	0.03
557	0.03
558	0.03
559	0.03
560	0.03
561	0.03
562	0.03
563	0.03
564	0.03
565	0.03
566	0.03
567	0.03
568	0.04
569	0.03
570	0.03
571	0.03
572	0.03
573	0.03
574	0.03
575	0.03
576	0.02
577	0.02
578	0.02
579	0.04
580	0.04
581	0.04
582	0.04
583	0.06
584	0.06
585	0.06
586	0.07
587	0.07
588	0.09
589	0.09
590	0.1
591	0.09
592	0.09
593	0.09
594	0.1
595	0.09
596	0.08
597	0.09
598	0.08
599	0.08
600	0.09
601	0.11
602	0.09
603	0.08
604	0.09
605	0.09
606	0.09
607	0.09
608	0.09
609	0.07
610	0.07
611	0.08
612	0.07
613	0.11
614	0.11
615	0.11
616	0.1
617	0.1
618	0.1
619	0.09
620	0.09
621	0.05
622	0.05
623	0.05
624	0.05
625	0.05
626	0.05
627	0.06
628	0.06
629	0.06
630	0.06
631	0.08
632	0.09
633	0.09
634	0.11
635	0.11
636	0.11
637	0.12
638	0.13
639	0.11
640	0.13
641	0.13
642	0.11
643	0.11
644	0.11
645	0.1
646	0.08
647	0.07
648	0.06
649	0.07
650	0.07
651	0.08
652	0.11
653	0.11
654	0.13
655	0.14
656	0.14
657	0.13
658	0.13
659	0.12
660	0.1
661	0.1
662	0.08
663	0.07
664	0.06
665	0.06
666	0.05
667	0.05
668	0.03
669	0.03
670	0.04
671	0.04
672	0.04
673	0.06
674	0.06
675	0.08
676	0.12
677	0.13
678	0.13
679	0.13
680	0.14
681	0.13
682	0.14
683	0.13
684	0.09
685	0.08
686	0.07
687	0.07
688	0.06
689	0.06
690	0.04
691	0.04
692	0.04
693	0.04
694	0.03
695	0.03
696	0.03
697	0.03
698	0.03
699	0.03
700	0.03
701	0.04
702	0.04
703	0.04
704	0.04
705	0.03
706	0.03
707	0.03
708	0.04
709	0.03
710	0.03
711	0.03
712	0.03
713	0.03
714	0.03
715	0.04
716	0.05
717	0.06
718	0.05
719	0.05
720	0.05
721	0.05
722	0.06
723	0.04
724	0.03
725	0.03
726	0.04
727	0.04
728	0.04
729	0.04
730	0.04
731	0.04
732	0.05
733	0.06
734	0.05
735	0.06
736	0.06
737	0.06
738	0.06
739	0.06
740	0.06
741	0.06
742	0.06
743	0.05
744	0.06
745	0.07
746	0.11
747	0.12
748	0.13
749	0.14
750	0.14
751	0.15
752	0.15
753	0.15
754	0.12
755	0.12
756	0.11
757	0.12
758	0.12
759	0.11
760	0.11
761	0.1
762	0.09
763	0.1
764	0.08
765	0.06
766	0.08
767	0.09
768	0.1
769	0.1
770	0.1
771	0.09
772	0.1
773	0.1
774	0.1
775	0.09
776	0.12
777	0.17
778	0.21
779	0.23
780	0.23
781	0.25
782	0.24
783	0.26
784	0.24
785	0.24
786	0.25
787	0.32
788	0.33
789	0.33
790	0.33
791	0.33
792	0.34
793	0.31
794	0.32
795	0.27
796	0.28
797	0.28
798	0.28
799	0.29
800	0.29
801	0.29
802	0.24
803	0.25
804	0.25
805	0.26
806	0.28
807	0.26
808	0.28
809	0.3
810	0.3
811	0.28
812	0.26
813	0.26
814	0.26
815	0.27
816	0.26
817	0.24
818	0.22
819	0.19
820	0.17
821	0.15
822	0.13
823	0.11
824	0.08
825	0.06
826	0.06
827	0.07
828	0.07
829	0.07
830	0.07
831	0.06
832	0.07
833	0.09
834	0.09
835	0.08
836	0.13
837	0.2
838	0.21
839	0.27
840	0.3
841	0.33
842	0.38
843	0.46
844	0.48
845	0.5
846	0.55
847	0.54
848	0.57
849	0.6
850	0.59
851	0.59
852	0.58
853	0.52
854	0.48
855	0.45
856	0.39
857	0.32
858	0.3
859	0.22
860	0.17
861	0.15
862	0.12
863	0.1
864	0.09
865	0.07
866	0.06
867	0.05
868	0.03
869	0.03
870	0.02
871	0.02
872	0.02
873	0.02
874	0.02
875	0.02
876	0.02
877	0.02
878	0.02
879	0.02
880	0.03
881	0.03
882	0.04
883	0.04
884	0.05
885	0.07
886	0.11
887	0.17
888	0.21
889	0.25
890	0.25
891	0.27
892	0.27
893	0.27
894	0.29
895	0.27
896	0.25
897	0.22
898	0.26
899	0.27
900	0.29
901	0.3
902	0.25
903	0.25
904	0.27
905	0.28
906	0.33
907	0.33
908	0.36
909	0.35
910	0.35
911	0.31
912	0.3
913	0.33
914	0.3
915	0.29
916	0.32
917	0.31
918	0.33
919	0.35
920	0.33
921	0.29
922	0.31
923	0.32
924	0.3
925	0.31
926	0.29
927	0.27
928	0.27
929	0.25
930	0.18
931	0.16
932	0.09
933	0.08
934	0.08
935	0.08
936	0.09
937	0.09
938	0.09
939	0.1
940	0.1
941	0.1
942	0.1
943	0.1
944	0.09
945	0.11
946	0.11
947	0.09
948	0.09
949	0.08
950	0.07
951	0.07
952	0.06
953	0.03
954	0.03
955	0.03
956	0.03
957	0.03
958	0.03
959	0.03
960	0.04
961	0.09
962	0.11
963	0.12
964	0.13
965	0.16
966	0.2
967	0.23
968	0.25
969	0.2
970	0.23
971	0.25
972	0.25
973	0.23
974	0.19
975	0.17
976	0.15
977	0.17
978	0.18
979	0.21
980	0.28
981	0.32
982	0.39
983	0.43
984	0.44
985	0.49
986	0.53
987	0.56
988	0.55
989	0.54
990	0.48
991	0.53
992	0.57
993	0.54
994	0.52
995	0.49
996	0.43
997	0.39
998	0.37
999	0.29
1000	0.25
1001	0.23
1002	0.17
1003	0.11
1004	0.11
1005	0.11
1006	0.12
1007	0.11
1008	0.09
1009	0.09
1010	0.07
1011	0.07
1012	0.06
1013	0.09
1014	0.1
1015	0.11
1016	0.11
1017	0.12
1018	0.12
1019	0.12
1020	0.12
1021	0.12
1022	0.15
1023	0.22
1024	0.25
1025	0.31
1026	0.39
1027	0.42
1028	0.44
1029	0.48
1030	0.48
1031	0.45
1032	0.48
1033	0.43
1034	0.36
1035	0.34
1036	0.33

A0A194SCB2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer